CNOT8

Идентификаторы

CNOT8 , CAF1, Калифорния, Caf1b, POP2, hCAF1, CCR4-НЕ транскрипционный комплекс субъединицы 8

Внешние идентификаторы

OMIM : 603731 MGI : 1916375 HomoloGene : 48304 GeneCards : CNOT8

Расположение гена ( человек )

Chr.	Хромосома 5 (человека) ^[1]

Группа	5q33.2	Начинать	154 857 553 п.н. ^[1]
Группа	5q33.2	Конец	154 876 792 п.н. ^[1]

Расположение гена ( Мышь )

Chr.	Хромосома 11 (мышь) ^[2]

Группа	11 \| 11 B1.3	Начинать	58 104 153 п.н. ^[2]
Группа	11 \| 11 B1.3	Конец	58 118 594 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• поли (A) -специфическая рибонуклеазная активность • 3'-5'-экзорибонуклеазная активность • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • Связывание с ионами металлов • Связывание с белками GO: 0001948 • связывания РНК • связывание нуклеиновой кислоты • нуклеазы активности • экзонуклеазной активности • гидролазная активность
Сотовый компонент	• цитоплазма • цитозоль • комплекс CCR4-NOT • внутриклеточное • ядро клетки • P-тельца • ядерный комплекс CCR4-NOT
Биологический процесс	• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • гидролиз фосфодиэфирной связи нуклеиновой кислоты • позитивная регуляция катаболического процесса мРНК • транскрипция, ДНК-шаблон • сайленсинг генов с помощью миРНК • позитивная регуляция клеточной пролиферации • экзонуклеолитический ядерно-транскрибируемый катаболический процесс мРНК, участвующий в деаденилировании- зависимый распад • молчание генов с помощью РНК • регуляция трансляции • негативная регуляция пролиферации клеток • ответ на повреждение ДНК, передача сигнала медиатором класса p53, приводящая к остановке клеточного цикла • Гидролиз фосфодиэфирной связи РНК, экзонуклеолитический • укорочение поли (A) хвоста мРНК, транскрибируемое ядром • негативная регуляция трансляции
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


9337


69125

Ансамбль


ENSG00000155508


ENSMUSG00000020515

UniProt


Q9UFF9


Q9D8X5

RefSeq (мРНК)

NM_001301073 NM_001301074 NM_001301075 NM_001301077 NM_001301080
NM_001301082 NM_001301083 NM_001301086 NM_004779


NM_026949 NM_001356477 NM_001363084 NM_001363085 NM_001363086

RefSeq (белок)

NP_001288002 NP_001288003 NP_001288004 NP_001288006 NP_001288009
NP_001288011 NP_001288012 NP_001288015 NP_004770


NP_081225 NP_001343406 NP_001350013 NP_001350014 NP_001350015

Расположение (UCSC)

Chr 5: 154,86 - 154,88 Мб

Chr 11: 58.1 - 58.12 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

CCR4-НЕ транскрипционный комплекс субъединица 8 представляет собой белок , который у человека кодируется CNOT8 гена . ^[5]^[6]^[7] Это субъединица комплекса CCR4-Not деаденилаза .

Взаимодействия [ править ]

CNOT8 взаимодействует с BTG2 , ^[8] BTG1 , ^[8]^[9] CNOT1 ^[6]^[10] и CNOT3 . ^[6]

