CLDN5

Идентификаторы

CLDN5 , AWAL, BEC1, CPETRL1, TMVCF, клаудин 5, TMDVCF

Внешние идентификаторы

OMIM: 602101 MGI: 1276112 ГомолоГен: 2459 Генные карты : CLDN5

Расположение гена (человек)

Chr.	Хромосома 22 (человека) ^[1]

Группа	22q11.21	Начинать	19 523 024 п.н. ^[1]
Группа	22q11.21	Конец	19 527 545 п.н. ^[1]

Расположение гена (Мышь)

Chr.	Хромосома 16 (мышь) ^[2]

Группа	16 A3 \| 16 11,63 см	Начинать	18 776 847 п.н. ^[2]
Группа	16 A3 \| 16 11,63 см	Конец	18 778 262 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• структурная активность молекулы • идентичное связывание с белками
Сотовый компонент	• мембрана • апиколатеральная плазматическая мембрана • кортикальный актиновый цитоскелет • межклеточное соединение • неотъемлемый компонент мембраны • двухклеточное плотное соединение • клеточная мембрана • соединение клеток
Биологический процесс	• клетка-клетка узел сборки • трансформации бета - рецептор фактора роста сигнального пути • морфогенез тракта оттока • обучение • позитивное регулирование создания эндотелиального барьера • небной развития • кальций-независимой клеточной адгезии-клеток с помощью плазменной мембраны молекул клеточной адгезии • лица морфогенеза • регулирование сборки двухклеточного плотного спая
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


7122


12741

Ансамбль


ENSG00000184113


ENSMUSG00000041378

UniProt


O00501


O54942

RefSeq (мРНК)


NM_003277 NM_001130861 NM_001363066 NM_001363067


NM_013805

RefSeq (белок)


NP_001124333 NP_003268 NP_001349995 NP_001349996


NP_038833

Расположение (UCSC)

Chr 22: 19.52 - 19.53 Мб

Chr 16: 18.78 - 18.78 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Claudin-5 представляет собой белок , который у человека кодируется CLDN5 гена . ^[5]^[6]^[7] Он принадлежит к группе клаудинов .

Функция [ править ]

Этот ген кодирует члена семейства клаудиновых. Клаудины являются интегральными мембранными белками и компонентами цепей плотных соединений. Плотные соединительные нити служат физическим барьером для предотвращения свободного прохождения растворенных веществ и воды через параклеточное пространство между листами эпителиальных или эндотелиальных клеток. Мутации в этом гене были обнаружены у пациентов с велокардиофациальным синдромом. ^[7]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что CLDN5 взаимодействует с CLDN1 ^[8] и CLDN3 . ^[8]

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000184113 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000041378 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Peacock RE, Keen TJ, Inglehearn CF (декабрь 1997). «Анализ человеческого гена, гомологичного белку вентральной простаты 1 крысы». Геномика . 46 (3): 443–9. DOI : 10.1006 / geno.1997.5033 . PMID 9441748 .
↑ Sirotkin H, Morrow B, Saint-Jore B, Puech A, Das Gupta R, Patanjali SR, Skoultchi A, Weissman SM, Kucherlapati R (сентябрь 1997 г.). «Идентификация, характеристика и точное картирование человеческого гена, кодирующего новый мембранный белок из области 22q11, удаленной при велокардиофациальном синдроме». Геномика . 42 (2): 245–51. DOI : 10.1006 / geno.1997.4734 . PMID 9192844 .
^ a b «Ген Entrez: CLDN5 клаудин 5 (трансмембранный белок удален при велокардиофациальном синдроме)» .
^ a b Coyne CB, Gambling TM, Boucher RC, Carson JL, Johnson LG (ноябрь 2003 г.). «Роль взаимодействий клаудина в проницаемости плотных соединений дыхательных путей». Являюсь. J. Physiol. Lung Cell Mol. Physiol . 285 (5): L1166-78. DOI : 10,1152 / ajplung.00182.2003 . PMID 12909588 .

Внешние ссылки [ править ]

Расположение генома человека CLDN5 и страница сведений о гене CLDN5 в браузере генома UCSC .

