CLCA1

Идентификаторы

CLCA1 , CACC, CACC1, CLCRG1, CaCC-1, GOB5, hhCaCC-1, принадлежность канала хлорида 1

Внешние идентификаторы

OMIM : 603906 MGI : 1346342 HomoloGene : 984 GeneCards : CLCA1

Расположение гена ( человек )

Chr.	Хромосома 1 (человека) ^[1]

Группа	1п22.3	Начинать	86 468 368 п.н. ^[1]
Группа	1п22.3	Конец	86 500 259 п.н. ^[1]

Расположение гена ( Мышь )

Chr.	Хромосома 3 (мышь) ^[2]

Группа	3 H2 \| 3 69,26 см	Начинать	145 003 817 п.н. ^[2]
Группа	3 H2 \| 3 69,26 см	Конец	145 032 776 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• ион металла связывание • пептидазы активности • гидролазы активности • хлоридного канала активность • metallopeptidase активность • metalloendopeptidase активность • внутриклеточная активность канала хлорида кальция , активированные
Сотовый компонент	• внеклеточная область • неотъемлемый компонент мембраны • неотъемлемый компонент плазматической мембраны • микроворсинки • мембрана зимогенной гранулы • мембрана • клеточная мембрана • секреторная гранула • внеклеточная
Биологический процесс	• ион кальция транспорт • протеолиз • Хлорид транспорт • ионного транспорта • ионный трансмембранный транспорт • клеточный ответ на гипоксию • трансмембранного транспорта хлоридов
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


1179


23844

Ансамбль


ENSG00000016490


ENSMUSG00000028255

UniProt


A8K7I4


Q9D7Z6

RefSeq (мРНК)


NM_001285


NM_017474

RefSeq (белок)


NP_001276


NP_059502

Расположение (UCSC)

Chr 1: 86,47 - 86,5 Мб

Chr 3: 145 - 145,03 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Хлорид канала аксессуар 1 представляет собой белок , который у человека кодируется CLCA1 гена . ^[5]^[6]

Этот ген кодирует член семейства чувствительных к кальцию белков с проводимостью хлоридов. На сегодняшний день все члены этого семейства генов картируются в одной и той же области на хромосоме 1p31-p22 и имеют высокую степень гомологии по размеру, последовательности и предполагаемой структуре, но значительно различаются по своему тканевому распределению. Кодируемый белок экспрессируется как белок-предшественник, который процессируется в две субъединицы, связанные с клеточной поверхностью, хотя сайт, в котором расщепляется предшественник, точно не определен. Кодируемый белок может участвовать в обеспечении проводимости хлоридов, активируемых кальцием, в кишечнике. ^[6] Методы прогнозирования структуры белка предполагают, что N-концевой участок белка CLCA1 представляет собой металлопротеиназу цинка . ^[7]

См. Также [ править ]

