Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
CAMK2B
Белок CAMK2B PDB 2ux0.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

3BHH

Идентификаторы
ПсевдонимыCAMK2B , CAM2, CAMK2, CAMKB, кальций / кальмодулин-зависимая протеинкиназа II бета, MRD54, CaMKIIbeta
Внешние идентификаторыOMIM : 607707 MGI : 88257 HomoloGene : 111050 GeneCards : CAMK2B
Расположение гена ( человек )
Хромосома 7 (человек)
Chr.Хромосома 7 (человек) [1]
Хромосома 7 (человек)
Геномное расположение CAMK2B
Геномное расположение CAMK2B
Группа7p13Начинать44 217 150 п.н. [1]
Конец44 334 577 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 11 (мышь)
Chr.Хромосома 11 (мышь) [2]
Хромосома 11 (мышь)
Геномное расположение CAMK2B
Геномное расположение CAMK2B
Группа11 A1 | 11 3,89 смНачинать5 969 644 п.н. [2]
Конец6 066 362 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE CAMK2B 211483 x at fs.png

PBB GE CAMK2B 210404 x at fs.png

PBB GE CAMK2B 209956 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• трансферазной активности
• нуклеотид связывания
• протеинкиназа активность
• белок гомодимеризация активность
• активность киназы
• ГО: связывание 0001948 белок
• актина связывания
• АТФ связывания
• белок серин / треонин киназы
• Рас гуанил-нуклеотид коэффициент активности обмена
• кальмодулин-зависимой протеинкиназы активность
• кальмодулин связывания
• связывание белка идентичны
Сотовый компонент• эндоцитотический везикулы мембраны
• цитозоль
• мембрана
• клеточная мембрана
• нуклеоплазма
• центр организации микротрубочек
• саркоплазматического ретикулума мембраны
• саркоплазматического ретикулума
• цитоскелета
• цитоплазма
• нейрон проекция
• межклеточные контакты
• синапса
Биологический процесс• дифференцировка клеток
• регуляция структурной пластичности синапсов
• регуляция транспорта ионов кальция
• регуляция долговременной синаптической пластичности нейронов
• сигнальный путь, опосредованный гамма-интерфероном
• фосфорилирование
• развитие нервной системы
• каскад MAPK
• развитие многоклеточных организмов
• положительная регуляция синапсов созревание
• фосфорилирование белков
• положительная регуляция развития проекций нейронов
• аутофосфорилирование
• регуляция адаптации скелетных мышц
• положительная регуляция морфогенеза дендритных шипов
• регуляция развития дендритных шипов
• сигнальная трансдукция
• фосфорилирование пептидил-серина
• фосфорилирование пептидил-треонина
• внутриклеточная передача сигнала GO: 0007243
• регуляция миграции нейронов
• регуляция клеточного ответа на тепло
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

816

12323

Ансамбль

ENSG00000058404

ENSMUSG00000057897

UniProt

Q13554

P28652

RefSeq (мРНК)
NM_001220
NM_001293170
NM_172078
NM_172079
NM_172080

NM_172081
NM_172082
NM_172083
NM_172084

NM_001174053
NM_001174054
NM_007595

RefSeq (белок)
NP_001211
NP_001280099
NP_742075
NP_742076
NP_742077

NP_742078
NP_742079
NP_742080
NP_742081

NP_001167524
NP_001167525
NP_031621

Расположение (UCSC)Chr 7: 44,22 - 44,33 МбChr 11: 5.97 - 6.07 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Кальций / кальмодулин-зависимой протеинкиназы II типа бета - цепь представляет собой фермент , который у человека кодируется CAMK2B гена .