Дальнейшее чтение [ править ]

Книзель У., Вольбург Х (2000). «Плотные стыки гематоэнцефалического барьера». Клетка. Мол. Neurobiol . 20 (1): 57–76. DOI : 10,1023 / A: 1006995910836 . PMID 10690502 .
Хейскала М., Петерсон П.А., Ян Й. (2001). «Роли белков суперсемейства клаудина в параклеточном транспорте» . Трафик . 2 (2): 93–8. DOI : 10.1034 / j.1600-0854.2001.020203.x . PMID 11247307 .
Цукита С., Фурузе М., Ито М. (2001). «Многофункциональные пряди в плотных стыках». Nat. Преподобный Мол. Cell Biol . 2 (4): 285–93. DOI : 10.1038 / 35067088 . PMID 11283726 .
Цукита С, Фурусэ М (2002). «Барьер на основе Клаудина в простых и многослойных ячеистых листах». Curr. Мнение. Cell Biol . 14 (5): 531–6. DOI : 10.1016 / S0955-0674 (02) 00362-9 . PMID 12231346 .
Гонсалес-Марискаль Л., Бетансос А., Нава П., Харамилло Б. Э. (2003). «Белки с плотным контактом» . Прог. Биофиз. Мол. Биол . 81 (1): 1–44. DOI : 10.1016 / S0079-6107 (02) 00037-8 . PMID 12475568 .
Король JE, Евгенин EA, Бакнер CM, Берман JW (2006). «ВИЧ-инфекция и нейротоксичность». Микробы заражают . 8 (5): 1347–57. DOI : 10.1016 / j.micinf.2005.11.014 . PMID 16697675 .
Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
Морита К., Фурусэ М., Фудзимото К., Цукита С. (1999). «Мультигенное семейство Claudin, кодирующее белковые компоненты с четырьмя трансмембранными доменами цепей плотного соединения» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 96 (2): 511–6. DOI : 10.1073 / pnas.96.2.511 . PMC 15167 . PMID 9892664 .
Ито М., Фурузе М., Морита К., Кубота К., Сайтоу М., Цукита С. (1999). «Прямое связывание трех MAGUK, связанных с плотными соединениями, ZO-1, ZO-2 и ZO-3, с концами COOH клаудинов» . J. Cell Biol . 147 (6): 1351–63. DOI : 10.1083 / jcb.147.6.1351 . PMC 2168087 . PMID 10601346 .
Кодзима С., Ранер С., Пэн С., Риццоло Л.Дж. (2002). «Клаудин 5 временно экспрессируется во время развития пигментного эпителия сетчатки». J. Membr. Биол . 186 (2): 81–8. DOI : 10.1007 / s00232-001-0137-7 . PMID 11944085 .
Поляк С., Матлис С., Ульмер С., Шерер С.С., Пелеш Е. (2002). «Отдельные клаудины и ассоциированные белки PDZ образуют различные аутотипические плотные контакты в миелинизирующих шванновских клетках» . J. Cell Biol . 159 (2): 361–72. DOI : 10,1083 / jcb.200207050 . PMC 2173042 . PMID 12403818 .
Helms HC, Waagepetersen HS, Nielsen CU, Brodin B (2010). «Параклеточная герметичность и экспрессия клаудина-5 увеличиваются в модели гематоэнцефалического барьера BCEC / астроцитов за счет увеличения буферной емкости среды во время роста» . ГПД Дж . 12 (4): 759–70. DOI : 10,1208 / s12248-010-9237-6 . PMC 2976989 . PMID 20967520 .
Лю Ф., Коваль М., Ранганатан С., Фанаян С., Хэнкок В.С., Лундберг Е.К., Бивис Р.С., Лейн Л., Дуек П., Маккуэйд Л., Келлехер Н.Л., Бейкер М.С. (2015). "Системная протеомика вид эндогенного человеческого семейства белков клаудина" . J Proteome Res . DOI : 10.1021 / acs.jproteome.5b00769 . PMC 4777318 . PMID 26680015 .

Эта статья о гене на хромосоме 22 человека - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000184113 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000041378 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9441748-5] Peacock RE, Keen TJ, Inglehearn CF (декабрь 1997). «Анализ человеческого гена, гомологичного белку вентральной простаты 1 крысы». Геномика . 46 (3): 443–9. DOI : 10.1006 / geno.1997.5033 . PMID 9441748 .

[pmid9192844-6] Sirotkin H, Morrow B, Saint-Jore B, Puech A, Das Gupta R, Patanjali SR, Skoultchi A, Weissman SM, Kucherlapati R (сентябрь 1997 г.). «Идентификация, характеристика и точное картирование человеческого гена, кодирующего новый мембранный белок из области 22q11, удаленной при велокардиофациальном синдроме». Геномика . 42 (2): 245–51. DOI : 10.1006 / geno.1997.4734 . PMID 9192844 .

[entrez-7] «Ген Entrez: CLDN5 клаудин 5 (трансмембранный белок удален при велокардиофациальном синдроме)» .

[pmid12909588-8] Coyne CB, Gambling TM, Boucher RC, Carson JL, Johnson LG (ноябрь 2003 г.). «Роль взаимодействий клаудина в проницаемости плотных соединений дыхательных путей». Являюсь. J. Physiol. Lung Cell Mol. Physiol . 285 (5): L1166-78. DOI : 10,1152 / ajplung.00182.2003 . PMID 12909588 .

[1]