Chromobox белок гомолог 3 представляет собой белок , который кодируется CBX3 гена в организме человека. [5] [6]
CBX3 | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | CBX3 , HECH, НР1-ГАММА, HP1Hs-гамма, chromobox 3 | ||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | OMIM : 604477 MGI : 108515 HomoloGene : 40583 GeneCards : CBX3 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||||||||||
Разновидность | Человек | Мышь | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||||||||||
Ансамбль |
|
| |||||||||||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (белок) |
|
| |||||||||||||||||||||||
Расположение (UCSC) | Chr 7: 26,2 - 26,21 Мб | Chr 6: 51,47 - 51,48 Мб | |||||||||||||||||||||||
PubMed поиск | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Викиданные | |||||||||||||||||||||||||
|
В ядерной оболочке ядерная пластинка и гетерохроматин прилегают к внутренней ядерной мембране . Белок, кодируемый этим геном, связывает ДНК и является компонентом гетерохроматина. Этот белок также может связывать рецептор ламина B, интегральный мембранный белок, обнаруженный во внутренней ядерной мембране. Двойные связывающие функции кодируемого белка могут объяснить ассоциацию гетерохроматина с внутренней ядерной мембраной. Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие один и тот же белок, но различающиеся 5'-UTR. [6]
Взаимодействия
CBX3 было показано, взаимодействуют с PIM1 , [7] Ki-67 , [8] рецептора ламина В , [9] CBX5 [10] и CBX1 . [10]
Смотрите также
- Гетерохроматиновый белок 1
Рекомендации
- ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000122565 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029836 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Йе Кью, Ворман Х. Дж. (Август 1996 г.). «Взаимодействие между интегральным белком внутренней мембраны ядерной оболочки и белками хромодомена человека, гомологичными Drosophila HP1» . J Biol Chem . 271 (25): 14653–6. DOI : 10.1074 / jbc.271.25.14653 . PMID 8663349 .
- ^ а б «Ген Entrez: хромобокс-гомолог 3 CBX3 (гамма-гомолог HP1, Drosophila)» .
- ^ Koike, N; Maita H; Taira T; Ariga H; Игучи-Арига С.М. (февраль 2000 г.). «Идентификация гетерохроматинового белка 1 (HP1) в качестве мишени фосфорилирования с помощью киназы Pim-1 и влияние фосфорилирования на функцию репрессии транскрипции HP1 (1)» . FEBS Lett . 467 (1): 17–21. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (00) 01105-4 . ISSN 0014-5793 . PMID 10664448 . S2CID 29392124 .
- ^ Каметака, Ай; Такаги Масатоши; Хаякава Томохиро; Харагути Токуко; Хираока Ясуси; Йонеда Ёсихиро (декабрь 2002 г.). «Взаимодействие индуцирующего уплотнение хроматина домена (LR-домен) антигена Ki-67 с белками HP1». Гены Клетки . 7 (12): 1231–42. DOI : 10.1046 / j.1365-2443.2002.00596.x . ISSN 1356-9597 . PMID 12485163 . S2CID 6802841 .
- ^ Ye, Q; Worman HJ (июнь 1996 г.). «Взаимодействие между интегральным белком внутренней мембраны ядерной оболочки и белками хромодомена человека, гомологичными Drosophila HP1» . J. Biol. Chem . 271 (25): 14653–6. DOI : 10.1074 / jbc.271.25.14653 . ISSN 0021-9258 . PMID 8663349 .
- ^ а б Nielsen, AL; Улад-Абдельгани М; Ortiz JA; Remboutsika E; Chambon P; Лоссон Р. (апрель 2001 г.). «Образование гетерохроматина в клетках млекопитающих: взаимодействие между гистонами и белками HP1». Мол. Cell . 7 (4): 729–39. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (01) 00218-0 . ISSN 1097-2765 . PMID 11336697 .
дальнейшее чтение
- Йе Кью, Каллебаут И., Пежман А. и др. (1997). «Домен-специфические взаимодействия хромодоменных белков HP1-типа человека и белка внутренней ядерной мембраны LBR» . J. Biol. Chem . 272 (23): 14983–9. DOI : 10.1074 / jbc.272.23.14983 . PMID 9169472 .
- Лессард Дж., Бабан С., Соважо Г. (1998). «Стадия-специфическая экспрессия генов группы поликомб в клетках костного мозга человека» . Кровь . 91 (4): 1216–24. DOI : 10.1182 / blood.V91.4.1216 . PMID 9454751 .
- Зеелер Дж. С., Маркио А., Ситтерлин Д. и др. (1998). «Взаимодействие SP100 с белками HP1: связь между ядерными тельцами, связанными с промиелоцитарным лейкозом, и компартментом хроматина» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 95 (13): 7316–21. Bibcode : 1998PNAS ... 95.7316S . DOI : 10.1073 / pnas.95.13.7316 . PMC 22602 . PMID 9636146 .
- Lehming N, Le Saux A, Schüller J, Ptashne M (1998). «Компоненты хроматина как часть предполагаемого комплекса репрессии транскрипции» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 95 (13): 7322–6. Bibcode : 1998PNAS ... 95.7322L . DOI : 10.1073 / pnas.95.13.7322 . PMC 22604 . PMID 9636147 .
