Из Википедии, свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
CDH12
Идентификаторы
ПсевдонимыCDH12 , CDHB, кадгерин 12
Внешние идентификаторыOMIM : 600562 MGI : 109503 HomoloGene : 37873 GeneCards : CDH12
Расположение гена ( человек )
Хромосома 5 (человек)
Chr.Хромосома 5 (человека) [1]
Хромосома 5 (человек)
Геномное расположение CDH12
Геномное расположение CDH12
Группа5п14.3Начинать21 750 673 п.н. [1]
Конец22 853 622 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 15 (мышь)
Chr.Хромосома 15 (мышь) [2]
Хромосома 15 (мышь)
Геномное расположение CDH12
Геномное расположение CDH12
Группа15 A2 | 15 8,25 смНачинать20 449 265 п.н. [2]
Конец21 589 533 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE CDH12 207149 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• ион кальция связывание
• иона металла связывания
• цитоскелет связывание с белками
• белок гомодимеризации активности
• кадгерином связывания
Сотовый компонент• неотъемлемый компонент мембраны
• клеточная мембрана
• мембрана
• клеточная поверхность
• катениновый комплекс
Биологический процесс• клеточная адгезия
• организация слипчивых соединений
• гомофильная клеточная адгезия через молекулы адгезии плазматической мембраны
• сборка межклеточного соединения
• кальций-зависимая клеточная адгезия через молекулы клеточной адгезии плазматической мембраны
• межклеточная адгезия, опосредованная кадгерином
• межклеточная адгезия
• клеточный морфогенез
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

1010

215654

Ансамбль

ENSG00000154162

ENSMUSG00000040452

UniProt

P55289

Q5RJH3

RefSeq (мРНК)

NM_004061
NM_001317227
NM_001317228

NM_001008420

RefSeq (белок)
NP_001304156
NP_001304157
NP_004052
NP_001351033
NP_001351034

NP_001351035
NP_001351036
NP_001351037
NP_001351038

NP_001008420

Расположение (UCSC)Chr 5: 21,75 - 22,85 МбChr 15: 20.45 - 21.59 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Кадгерин-12 представляет собой белок , который у человека кодируется CDH12 гена . [5] [6]

Этот ген кодирует классический кадгерин типа II из суперсемейства кадгеринов интегральных мембранных белков, которые опосредуют кальций-зависимую межклеточную адгезию. Зрелые белки кадгерина состоят из большого N-концевого внеклеточного домена, единственного трансмембранного домена и небольшого, высококонсервативного C-концевого цитоплазматического домена. Кадгерины типа II (атипичные) определяются на основании отсутствия в них последовательности распознавания адгезии клеток HAV, специфичной для кадгеринов типа I. Этот конкретный кадгерин, по-видимому, специфически экспрессируется в головном мозге, и его временной паттерн экспрессии согласуется с ролью в критический период развития нейронов, возможно, особенно во время синаптогенеза. [6]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000154162 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040452 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Селиг S, Бруно S, Scharf JM, Ван СН, Виталь Е, Гилли ТС, Kunkel Л.М. июнь (1995). «Экспрессированные псевдогены кадгерина локализованы в критической области гена спинальной мышечной атрофии» . Proc Natl Acad Sci USA . 92 (9): 3702–6. DOI : 10.1073 / pnas.92.9.3702 . PMC 42029 . PMID 7731968 .  
  6. ^ a b «Ген Энтреза: CDH12 кадгерин 12, тип 2 (N-кадгерин 2)» .

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Жан Вайссенбах ; Гяпай Г; Dib C; и другие. (1992). «Карта сцепления второго поколения человеческого генома». Природа . 359 (6398): 794–801. DOI : 10.1038 / 359794a0 . PMID  1436057 . S2CID  4331117 .
  • Сузуки С., Сано К., Танихара Х (1991). «Разнообразие семейства кадгеринов: данные о восьми новых кадгеринах в нервной ткани» . Cell Regul . 2 (4): 261–70. DOI : 10.1091 / mbc.2.4.261 . PMC  361775 . PMID  2059658 .
  • Gyapay G, Morissette J, Vignal A, et al. (1994). "Карта генетических связей человека генетонов 1993-94 гг.". Nat. Genet . 7 (2 спец. №): 246–339. DOI : 10.1038 / ng0694supp-246 . PMID  7545953 . S2CID  24662426 .
  • Танихара Х., Сано К., Хеймарк Р.Л. и др. (1995). «Клонирование пяти человеческих кадгеринов проясняет характерные особенности внеклеточного домена кадгерина и предоставляет дополнительные доказательства двух структурно различных типов кадгерина». Сотовые клеи. Commun . 2 (1): 15–26. DOI : 10.3109 / 15419069409014199 . PMID  7982033 .
  • Селиг С., Лидов Х.Г., Бруно С.А. и др. (1997). «Молекулярная характеристика Br-кадгерина, регулируемого в процессе развития, специфичного для мозга кадгерина» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 94 (6): 2398–403. DOI : 10.1073 / pnas.94.6.2398 . PMC  20099 . PMID  9122206 .
  • Креммидиотис Г., Бейкер Э., Кроуфорд Дж. И др. (1998). «Локализация генов кадгерина человека в областях хромосом, демонстрирующих связанную с раком потерю гетерозиготности». Геномика . 49 (3): 467–71. DOI : 10.1006 / geno.1998.5281 . PMID  9615235 .
  • Чалмерс И.Дж., Хёфлер Х., Аткинсон М.Дж. (1999). «Картирование кластера генов кадгерина в области хромосомы 5, подверженной частой аллельной потере при карциноме». Геномика . 57 (1): 160–3. DOI : 10.1006 / geno.1998.5717 . PMID  10191097 .
  • Симояма Ю., Цудзимото Г., Китадзима М., Натори М. (2001). «Идентификация трех классических кадгеринов типа II человека и частые гетерофильные взаимодействия между различными подклассами классических кадгеринов типа II» . Биохим. Дж . 349 (Pt 1): 159–67. DOI : 10.1042 / 0264-6021: 3490159 . PMC  1221133 . PMID  10861224 .
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932 .
  • Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. DOI : 10,1038 / нг1285 . PMID  14702039 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Расположение человеческого гена CDH12 в браузере генома UCSC .
  • Подробная информация о человеческом гене CDH12 в браузере генома UCSC .


  • v
  • т
  • е