CDH3 (ген)

CDH3

Доступные конструкции

Ортолог поиск: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
4OY9

Идентификаторы

Псевдонимы

CDH3 , CDHP, HJMD, PCAD, кадгерина 3

Внешние идентификаторы

OMIM : 114021 MGI : 88356 HomoloGene : 20425 GeneCards : CDH3

Расположение гена ( человек )

Chr.	Хромосома 16 (человека) ^[1]

Группа	16q22.1	Начинать	68 636 189 п.н. ^[1]
Группа	16q22.1	Конец	68 727 468 п.н. ^[1]

Расположение гена ( Мышь )

Chr.	Хромосома 8 (мышь) ^[2]

Группа	8 D3 \| 8 53,16 см	Начинать	106 510 891 п.н. ^[2]
Группа	8 D3 \| 8 53,16 см	Конец	106 557 297 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• ион кальция связывание • иона металла связывания • молекулярной функции • цитоскелета связывания с белками • белок гомодимеризации активности • кадгерином связывания
Сотовый компонент	• цитоплазма • неотъемлемый компонент мембраны • мембрана • клеточная мембрана • поверхность клетки • комплекс катенина
Биологический процесс	• процесс цикла волос • позитивная регуляция пролиферации кератиноцитов • негативная регуляция времени катагена • реакция на стимул • кератинизация • заживление ран • регуляция цикла волос с помощью канонического сигнального пути Wnt • негативная регуляция продукции трансформирующего фактора роста бета2 • позитивная регуляция монофенола активность монооксигеназы • гомеостаз сетчатки • позитивная регуляция экспрессии генов • клеточная адгезия • позитивная регуляция сигнального пути рецептора инсулиноподобного фактора роста • канонический путь передачи сигналов Wnt • позитивная регуляция процесса биосинтеза меланина • позитивная регуляция транспорта меланосом • организация слипчивых соединений • ответ на лекарственное средство • зрительное восприятие • гомофильная клеточная адгезия через молекулы адгезии плазматической мембраны • межклеточная адгезия • позитивная регуляция канонического сигнального пути Wnt • сборка межклеточного соединения • кальций-зависимая клеточная адгезия через молекулы клеточной адгезии плазматической мембраны • межклеточная адгезия, опосредованная кадгерином • клеточный морфогенез
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


1001


12560

Ансамбль


ENSG00000062038


ENSMUSG00000061048

UniProt


P22223


P10287

RefSeq (мРНК)


NM_001793 NM_001317195 NM_001317196


NM_001037809 NM_007665

RefSeq (белок)


NP_001304124 NP_001304125 NP_001784


NP_001032898 NP_031691

Расположение (UCSC)

Chr 16: 68.64 - 68.73 Мб

Chr 8: 106,51 - 106,56 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Кадгерин-3 , также известный как Р-кадгерин , является белком , который в организме человека кодируется CDH3 геном . ^[5]^[6]

Функция [ править ]

Этот ген представляет собой классический кадгерин из суперсемейства кадгеринов. Кодируемый белок представляет собой кальций-зависимый гликопротеин клеточно-клеточной адгезии, состоящий из пяти внеклеточных повторов кадгерина, трансмембранного участка и высококонсервативного цитоплазматического хвоста . Этот ген расположен в кластере из шести кадгеринов в области на длинном плече хромосомы 16, которая участвует в потере событий гетерозиготности при раке груди и простаты. Кроме того, аберрантная экспрессия этого белка наблюдается при аденокарциноме шейки матки.

Клиническое значение [ править ]

Мутации в этом гене были связаны с врожденным гипотрихозом с ювенильной макулярной дистрофией . ^[6]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что CDH3 (ген) взаимодействует с:

Бета-катенин , ^[7]^[8]
CDH1 , ^[7]
Катенин (белок, связанный с кадгерином), альфа 1 , ^[7]^[8]
Нефрин ^[9] и
Плакоглобин . ^[7]

См. Также [ править ]

