удлинение транскрипции от промотора РНК-полимеразы II
регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
транскрипция РНК-полимеразой II
негативная регуляция элонгации транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
транскрипция, ДНК-шаблон
негативная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
пролиферация клеточной популяции
дифференцировка стволовых клеток
негативная регуляция дифференцировки стволовых клеток
позитивная регуляция вирусной транскрипции
Источники: Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность
Человек
мышь
Энтрез
25920
58202
Ансамбль
ENSG00000188986
ЭНСМУСГ00000013465
ЮниПрот
Q8WX92
Q8C4Y3
RefSeq (мРНК)
NM_015456
NM_021393 NM_001310157
RefSeq (белок)
NP_056271
НП_001297086 НП_067368
Местоположение (UCSC)
Хр 9: 137,26 – 137,27 Мб
Хр 2: 25,2 – 25,21 Мб
Поиск в пабмеде
[3]
[4]
Викиданные
Просмотр/редактирование человека
Просмотр/редактирование мыши
Кофактор BRCA1 , также известный как COBRA1 , представляет собой человеческий ген [5] , который кодирует NELF-B.
Содержание
1 функция
2 взаимодействия
3 ссылки
4 Дополнительная литература
Функция
NELF-B является субъединицей отрицательного фактора удлинения (NELF) , который также включает NELF-A ( WHSC2 ; MIM 606026), NELF-C или NELF-D (TH1L; MIM 605297) и NELF-E ( RDBP ; MIM 606026). 154040). NELF действует с фактором, индуцирующим чувствительность DRB ( DSIF ), гетеродимером SPT4 (SUPT4H1; MIM 603555) и SPT5 (SUPT5H; MIM 602102), вызывая приостановку транскрипции РНК-полимеразы II (см. MIM 180660). [6] COBRA1 был первоначально идентифицирован в двухгибридном скрининге дрожжей с использованием домена BRCT1 BRCA1 в качестве приманки. [7]
Взаимодействия
Было показано, что кофактор BRCA1 взаимодействует с:
BRCA1 [8]
С-Фос , [9]
Си-Джун , [9]
Рецептор эстрогена альфа , [10]
RDBP , [11] [12] и
TH1L . [11] [13]
использованная литература
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000188986 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000013465 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Справочник по PubMed для людей:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ "Справочник по PubMed для мыши:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ген Entrez: кофактор COBRA1 BRCA1» .
^ Нарита Т., Ямагути Ю., Яно К., Сугимото С., Чанарат С., Вада Т., Ким Д.К., Хасэгава Дж., Омори М., Инукай Н., Эндох М., Ямада Т., Ханда Х. (2003). «Фактор удлинения транскрипции человека NELF: идентификация новых субъединиц и восстановление функционально активного комплекса» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (6): 1863–1873. doi : 10.1128/MCB.23.6.1863-1873.2003 . ПВК 149481 . PMID 12612062 .
^ Ye Q, Hu YF, Zhong H, Nye AC, Belmont AS, Li R (2001). «Вызванное BRCA1 крупномасштабное развертывание хроматина и аллель-специфические эффекты предрасполагающих к раку мутаций» . Журнал клеточной биологии . 155 (6): 911–922. doi : 10.1083/jcb.200108049 . ПМК 2150890 . PMID 11739404 .
↑ Ye Q, Hu YF, Zhong H, Nye AC, Belmont AS, Li R (декабрь 2001 г.). «Вызванное BRCA1 крупномасштабное развертывание хроматина и аллель-специфические эффекты предрасполагающих к раку мутаций» . Дж. Клеточная биология . 155 (6): 911–921. doi : 10.1083/jcb.200108049 . ПМК 2150890 . PMID 11739404 .
^ a b Чжун Х., Чжу Дж., Чжан Х., Дин Л., Сунь Й., Хуан С., Е К. (декабрь 2004 г.). «COBRA1 ингибирует транскрипционную активность AP-1 в трансфицированных клетках». Биохим. Биофиз. Рез. коммун . 325 (2): 568–573. doi : 10.1016/j.bbrc.2004.10.079 . PMID 15530430 .
↑ Айяр С.Э., Сан Дж.Л., Блэр А.Л., Москалюк К.А., Лу Ю.З., Йе К.Н., Ямагучи Ю., Мукерджи А., Рен Д.М., Ханда Х., Ли Р. (сентябрь 2004 г.). «Ослабление транскрипции, опосредованной альфа-рецептором эстрогена, за счет стимулированного эстрогеном рекрутирования отрицательного фактора удлинения» . Джинс Дев . 18 (17): 2134–2146. doi : 10.1101/gad.1214104 . ПМС 515291 . PMID 15342491 .
^ a b Нарита Т., Ямагути Ю., Яно К., Сугимото С., Чанарат С., Вада Т., Ким Д.К., Хасегава Дж., Омори М., Инукай Н., Эндох М., Ямада Т., Ханда Х. (март 2003 г.). «Человеческий фактор элонгации транскрипции NELF: идентификация новых субъединиц и восстановление функционально активного комплекса» . Мол. Клетка. биол . 23 (6): 1863–1873. doi : 10.1128/MCB.23.6.1863-1873.2003 . ПВК 149481 . PMID 12612062 .
↑ Ленер Б., Семпл Дж. И., Браун С. Е., Адвокат Д., Кэмпбелл Р. Д., Сандерсон К. М. (январь 2004 г.). «Анализ высокопроизводительной двухгибридной системы дрожжей и ее использование для прогнозирования функции внутриклеточных белков, закодированных в области MHC класса III человека». Геномика . 83 (1): 153–167. doi : 10.1016/S0888-7543(03)00235-0 . PMID 14667819 .
^ Юинг Р.М., Чу П., Элисма Ф., Ли Х., Тейлор П., Клими С., МакБрум-Цераевски Л., Робинсон М.Д., О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дарси М., Хо И, Хейлбут А., Мур Л., Чжан С., Орнацкий О., Бухман Ю.В., Этьер М., Шэн Ю., Василеску Дж., Абу-Фарха М., Ламберт Дж.П., Дьюэл Х.С., Стюарт II, Кюль Б., Хог К., Колвилл К., Гладвиш К., Мускат Б., Кинач Р., Адамс С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглу Т., Фигейс Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии» . Мол. Сист. биол . 3 : 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .
дальнейшее чтение
Стивенс М., Де Клерк Э., Бальзарини Дж. (2007). «Регулирование транскрипции ВИЧ-1: молекулярные мишени для химиотерапевтического вмешательства» . Мед. Res Rev. 26 (5): 595–625. doi : 10.1002/med.20081 . ПВК 7168390 . PMID 16838299 .
Ямагути Ю., Такаги Т., Вада Т., Яно К., Фуруя А., Сугимото С., Хасэгава Дж., Ханда Х. (1999). «NELF, мультисубъединичный комплекс, содержащий RD, взаимодействует с DSIF для подавления удлинения РНК-полимеразы II» . Сотовый . 97 (1): 41–51. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80713-8 . PMID 10199401 . S2CID 16855257 .
Хиросава М., Нагасе Т., Исикава К., Кикуно Р., Номура Н., Охара О. (2000). «Характеристика клонов кДНК, отобранных с помощью анализа GeneMark из фракционированных по размеру библиотек кДНК из головного мозга человека» . Рез.ДНК . 6 (5): 329–336. doi : 10.1093/dnares/6.5.329 . PMID 10574461 .
Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш М. А. (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфичной рекомбинации in vitro» . Геном Рез . 10 (11): 1788–1795. doi : 10.1101/гр.143000 . ПВК 310948 . PMID 11076863 .
Пинг Ю.Х., Рана ТМ (2001). «DSIF и NELF взаимодействуют с комплексом элонгации РНК-полимеразы II, а Tat ВИЧ-1 стимулирует P-TEFb-опосредованное фосфорилирование РНК-полимеразы II и DSIF во время элонгации транскрипции» . Дж. Биол. хим . 276 (16): 12951–12958. doi : 10.1074/jbc.M006130200 . PMID 11112772 .
Виманн С., Вайль Б., Велленройтер Р., Гассенхубер Дж., Глассль С., Ансорге В., Бёхер М., Блёкер Х., Бауэрсахс С., Блюм Х., Лаубер Дж., Дюстерхёфт А., Бейер А., Кёрер К., Штрак Н., Мевес Х.В., Оттенвальдер Б. , Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (2001). «На пути к каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека» . Геном Рез . 11 (3): 422–435. doi : 10.1101/gr.GR1547R . ПМС 311072 . PMID 11230166 .