Функция [ править ]

Продукт этого гена принадлежит к семейству серин / треониновых протеинкиназ и к подсемейству Ca 2+ / кальмодулин-зависимых протеинкиназ. Передача сигналов кальция имеет решающее значение для нескольких аспектов пластичности глутаматергических синапсов. В клетках млекопитающих фермент состоит из четырех различных цепей: альфа, бета, гамма и дельта. Продукт этого гена - бета-цепь. Возможно, что разные изоформы этой цепи имеют разную клеточную локализацию и по-разному взаимодействуют с кальмодулином. Для этого гена идентифицировано восемь вариантов транскрипта, кодирующих восемь различных изоформ. [5]

Взаимодействия [ править ]

CAMK2B взаимодействует с актинином альфа 4 . [6]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000058404 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000057897 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ "Entrez Gene: CAMK2B кальций / кальмодулин-зависимая протеинкиназа (CaM киназа) II бета" .
  6. ^ Walikonis RS, Огуни A, Хорошева Е.М., Йенг CJ, Асунсьон FJ, Kennedy MB (январь 2001). «Денсин-180 образует тройной комплекс с (альфа) -субъединицей Са2 + / кальмодулин-зависимой протеинкиназы II и (альфа) -актинином» . J. Neurosci . 21 (2): 423–33. DOI : 10.1523 / JNEUROSCI.21-02-00423.2001 . PMC 6763799 . PMID 11160423 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Ямамото Х (2002). «[Молекулярные механизмы внутриклеточной локализации изоформ Са2 + / кальмодулин-зависимой протеинкиназы II и их физиологические функции]». Танпакушицу Какусан Косо . 47 (3): 241–7. PMID  11889801 .
  • Тиль Г., Черник А.Дж., Горелик Ф., Нэрн А.С., Грингард П. (1988). «Са2 + / кальмодулин-зависимая протеинкиназа II: идентификация треонина-286 в качестве сайта аутофосфорилирования в альфа-субъединице, связанного с генерацией Са2 + -независимой активности» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 85 (17): 6337–41. DOI : 10.1073 / pnas.85.17.6337 . PMC  281965 . PMID  2842767 .
  • Schworer CM, Colbran RJ, Keefer JR, Soderling TR (1988). «Са2 + / кальмодулин-зависимая протеинкиназа II. Идентификация регуляторного сайта аутофосфорилирования, смежного с ингибирующим и кальмодулин-связывающим доменами». J. Biol. Chem . 263 (27): 13486–9. PMID  3417668 .
  • Penadés JR, Bernal D, Revert F, Johansson C, Fresquet VJ, Cervera J, Wieslander J, Quinones S, Saus J (1995). «Характеристика и экспрессия множества альтернативно сплайсированных транскриптов области гена антигена Goodpasture. Антитела Goodpasture распознают рекомбинантные белки, представляющие аутоантиген и одну из его альтернативных форм». Евро. J. Biochem . 229 (3): 754–60. DOI : 10.1111 / j.1432-1033.1995.tb20524.x . PMID  7758473 .
  • Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID  8125298 .
  • Омкумар Р.В., Кили М.Дж., Розенштейн А.Дж., Мин К.Т., Кеннеди МБ (1997). «Идентификация сайта фосфорилирования кальций / кальмодулин-зависимой протеинкиназы II в субъединице NR2B рецептора N-метил-D-аспартата» . J. Biol. Chem . 271 (49): 31670–8. DOI : 10.1074 / jbc.271.49.31670 . PMID  8940188 .
  • Могилы Р.М., Кристал Г.В. (1997). «Идентификация новых вариантов CaMK-II, специфичных для опухолевых клеток человека». Биохим. Биофиз. Acta . 1355 (3): 281–92. DOI : 10.1016 / S0167-4889 (96) 00141-3 . PMID  9060999 .
  • Мойерс Дж. С., Билан П. Дж., Чжу Дж., Кан Ч. Р. (1997). «Rad и Rad-связанные GTPases взаимодействуют с кальмодулином и кальмодулин-зависимой протеинкиназой II» . J. Biol. Chem . 272 (18): 11832–9. DOI : 10.1074 / jbc.272.18.11832 . PMID  9115241 .
  • Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Конструирование и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID  9373149 .
  • Чанг Б.Х., Мукхерджи С., Содерлинг Т.Р. (1998). «Характеристика белка ингибитора кальмодулин киназы II в головном мозге» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 95 (18): 10890–5. DOI : 10.1073 / pnas.95.18.10890 . PMC  27991 . PMID  9724800 .
  • Рохлитц Х., Фойгт А, Ланкат-Буттгерайт Б, Гёке Б., Хаймберг Х., Наук М.А., Шиман У., Шатц Х., Пфайффер А.Ф. (2000). «Клонирование и количественное определение изоформ Ca2 + / кальмодулин-зависимой протеинкиназы II (CaMK II) человека в бета-клетках человека» . Диабетология . 43 (4): 465–73. DOI : 10.1007 / s001250051330 . PMID  10819240 .
  • Ван П., Ву Й.Л., Чжоу Т.Х., Сунь Й., Пей Г. (2000). «Идентификация альтернативных вариантов сплайсинга бета-субъединицы Са (2 +) / кальмодулин-зависимой протеинкиназы II человека с различной активностью» . FEBS Lett . 475 (2): 107–10. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (00) 01634-3 . PMID  10858498 . S2CID  39732332 .
  • Новак Г., Симан П., Таллерико Т. (2001). «Шизофрения: повышенная мРНК для кальций-кальмодулин-зависимой протеинкиназы IIbeta во фронтальной коре головного мозга». Brain Res. Мол. Brain Res . 82 (1–2): 95–100. DOI : 10.1016 / S0169-328X (00) 00188-1 . PMID  11042361 .
  • Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Genome Res . 10 (11): 1788–95. DOI : 10.1101 / gr.143000 . PMC  310948 . PMID  11076863 .
  • Валиконис Р.С., Огуни А., Хорошева Е.М., Дженг С.Дж., Асунсьон Ф.Дж., Кеннеди МБ (2001). «Денсин-180 образует тройной комплекс с (альфа) -субъединицей Са2 + / кальмодулин-зависимой протеинкиназы II и (альфа) -актинином» . J. Neurosci . 21 (2): 423–33. DOI : 10.1523 / JNEUROSCI.21-02-00423.2001 . PMC  6763799 . PMID  11160423 .
  • Ляо GY, Вагнер Д.А., Сюй MH, Леонард JP (2001). «Доказательства прямой модуляции опосредованной протеинкиназой-C тока рецептора N-метил-D-аспартата». Мол. Pharmacol . 59 (5): 960–4. DOI : 10,1124 / mol.59.5.960 . PMID  11306676 .
  • Юэ Ц., Санборн Б.М. (2001). «KN-93 ингибирование передачи сигналов G-белка не зависит от способности Ca2 + / кальмодулин-зависимой протеинкиназы II фосфорилировать фосфолипазу Cbeta3 по 537-Ser». Мол. Клетка. Эндокринол . 175 (1–2): 149–56. DOI : 10.1016 / S0303-7207 (01) 00383-5 . PMID  11325525 . S2CID  338776 .
  • Шелл М.Дж., Эрнё К., Ирвин РФ (2001). «Инозитол-1,4,5-трифосфат-3-киназа А связывается с F-актином и дендритными шипами через свой N-конец» . J. Biol. Chem . 276 (40): 37537–46. DOI : 10.1074 / jbc.M104101200 . PMID  11468283 .
  • Ли Джи, Лаабич А., Лю ЛО, Сюэ Дж., Купер Н.Г. (2002). «Молекулярное клонирование и анализ последовательности кальций / кальмодулин-зависимой протеинкиназы II из мозга плода и взрослого человека. Анализ последовательности кальций / кальмодулин-зависимой протеинкиназы II человеческого мозга». Мол. Биол. Rep . 28 (1): 35–41. DOI : 10,1023 / A: 1011951814898 . PMID  11710563 . S2CID  22670733 .
  • Поджи А., Карозио Р., Спаггиари Г. М., Фортис С., Тамбусси Г., Делль'Антонио Г., Даль Син Е., Рубартелли А., Зокки М. Р. (2002). «Активация NK-клеток дендритными клетками зависит от LFA-1-опосредованной индукции кальций-кальмодулинкиназы II: ингибирования С-концевым доменом Tat ВИЧ-1» . J. Immunol . 168 (1): 95–101. DOI : 10.4049 / jimmunol.168.1.95 . PMID  11751951 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Расположение генома человека CAMK2B и страница сведений о гене CAMK2B в браузере генома UCSC .