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000155508 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020515 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Фидлер С, Wainscoat JS, Boultwood J (май 1999 г.). «Ген POP2 человека: идентификация, секвенирование и картирование критической области 5q-синдрома». Геномика . 56 (1): 134–6. DOI : 10.1006 / geno.1998.5687 . PMID 10036195 .
^ a b c Альберт Т.К., Лемер М, ван Беркум Н.Л., Генц Р., Колларт М.А., Тиммерс Х.Т. (март 2000 г.). «Выделение и характеристика человеческих ортологов дрожжевых субъединиц CCR4-NOT» . Nucleic Acids Res . 28 (3): 809–17. DOI : 10.1093 / NAR / 28.3.809 . PMC 102560 . PMID 10637334 .
^ «Энтрез Ген: CNOT8 CCR4-НЕ транскрипционный комплекс, субъединица 8» .
^ a b Прево Д., Морель А.П., Воельцель Т., Ростан М.С., Римох Р., Маго Дж. П., Корбо Л. (март 2001 г.). «Отношения антипролиферативных белков BTG1 и BTG2 с CAF1, человеческим гомологом компонента дрожжевого транскрипционного комплекса CCR4: участие в сигнальном пути рецептора эстрогена альфа» . J. Biol. Chem . 276 (13): 9640–8. DOI : 10.1074 / jbc.M008201200 . PMID 11136725 .
^ Руала ДФ, Венкатесан К, Хао Т, Hirozane-Kishikawa Т, Dricot А, Ли Н, Беррис Г.Ф., Джиббонс ФО, Дрезе М, Ayivi-Guedehoussou Н, Klitgord Н, Саймон С, Boxem М, Мильштейн S, Розенберг J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S , Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети белок-белкового взаимодействия человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . DOI : 10,1038 / природа04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .
^ Юинга Р. М., Чу Р, Р Elisma, Ли Н, Р Тейлор, Клими S, McBroom-Cerajewski л, Робинсон М. Д., О'Коннор л, Ли М, R Тейлор, Dharsee М, Хо У, Heilbut А, Мур л, Чжан С., Орнатский О., Бухман Ю.В., Этье М., Шенг Й., Василеску Дж., Абу-Фарха М., Ламберт Дж. П., Дьювель Х.С., Стюарт II, Кюль Б., Хог К, Колвилл К., Глэдвиш К., Маскат Б., Кинах Р., Адамс С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии» . Мол. Syst. Биол . 3 (1): 89. DOI : 10.1038 / msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Богдан Дж. А., Адамс-Бертон С., Педикорд Д. Л., Сукович Д. А., Бенфилд П. А., Корджай М. Х., Столтенборг Дж. К., Дикер И.Б. (1998). «Человеческий углеродный репрессорный белок катаболита (CCR4) -ассоциативный фактор 1: клонирование, экспрессия и характеристика его взаимодействия с белком транслокации B-клеток BTG1» . Биохим. Дж . 336 (Pt 2): 471–81. DOI : 10.1042 / bj3360471 . PMC 1219893 . PMID 9820826 .
Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2000). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Genome Res . 10 (11): 1788–95. DOI : 10.1101 / gr.143000 . PMC 310948 . PMID 11076863 .
Прево Д., Морель А.П., Воельцель Т., Ростан М.С., Римох Р., Магауд Дж. П., Корбо Л. (2001). «Отношения антипролиферативных белков BTG1 и BTG2 с CAF1, человеческим гомологом компонента дрожжевого транскрипционного комплекса CCR4: участие в сигнальном пути рецептора эстрогена альфа» . J. Biol. Chem . 276 (13): 9640–8. DOI : 10.1074 / jbc.M008201200 . PMID 11136725 .
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Обермайер Б., Тампе Дж., Хойбнер Д., Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Поустка А. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека» . Genome Res . 11 (3): 422–35. DOI : 10.1101 / гр . GR1547R . PMC 311072 . PMID 11230166 .
Симпсон Дж. С., Велленройтер Р., Поустка А., Пепперкок Р., Виманн С. (2000). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК» . EMBO Rep . 1 (3): 287–92. DOI : 10.1093 / embo-reports / kvd058 . PMC 1083732 . PMID 11256614 .
Морел А.П., Сентис С., Бьянчин С., Ле Романтик М., Джонард Л., Ростан М.С., Римох Р., Корбо Л. (2003). «Антипролиферативный белок BTG2 взаимодействует с комплексом CCR4 человека, существующим in vivo в трех формах, регулируемых клеточным циклом» . J. Cell Sci . 116 (Pt 14): 2929–36. DOI : 10,1242 / jcs.00480 . PMID 12771185 .
Wiemann S, Arlt D, Huber W, Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики» . Genome Res . 14 (10B): 2136–44. DOI : 10.1101 / gr.2576704 . PMC 528930 . PMID 15489336 .
Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И., дель Валь С., Арльт Д., Хане Ф., Бектель С., Симпсон Дж., Хофманн О., Хиде В., Глаттинг К. Х., Хубер В., Пепперкок Р., Поустка А., Виманн С. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году» . Nucleic Acids Res . 34 (Проблема с базой данных): D415-8. DOI : 10.1093 / NAR / gkj139 . PMC 1347501 . PMID 16381901 .
Дорфлейтнер А., Брайан Н.Б., Тэлботт С.Дж., Фунья К.Н., Реллик С.Л., Рид Дж.С., Ши Х, Рожанасакул Ю. «Клеточный белок 2, содержащий только пириновый домен, является кандидатом в регулятор активации инфламмасом» . Заразить. Иммун . 75 (3): 1484–92. DOI : 10.1128 / IAI.01315-06 . PMC 1828547 . PMID 17178784 .

Внешние ссылки [ править ]

Человек CNOT8 место генома и CNOT8 ген подробно страницу в браузере УСК генома .

Эта статья о гене в хромосоме 5 человека - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000155508 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020515 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10036195-5] Фидлер С, Wainscoat JS, Boultwood J (май 1999 г.). «Ген POP2 человека: идентификация, секвенирование и картирование критической области 5q-синдрома». Геномика . 56 (1): 134–6. DOI : 10.1006 / geno.1998.5687 . PMID 10036195 .

[pmid10637334-6] Альберт Т.К., Лемер М, ван Беркум Н.Л., Генц Р., Колларт М.А., Тиммерс Х.Т. (март 2000 г.). «Выделение и характеристика человеческих ортологов дрожжевых субъединиц CCR4-NOT» . Nucleic Acids Res . 28 (3): 809–17. DOI : 10.1093 / NAR / 28.3.809 . PMC 102560 . PMID 10637334 .

[entrez-7] «Энтрез Ген: CNOT8 CCR4-НЕ транскрипционный комплекс, субъединица 8» .

[pmid11136725-8] Прево Д., Морель А.П., Воельцель Т., Ростан М.С., Римох Р., Маго Дж. П., Корбо Л. (март 2001 г.). «Отношения антипролиферативных белков BTG1 и BTG2 с CAF1, человеческим гомологом компонента дрожжевого транскрипционного комплекса CCR4: участие в сигнальном пути рецептора эстрогена альфа» . J. Biol. Chem . 276 (13): 9640–8. DOI : 10.1074 / jbc.M008201200 . PMID 11136725 .

[pmid16189514-9] Руала ДФ, Венкатесан К, Хао Т, Hirozane-Kishikawa Т, Dricot А, Ли Н, Беррис Г.Ф., Джиббонс ФО, Дрезе М, Ayivi-Guedehoussou Н, Klitgord Н, Саймон С, Boxem М, Мильштейн S, Розенберг J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S , Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети белок-белкового взаимодействия человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . DOI : 10,1038 / природа04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .

[pmid17353931-10] Юинга Р. М., Чу Р, Р Elisma, Ли Н, Р Тейлор, Клими S, McBroom-Cerajewski л, Робинсон М. Д., О'Коннор л, Ли М, R Тейлор, Dharsee М, Хо У, Heilbut А, Мур л, Чжан С., Орнатский О., Бухман Ю.В., Этье М., Шенг Й., Василеску Дж., Абу-Фарха М., Ламберт Дж. П., Дьювель Х.С., Стюарт II, Кюль Б., Хог К, Колвилл К., Глэдвиш К., Маскат Б., Кинах Р., Адамс С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии» . Мол. Syst. Биол . 3 (1): 89. DOI : 10.1038 / msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .

[1]