Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
CCL17
Белок CCL17 PDB 1nr2.png
Доступные конструкции
PDBПоиск человеческого UniProt: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

1NR2 , 1NR4

Идентификаторы
ПсевдонимыCCL17 , A-152E5.3, ABCD-2, SCYA17, TARC, хемокиновый лиганд с мотивом CC 17
Внешние идентификаторыOMIM : 601520 MGI : 1329039 HomoloGene : 2246 GeneCards : CCL17
Расположение гена ( человек )
Хромосома 16 (человек)
Chr.Хромосома 16 (человека) [1]
Хромосома 16 (человек)
Геномное расположение CCL17
Геномное расположение CCL17
Группа16q21Начинать57 404 767 п.н. [1]
Конец57 416 063 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 8 (мышь)
Chr.Хромосома 8 (мышь) [2]
Хромосома 8 (мышь)
Геномное расположение CCL17
Геномное расположение CCL17
Группа8 C5 | 8 46,85 смНачинать94 810 453 п.н. [2]
Конец94 812 036 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE CCL17 207900 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• активность цитокинов
• связывание рецептора CCR хемокинов
• связывание рецептора
• хемокинов активность
• рецепторов хемокинов CCR4 связывания
• GO: связывание белка 0001948
Сотовый компонент• внеклеточная область
• внеклеточная
Биологический процесс• Связанный с G-белком сигнальный путь рецептора
• негативная регуляция дифференцировки миобластов
• хемотаксис моноцитов
• сигнальный путь, опосредованный хемокинами
• клеточный ответ на фактор некроза опухоли
• передача сигналов между клетками
• хемотаксис нейтрофилов
• развитие многоклеточного организма
• хемотаксис
• GO: 0032320, GO : 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase
• клеточный ответ на интерлейкин-1
• иммунный ответ
• положительная регуляция каскада ERK1 и ERK2
• клеточный ответ на интерферон-гамма
• хемотаксис лимфоцитов
• воспалительный ответ
• антимикробный гуморальный иммунный ответ, опосредованный антимикробным пептидом
• регуляция активности рецепторов
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

6361

20295

Ансамбль

ENSG00000102970

ENSMUSG00000031780

UniProt

Q92583

н / д

RefSeq (мРНК)

NM_002987

NM_011332

RefSeq (белок)

NP_002978

н / д

Расположение (UCSC)Chr 16: 57,4 - 57,42 МбChr 8: 94,81 - 94,81 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Хемокин (мотив СС) лиганд 17 (CCL17) (также известный как TARC) представляет собой небольшой цитокин, принадлежащий к семейству хемокинов СС , также известный как тимус и хемокин, регулируемый активацией (TARC). CCL17 конститутивно экспрессируется в тимусе, но только временно в мононуклеарных клетках периферической крови, стимулированных фитогемагглютинином . [5] Этот хемокин специфически связывает и индуцирует хемотаксис в Т-клетках и вызывает его эффекты, взаимодействуя с хемокиновым рецептором CCR4 . [5] [6] Ген CCL17 расположен на хромосоме 16.у человека, наряду с другими хемокинами, называемыми CCL22 и CX3CL1 . [7] [8]

