Из Википедии, свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
CDH4
Идентификаторы
ПсевдонимыCDH4 , CAD4, R-CAD, RCAD, кадгерин 4
Внешние идентификаторыOMIM : 603006 MGI : 99218 HomoloGene : 48044 GeneCards : CDH4
Расположение гена ( человек )
Хромосома 20 (человек)
Chr.Хромосома 20 (человека) [1]
Хромосома 20 (человек)
Геномное расположение CDH4
Геномное расположение CDH4
Группа20q13.33Начинать61 252 261 п.н. [1]
Конец61 940 617 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 2 (мышь)
Chr.Хромосома 2 (мышь) [2]
Хромосома 2 (мышь)
Геномное расположение CDH4
Геномное расположение CDH4
Группа2 H4 | 211,86 смНачинать179 442 431 п.н. [2]
Конец179 899 373 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE CDH4 206866 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• ион кальция связывание
• иона металла связывания
• цитоскелет связывание с белками
• белок гомодимеризации активности
• кадгерином связывания
Сотовый компонент• неотъемлемый компонент мембраны
• клеточная мембрана
• неотъемлемый компонент плазматической мембраны
• мембрана
• поверхность клетки
• катениновый комплекс
Биологический процесс• гетерофильных межклеточная адгезия с помощью плазменных молекул адгезии клеточной мембраны
• клеточной адгезии
• положительное регулирование расширения аксонов
• слипчивой организации перехода
• гомофильной клеточной адгезии с помощью плазменной мембраны адгезии молекулы
• аксонов
• межклеточного узел в сборе
• кальций-зависимый клеточно-клеток адгезия через плазматическую мембрану молекул клеточной адгезии
• межклеточная адгезия, опосредованная кадгерином
• межклеточная адгезия
• клеточный морфогенез
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

1002

12561

Ансамбль

ENSG00000280641
ENSG00000179242

ENSMUSG00000000305

UniProt

P55283

P39038

RefSeq (мРНК)

NM_001794
NM_001252338
NM_001252339

NM_009867
NM_001316723

RefSeq (белок)

NP_001239267
NP_001239268
NP_001785

NP_001303652
NP_033997

Расположение (UCSC)Chr 20: 61,25 - 61,94 МбChr 2: 179,44 - 179,9 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Кадгерин-4 представляет собой белок , который у человека кодируется CDH4 гена . [5] [6] [7]

Этот ген представляет собой классический кадгерин из суперсемейства кадгеринов. Кодируемый белок представляет собой кальций-зависимый гликопротеин клеточно-клеточной адгезии, состоящий из пяти внеклеточных повторов кадгерина, трансмембранного участка и высококонсервативного цитоплазматического хвоста. Основываясь на исследованиях на курице и мышах, считается, что этот кадгерин играет важную роль во время сегментации мозга и разрастания нейронов. Кроме того, указана роль в развитии почек и мышц. Особый интерес представляют исследования, показывающие стабильные цис-гетеродимеры кадгеринов 2 и 4 в линиях котрансфицированных клеток. Ранее считалось, что они взаимодействуют исключительно гомофильным образом, это первое свидетельство гетеродимеризации кадгерина. [7]

Взаимодействия [ править ]

Кадгерин-4 взаимодействует с:

  • PTPmu [8]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c ENSG00000179242 GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000280641, ENSG00000179242 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000000305 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Чалмерс IJ, Hofler H, Аткинсон MJ (июнь 1999). «Картирование кластера генов кадгерина в области хромосомы 5, подверженной частой аллельной потере при карциноме». Геномика . 57 (1): 160–3. DOI : 10.1006 / geno.1998.5717 . PMID 10191097 . 
  6. ^ Kools P, K Vanhalst, ван Рой F (октябрь 1999). «Отнесение кадгерина-4 (R-кадгерин, CDH4) к полосе хромосомы человека 20q13.3». Cytogenet Cell Genet . 86 (1): 26–7. DOI : 10.1159 / 000015423 . PMID 10516427 . S2CID 27578498 .  
  7. ^ a b «Ген Энтреса: CDH4 кадгерин 4, тип 1, R-кадгерин (сетчатка)» .
  8. ^ Brady-Kalnay SM, Mourton T, Nixon JP, Pietz GE, Kinch M, Chen H и др. (1998). «Динамическое взаимодействие PTPmu с несколькими кадгеринами in vivo» . J Cell Biol . 141 (1): 287–96. DOI : 10.1083 / jcb.141.1.287 . PMC 2132733 . PMID 9531566 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Тальярини Ф (1977). «[Связь между социальной защитой и криминологическими тенденциями с 1930-х годов до наших дней]». Quaderni di Criminologia Clinica . 18 (3): 289–352. PMID  798233 .
  • Сузуки С., Сано К., Танихара Х (1991). «Разнообразие семейства кадгеринов: данные о восьми новых кадгеринах в нервной ткани» . Cell Regul . 2 (4): 261–70. DOI : 10.1091 / mbc.2.4.261 . PMC  361775 . PMID  2059658 .
  • Танихара Х., Сано К., Хеймарк Р.Л. и др. (1995). «Клонирование пяти человеческих кадгеринов проясняет характерные особенности внеклеточного домена кадгерина и предоставляет дополнительные доказательства двух структурно различных типов кадгерина». Сотовые клеи. Commun . 2 (1): 15–26. DOI : 10.3109 / 15419069409014199 . PMID  7982033 .
  • Шан В.С., Танака Х., Филлипс Г.Р. и др. (2000). «Функциональные цис-гетеродимеры N- и R-кадгеринов» . J. Cell Biol . 148 (3): 579–90. DOI : 10,1083 / jcb.148.3.579 . PMC  2174798 . PMID  10662782 .
  • Леканда Ф., Ченг С.Л., Шин С.С. и др. (2000). «Дифференциальная регуляция кадгеринов дексаметазоном в клетках остеобластов человека». J. Cell. Биохим . 77 (3): 499–506. DOI : 10.1002 / (SICI) 1097-4644 (20000601) 77: 3 <499 :: AID-JCB14> 3.0.CO; 2-0 . PMID  10760957 .
  • Китагава М., Натори М., Мурасе С. и др. (2000). «Мутационный анализ кадгерина-4 выявляет аминокислотные остатки EC1, важные для структуры и функции». Биохим. Биофиз. Res. Commun . 271 (2): 358–63. DOI : 10.1006 / bbrc.2000.2636 . PMID  10799302 .
  • Делукас П., Мэтьюз Л.Х., Ашерст Дж. И др. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ хромосомы 20 человека» . Природа . 414 (6866): 865–71. DOI : 10.1038 / 414865a . PMID  11780052 .
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932 .
  • Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. DOI : 10,1038 / нг1285 . PMID  14702039 .
  • Джонсон Э, Тайзен С.С., Джонсон КР, Уилок MJ (2004). «R-кадгерин влияет на подвижность клеток через GTPases семейства Rho» . J. Biol. Chem . 279 (30): 31041–9. DOI : 10.1074 / jbc.M400024200 . PMID  15143071 .
  • Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. DOI : 10.1101 / gr.2596504 . PMC  528928 . PMID  15489334 .
  • Миотто Э., Саббиони С., Веронезе А. и др. (2005). «Частое аберрантное метилирование промотора гена CDH4 при колоректальном раке и раке желудка человека» . Cancer Res . 64 (22): 8156–9. DOI : 10.1158 / 0008-5472.CAN-04-3000 . PMID  15548679 .
  • Маэда М., Джонсон Э., Мандал С.Х. и др. (2006). «Экспрессия несоответствующих кадгеринов эпителиальными опухолевыми клетками способствует эндоцитозу и деградации E-кадгерина через конкуренцию за p120 (ctn)» . Онкоген . 25 (33): 4595–604. DOI : 10.1038 / sj.onc.1209396 . PMID  16786001 .

Внешние ссылки [ править ]

  • CDH4 местоположение гена человеческого в браузере УСК генома .
  • CDH4 детали гена человеческого в браузере УСК генома .


  • v
  • т
  • е