CLK1

Доступные конструкции

Ортолог поиск: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
1Z57 , 2VAG , 5J1V , 5J1W

Идентификаторы

Псевдонимы

CLK1 , CLK, CLK / STY, STY, CDC как киназа 1

Внешние идентификаторы

OMIM : 601951 MGI : 107403 HomoloGene : 101535 GeneCards : CLK1

Расположение гена ( человек )

Chr.	Хромосома 2 (человека) ^[1]

Группа	2q33.1	Начинать	200 853 009 п.н. ^[1]
Группа	2q33.1	Конец	200 864 744 п.н. ^[1]

Расположение гена ( Мышь )

Chr.	Хромосома 1 (мышь) ^[2]

Группа	1 C1.3 \| 1 29.09 см	Начинать	58 410 189 п.н. ^[2]
Группа	1 C1.3 \| 1 29.09 см	Конец	58 424 066 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• трансферазной активность • связывание нуклеотида • белок серин / треонин / тирозинкиназы • протеин серин / треонин киназа • протеинкиназа активность • протеина - тирозин - киназа • не-трансмембранный протеин - тирозин - киназа • GO: связывание 0001948 белок • связывание АТФ • киназная активность
Сотовый компонент	• цитоплазма • ядро
Биологический процесс	• аутофосфорилирование белков • фосфорилирование пептидил-тирозина • регуляция сплайсинга РНК • фосфорилирование белков • пролиферация клеточной популяции • фосфорилирование пептидил-треонина • фосфорилирование пептидил-серина • фосфорилирование
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


1195


12747

Ансамбль


ENSG00000013441


ENSMUSG00000026034

UniProt


P49759


P22518

RefSeq (мРНК)


NM_001024646 NM_001162407 NM_004071


NM_001042634 NM_009905

RefSeq (белок)


NP_001155879 NP_004062


NP_001036099

Расположение (UCSC)

Chr 2: 200,85 - 200,86 Мб

Chr 1: 58.41 - 58.42 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Двойной протеин киназа специфичности CLK1 представляет собой фермент , который у человека кодируется CLK1 геном . ^[5]^[6]

Функция [ править ]

Этот ген кодирует члена семейства CDC2-подобных (или LAMMER) протеинкиназ двойной специфичности . В ядре клетки кодируемый белок фосфорилирует богатые серином / аргинином белки, участвующие в процессинге пре-мРНК, высвобождая их в нуклеоплазму . Выбор сайтов сплайсинга во время процессинга пре-мРНК может регулироваться концентрацией трансактирующих факторов, включая белки, богатые серином / аргинином. Следовательно, кодируемый белок может играть косвенную роль в управлении выбором сайта сплайсинга. ^[6]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что CLK1 взаимодействует с ASF / SF2 . ^[7]^[8]

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000013441 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026034 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Талмадж СВ, Finkernagel S, Sumegi Дж, Sciorra л, Рабинов л (декабрь 1998). «Хромосомное картирование трех генов, кодирующих протеинкиназу человека LAMMER». Hum Genet . 103 (4): 523–4. DOI : 10.1007 / s004390050861 . PMID 9856501 . S2CID 40593571 .
^ a b «Ген Entrez: CDC-подобная киназа 1 CLK1» .
^ Колвилл K, Feng LL, Yeakley JM, Gish GD, Касерес JF, Pawson T, Fu XD (октябрь 1996). «Протеинкиназы SRPK1 и Clk / Sty демонстрируют различные субстратные специфичности для факторов сплайсинга, богатых серином / аргинином» . J. Biol. Chem . 271 (40): 24569–75. DOI : 10.1074 / jbc.271.40.24569 . PMID 8798720 .
^ Умэхара Н, Nishii Y, Морисимы М, Kakehi Y, Kioka Н, Amachi Т, J Коидзой, Хагивар М, К Уеду (февраль 2003 г.). «Влияние лечения цисплатином на пятнистое распределение богатого серином / аргинином ядерного белка CROP / Luc7A». Биохим. Биофиз. Res. Commun . 301 (2): 324–9. DOI : 10.1016 / S0006-291X (02) 03017-6 . PMID 12565863 .

