Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
CLEC4M
Белок CLEC4M PDB 1k9j.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

1K9J , 1SL6 , 1XAR , 1XPH , 3JQH

Идентификаторы
ПсевдонимыCLEC4M , CD209L, CD299, DC-SIGN2, DC-SIGNR, DCSIGNR, HP10347, L-SIGN, LSIGN, семейство лектиновых доменов C-типа, 4 члена M
Внешние идентификаторыOMIM : 605872 MGI : 2157942 HomoloGene : 129771 GeneCards : CLEC4M
Расположение гена ( человек )
Хромосома 19 (человек)
Chr.Хромосома 19 (человека) [1]
Хромосома 19 (человек)
Геномное расположение CLEC4M
Геномное расположение CLEC4M
Группа19p13.2Начинать7 763 210 п.н. [1]
Конец7 769 605 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 8 (мышь)
Chr.Хромосома 8 (мышь) [2]
Хромосома 8 (мышь)
Геномное расположение CLEC4M
Геномное расположение CLEC4M
Группа8 | 8 A1.1Начинать3 743 397 п.н. [2]
Конец3 748 984 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE CLEC4M 210481 s в формате fs.png

PBB GE CLEC4M 207995 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• связывание пептида с антигеном
• активность вирусного рецептора
• связывание ионов металлов
• кальций-зависимое связывание с белками
• связывание маннозы
• связывание вириона
• активность рецептора ICAM-3
• связывание углеводов
• активность сигнального рецептора
• связывание с белком GO: 0001948
Сотовый компонент• цитоплазма
• неотъемлемый компонент мембраны
• мембрана
• клеточная мембрана
• неотъемлемый компонент плазматической мембраны
• внеклеточная область
• клетка-хозяин
Биологический процесс• лейкоцитарная межклеточная адгезия
• распознавание клеток
• межклеточный транспорт вируса GO: 0046795
• передача внутриклеточного сигнала GO: 0007243
• процессинг и презентация антигена
• эндоцитоз
• адаптивный иммунный ответ
• процесс иммунной системы
• репликация вируса
• транспорт пептидного антигена
• модуляция вирусом морфологии или физиологии хозяина
• врожденной иммунной системой
• вирусным процессом GO: 0022415
• прикреплением вириона к клетке хозяина
• проникновением вируса
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

10332

170786

Ансамбль

ENSG00000104938

ENSMUSG00000031494

UniProt

Q9H2X3

Q91ZX1

RefSeq (мРНК)
NM_001144904
NM_001144905
NM_001144906
NM_001144907
NM_001144908

NM_001144909
NM_001144910
NM_001144911
NM_014257
NM_214675
NM_214676

NM_133238

RefSeq (белок)
NP_001138376
NP_001138377
NP_001138378
NP_001138379
NP_001138380

NP_001138381
NP_001138382
NP_001138383
NP_055072

NP_573501

Расположение (UCSC)Chr 19: 7.76 - 7.77 МбChr 8: 3.74 - 3.75 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

С-типа лектина домена семьи 4 члена М представляет собой белок , который у человека кодируется CLEC4M гена . [5] CLEC4M также был обозначен как CD299 ( кластер дифференцировки 299).

Этот ген кодирует L-SIGN (молекулы внутриклеточной адгезии, специфичные для печени / лимфатических узлов-3, захватывающие неинтегрин), интегральный мембранный белок типа II, который на 77% идентичен антигену CD209 , связывающему gp120 белку ВИЧ . Этот белок, как и CD209, эффективно связывает как молекулу межклеточной адгезии 3 ( ICAM3 ), так и gp120 ВИЧ-1, и усиливает инфицирование Т-клеток ВИЧ-1. Этот ген картирован в 19p13.3 в кластере с генами CD209 и CD23 / FCER2. Для этого гена было обнаружено множество альтернативно сплайсированных вариантов транскриптов, но биологическая достоверность некоторых вариантов не была определена. [6]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000104938 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031494 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ↑ Yokoyama-Kobayashi M, Yamaguchi T, Sekine S, Kato S (апрель 1999). «Выбор кДНК, кодирующих предполагаемые мембранные белки типа II на поверхности клетки, из банка полноразмерных кДНК человека». Джин . 228 (1–2): 161–7. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (99) 00004-9 . PMID 10072769 . 
  6. ^ «Энтрез Ген: CLEC4M C-тип лектинового домена семейства 4, член M» .