Синдром EEM

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000062038 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000061048 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Kaupmann К, Беккер-Follmann Дж, Шерер G, Джокуш Н, Starzinski-Powitz А (октябрь 1992). «Ген молекулы клеточной адгезии M-кадгерин отображается на хромосоме 8 мыши и хромосоме 16q24.1-qter человека и находится рядом с локусом E-кадгерина (увоморулина) у обоих видов». Геномика . 14 (2): 488–90. DOI : 10.1016 / S0888-7543 (05) 80247-2 . PMID 1427864 .
^ a b «Ген Энтреза: CDH3 кадгерин 3, тип 1, Р-кадгерин (плацентарный)» .
^ a b c d Klingelhöfer J, Трояновский РБ, Laur OY, Трояновский S (август 2000 г.). «Амино-концевой домен классических кадгеринов определяет специфичность адгезивных взаимодействий». Журнал клеточной науки . 113 (16): 2829–36. PMID 10910767 .
^ Б Шмайсер K, Гранд RJ (апрель 1999). «Судьба E- и P-кадгерина на ранних стадиях апоптоза» . Смерть и дифференциация клеток . 6 (4): 377–86. DOI : 10.1038 / sj.cdd.4400504 . PMID 10381631 .
^ Лехтонен S, Лехтонен Е, Kudlicka К, Holthöfer Н, Фарквхар МГ (сентябрь 2004). «Нефрин образует комплекс с белками адгезивных соединений и CASK в подоцитах и в клетках почек собак Madin-Darby, экспрессирующих нефрин» . Американский журнал патологии . 165 (3): 923–36. DOI : 10.1016 / S0002-9440 (10) 63354-8 . PMC 1618613 . PMID 15331416 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Herrenknecht K, Ozawa M, Eckerskorn C, Lottspeich F, Lenter M, Kemler R (октябрь 1991 г.). «Альфа-катенин, связывающий увоморулин, является гомологом винкулина» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 88 (20): 9156–60. DOI : 10.1073 / pnas.88.20.9156 . PMC 52671 . PMID 1924379 .
Симояма Ю., Хирохаши С., Хирано С., Ногучи М., Симосато Ю., Такеити М., Абе О. (апрель 1989 г.). «Молекулы адгезии клеток кадгерина в эпителиальных тканях и карциномах человека». Исследования рака . 49 (8): 2128–33. PMID 2702654 .
Симояма Й., Йошида Т., Терада М., Симосато Й., Абе О, Хирохаши С. (октябрь 1989 г.). «Молекулярное клонирование Са2 + -зависимой молекулы клеточно-клеточной адгезии, гомологичной мышиному кадгерину плаценты: его низкая экспрессия в тканях плаценты человека» . Журнал клеточной биологии . 109 (4 Pt 1): 1787–94. DOI : 10,1083 / jcb.109.4.1787 . PMC 2115800 . PMID 2793940 .
Паласиос Дж., Бенито Н., Писарро А., Суарес А., Эспада Дж., Кано А., Гамалло С. (март 1995 г.). «Аномальная экспрессия Р-кадгерина при карциноме молочной железы. Корреляция с экспрессией E-кадгерина и патологическими особенностями» . Американский журнал патологии . 146 (3): 605–12. PMC 1869170 . PMID 7534041 .
van der Linden PJ, de Goeij AF, Dunselman GA, Erkens HW, Evers JL (июнь 1995 г.). «Экспрессия кадгеринов и интегринов в эндометрии человека на протяжении менструального цикла». Фертильность и бесплодие . 63 (6): 1210–6. DOI : 10.1016 / s0015-0282 (16) 57599-2 . PMID 7538474 .
Тан А., Эллер М.С., Хара М., Яар М., Хирохаши С., Гилкрест Б.А. (апрель 1994 г.). «E-кадгерин является основным медиатором адгезии меланоцитов человека к кератиноцитам in vitro». Журнал клеточной науки . 107 (4): 983–92. PMID 8056851 .
Tassin MT, Beziau A, Gubler MC, Boyer B (март 1994). «Пространственно-временная экспрессия молекул, связанных с соединительными комплексами во время созревания in vivo почечных подоцитов». Международный журнал биологии развития . 38 (1): 45–54. PMID 8074995 .
Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
Наварро П., Лосано Е., Кано А. (август 1993 г.). «Экспрессия E- или P-кадгерина недостаточна для изменения морфологии и онкогенного поведения клеток карциномы веретена мыши. Возможное участие плакоглобина». Журнал клеточной науки . 105 (4): 923–34. PMID 8227214 .
Reynolds AB, Daniel JM, Mo YY, Wu J, Zhang Z (июнь 1996 г.). «Новый катенин p120cas связывает классические кадгерины и вызывает необычный морфологический фенотип в фибробластах NIH3T3». Экспериментальные исследования клеток . 225 (2): 328–37. DOI : 10.1006 / excr.1996.0183 . PMID 8660921 .
Soler AP, Harner GD, Knudsen KA, McBrearty FX, Grujic E, Salazar H, Han AC, Keshgegian AA (август 1997 г.). «Экспрессия Р-кадгерина позволяет идентифицировать простатоспецифические антиген-отрицательные клетки в эпителиальных тканях мужских половых дополнительных органов и в карциномах простаты. Значение для биологии рака простаты» . Американский журнал патологии . 151 (2): 471–8. PMC 1858007 . PMID 9250159 .
Вакита Х., Фурукава Ф., Баба С., Такигава М. (ноябрь 1997 г.). «Клетки линии клеток плоскоклеточной карциномы человека (DJM-1) синтезируют молекулы Р-кадгерина за счет увеличения внеклеточного кальция: кальций регулирует экспрессию гена Р-кадгерина на уровне трансляции через фосфорилирование тирозина белка» . Международный журнал рака . 73 (3): 432–9. DOI : 10.1002 / (SICI) 1097-0215 (19971104) 73: 3 <432 :: AID-IJC19> 3.0.CO; 2-E . PMID 9359492 .
Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
Креммидиотис Дж., Бейкер Е., Кроуфорд Дж., Эйр Х. Дж., Нахмиас Дж., Каллен Д. Ф. (май 1998 г.). «Локализация генов кадгерина человека в областях хромосом, демонстрирующих связанную с раком потерю гетерозиготности». Геномика . 49 (3): 467–71. DOI : 10.1006 / geno.1998.5281 . PMID 9615235 .
Джаррард Д.Ф., Пол Р., ван Боховен А., Нгуен С.Х., Бова Г.С., Уилок М.Дж., Джонсон К.Р., Шалкен Дж., Бассемейкерс М., Айзекс В.Б. (ноябрь 1997 г.). «Р-кадгерин представляет собой базальный клеточно-специфический эпителиальный маркер, который не экспрессируется при раке простаты». Клинические исследования рака . 3 (11): 2121–8. PMID 9815605 .
Schmeiser K, Grand RJ (апрель 1999 г.). «Судьба E- и P-кадгерина на ранних стадиях апоптоза» . Смерть и дифференциация клеток . 6 (4): 377–86. DOI : 10.1038 / sj.cdd.4400504 . PMID 10381631 .
Руфас О., Фиш Б., Зив С., Шалги Р. (февраль 2000 г.). «Экспрессия молекул адгезии кадгерина на человеческих гаметах» . Молекулярная репродукция человека . 6 (2): 163–9. DOI : 10.1093 / molehr / 6.2.163 . PMID 10655458 .
Клингельхёфер Дж, Трояновский РБ, Лаур О.Ю., Трояновский С (август 2000 г.). «Амино-концевой домен классических кадгеринов определяет специфичность адгезивных взаимодействий». Журнал клеточной науки . 113 (16): 2829–36. PMID 10910767 .
Хан А.С., Эдельсон М.И., Перальта Солер А., Кнудсен К.А., Лифшиц-Мерсер Б., Чернобыльский Б., Розенблюм Н.Г., Салазар Н. (ноябрь 2000 г.). «Экспрессия кадгерина в железистых опухолях шейки матки». Рак . 89 (10): 2053–8. DOI : 10,1002 / 1097-0142 (20001115) 89:10 <2053 :: АИД-CNCR4> 3.0.CO; 2-С . PMID 11066045 .
Bauer K, Gosau M, Reinders J, Oefner P, Reichert TE, Bauer R (ноябрь 2013 г.). «Пресенилин 1 / γ-секретаза модулирует процессинг Р-кадгерина и влияет на адгезию клеток в клеточных линиях плоскоклеточного рака полости рта» . Канцерогенез . 34 (11): 2622–8. DOI : 10.1093 / carcin / bgt211 . PMID 23740836 .

