Нуклеопорин 214
Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлено из CAN (ген) )
Перейти к навигации Перейти к поиску
НУП214
Белок NUP214 PDB 2oit.png
Доступные структуры
PDBОртологический поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

2ОИТ , 3ФХК , 3ФМО , 3ФМП , 5ДИС

Идентификаторы
ПсевдонимыNUP214 , CAIN, CAN, D9S46E, N214, p250, нуклеопорин 214 кДа, нуклеопорин 214, IIAE9
Внешние идентификаторыOMIM : 114350 MGI : 1095411 HomoloGene : 38008 GeneCards : NUP214
Местоположение гена ( человек )
Хромосома 9 (человек)
Хр.Хромосома 9 (человек) [1]
Хромосома 9 (человек)
Геномное местоположение для NUP214
Геномное местоположение для NUP214
Группа9q34.13Начинать131 125 573 п.н. [1]
Конец131 234 663 п.н. [1]
Местоположение гена ( Мышь )
Хромосома 2 (мышь)
Хр.Хромосома 2 (мышь) [2]
Хромосома 2 (мышь)
Геномное местоположение для NUP214
Геномное местоположение для NUP214
Группа2 В|2 21,97 смНачинать31 864 448 п.н. [2]
Конец31 943 987 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
Бгы
Топ выражен в
  • моноцит
  • кровь
  • клетки костного мозга
  • икроножный нерв
  • селезенка
  • Ганглиозное возвышение
  • периодонтальное волокно
  • сперма
  • правая маточная труба
  • кожа живота
Дополнительные данные эталонного выражения
БиоGPS


Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция
  • активность рецептора сигнала ядерного экспорта
  • GO:0001948 связывание белка
  • связывание последовательности ядерной локализации
  • GO:0005487 структурный компонент ядерной поры
    • Сотовый компонент
    • цитозоль
    • внутриклеточная ограниченная мембраной органелла
    • очаговая адгезия
    • нуклеоплазма
    • ядро
    • цитоплазматическая сторона ядерной поры
    • ядерная пора ядерная корзина
    • центральный транспортный канал ядерной поры
    • ядерная пора
    • ядерная оболочка
    • клетка-хозяин
    Биологический процесс
    • транспорт мРНК
    • регуляция стабильности мРНК
    • регуляция клеточного цикла
    • экспорт белка из ядра
    • транспорт белка
    • GO:0022415 вирусный процесс
    • импорт белка в ядро
    • Экспорт РНК из ядра
    • экспорт мРНК из ядра
    • регуляция ядерно-цитоплазматического транспорта
    • GO:0007067 митотический клеточный цикл
    • регуляция гликолитического процесса
    • экспорт тРНК из ядра
    • сумоилирование белка
    • вирусная транскрипция
    • регуляция молчания генов с помощью микроРНК
    • GO:0046795 внутриклеточный транспорт вируса
    • регуляция клеточного ответа на тепло
    Источники: Амиго / QuickGO
    Ортологи
    РазновидностьЧеловекмышь
    Энтрез

    8021

    227720

    Ансамбль

    ENSG00000126883

    ЭНСМУСГ00000001855

    ЮниПрот

    P35658

    Q80U93

    RefSeq (мРНК)

    НМ_005085
    НМ_001318324
    НМ_001318325

    NM_172268

    RefSeq (белок)

    НП_001305253
    НП_001305254
    НП_005076

    NP_758472
    NP_001395026

    Местоположение (UCSC)Хр 9: 131,13 – 131,23 МбХр 2: 31,86 – 31,94 Мб
    Поиск в пабмеде[3][4]
    Викиданные
    Просмотр/редактирование человекаПросмотр/редактирование мыши

    Нуклеопорин 214 ( Nup2014 ) представляет собой белок , который у человека кодируется геном NUP214 . [5] [6] [7]

    Функция

    Комплекс ядерных пор представляет собой массивную структуру, которая простирается через ядерную оболочку, образуя ворота, регулирующие поток макромолекул между ядром и цитоплазмой . Нуклеопорины являются основными компонентами комплекса ядерных пор в эукариотических клетках. Этот ген является членом нуклеопоринов, содержащих FG-повторы. Белок, кодируемый этим геном, локализован на цитоплазматической поверхности комплекса ядерных пор, где он необходим для правильного прохождения клеточного цикла и ядерно-цитоплазматического транспорта. 3'-часть этого гена образует ген слияния с геном DEK на хромосоме 6 в транслокации at(6,9).связаны с острым миелоидным лейкозом и миелодиспластическим синдромом . [7]

