Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
CDKN2D
Белок CDKN2D PDB 1bd8.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

1BD8 , 1BI8

Идентификаторы
ПсевдонимыCDKN2D , INK4D, p19 , p19-INK4D, ингибитор циклин-зависимой киназы 2D, ингибитор циклин-зависимой киназы 2D
Внешние идентификаторыOMIM : 600927 MGI : 105387 HomoloGene : 36081 GeneCards : CDKN2D
Расположение гена ( человек )
Хромосома 19 (человек)
Chr.Хромосома 19 (человека) [1]
Хромосома 19 (человек)
Геномное расположение CDKN2D
Геномное расположение CDKN2D
Группа19p13.2Начинать10 566 460 п.н. [1]
Конец10 569 059 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 9 (мышь)
Chr.Хромосома 9 (мышь) [2]
Хромосома 9 (мышь)
Геномное расположение CDKN2D
Геномное расположение CDKN2D
Группа9 | 9 A3Начинать21 288 410 п.н. [2]
Конец21 291 407 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE CDKN2D 210240 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• GO: 0001948 связывание белка
• циклин-зависимый белок серин / треонин киназа ингибитором активности
• протеинкиназа связывания
Сотовый компонент• цитоплазма
• нуклеоплазма
• ядро клетки
• цитозоль
• комплекс циклин D2-CDK4
Биологический процесс• Синтез ДНК, участвующий в репарации ДНК
• Регулирование активности циклин-зависимой протеин-серин / треонинкиназы
• Негативная регуляция активности эндопептидазы цистеинового типа, участвующей в процессе апоптоза
• Ответ на витамин D
• Ответ на ретиноевую кислоту
• Негативная регуляция внутреннего апоптотического сигнального пути в ответ на повреждение ДНК
• негативная регуляция роста клеток
• остановка клеточного цикла
• клеточный цикл
• негативная регуляция фосфорилирования
• реакция на УФ
• аутофагическая гибель клеток
• негативная регуляция пролиферации клеток
• сенсорное восприятие звука
• негативная регуляция фазового перехода G1 / S клеточного цикла
• G1 / S переход митотического клеточного цикла
• негативная регуляция активности циклин-зависимого белка серин / треонинкиназы
• негативная регуляция перехода G1 / S митотического клеточного цикла
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

1032

12581

Ансамбль

ENSG00000129355

ENSMUSG00000096472

UniProt

P55273

Q60773

RefSeq (мРНК)

NM_079421
NM_001800

NM_009878

RefSeq (белок)

NP_001791
NP_524145

NP_034008

Расположение (UCSC)Chr 19: 10,57 - 10,57 МбChr 9: 21.29 - 21.29 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Циклин-зависимой киназы 4 ингибитора D представляет собой фермент , который у человека кодируется CDKN2D гена . [5] [6]

Белок , кодируемый этим геном является членом INK4 семейства циклин-зависимых киназ ингибиторов . Было показано, что этот белок образует стабильный комплекс с CDK4 или CDK6 и предотвращает активацию киназ CDK , таким образом, функционируя как регулятор роста клеток, который контролирует развитие клеточного цикла G1 . Было обнаружено, что количество транскрипта этого гена колеблется в зависимости от клеточного цикла с самой низкой экспрессией в середине G1 и максимальной экспрессией во время S фазы. Было показано, что негативная регуляция клеточного цикла, связанная с этим белком, участвует в репрессии нейрональных клеток.пролиферация, а также сперматогенез . Сообщалось о двух альтернативно сплайсированных вариантах этого гена, которые кодируют идентичный белок. [6]

Обратите внимание, что этот белок не следует путать с p19-ARF (мышиный) или человеческим эквивалентом p14ARF , которые являются альтернативными продуктами гена CDKN2A .

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000129355 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000096472 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Окуда Т, Хираи Н, Валентина В.А., Шертлефф С.А., Кидд В.Я., Лахти Ю.М., Шерр CJ, Даунинг JR (март 1996). «Молекулярное клонирование, паттерн экспрессии и хромосомная локализация человеческого CDKN2D / INK4d, ингибитора циклин D-зависимых киназ». Геномика . 29 (3): 623–30. DOI : 10.1006 / geno.1995.9957 . PMID 8575754 . 
  6. ^ a b «Ген Entrez: CDKN2D циклин-зависимый ингибитор киназы 2D (p19, ингибирует CDK4)» .