- Ainsztein AM, Kandels-Lewis SE, Mackay AM, Earnshaw WC (1999). "Нацеливание на центреры и веретено INCENP: идентификация основных консервативных мотивов и участие гетерохроматинового белка HP1" . J. Cell Biol . 143 (7): 1763–74. DOI : 10.1083 / jcb.143.7.1763 . PMC 2175214 . PMID 9864353 .
- Райан Р.Ф., Шульц Д.К., Айанатан К. и др. (1999). «KAP-1 Corepressor Protein взаимодействует и колокализуется с гетерохроматическими и эухроматическими белками HP1: потенциальная роль Krüppel-ассоциированных белков бок-цинковых пальцев в опосредованном гетерохроматином глушении» . Мол. Клетка. Биол . 19 (6): 4366–78. DOI : 10.1128 / mcb.19.6.4366 . PMC 104396 . PMID 10330177 .
- Минк Э., Аллори Ю., Ворман Х. Дж. И др. (1999). «Локализация и фосфорилирование белков HP1 во время клеточного цикла в клетках млекопитающих». Хромосома . 108 (4): 220–34. DOI : 10.1007 / s004120050372 . PMID 10460410 . S2CID 12381860 .
- Нильсен А.Л., Ортис Дж. А., Ю Дж. И др. (2000). «Взаимодействие с членами семейства гетерохроматиновых белков 1 (HP1) и деацетилирование гистонов по-разному вовлечены в подавление транскрипции членами семейства TIF1» . EMBO J . 18 (22): 6385–95. DOI : 10.1093 / emboj / 18.22.6385 . PMC 1171701 . PMID 10562550 .
- Koike N, Maita H, Taira T и др. (2000). «Идентификация гетерохроматинового белка 1 (HP1) в качестве мишени фосфорилирования с помощью киназы Pim-1 и влияние фосфорилирования на функцию репрессии транскрипции HP1 (1)» . FEBS Lett . 467 (1): 17–21. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (00) 01105-4 . PMID 10664448 . S2CID 29392124 .
- Minc E, Courvalin JC, Buendia B (2001). «HP1gamma связывается с эухроматином и гетерохроматином в ядрах и хромосомах млекопитающих». Cytogenet. Cell Genet . 90 (3–4): 279–84. DOI : 10.1159 / 000056789 . PMID 11124534 . S2CID 24349769 .
- Лахнер М., О'Кэрролл Д., Ри С. и др. (2001). «Метилирование гистона H3 лизином 9 создает сайт связывания для белков HP1». Природа . 410 (6824): 116–20. Bibcode : 2001Natur.410..116L . DOI : 10.1038 / 35065132 . PMID 11242053 . S2CID 4331863 .
- Нильсен А.Л., Улад-Абдельгани М., Ортис Дж. А. и др. (2001). «Образование гетерохроматина в клетках млекопитающих: взаимодействие между гистонами и белками HP1». Мол. Cell . 7 (4): 729–39. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (01) 00218-0 . PMID 11336697 .
- Scholzen T, Endl E, Wohlenberg C, et al. (2002). «Белок Ki-67 взаимодействует с членами семейства гетерохроматиновых белков 1 (HP1): потенциальная роль в регуляции структуры хроматина более высокого порядка». J. Pathol . 196 (2): 135–44. DOI : 10.1002 / path.1016 . PMID 11793364 . S2CID 36130549 .
- Вассалло М.Ф., Танезе Н. (2002). «Изоформа-специфическое взаимодействие HP1 с человеческим TAFII130» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (9): 5919–24. Bibcode : 2002PNAS ... 99.5919V . DOI : 10.1073 / pnas.092025499 . PMC 122877 . PMID 11959914 .
- Огава Х., Исигуро К., Гаубац С. и др. (2002). «Комплекс с модификаторами хроматина, который занимает E2F- и Myc-чувствительные гены в клетках G0». Наука . 296 (5570): 1132–6. Bibcode : 2002Sci ... 296.1132O . DOI : 10.1126 / science.1069861 . PMID 12004135 . S2CID 34863978 .
- Хван К.К., Ворман Х.Дж. (2002). «Генная регуляция человеческими ортологами гетерохроматинового белка 1 дрозофилы». Биохим. Биофиз. Res. Commun . 293 (4): 1217–22. DOI : 10.1016 / S0006-291X (02) 00377-7 . PMID 12054505 .
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M . DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
- Каметака А., Такаги М., Хаякава Т. и др. (2003). «Взаимодействие индуцирующего уплотнение хроматина домена (LR-домен) антигена Ki-67 с белками HP1». Гены Клетки . 7 (12): 1231–42. DOI : 10.1046 / j.1365-2443.2002.00596.x . PMID 12485163 . S2CID 6802841 .
- Cheutin T, McNairn AJ, Jenuwein T и др. (2003). «Поддержание стабильных доменов гетерохроматина за счет динамического связывания HP1». Наука . 299 (5607): 721–5. Bibcode : 2003Sci ... 299..721C . DOI : 10.1126 / science.1078572 . PMID 12560555 . S2CID 32776616 .
Внешние ссылки
- CBX3 + белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
- Человек CBX3 место генома и CBX3 ген подробно страницу в браузере УСК генома .
Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии .