CDK5R1

Доступные конструкции

Ортолог поиск: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
1H4L , 1UNG , 1UNH , 1UNL , 3O0G

Идентификаторы

Псевдонимы

CDK5R1 , CDK5P35, CDK5R, NCK5A, p23, p25, p35, p35nck5a, циклин-зависимая киназа 5, регуляторная субъединица 1 (p35), регуляторная субъединица 1 циклин-зависимой киназы 5

Внешние идентификаторы

OMIM : 603460 MGI : 101764 HomoloGene : 31200 GeneCard : CDK5R1

Расположение гена ( человек )

Chr.	Хромосома 17 (человека) ^[1]

Группа	17q11.2	Начинать	32 486 993 п.н. ^[1]
Группа	17q11.2	Конец	32 491 253 п.н. ^[1]

Расположение гена ( Мышь )

Chr.	Хромосома 11 (мышь) ^[2]

Группа	11 B5 \| 11 47,94 см	Начинать	80 477 023 п.н. ^[2]
Группа	11 B5 \| 11 47,94 см	Конец	80 481 184 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• протеинкиназа активность • ион кальция связывания • эфрин связывания с рецептором • кадгерин связывания • GO: 0016534 циклин-зависимой протеин серин / треонин киназа активатора активности • активность киназы • ГО: 0001948 связывание белка • протеинкиназы связывания • белок серин / треонин киназа активатора активности • протеазы связывания • актина связывания • ионотропную рецептора глутамата связывания • альфа-тубулина связывания • бета-тубулина связывания • актина связывания нити • активность активатора протеинкиназы
Сотовый компонент	• цитоплазма • цитозоль • мембрана • GO: 0097483, GO: 0097481 постсинаптическая плотность • органелла, ограниченная внутриклеточной мембраной • конус роста • нервно-мышечное соединение • дендритный позвоночник • аксон • тело нейрональной клетки • дендрит • холоферментный комплекс циклин-зависимой протеинкиназы 5 • перинуклеарный область цитоплазмы • сократительное волокно • ядро клетки • нуклеоплазма • клеточная мембрана • микротрубочки • проекция нейрона • пресинапс
Биологический процесс	• положительная регуляция активности протеинкиназы • регуляция дифференцировки нейронов • сигнальный путь рецептора ацетилхолина, связанный с G-белком • регуляция активности циклин-зависимого белка серин / треонинкиназы • регуляция организации актинового цитоскелета • развитие эмбриона • ритмический процесс • сигнальный путь рецептора эфрина • клеточная адгезия нейрона • регуляция организации цитоскелета микротрубочек • миграция нейронов • развитие мозжечка • положительная регуляция активности протеин-серин / треонинкиназы • позитивная регуляция апоптотического процесса нейронов • развитие мозга • путь передачи сигналов ионотропного глутаматного рецептора • формирование слоя в коре головного мозга • фосфорилирование пептидилсерина • дифференцировка нейронов • клеточная пролиферация • фосфорилирование пептидил-треонина • негативная регуляция транскрипции, шаблонная ДНК • проекция нейрона развитие • радиально ориентированная миграция клеток коры головного мозга • фасцикуляция аксонов • развитие гиппокампа • негативная регуляция удлинения аксонов • регуляция морфогенеза дендритных шипов • регуляция макроаутофагии • созревание высшего оливарного ядра • позитивная регуляция остановки клеточного цикла • позитивная регуляция нацеливания белка на мембрану • управление аксонами • регуляция передачи сигнала медиатором класса p53 • фосфорилирование серина белка STAT • цитоскелет микротрубочек организация • развитие эмбриона, заканчивающееся рождением или вылуплением яйца • позитивная регуляция полимеризации микротрубочек • позитивная регуляция активности циклин-зависимой протеин-серин / треонинкиназы • регуляция цикла синаптических везикул • активация активности протеинкиназ
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


8851


12569

Ансамбль


ENSG00000176749


ENSMUSG00000048895

UniProt


Q15078


P61809

RefSeq (мРНК)


NM_003885


NM_009871

RefSeq (белок)


NP_003876


NP_034001

Расположение (UCSC)

Chr 17: 32,49 - 32,49 Мб

Chr 11: 80.48 - 80.48 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Циклин-зависимая киназа 5 активатор 1 представляет собой фермент , который у человека кодируется cdk5r1 геном . ^[5]^[6]

Функция [ править ]

Белок, кодируемый этим геном (p35), является нейрон-специфическим активатором циклин-зависимой киназы 5 (CDK5); активация CDK5 необходима для правильного развития центральной нервной системы. Р35 форма этого белка протеолитический расщеплена кальпаин , создавая форму P25. Расщепление p35 на p25 приводит к перемещению белка с периферии клетки в ядерные и перинуклеарные области. P25 нарушает регуляцию активности CDK5, продлевая его активацию и изменяя его клеточное расположение. Форма p25 накапливается в нейронах мозга пациентов с болезнью Альцгеймера. Это накопление коррелирует с увеличением активности киназы CDK5 и может привести к аберрантно фосфорилированным формам белка тау, ассоциированного с микротрубочками, который способствуетБолезнь Альцгеймера . ^[6]

В меланоцитарных клетках экспрессия гена CDK5R1 может регулироваться MITF . ^[7]

Взаимодействия [ править ]

CDK5R1 взаимодействует с:

Актинин, альфа 1 ^[8]
Амфифизин , ^[9]
Бета-катенин , ^[10]
CAMK2A , ^[11]
CDK5RAP2 , ^[12]
Циклинзависимая киназа 5 , ^[13]^[14]
Белковый НАБОР , ^[15]

См. Также [ править ]

CDK5RAP1
CDK5RAP2
CDK5RAP3

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000176749 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000048895 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Tsai LH, Delalle I, Caviness VS - младший, Чэ T, Harlow E (октябрь 1994). «p35 представляет собой нервно-специфическую регуляторную субъединицу циклин-зависимой киназы 5». Природа . 371 (6496): 419–23. DOI : 10.1038 / 371419a0 . PMID 8090221 . S2CID 4267944 .
^ a b «Ген Entrez: CDK5R1 циклин-зависимая киназа 5, регуляторная субъединица 1 (p35)» .
^ Хук К.С., Шлегель Н.С., Эйххофф О.М. и др. (2008). «Новые мишени MITF идентифицированы с использованием двухэтапной стратегии ДНК-микрочипов» . Pigment Cell Melanoma Res . 21 (6): 665–76. DOI : 10.1111 / j.1755-148X.2008.00505.x . PMID 19067971 . S2CID 24698373 .
↑ Cheng K, Li Z, Fu WY, Wang JH, Fu AK, Ip NY (август 2002). «Pctaire1 взаимодействует с p35 и является новым субстратом для Cdk5 / p35» . J. Biol. Chem . 277 (35): 31988–93. DOI : 10.1074 / jbc.M201161200 . PMID 12084709 .
↑ Floyd SR, Porro EB, Slepnev VI, Ochoa GC, Tsai LH, De Camilli P (март 2001 г.). «Амфифизин 1 связывает циклинзависимую киназу (cdk) 5 регуляторной субъединицы p35 и фосфорилируется cdk5 и cdc2» . J. Biol. Chem . 276 (11): 8104–10. DOI : 10.1074 / jbc.M008932200 . PMID 11113134 .
^ Kesavapany S, Лау KF, Маклолин ДМ, Браунлис Дж, Ackerley S, Ли Ру, Шоу CE, Миллер CC (январь 2001). «p35 / cdk5 связывает и фосфорилирует бета-катенин и регулирует взаимодействие бета-катенин / пресенилин-1». Евро. J. Neurosci . 13 (2): 241–7. DOI : 10,1046 / j.1460-9568.2001.01376.x . PMID 11168528 .
^ Дхаван R, Грир PL, Morabito MA, Orlando LR, Tsai LH (сентябрь 2002). «Активаторы циклин-зависимой киназы 5 p35 и p39 взаимодействуют с альфа-субъединицей Са2 + / кальмодулин-зависимой протеинкиназы II и альфа-актинина-1 кальций-зависимым образом» . J. Neurosci . 22 (18): 7879–91. DOI : 10.1523 / JNEUROSCI.22-18-07879.2002 . PMC 6758084 . PMID 12223541 .
↑ Wang X, Ching YP, Lam WH, Qi Z, Zhang M, Wang JH (октябрь 2000 г.). «Идентификация общей области ассоциации белков в нейрональном активаторе Cdk5» . J. Biol. Chem . 275 (41): 31763–9. DOI : 10.1074 / jbc.M004358200 . PMID 10915792 .
↑ Chen F, Studzinski GP (июнь 2001). «Экспрессия нейронального активатора циклин-зависимой киназы 5 p35Nck5a в моноцитарных клетках человека связана с дифференцировкой» . Кровь . 97 (12): 3763–7. DOI : 10.1182 / blood.V97.12.3763 . PMID 11389014 .
^ Tarricone С, Дхаваном R, Пэн J, Areces Л. Б., Цай ЛГ, Музакий А (сентябрь 2001 г.). «Структура и регуляция комплекса CDK5-p25 (nck5a)». Мол. Cell . 8 (3): 657–69. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (01) 00343-4 . PMID 11583627 .
↑ Qu D, Li Q, Lim HY, Cheung NS, Li R, Wang JH, Qi RZ (март 2002 г.). «Белок SET связывает нейрональный активатор Cdk5 p35nck5a и модулирует активность Cdk5 / p35nck5a» . J. Biol. Chem . 277 (9): 7324–32. DOI : 10.1074 / jbc.M107270200 . PMID 11741927 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Перуцци Ф., Гордон Дж., Дарбинян Н., Амини С. (2003). «Tat-индуцированная дерегуляция нейрональной дифференцировки и выживания посредством пути фактора роста нервов». J. Neurovirol . 8 Дополнение 2 (2): 91–6. DOI : 10.1080 / 13550280290167885 . PMID 12491158 .
Студзинский Г.П., Харрисон Дж.С. (2003). «Нейрональный активатор циклин-зависимой киназы 5 p35Nck5a и активность Cdk5 в моноцитарных клетках». Лейк. Лимфома . 44 (2): 235–40. DOI : 10.1080 / 1042819021000030009 . PMID 12688339 . S2CID 30242995 .
Такахаши М., Томидзава К., Сато К. и др. (1995). «Новая тау-тубулинкиназа из бычьего мозга» . FEBS Lett . 372 (1): 59–64. DOI : 10.1016 / 0014-5793 (95) 00955-9 . PMID 7556643 . S2CID 42295269 .
Тан Д, Юнг Дж, Ли КИ и др. (1995). «Изоформа нейронального активатора циклин-зависимой киназы 5 (Cdk5)» . J. Biol. Chem . 270 (45): 26897–903. DOI : 10.1074 / jbc.270.45.26897 . PMID 7592934 .
Чае Т., Квон Ю.Т., Бронсон Р. и др. (1997). «Мыши, лишенные p35, нейронального активатора Cdk5, демонстрируют дефекты коркового ламинирования, судороги и летальность взрослых». Нейрон . 18 (1): 29–42. DOI : 10.1016 / S0896-6273 (01) 80044-1 . PMID 9010203 . S2CID 18685470 .
Пун Р.Й., Лью Дж., Хантер Т. (1997). «Идентификация функциональных доменов в нейрональном белке-активаторе Cdk5» . J. Biol. Chem . 272 (9): 5703–8. DOI : 10.1074 / jbc.272.9.5703 . PMID 9038181 .
Флетчер А.И., Шуанг Р., Джованнуччи Д.Р. и др. (1999). «Регулирование экзоцитоза циклин-зависимой киназой 5 посредством фосфорилирования Munc18» . J. Biol. Chem . 274 (7): 4027–35. DOI : 10.1074 / jbc.274.7.4027 . PMID 9933594 .
Патрик Г. Н., Цукерберг Л., Николич М. и др. (2000). «Превращение p35 в p25 нарушает регуляцию активности Cdk5 и способствует нейродегенерации». Природа . 402 (6762): 615–22. DOI : 10.1038 / 45159 . PMID 10604467 . S2CID 4414281 .
Чинг Ю.П., Ци З., Ван Дж.Х. (2000). «Клонирование трех новых нейрональных белков, связывающих активатор Cdk5». Джин . 242 (1-2): 285–94. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (99) 00499-0 . PMID 10721722 .
Квон Ю.Т., Гупта А., Чжоу Ю. и др. (2000). «Регулирование N-кадгерин-опосредованной адгезии киназой p35-Cdk5». Curr. Биол . 10 (7): 363–72. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (00) 00411-5 . PMID 10753743 . S2CID 16438320 .
Ли М.С., Квон Ю.Т., Ли М. и др. (2000). «Нейротоксичность вызывает расщепление p35 до p25 кальпаином». Природа . 405 (6784): 360–4. DOI : 10.1038 / 35012636 . PMID 10830966 . S2CID 205006589 .
Ван X, Чинг Ю.П., Лам WH и др. (2000). «Идентификация общей области ассоциации белков в нейрональном активаторе Cdk5» . J. Biol. Chem . 275 (41): 31763–9. DOI : 10.1074 / jbc.M004358200 . PMID 10915792 .
Флойд С.Р., Порро Е.Б., Слепнев В.И. и др. (2001). «Амфифизин 1 связывает циклинзависимую киназу (cdk) 5 регуляторной субъединицы p35 и фосфорилируется cdk5 и cdc2» . J. Biol. Chem . 276 (11): 8104–10. DOI : 10.1074 / jbc.M008932200 . PMID 11113134 .
Кесавапани С., Лау К.Ф., Маклафлин Д.М. и др. (2001). «p35 / cdk5 связывает и фосфорилирует бета-катенин и регулирует взаимодействие бета-катенин / пресенилин-1». Евро. J. Neurosci . 13 (2): 241–7. DOI : 10,1046 / j.1460-9568.2001.01376.x . PMID 11168528 .
Чен Ф, Студзинский Г.П. (2001). «Экспрессия нейронального активатора циклин-зависимой киназы 5 p35Nck5a в моноцитарных клетках человека связана с дифференцировкой» . Кровь . 97 (12): 3763–7. DOI : 10.1182 / blood.V97.12.3763 . PMID 11389014 .
Tarricone C, Dhavan R, Peng J, et al. (2001). «Структура и регуляция комплекса CDK5-p25 (nck5a)». Мол. Cell . 8 (3): 657–69. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (01) 00343-4 . PMID 11583627 .
Рашид Т., Банерджи М., Николич М. (2002). «Фосфорилирование Pak1 киназой p35 / Cdk5 влияет на морфологию нейронов» . J. Biol. Chem . 276 (52): 49043–52. DOI : 10.1074 / jbc.M105599200 . PMID 11604394 .
Qu D, Li Q, Lim HY и др. (2002). «Белок SET связывает нейрональный активатор Cdk5 p35nck5a и модулирует активность Cdk5 / p35nck5a» . J. Biol. Chem . 277 (9): 7324–32. DOI : 10.1074 / jbc.M107270200 . PMID 11741927 .
Пацке Х., Цай Л.Х. (2002). «Опосредованное кальпаином расщепление циклин-зависимого активатора киназы-5 с р39 до р29» . J. Biol. Chem . 277 (10): 8054–60. DOI : 10.1074 / jbc.M109645200 . PMID 11784720 .