Колониестимулирующий фактор гранулоцитов-макрофагов (GM-CSF) усиливает выработку CCL17 в моноцитах и макрофагах . [9] Было показано, что нейтрализация CCL17 с помощью моноклональных антител облегчает воспалительный артрит и остеоартрит . [9]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000102970 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031780 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ а б Имаи Т., Ёсида Т., Баба М., Нисимура М., Какизаки М., Йоши О. (1996). «Молекулярное клонирование нового Т-клеточного CC-хемокина, экспрессированного в тимусе, с помощью ловушки сигнальной последовательности с использованием вектора вируса Эпштейна-Барра» . J. Biol. Chem . 271 (35): 21514–21. DOI : 10.1074 / jbc.271.35.21514 . PMID 8702936 . 
  6. Перейти ↑ Imai T, Baba M, Nishimura M, Kakizaki M, Takagi S, Yoshie O (1997). «Направленный Т-клетками CC-хемокин TARC является высокоспецифичным биологическим лигандом для CC-хемокинового рецептора 4» . J. Biol. Chem . 272 (23): 15036–42. DOI : 10.1074 / jbc.272.23.15036 . PMID 9169480 . 
  7. ^ Nomiyama Н, Имаи Т, Кусуда Дж, Миура R, Каллен DF, Йоши O (1997). «Отнесение человеческого гена хемокина CC TARC (SCYA17) к хромосоме 16q13». Геномика . 40 (1): 211–3. DOI : 10.1006 / geno.1996.4552 . PMID 9070951 . 
  8. ^ Nomiyama Н, Имаи Т, Кусуда Дж, Миура R, Каллен DF, Йоши O (1998). «Человеческие хемокины фракталкин (SCYD1), MDC (SCYA22) и TARC (SCYA17) сгруппированы на хромосоме 16q13». Cytogenet. Cell Genet . 81 (1): 10–1. DOI : 10.1159 / 000015000 . PMID 9691168 . S2CID 46851784 .  
  9. ^ а б Ли К., Ачутан А.А., Гамильтон Дж. А. (2020). «GM-CSF: многообещающая цель при воспалении и аутоиммунитетах» . Иммуно-мишени и терапия . 9 : 225–240. DOI : 10.2147 / ITT.S262566 . PMC 7605919 . PMID 33150139 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Саэки Х, Тамаки К. (2006). «Тимус и хемокин, регулируемый активацией (TARC) / CCL17 и кожные заболевания». J. Dermatol. Sci . 43 (2): 75–84. DOI : 10.1016 / j.jdermsci.2006.06.002 . PMID  16859899 .
  • Имаи Т., Йошида Т., Баба М. и др. (1996). «Молекулярное клонирование нового Т-клеточного CC-хемокина, экспрессированного в тимусе, с помощью ловушки сигнальной последовательности с использованием вектора вируса Эпштейна-Барра» . J. Biol. Chem . 271 (35): 21514–21. DOI : 10.1074 / jbc.271.35.21514 . PMID  8702936 .
  • Номияма Х., Имаи Т., Кусуда Дж. И др. (1997). «Отнесение человеческого гена хемокина CC TARC (SCYA17) к хромосоме 16q13». Геномика . 40 (1): 211–3. DOI : 10.1006 / geno.1996.4552 . PMID  9070951 .
  • Имаи Т., Баба М., Нисимура М. и др. (1997). «Направленный Т-клетками CC-хемокин TARC является высокоспецифичным биологическим лигандом для CC-хемокинового рецептора 4» . J. Biol. Chem . 272 (23): 15036–42. DOI : 10.1074 / jbc.272.23.15036 . PMID  9169480 .
  • Имаи Т., Чантри Д., Рапорт С.Дж. и др. (1998). «Хемокин, полученный из макрофагов, является функциональным лигандом для хемокинового рецептора 4 СС» . J. Biol. Chem . 273 (3): 1764–8. DOI : 10.1074 / jbc.273.3.1764 . PMID  9430724 .
  • Бернардини Дж., Хедрик Дж., Соццани С. и др. (1998). «Идентификация CC-хемокинов TARC и макрофагального воспалительного белка-1 бета в качестве новых функциональных лигандов для рецептора CCR8» . Евро. J. Immunol . 28 (2): 582–8. DOI : 10.1002 / (SICI) 1521-4141 (199802) 28:02 <582 :: AID-IMMU582> 3.0.CO; 2-A . PMID  9521068 .
  • Номияма Х., Имаи Т., Кусуда Дж. И др. (1998). «Человеческие хемокины фракталкин (SCYD1), MDC (SCYA22) и TARC (SCYA17) сгруппированы на хромосоме 16q13». Cytogenet. Cell Genet . 81 (1): 10–1. DOI : 10.1159 / 000015000 . PMID  9691168 . S2CID  46851784 .
  • Струйф С., Проост П., Соццани С. и др. (1998). «Повышенная анти-ВИЧ-1 активность и измененная хемотаксическая активность хемокина, производного от макрофагов с NH2-концом (MDC), подразумевают наличие дополнительного рецептора MDC». J. Immunol . 161 (6): 2672–5. PMID  9743322 .