    Структура

    Структура N-концевого домена Nup214 обнаруживает семилопастную складку бета-пропеллера, за которой следует С-концевой расширенный пептидный сегмент (CTE) из 30 остатков. CTE складывается обратно на бета-пропеллер и прикрепляется к его нижней поверхности. [8]Структура Nup214 NTD, связанного с геликазой Ddx19 в ее ADP-связанном состоянии, раскрывает молекулярную основу взаимодействия между двумя белками. Показано, что консервативный остаток Ddx19 имеет решающее значение для комплексообразования in vitro и in vivo. Поразительно, что поверхности взаимодействия демонстрируют сильно противоположные поверхностные потенциалы, при этом поверхность геликазы заряжена положительно, а поверхность Nup214 заряжена отрицательно. Показано, что Ddx19 связывает РНК только в ее АТФ-связанном состоянии, а связывание РНК и NTD Nup214 является взаимоисключающим. [9]

    Взаимодействия

    Было показано, что NUP214 взаимодействует с:

    • DDX19 , [9]
    • CRM1
    • NXF1 , [10] [11] и
    • NXF2 , [10] и
    • ЗФП36 . [12]

    использованная литература

    1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000126883 - Ensembl , май 2017 г.
    2. ^ a b c GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000001855 - Ensembl , май 2017 г.
    3. ^ "Справочник по PubMed для людей:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
    4. ^ "Справочник по PubMed для мыши:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
    5. ↑ Кремер Д., Возняк Р.В., Блобель Г., Раду А. (февраль 1994 г.). «Белок CAN человека, предполагаемый онкогенный продукт, связанный с миелоидным лейкемогенезом, представляет собой белок комплекса ядерных пор, обращенный к цитоплазме» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (4): 1519–1523. Бибкод : 1994PNAS...91.1519K . doi : 10.1073/pnas.91.4.1519 . ПМС 43191 . PMID 8108440 .  
    6. ↑ фон Линдерн М., Пустка А., Лерах Х., Гросвельд Г. (август 1990 г.). «Транслокация (6;9) хромосом, связанная с определенным подтипом острого нелимфоцитарного лейкоза, приводит к аберрантной транскрипции гена-мишени на 9q34» . Молекулярная и клеточная биология . 10 (8): 4016–26. doi : 10.1128/mcb.10.8.4016 . ПМС 360912 . PMID 2370860 .  
    7. ^ a b «Ген Entrez: нуклеопорин NUP214 214 кДа» .
    8. ^ Напетшниг Дж., Блобель Г., Хёльц А. (2007). «Кристаллическая структура N-концевого домена протоонкогена человека Nup214/CAN» . проц. Натл. акад. науч. США . 104 (6): 1783–1788. Бибкод : 2007PNAS..104.1783N . doi : 10.1073/pnas.0610828104 . ПВК 1794303 . PMID 17264208 .  
    9. ^ a b Napetschnig J, Kassube SA, Debler EW, Wong RW, Blobel G, Hoelz A (2009). «Структурный и функциональный анализ взаимодействия между нуклеопорином Nup214 и геликазой DEAD-бокса Ddx19» . проц. Натл. акад. науч. США . 106 (9): 3089–94. Бибкод : 2009PNAS..106.3089N . doi : 10.1073/pnas.0813267106 . ПВК 2651337 . PMID 19208808 .  
    10. ^ a b Герольд А., Суяма М., Родригес Дж. П., Браун И. С., Кутай У., Кармо-Фонсека М., Борк П., Изаурральде Э. (декабрь 2000 г.). «TAP (NXF1) принадлежит к мультигенному семейству предполагаемых факторов экспорта РНК с консервативной модульной архитектурой» . Молекулярная и клеточная биология . 20 (23): 8996–9008. doi : 10.1128/mcb.20.23.8996-9008.2000 . ПМС 86553 . PMID 11073998 .  
    11. ↑ Шмитт И., Джераче Л. (ноябрь 2001 г.). «Анализ ядерного транспорта in vitro, опосредованного С-концевым челночным доменом Tap» . Журнал биологической химии . 276 (45): 42355–63. doi : 10.1074/jbc.M103916200 . PMID 11551912 . 
    12. ^ Карман Дж. А., Надлер С. Г. (март 2004 г.). «Прямая ассоциация тристетрапролина с нуклеопорином CAN / Nup214». Коммуникации по биохимическим и биофизическим исследованиям . 315 (2): 445–9. doi : 10.1016/j.bbrc.2004.01.080 . PMID 14766228 . 