Внешние ссылки [ править ]

CDH3 местоположение гена человеческого в браузере УСК генома .
CDH3 детали гена человеческого в браузере УСК генома .

Эта статья о гене в хромосоме 16 человека - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000062038 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000061048 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1427864-5] Kaupmann К, Беккер-Follmann Дж, Шерер G, Джокуш Н, Starzinski-Powitz А (октябрь 1992). «Ген молекулы клеточной адгезии M-кадгерин отображается на хромосоме 8 мыши и хромосоме 16q24.1-qter человека и находится рядом с локусом E-кадгерина (увоморулина) у обоих видов». Геномика . 14 (2): 488–90. DOI : 10.1016 / S0888-7543 (05) 80247-2 . PMID 1427864 .

[entrez-6] «Ген Энтреза: CDH3 кадгерин 3, тип 1, Р-кадгерин (плацентарный)» .

[pmid10910767-7] Klingelhöfer J, Трояновский РБ, Laur OY, Трояновский S (август 2000 г.). «Амино-концевой домен классических кадгеринов определяет специфичность адгезивных взаимодействий». Журнал клеточной науки . 113 (16): 2829–36. PMID 10910767 .

[pmid10381631-8] Б Шмайсер K, Гранд RJ (апрель 1999). «Судьба E- и P-кадгерина на ранних стадиях апоптоза» . Смерть и дифференциация клеток . 6 (4): 377–86. DOI : 10.1038 / sj.cdd.4400504 . PMID 10381631 .

[pmid15331416-9] Лехтонен S, Лехтонен Е, Kudlicka К, Holthöfer Н, Фарквхар МГ (сентябрь 2004). «Нефрин образует комплекс с белками адгезивных соединений и CASK в подоцитах и в клетках почек собак Madin-Darby, экспрессирующих нефрин» . Американский журнал патологии . 165 (3): 923–36. DOI : 10.1016 / S0002-9440 (10) 63354-8 . PMC 1618613 . PMID 15331416 .

[1]