  • Лофтус Б.Дж., Ким Ю.Дж., Снеддон В.П. и др. (1999). «Дупликации генома и другие особенности в 12 Mb последовательности ДНК из хромосомы 16p и 16q человека». Геномика . 60 (3): 295–308. DOI : 10.1006 / geno.1999.5927 . PMID  10493829 .
  • Гарлиси К.Г., Сяо Х., Тиан Ф. и др. (1999). «Назначение пар хемокин-хемокиновый рецептор: TARC и MIP-1 бета не являются лигандами для человеческого CC-хемокинового рецептора 8» . Евро. J. Immunol . 29 (10): 3210–5. DOI : 10.1002 / (SICI) 1521-4141 (199910) 29:10 <3210 :: AID-IMMU3210> 3.0.CO; 2-W . PMID  10540332 .
  • Диас Нето Э., Корреа Р.Г., Верджовски-Алмейда С. и др. (2000). «Дробовое секвенирование человеческого транскриптома с помощью тегов последовательности, экспрессируемой ORF» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 97 (7): 3491–6. DOI : 10.1073 / pnas.97.7.3491 . PMC  16267 . PMID  10737800 .
  • Ghia P, Transidico P, Veiga JP и др. (2001). «Хемоаттрактанты MDC и TARC секретируются предшественниками злокачественных В-клеток после лигирования CD40 и поддерживают миграцию лейкоз-специфичных Т-клеток» . Кровь . 98 (3): 533–40. DOI : 10.1182 / blood.V98.3.533 . PMID  11468146 .
  • Морита А., Кикуока С., Хорикава Т. и др. (2002). «Оценка концентрации тимуса человека и регулируемых активацией хемокинов в крови с использованием нового сэндвич-ELISA на основе моноклональных антител». Clin. Чим. Acta . 322 (1–2): 67–75. DOI : 10.1016 / S0009-8981 (02) 00131-6 . PMID  12104083 .
  • Басу С., Шефер TM, Гош М. и др. (2003). «Молекулярное клонирование и секвенирование 25 различных кДНК хемокинов макака-резуса показывает эволюционную консервативность среди семейств хемокинов C, CC, CXC и CX3C». Цитокин . 18 (3): 140–8. DOI : 10,1006 / cyto.2002.0875 . PMID  12126650 .
  • Д'Амброзио Д., Альбанези С., Ланг Р. и др. (2002). «Количественные различия в вовлечении хемокинового рецептора создают разнообразие интегрин-зависимой адгезии лимфоцитов» . J. Immunol . 169 (5): 2303–12. DOI : 10.4049 / jimmunol.169.5.2303 . PMID  12193695 .
  • Мацумото Н., Мукаэ Х., Накамура-Учияма Ф. и др. (2002). «Повышенные уровни тимуса и регулируемого активацией хемокина (TARC) в образцах плеврального выпота от пациентов, инфицированных Paragonimus westermani» . Clin. Exp. Иммунол . 130 (2): 314–8. DOI : 10.1046 / j.1365-2249.2002.01985.x . PMC  1906524 . PMID  12390321 .
  • Чжэн X, Накамура К., Тодзё М. и др. (2003). «TGF-beta1-опосредованная регуляция тимуса и регулируемый активацией синтез и секреция хемокинов (TARC / CCL17) клетками HaCaT, совместно стимулированными TNF-альфа и IFN-гамма». J. Dermatol. Sci . 30 (2): 154–60. DOI : 10.1016 / S0923-1811 (02) 00071-3 . PMID  12413771 .
  • Какинума Т., Накамура К., Вакугава М. и др. (2003). «IL-4, но не IL-13, модулирует TARC (тимус и хемокин, регулируемый активацией) / CCL17 и IP-10 (интерферон-индуцированный белок 10kDA) / высвобождение CXCL10 TNF-альфа и IFN-гамма в клеточной линии HaCaT. ". Цитокин . 20 (1): 1–6. DOI : 10,1006 / cyto.2002.1965 . PMID  12441140 .
  • Uchida T, Suto H, Ra C и др. (2003). «Предпочтительная экспрессия хемокина типа T (h) 2 и его рецептора при атопическом дерматите» . Int. Иммунол . 14 (12): 1431–8. DOI : 10,1093 / intimm / dxf109 . PMID  12456591 .
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932 .
  • Джонс, К. (1 февраля 2013 г.). «Сывороточные CD163 и TARC как биомаркеры реакции на заболевание при классической лимфоме Ходжкина» . Clin Cancer Res . 19 (3): 731–42. DOI : 10.1158 / 1078-0432.CCR-12-2693 . PMID  23224400 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Расположение генома человека CCL17 и страница сведений о гене CCL17 в браузере генома UCSC .