    дальнейшее чтение

    • Стоффлер Д., Фаренкрог Б., Эби Ю. (июнь 1999 г.). «Комплекс ядерных пор: от молекулярной архитектуры к функциональной динамике». Текущее мнение в области клеточной биологии . 11 (3): 391–401. doi : 10.1016/S0955-0674(99)80055-6 . PMID  10395558 .
    • фон Линдерн М., Форнерод М., ван Баал С., Джегле М., де Вит Т., Буйс А., Гросвельд Г. (апрель 1992 г.). «Транслокация (6; 9), связанная с определенным подтипом острого миелоидного лейкоза, приводит к слиянию двух генов, dek и can, и экспрессии химерной, специфичной для лейкемии мРНК dek-can» . Молекулярная и клеточная биология . 12 (4): 1687–1697. doi : 10.1128/mcb.12.4.1687 . ПМС  369612 . PMID  1549122 .
    • Номура Н., Миядзима Н., Сазука Т., Танака А., Каварабаяси Ю., Сато С., Нагасе Т., Секи Н., Исикава К., Табата С. (1995). «Предсказание кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. I. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0001-KIAA0040), полученные путем анализа случайно отобранных клонов кДНК из линии незрелых миелоидных клеток человека KG-1» . Исследования ДНК . 1 (1): 27–35. doi : 10.1093/dnares/1.1.27 . PMID  7584026 .
    • Номура Н., Миядзима Н., Сазука Т., Танака А., Каварабаяси Ю., Сато С., Нагасе Т., Секи Н., Исикава К., Табата С. (1995). «Предсказание кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. I. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0001-KIAA0040), полученные путем анализа случайно отобранных клонов кДНК из линии незрелых миелоидных клеток человека KG-1 (дополнение)» . Исследования ДНК . 1 (1): 47–56. doi : 10.1093/dnares/1.1.47 . PMID  7584028 .
    • Пильц А., Вудворд К., Пови С., Эббот С. (январь 1995 г.). «Сравнительное картирование 50 локусов хромосомы 9 человека у лабораторной мыши». Геномика . 25 (1): 139–49. doi : 10.1016/0888-7543(95)80119-7 . PMID  7774911 .
    • Штутц Ф., Изаурральде Э., Маттай И.В., Росбаш М. (декабрь 1996 г.). «Роль доменов повторов нуклеопорина FG в экспорте белка Rev вируса иммунодефицита человека типа 1 и РНК из ядра» . Молекулярная и клеточная биология . 16 (12): 7144–50. doi : 10.1128/mcb.16.12.7144 . ПВК 231718  . PMID 8943370 . 
    • Форнерод М., ван Дерсен Дж., ван Баал С., Рейнольдс А., Дэвис Д., Мурти К.Г., Франсен Дж., Гросвельд Г. (февраль 1997 г.). «Человеческий гомолог дрожжевого CRM1 находится в динамическом субкомплексе с CAN/Nup214 и новым компонентом ядерной поры Nup88» . Журнал EMBO . 16 (4): 807–16. doi : 10.1093/emboj/16.4.807 . ПВК 1169681  . PMID 9049309 . 
    • Ясин Н.Р., Блобель Г. (апрель 1997 г.). «Клонирование и характеристика человеческого кариоферина бета3» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (9): 4451-6. Бибкод : 1997PNAS...94.4451Y . doi : 10.1073/pnas.94.9.4451 . ЧВК  20743 . PMID  9114010 .
    • Бонифачи Н., Морояну Дж., Раду А., Блобель Г. (май 1997 г.). «Кариоферин бета2 опосредует ядерный импорт мРНК-связывающего белка» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (10): 5055–60. Бибкод : 1997PNAS...94.5055B . doi : 10.1073/pnas.94.10.5055 . ПМС  24630 . PMID  9144189 .