Внешние ссылки [ править ]

Расположение генома человека CDK5R1 и страница сведений о гене CDK5R1 в браузере генома UCSC .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000176749 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000048895 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8090221-5] Tsai LH, Delalle I, Caviness VS - младший, Чэ T, Harlow E (октябрь 1994). «p35 представляет собой нервно-специфическую регуляторную субъединицу циклин-зависимой киназы 5». Природа . 371 (6496): 419–23. DOI : 10.1038 / 371419a0 . PMID 8090221 . S2CID 4267944 .

[entrez-6] «Ген Entrez: CDK5R1 циклин-зависимая киназа 5, регуляторная субъединица 1 (p35)» .

[pmid19067971-7] Хук К.С., Шлегель Н.С., Эйххофф О.М. и др. (2008). «Новые мишени MITF идентифицированы с использованием двухэтапной стратегии ДНК-микрочипов» . Pigment Cell Melanoma Res . 21 (6): 665–76. DOI : 10.1111 / j.1755-148X.2008.00505.x . PMID 19067971 . S2CID 24698373 .

[pmid12084709-8] Cheng K, Li Z, Fu WY, Wang JH, Fu AK, Ip NY (август 2002). «Pctaire1 взаимодействует с p35 и является новым субстратом для Cdk5 / p35» . J. Biol. Chem . 277 (35): 31988–93. DOI : 10.1074 / jbc.M201161200 . PMID 12084709 .

[pmid11113134-9] Floyd SR, Porro EB, Slepnev VI, Ochoa GC, Tsai LH, De Camilli P (март 2001 г.). «Амфифизин 1 связывает циклинзависимую киназу (cdk) 5 регуляторной субъединицы p35 и фосфорилируется cdk5 и cdc2» . J. Biol. Chem . 276 (11): 8104–10. DOI : 10.1074 / jbc.M008932200 . PMID 11113134 .

[pmid11168528-10] Kesavapany S, Лау KF, Маклолин ДМ, Браунлис Дж, Ackerley S, Ли Ру, Шоу CE, Миллер CC (январь 2001). «p35 / cdk5 связывает и фосфорилирует бета-катенин и регулирует взаимодействие бета-катенин / пресенилин-1». Евро. J. Neurosci . 13 (2): 241–7. DOI : 10,1046 / j.1460-9568.2001.01376.x . PMID 11168528 .

[pmid12223541-11] Дхаван R, Грир PL, Morabito MA, Orlando LR, Tsai LH (сентябрь 2002). «Активаторы циклин-зависимой киназы 5 p35 и p39 взаимодействуют с альфа-субъединицей Са2 + / кальмодулин-зависимой протеинкиназы II и альфа-актинина-1 кальций-зависимым образом» . J. Neurosci . 22 (18): 7879–91. DOI : 10.1523 / JNEUROSCI.22-18-07879.2002 . PMC 6758084 . PMID 12223541 .

[pmid10915792-12] Wang X, Ching YP, Lam WH, Qi Z, Zhang M, Wang JH (октябрь 2000 г.). «Идентификация общей области ассоциации белков в нейрональном активаторе Cdk5» . J. Biol. Chem . 275 (41): 31763–9. DOI : 10.1074 / jbc.M004358200 . PMID 10915792 .

[pmid11389014-13] Chen F, Studzinski GP (июнь 2001). «Экспрессия нейронального активатора циклин-зависимой киназы 5 p35Nck5a в моноцитарных клетках человека связана с дифференцировкой» . Кровь . 97 (12): 3763–7. DOI : 10.1182 / blood.V97.12.3763 . PMID 11389014 .

[pmid11583627-14] Tarricone С, Дхаваном R, Пэн J, Areces Л. Б., Цай ЛГ, Музакий А (сентябрь 2001 г.). «Структура и регуляция комплекса CDK5-p25 (nck5a)». Мол. Cell . 8 (3): 657–69. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (01) 00343-4 . PMID 11583627 .

[pmid11741927-15] Qu D, Li Q, Lim HY, Cheung NS, Li R, Wang JH, Qi RZ (март 2002 г.). «Белок SET связывает нейрональный активатор Cdk5 p35nck5a и модулирует активность Cdk5 / p35nck5a» . J. Biol. Chem . 277 (9): 7324–32. DOI : 10.1074 / jbc.M107270200 . PMID 11741927 .

[1]