Хлоридный канал

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000016490 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028255 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Gruber AD, Elble RC, Ji HL, Schreur KD, Фуллер CM, Pauli BU (январь 1999). «Геномное клонирование, молекулярная характеристика и функциональный анализ человеческого CLCA1, первого человеческого члена семейства Ca ²⁺ -активированных белков Cl ^- канала». Геномика . 54 (2): 200–14. DOI : 10.1006 / geno.1998.5562 . PMID 9828122 .
^ a b «Ген Entrez: канал хлорида CLCA1, активированный кальцием, член семьи 1» .
^ Павловский К., Леписто М., Мейнандер Н. и др. (2006). «Новый консервативный домен гидролазы в семействе CLCA предполагаемых кальций-активируемых хлоридных каналов». Белки . 63 (3): 424–39. DOI : 10.1002 / prot.20887 . PMID 16470849 . S2CID 40041491 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Хьюм Дж. Р., Дуан Д., Коллиер М. Л. и др. (2000). «Перенос анионов в сердце». Physiol. Ред . 80 (1): 31–81. DOI : 10.1152 / Physrev.2000.80.1.31 . PMID 10617765 .
Паули Б.У., Абдель-Гани М., Ченг Х.С. и др. (2001). «Молекулярные характеристики и функциональное разнообразие членов семейства CLCA». Clin. Exp. Pharmacol. Physiol . 27 (11): 901–5. DOI : 10.1046 / j.1440-1681.2000.03358.x . PMID 11071307 . S2CID 28762005 .
Агнель М., Верма Т., Кулулку Дж. М. (1999). «Идентификация трех новых членов семейства кальций-зависимых хлоридных каналов (CaCC), преимущественно экспрессируемых в пищеварительном тракте и трахее». FEBS Lett . 455 (3): 295–301. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (99) 00891-1 . PMID 10437792 . S2CID 82094058 .
Диас Нето Э., Корреа Р.Г., Верджовски-Алмейда С. и др. (2000). «Shotgun секвенирование человеческого транскриптома с помощью тегов последовательности, экспрессируемой ORF» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 97 (7): 3491–6. Bibcode : 2000PNAS ... 97.3491D . DOI : 10.1073 / pnas.97.7.3491 . PMC 16267 . PMID 10737800 .
Лю QH, Уильямс Д.А., Макманус С. и др. (2000). «ВИЧ-1 gp120 и хемокины активируют ионные каналы в первичных макрофагах посредством стимуляции CCR5 и CXCR4» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 97 (9): 4832–7. Bibcode : 2000PNAS ... 97.4832L . DOI : 10.1073 / pnas.090521697 . PMC 18318 . PMID 10758170 .
Тода М., Тулич М.К., Левитт Р.К., Хамид К. (2002). «Активированный кальцием хлоридный канал (HCLCA1) сильно связан с экспрессией IL-9 и выработкой слизи в бронхиальном эпителии пациентов с астмой». J. Allergy Clin. Иммунол . 109 (2): 246–50. DOI : 10,1067 / mai.2002.121555 . PMID 11842292 .
Гринвуд И.А., Миллер Л.Дж., Охя С., Горовиц Б. (2002). «Бета-субъединица калиевого канала с большой проводимостью может взаимодействовать и модулировать функциональные свойства активируемого кальцием хлоридного канала, CLCA1» . J. Biol. Chem . 277 (25): 22119–22. DOI : 10.1074 / jbc.C200215200 . PMID 11994272 .
Abdel-Ghany M, Cheng HC, Elble RC, Pauli BU (2002). «Киназа фокальной адгезии, активированная лигированием бета (4) интегрина с mCLCA1, опосредует ранний метастатический рост» . J. Biol. Chem . 277 (37): 34391–400. DOI : 10.1074 / jbc.M205307200 . PMID 12110680 .
Лоуэн М.Э., Бекар Л.К., Габриэль С.Е. и др. (2002). «pCLCA1 становится цАМФ-зависимым медиатором проводимости хлорида в клетках Caco-2». Биохим. Биофиз. Res. Commun . 298 (4): 531–6. DOI : 10.1016 / S0006-291X (02) 02498-1 . PMID 12408984 .
Чжоу Ю., Шапиро М., Донг К. и др. (2003). «Блокатор хлоридных каналов, активируемый кальцием, подавляет метаплазию бокаловидных клеток и гиперпродукцию слизи». Новартис найден. Symp . Симпозиумы Фонда Новартис. 248 : 150–65, обсуждение 165–70, 277–82. DOI : 10.1002 / 0470860790.ch10 . ISBN 9780470844786. PMID 12568493 .
Абдель-Гани М., Ченг Х.С., Эльбл Р.С. и др. (2004). «Взаимодействующие связывающие домены бета (4) интегрина и кальций-активируемых хлоридных каналов (CLCA) при метастазировании» . J. Biol. Chem . 278 (49): 49406–16. DOI : 10.1074 / jbc.M309086200 . PMID 14512419 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. DOI : 10,1038 / нг1285 . PMID 14702039 .
Хегаб А.Е., Сакамото Т., Учида Ю. и др. (2004). «Полиморфизмы гена CLCA1 при хронической обструктивной болезни легких» . J. Med. Genet . 41 (3): 27e – 27. DOI : 10.1136 / jmg.2003.012484 . PMC 1735703 . PMID 14985398 .
Камада Ф., Сузуки Ю., Шао С. и др. (2005). «Связь гена hCLCA1 с астмой у детей и взрослых» . Genes Immun . 5 (7): 540–7. DOI : 10.1038 / sj.gene.6364124 . PMID 15318163 .
Ритцка М., Станке Ф., Янсен С. и др. (2005). «Локус гена CLCA как модулятор основного желудочно-кишечного дефекта при муковисцидозе». Гм. Genet . 115 (6): 483–91. DOI : 10.1007 / s00439-004-1190-у . PMID 15490240 . S2CID 12935280 .
Гибсон А., Льюис А.П., Аффлек К. и др. (2005). «hCLCA1 и mCLCA3 являются секретируемыми неинтегральными мембранными белками и, следовательно, не являются ионными каналами» . J. Biol. Chem . 280 (29): 27205–12. DOI : 10.1074 / jbc.M504654200 . PMID 15919655 .
Чон С.М., Пак Х.К., Юн И.С. и др. (2005). «Клонирование и экспрессия Ca ²⁺ -активированного хлоридного канала из мозга крысы». Биохим. Биофиз. Res. Commun . 334 (2): 569–76. DOI : 10.1016 / j.bbrc.2005.06.122 . PMID 16023076 .

Внешние ссылки [ править ]

CLCA1 + белок, + человеческий по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
Расположение генома человека CLCA1 и страница сведений о гене CLCA1 в браузере генома UCSC .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии .

Эта статья о гене на хромосоме 1 человека - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000016490 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028255 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9828122-5] Gruber AD, Elble RC, Ji HL, Schreur KD, Фуллер CM, Pauli BU (январь 1999). «Геномное клонирование, молекулярная характеристика и функциональный анализ человеческого CLCA1, первого человеческого члена семейства Ca ²⁺ -активированных белков Cl ^- канала». Геномика . 54 (2): 200–14. DOI : 10.1006 / geno.1998.5562 . PMID 9828122 .

[entrez-6] «Ген Entrez: канал хлорида CLCA1, активированный кальцием, член семьи 1» .

[pmid16470849-7] Павловский К., Леписто М., Мейнандер Н. и др. (2006). «Новый консервативный домен гидролазы в семействе CLCA предполагаемых кальций-активируемых хлоридных каналов». Белки . 63 (3): 424–39. DOI : 10.1002 / prot.20887 . PMID 16470849 . S2CID 40041491 .

[1]