    • Бастос Р., Рибас де Пуплана Л., Энарсон М., Бодур К., Берк Б. (июнь 1997 г.). «Nup84, новый нуклеопорин, связанный с CAN/Nup214 на цитоплазматической поверхности комплекса ядерных пор» . Журнал клеточной биологии . 137 (5): 989–1000. doi : 10.1083/jcb.137.5.989 . ПВК 2136229  . PMID 9166401 . 
    • Бур Дж., Бонтен-Суртель Дж., Гросвельд Г. (март 1998 г.). «Сверхэкспрессия нуклеопорина CAN/NUP214 вызывает остановку роста, дефекты ядерно-цитоплазматического транспорта и апоптоз» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (3): 1236–1247. doi : 10.1128/mcb.18.3.1236 . ПМС  108836 . PMID  9488438 .
    • Богерд Х.П., Эчарри А., Росс Т.М., Каллен Б.Р. (ноябрь 1998 г.). «Ингибирование функции вируса иммунодефицита человека Rev и вируса Т-клеточного лейкоза человека Rex, но не активности конститутивного транспортного элемента вируса обезьяны Мейсон-Пфайзер, мутантным нуклеопорином человека, нацеленным на Crm1» . Журнал вирусологии . 72 (11): 8627–35. doi : 10.1128/ОВИ.72.11.8627-8635.1998 . ПМС  110274 . PMID  9765402 .
    • Золотухин А.С., Фельбер Б.К. (январь 1999 г.). «Нуклеопорины nup98 и nup214 участвуют в ядерном экспорте вируса иммунодефицита человека типа 1 Rev» . Журнал вирусологии . 73 (1): 120–7. doi : 10.1128/ОВИ.73.1.120-127.1999 . ПМС  103815 . PMID  9847314 .
    • Шмитт С., фон Коббе С., Бачи А., Панте Н., Родригес Дж. П., Бошерон С., Риго Г., Вильм М., Серафин Б., Кармо-Фонсека М., Изаурральде Э. (август 1999 г.). «Dbp5, белок DEAD-box, необходимый для экспорта мРНК, рекрутируется в цитоплазматические фибриллы комплекса ядерных пор посредством консервативного взаимодействия с CAN/Nup159p» . Журнал EMBO . 18 (15): 4332–47. doi : 10.1093/emboj/18.15.4332 . ПВК 1171509  . PMID 10428971 . 
    • Бачи А., Браун И.С., Родригес Дж.П., Панте Н., Риббек К., фон Коббе С., Кутай У., Вильм М., Гёрлих Д., Кармо-Фонсека М., Изаурральде Э. (январь 2000 г.). «С-концевой домен TAP взаимодействует с комплексом ядерной поры и способствует экспорту специфических субстратов РНК, несущих CTE» . РНК . 6 (1): 136–58. дои : 10.1017/S1355838200991994 . ПВК 1369901  . PMID 10668806 . 
    • Герольд А., Суяма М., Родригес Дж. П., Браун И. С., Кутай У., Кармо-Фонсека М., Борк П., Изаурральде Э. (декабрь 2000 г.). «TAP (NXF1) принадлежит к мультигенному семейству предполагаемых факторов экспорта РНК с консервативной модульной архитектурой» . Молекулярная и клеточная биология . 20 (23): 8996–9008. doi : 10.1128/MCB.20.23.8996-9008.2000 . ПМС  86553 . PMID  11073998 .
    • Хофманн В., Райхарт Б., Эвальд А., Мюллер Э., Шмитт И., Штаубер Р. Х., Лоттспейх Ф., Йокуш Б. М., Шеер У., Хаубер Дж., Дабаувалле М. С. (март 2001 г.). «Требования к кофактору для ядерного экспорта ретровирусных РНК, содержащих элемент ответа Rev (RRE) и конститутивный транспортный элемент (CTE). Неожиданная роль актина» . Журнал клеточной биологии . 152 (5): 895–910. doi : 10.1083/jcb.152.5.895 . ПВК 2198816  . PMID 11238447 . 
    Получено с https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Nucleoporin_214&oldid=1079684676 .
    Contribute a better translation