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Хираи Х., Руссель М.Ф., Като Дж.Й. и др. (1995). «Новые белки INK4, p19 и p18, являются специфическими ингибиторами циклин D-зависимых киназ CDK4 и CDK6» . Мол. Клетка. Биол . 15 (5): 2672–81. DOI : 10,1128 / MCB.15.5.2672 . PMC  230497 . PMID  7739547 .
  • Чан Ф.К., Чжан Дж., Ченг Л. и др. (1995). «Идентификация человеческого и мышиного p19, нового ингибитора CDK4 и CDK6, гомологичного p16ink4» . Мол. Клетка. Биол . 15 (5): 2682–8. DOI : 10,1128 / MCB.15.5.2682 . PMC  230498 . PMID  7739548 .
  • Гуан К.Л., Дженкинс К.В., Ли И и др. (1996). «Выделение и характеристика p19INK4d, связанного с p16 ингибитора, специфичного для CDK6 и CDK4» . Мол. Биол. Cell . 7 (1): 57–70. DOI : 10.1091 / mbc.7.1.57 . PMC  278612 . PMID  8741839 .
  • Шваллер Дж., Пабст Т., Кёффлер Х.П. и др. (1997). «Экспрессия и регуляция ингибиторов клеточного цикла G1 (p16INK4A, p15INK4B, p18INK4C, p19INK4D) при остром миелоидном лейкозе человека и нормальных миелоидных клетках» . Лейкоз . 11 (1): 54–63. DOI : 10.1038 / sj.leu.2400522 . PMID  9001419 .
  • Руссо А.А., Тонг Л., Ли Джо и др. (1998). «Структурная основа ингибирования циклин-зависимой киназы Cdk6 опухолевым супрессором p16INK4a». Природа . 395 (6699): 237–43. DOI : 10.1038 / 26155 . PMID  9751050 . S2CID  204997058 .
  • Brotherton DH, Dhanaraj V, Wick S и др. (1998). «Кристаллическая структура комплекса циклин D-зависимой киназы Cdk6, связанного с ингибитором клеточного цикла p19INK4d». Природа . 395 (6699): 244–50. DOI : 10,1038 / 26164 . PMID  9751051 . S2CID  13337394 .
  • Баумгартнер Р., Фернандес-Каталан С., Виното А. и др. (1998). «Структура человеческого ингибитора циклин-зависимой киназы p19INK4d: сравнение с известными структурами, содержащими анкирин-повторы, и последствия для дисфункции опухолевого супрессора p16INK4a» . Структура . 6 (10): 1279–90. DOI : 10.1016 / S0969-2126 (98) 00128-2 . PMID  9782052 .
  • Шрайбер М., Мюллер В.Дж., Сингх Г., Грэм Флорида (1999). «Сравнение эффективности аденовирусных векторов, экспрессирующих ингибиторы циклинкиназы p16INK4A, p18INK4C, p19INK4D, p21 (WAF1 / CIP1) и p27KIP1 в индукции остановки клеточного цикла, апоптоза и ингибирования онкогенности» . Онкоген . 18 (9): 1663–76. DOI : 10.1038 / sj.onc.1202466 . PMID  10208428 .
  • Ньютон Бишоп Дж. А., Харланд М., Беннетт Д. К. и др. (1999). «Тестирование мутаций в семьях меланомы: INK4A, CDK4 и INK4D» . Br. J. Рак . 80 (1–2): 295–300. DOI : 10.1038 / sj.bjc.6690354 . PMC  2363010 . PMID  10390011 .
  • Зинди Ф., Каннингем Дж. Дж., Шерр С. Дж. И др. (1999). «Постнатальная пролиферация нейронов у мышей, лишенных Ink4d и Kip1 ингибиторов циклин-зависимых киназ» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 96 (23): 13462–7. DOI : 10.1073 / pnas.96.23.13462 . PMC  23970 . PMID  10557343 .
  • Туллберг М., Барткова Дж., Хан С. и др. (2000). «Отличительные и повторяющиеся свойства среди членов семейства INK4 циклин-зависимых ингибиторов киназ» . FEBS Lett . 470 (2): 161–6. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (00) 01307-7 . PMID  10734227 . S2CID  45439595 .
  • Барткова Дж., Туллберг М., Райперт-Де Мейтс Э. и др. (2000). «Отсутствие p19INK4d в опухолях половых клеток яичка человека контрастирует с высокой экспрессией при нормальном сперматогенезе» . Онкоген . 19 (36): 4146–50. DOI : 10.1038 / sj.onc.1203769 . PMID  10962575 .
  • Финк-младший, ЛеБьен Т.В. (2001). «Новая экспрессия ингибиторов циклин-зависимой киназы в предшественниках В-клеток человека». Exp. Гематол . 29 (4): 490–8. DOI : 10.1016 / S0301-472X (01) 00619-1 . PMID  11301189 .
  • Zeeb M, Rösner H, Zeslawski W, et al. (2002). «Фолдинг белка и стабильность человеческого ингибитора CDK p19 (INK4d)». J. Mol. Биол . 315 (3): 447–57. DOI : 10.1006 / jmbi.2001.5242 . PMID  11786024 .
  • Мацузаки Ю., Миядзава К., Йокота Т. и др. (2002). «Молекулярное клонирование и характеристика промотора гена p19 человека (INK4d)» . FEBS Lett . 517 (1–3): 272–6. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (02) 02647-9 . PMID  12062451 . S2CID  82054693 .
  • Arcellana-Panlilio MY, Egeler RM, Ujack E, et al. (2002). «Доказательства роли семейства INK4 циклин-зависимых ингибиторов киназ в опухолях гранулезных клеток яичников». Гены Хромосомы Рак . 35 (2): 176–81. DOI : 10.1002 / gcc.10108 . PMID  12203782 . S2CID  27477191 .
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932 .
  • Геваерт К., Гетальс М., Мартенс Л. и др. (2004). «Изучение протеомов и анализ процессинга белков с помощью масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». Nat. Biotechnol . 21 (5): 566–9. DOI : 10.1038 / nbt810 . PMID  12665801 . S2CID  23783563 .
  • Комата Т., Канзава Т., Такеучи Х. и др. (2004). «Противоопухолевый эффект ингибиторов циклин-зависимых киназ (p16 (INK4A), p18 (INK4C), p19 (INK4D), p21 (WAF1 / CIP1) и p27 (KIP1)) на злокачественные клетки глиомы» . Br. J. Рак . 88 (8): 1277–80. DOI : 10.1038 / sj.bjc.6600862 . PMC  2747579 . PMID  12698196 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Расположение человеческого гена CDKN2D в браузере генома UCSC .
  • Подробная информация о человеческом гене CDKN2D в браузере генома UCSC .
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P55273 (циклин-зависимый ингибитор киназы 4 D) в PDBe-KB .


  • v
  • т
  • е