Симпсон Дж. К., Велленройтер Р., Пустка А., Пепперкок Р., Виманн С. (2001). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированная с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК» . Представитель EMBO . 1 (3): 287–292. doi : 10.1093/embo-reports/kvd058 . ПМС 1083732 . PMID 11256614 .
Ye Q, Hu YF, Zhong H, Nye AC, Belmont AS, Li R (2002). «Вызванное BRCA1 крупномасштабное развертывание хроматина и аллель-специфические эффекты предрасполагающих к раку мутаций» . Дж. Клеточная биология . 155 (6): 911–921. doi : 10.1083/jcb.200108049 . ПМК 2150890 . PMID 11739404 .
Нарита Т., Ямагути Ю., Яно К., Сугимото С., Чанарат С., Вада Т., Ким Д.К., Хасэгава Дж., Омори М., Инукай Н., Эндох М., Ямада Т., Ханда Х. (2003). «Фактор удлинения транскрипции человека NELF: идентификация новых субъединиц и восстановление функционально активного комплекса» . Мол. Клетка. биол . 23 (6): 1863–1873. doi : 10.1128/MCB.23.6.1863-1873.2003 . ПВК 149481 . PMID 12612062 .
Ленер Б., Семпл Дж. И., Браун С. Е., Адвокат Д., Кэмпбелл Р. Д., Сандерсон К. М. (2004). «Анализ высокопроизводительной двухгибридной системы дрожжей и ее использование для прогнозирования функции внутриклеточных белков, закодированных в области MHC класса III человека». Геномика . 83 (1): 153–167. doi : 10.1016/S0888-7543(03)00235-0 . PMID 14667819 .
Чжу Дж., Сун С., Цзян З., Ян Дж., Лу Ц., Хуан С., Е Ц. (2005). «Характеристика COBRA1 в клеточных линиях рака молочной железы человека с использованием нового поликлонального антитела против COBRA1». Жизнь ИУБМБ . 56 (3): 161–166. дои : 10.1080/15216540410001699826 . PMID 15185750 . S2CID 31137609 .
Босолей С.А., Джедрыховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М.А., Кэнтли Л.С., Гиги С.П. (2004). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . проц. Натл. акад. науч. США . 101 (33): 12130–12135. Бибкод : 2004PNAS..10112130B . doi : 10.1073/pnas.0404720101 . ПВК 514446 . PMID 15302935 .
Айяр С.Э., Сан Дж.Л., Блэр А.Л., Москалюк К.А., Лу Ю.З., Йе К.Н., Ямагучи Ю., Мукерджи А., Рен Д.М., Ханда Х., Ли Р. (2004). «Ослабление транскрипции, опосредованной рецептором эстрогена α, за счет стимулированного эстрогеном рекрутирования отрицательного фактора удлинения» . Джинс Дев . 18 (17): 2134–2146. doi : 10.1101/gad.1214104 . ПМС 515291 . PMID 15342491 .
Виманн С., Арльт Д., Хубер В., Велленройтер Р., Шлегер С., Мерле А., Бехтель С., Зауэрманн М., Корф У., Пепперкок Р., Зюльтманн Х., Поустка А. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики» . Геном Рез . 14 (10Б): 2136–2144. doi : 10.1101/gr.2576704 . ПМС 528930 . PMID 15489336 .
Чжун Х., Чжу Дж., Чжан Х., Дин Л., Сунь И., Хуанг С., Е К. (2005). «COBRA1 ингибирует транскрипционную активность AP-1 в трансфицированных клетках». Биохим. Биофиз. Рез. коммун . 325 (2): 568–573. doi : 10.1016/j.bbrc.2004.10.079 . PMID 15530430 .
Мерле А., Розенфельдер Х., Шупп И., дель Вал С., Арльт Д., Хане Ф., Бехтель С., Симпсон Дж., Хофманн О., Хиде В., Глаттинг К.Х., Хубер В., Пепперкок Р., Поустка А., Виманн С. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году» . Нуклеиновые Кислоты Рез . 34 (выпуск базы данных): D415–8. doi : 10.1093/нар/gkj139 . ПМС 1347501 . PMID 16381901 .
Макчесни П.А., Айяр С.Е., Ли О.Дж., Зайка А., Москалюк С., Ли Р., Эль-Рифаи В. (2006). «Кофактор BRCA1: новый регулятор фактора транскрипции при аденокарциномах верхних отделов желудочно-кишечного тракта» . Рак Рез . 66 (3): 1346–1353. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-05-3593 . PMID 16452188 .