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Барибо Ф, Домс Р. В., Пельманн С (2006). «Роль DC-SIGN и DC-SIGNR в инфицировании вирусом ВИЧ и Эбола: могут ли потенциальные терапевтические средства блокировать передачу и распространение вируса?». Мнение эксперта. Ther. Цели . 6 (4): 423–31. DOI : 10.1517 / 14728222.6.4.423 . PMID  12223058 . S2CID  21541850 .
  • Беккер Y (2004). «Связывание gp120 ВИЧ-1 с рецепторами дендритных клеток мобилизует вирус к лимфатическим узлам, но индуцированный синтез IL-4 гемопоэтическими клетками FcepsilonRI + повреждает адаптивный иммунитет - обзор, гипотеза и последствия». Гены вирусов . 29 (1): 147–65. DOI : 10,1023 / Б: VIRU.0000032797.43537.d3 . PMID  15215692 . S2CID  5666009 .
  • Лалор П.Ф., Лай В.К., Кербишли С.М. и др. (2006). «Человеческие синусоидальные эндотелиальные клетки печени можно отличить по экспрессии фенотипических маркеров, связанных с их специализированными функциями in vivo» . Мир J. Gastroenterol . 12 (34): 5429–39. DOI : 10,3748 / wjg.v12.i34.5429 . PMC  4088223 . PMID  17006978 .
  • Curtis BM, Scharnowske S, Watson AJ (1992). «Последовательность и экспрессия ассоциированного с мембраной лектина С-типа, который проявляет CD4-независимое связывание гликопротеина оболочки вируса иммунодефицита человека gp120» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 89 (17): 8356–60. Bibcode : 1992PNAS ... 89.8356C . DOI : 10.1073 / pnas.89.17.8356 . PMC  49917 . PMID  1518869 .
  • Гаттегно Л., Рамдани А., Жуо Т. и др. (1992). «Лектино-углеводные взаимодействия и инфекционность вируса иммунодефицита человека 1 типа (ВИЧ-1)». AIDS Res. Гм. Ретровирусы . 8 (1): 27–37. DOI : 10,1089 / aid.1992.8.27 . PMID  1736938 .
  • Сойле Э. Дж., Бартен Р., Троусдейл Дж. (2000). «DC-SIGN; родственный ген DC-SIGNR; и CD23 образуют кластер на 19p13» . J. Immunol . 165 (6): 2937–42. DOI : 10.4049 / jimmunol.165.6.2937 . PMID  10975799 .
  • Pöhlmann S, Soilleux EJ, Baribaud F и др. (2001). «DC-SIGNR, гомолог DC-SIGN, экспрессируемый в эндотелиальных клетках, связывается с вирусами иммунодефицита человека и обезьян и активирует инфекцию в транс» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 98 (5): 2670–5. Bibcode : 2001PNAS ... 98.2670P . DOI : 10.1073 / pnas.051631398 . PMC  30196 . PMID  11226297 .
  • Баширова А.А., Гейтенбек Т.Б., Ван Дуйнховен Г.К. и др. (2001). «Специфическая для дендритных клеток молекула межклеточной адгезии, 3-захватывающий неинтегрин (DC-SIGN) -зависимый белок, высоко экспрессируется на синусоидальных эндотелиальных клетках печени человека и способствует инфицированию ВИЧ-1» . J. Exp. Med . 193 (6): 671–8. DOI : 10,1084 / jem.193.6.671 . PMC  2193415 . PMID  11257134 .
  • Муммиди С., Катано Дж., Лам Л. и др. (2001). «Обширный репертуар мембраносвязанных и растворимых дендритных клеток, специфичных для ICAM-3-захватывающих неинтегрин 1 (DC-SIGN1) и изоформ DC-SIGN2. Межиндивидуальные различия в экспрессии транскриптов DC-SIGN» . J. Biol. Chem . 276 (35): 33196–212. DOI : 10.1074 / jbc.M009807200 . PMID  11337487 .
  • Митчелл Д.А., Фадден А.Дж., Дрикамер К. (2001). «Новый механизм распознавания углеводов лектинами C-типа DC-SIGN и DC-SIGNR. Субъединичная организация и связывание с поливалентными лигандами» . J. Biol. Chem . 276 (31): 28939–45. DOI : 10.1074 / jbc.M104565200 . PMID  11384997 .
  • Файнберг Х., Митчелл Д.А., Дрикамер К., Вайс В.И. (2002). «Структурная основа для избирательного распознавания олигосахаридов с помощью DC-SIGN и DC-SIGNR». Наука . 294 (5549): 2163–6. DOI : 10.1126 / science.1066371 . PMID  11739956 . S2CID  25046581 .
  • Альварес С.П., Ласала Ф., Каррильо Дж. И др. (2002). «Лектины C-типа DC-SIGN и L-SIGN опосредуют проникновение вируса Эбола в клетки цис и транс» . J. Virol . 76 (13): 6841–4. DOI : 10,1128 / JVI.76.13.6841-6844.2002 . PMC  136246 . PMID  12050398 .
  • Soilleux EJ, Morris LS, Rushbrook S, et al. (2002). «Экспрессия лектина DC-SIGNR, связывающего вирус иммунодефицита человека (ВИЧ): последствия для ВИЧ-инфекции и иммунитета». Гм. Патол . 33 (6): 652–9. DOI : 10.1053 / hupa.2002.124036 . PMID  12152166 .
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932 .
  • Лин Дж., Симмонс Дж., Пельманн С. и др. (2003). «Дифференциальное N-связанное гликозилирование гликопротеинов оболочки вируса иммунодефицита человека и вируса Эбола модулирует взаимодействия с DC-SIGN и DC-SIGNR» . J. Virol . 77 (2): 1337–46. DOI : 10,1128 / JVI.77.2.1337-1346.2003 . PMC  140807 . PMID  12502850 .
  • Pöhlmann S, Zhang J, Baribaud F, et al. (2003). «Гликопротеины вируса гепатита С взаимодействуют с DC-SIGN и DC-SIGNR» . J. Virol . 77 (7): 4070–80. DOI : 10,1128 / JVI.77.7.4070-4080.2003 . PMC  150620 . PMID  12634366 .
  • Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. DOI : 10,1038 / нг1285 . PMID  14702039 .
  • Энгеринг А., ван Влит С.Дж., Хебеда К. и др. (2004). «Динамические популяции дендритных клеток-специфичных ICAM-3, захватывающих неинтегрин-положительные незрелые дендритные клетки, и специфичных для печени / лимфатических узлов ICAM-3, захватывающих неинтегрин-положительные эндотелиальные клетки во внешних зонах паракортикального слоя лимфатических узлов человека» . Являюсь. J. Pathol . 164 (5): 1587–95. DOI : 10.1016 / S0002-9440 (10) 63717-0 . PMC  1615649 . PMID  15111305 .

Внешние ссылки [ править ]

  • CLEC4M + белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
  • Расположение человеческого гена CLEC4M в браузере генома UCSC .
  • Подробная информация о человеческом гене CLEC4M в браузере генома UCSC .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии .

  • v
  • т
  • е