Внешние ссылки [ править ]

Расположение генома человека CLK1 и страница сведений о гене CLK1 в браузере генома UCSC .

Дальнейшее чтение [ править ]

Джонсон К.В., Смит К.А. (1991). «Молекулярное клонирование новой человеческой cdc2 / CDC28-подобной протеинкиназы». J. Biol. Chem . 266 (6): 3402–7. PMID 1704889 .
Бен-Дэвид Y, Летвин К., Таннок Л., Бернштейн А., Поусон Т. (1991). «Протеинкиназа млекопитающих с потенциалом фосфорилирования серина / треонина и тирозина связана с регуляторами клеточного цикла» . EMBO J . 10 (2): 317–25. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1991.tb07952.x . PMC 452648 . PMID 1825055 .
Ханес Дж, фон дер Каммер Х, Клаудины Дж, Шайт К.Х. (1995). «Характеристика клонированием кДНК двух новых протеинкиназ человека. Доказательства путем сравнения последовательностей нового семейства протеинкиназ млекопитающих». J. Mol. Биол . 244 (5): 665–72. DOI : 10.1006 / jmbi.1994.1763 . PMID 7990150 .
Колвилл К., Поусон Т., Эндрюс Б., Прасад Дж., Мэнли Дж. Л., Белл Дж. К., Дункан П. И. (1996). «Протеинкиназа Clk / Sty фосфорилирует факторы сплайсинга SR и регулирует их внутриядерное распределение» . EMBO J . 15 (2): 265–75. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00357.x . PMC 449941 . PMID 8617202 .
Колвилл К., Фэн Л.Л., Йикли Дж. М., Гиш Г. Д., Касерес Дж. Ф., Поусон Т., Фу XD (1996). «Протеинкиназы SRPK1 и Clk / Sty демонстрируют различные субстратные специфичности для факторов сплайсинга, богатых серином / аргинином» . J. Biol. Chem . 271 (40): 24569–75. DOI : 10.1074 / jbc.271.40.24569 . PMID 8798720 .
Нестель Ф.П., Колвилл К., Харпер С., Поусон Т., Андерсон С.К. (1997). «RS циклофилины: идентификация циклофилина, родственного NK-TR1». Джин . 180 (1–2): 151–5. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (96) 00436-2 . PMID 8973360 .
Moeslein FM, Myers MP, Landreth GE (1999). «Киназы семейства CLK, CLK1 и CLK2, фосфорилируют и активируют тирозинфосфатазу, PTP-1B» . J. Biol. Chem . 274 (38): 26697–704. DOI : 10.1074 / jbc.274.38.26697 . PMID 10480872 .
Менегей Х. Дж., Майерс М. П., Мослейн Ф. М., Ландрет Дж. Э. (2000). «Биохимическая характеристика и локализация киназы двойной специфичности CLK1». J. Cell Sci . 113 (18): 3241–53. PMID 10954422 .
Кодзима Т., Зама Т., Вада К., Оноги Х., Хагивара М. (2001). «Клонирование человеческого PRP4 обнаруживает взаимодействие с Clk1» . J. Biol. Chem . 276 (34): 32247–56. DOI : 10.1074 / jbc.M103790200 . PMID 11418604 .
Хартманн А.М., Руджеску Д., Джаннакурос Т., Николакаки Э., Годерт М., Мандельков Е.М., Гао К.С., Андредис А., Штамм С. (2001). «Регулирование альтернативного сплайсинга экзона 10 человеческого тау путем фосфорилирования факторов сплайсинга». Мол. Клетка. Neurosci . 18 (1): 80–90. DOI : 10.1006 / mcne.2001.1000 . PMID 11461155 . S2CID 18388526 .
Лай М.С., Линь Р.И., Тарн В.Й. (2003). «Дифференциальные эффекты гиперфосфорилирования на фактор сплайсинга SRp55» . Биохим. Дж . 371 (Pt 3): 937–45. DOI : 10.1042 / BJ20021827 . PMC 1223332 . PMID 12549978 .
Умехара Х., Нишии Ю., Моришима М., Какехи Ю., Киока Н., Амачи Т., Коидзуми Дж., Хагивара М., Уэда К. (2003). «Влияние лечения цисплатином на пятнистое распределение богатого серином / аргинином ядерного белка CROP / Luc7A». Биохим. Биофиз. Res. Commun . 301 (2): 324–9. DOI : 10.1016 / S0006-291X (02) 03017-6 . PMID 12565863 .
Кантам Л., Керр-Бейлс Л., Годд Н., Квик М., Уэбб Р., Сандерленд Т., Бонд Дж., Уолдер К., Огерт Г., Кольер Г. (2003). «Маяк взаимодействует с cdc2 / cdc28-подобными киназами». Биохим. Биофиз. Res. Commun . 304 (1): 125–9. DOI : 10.1016 / S0006-291X (03) 00549-7 . PMID 12705895 .
Прасад Дж., Мэнли Дж. Л. (2003). «Регулирование и субстратная специфичность протеинкиназы SR Clk / Sty» . Мол. Клетка. Биол . 23 (12): 4139–49. DOI : 10.1128 / MCB.23.12.4139-4149.2003 . PMC 156123 . PMID 12773558 .
Hillman RT, Green RE, Brenner SE (2005). «Недооцененная роль надзора за РНК» . Genome Biol . 5 (2): R8. DOI : 10.1186 / GB-2004-5-2-r8 . PMC 395752 . PMID 14759258 .
Мураки М., Окавара Б., Хосоя Т., Оноги Х., Коидзуми Дж., Коидзуми Т., Суми К., Йомода Дж., Мюррей М.В., Кимура Х., Фуруичи К., Сибуя Х., Крайнер А.Р., Судзуки М., Хагивара М. (2004). «Манипуляции альтернативным сплайсингом с помощью недавно разработанного ингибитора Clks» . J. Biol. Chem . 279 (23): 24246–54. DOI : 10.1074 / jbc.M314298200 . PMID 15010457 .
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Милштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот П.П., Видал М. (2005). «К карте протеомного масштаба сети белок-белкового взаимодействия человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. DOI : 10,1038 / природа04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .
Веласкес-Донес А., Хагопиан Дж. К., Ма CT, Чжун XY, Чжоу Х., Гош Г., Фу XD, Адамс Дж. А. (2006). «Масс-спектрометрический и кинетический анализ фосфорилирования ASF / SF2 с помощью SRPK1 и Clk / Sty» . J. Biol. Chem . 280 (50): 41761–8. DOI : 10.1074 / jbc.M504156200 . PMID 16223727 .

Эта статья о гене на хромосоме 2 человека - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000013441 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026034 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9856501-5] Талмадж СВ, Finkernagel S, Sumegi Дж, Sciorra л, Рабинов л (декабрь 1998). «Хромосомное картирование трех генов, кодирующих протеинкиназу человека LAMMER». Hum Genet . 103 (4): 523–4. DOI : 10.1007 / s004390050861 . PMID 9856501 . S2CID 40593571 .

[entrez-6] «Ген Entrez: CDC-подобная киназа 1 CLK1» .

[pmid8798720-7] Колвилл K, Feng LL, Yeakley JM, Gish GD, Касерес JF, Pawson T, Fu XD (октябрь 1996). «Протеинкиназы SRPK1 и Clk / Sty демонстрируют различные субстратные специфичности для факторов сплайсинга, богатых серином / аргинином» . J. Biol. Chem . 271 (40): 24569–75. DOI : 10.1074 / jbc.271.40.24569 . PMID 8798720 .

[pmid12565863-8] Умэхара Н, Nishii Y, Морисимы М, Kakehi Y, Kioka Н, Amachi Т, J Коидзой, Хагивар М, К Уеду (февраль 2003 г.). «Влияние лечения цисплатином на пятнистое распределение богатого серином / аргинином ядерного белка CROP / Luc7A». Биохим. Биофиз. Res. Commun . 301 (2): 324–9. DOI : 10.1016 / S0006-291X (02) 03017-6 . PMID 12565863 .

[1]