Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлено с COL4A2 )
Перейти к навигации Перейти к поиску
COL4A2
Белок COL4A2 PDB 1li1.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

1LI1

Идентификаторы
ПсевдонимыCOL4A2 , ICH, POREN2, коллаген типа IV альфа 2, коллаген типа IV альфа 2 цепь, BSVD2
Внешние идентификаторыOMIM: 120090 MGI: 88455 HomoloGene: 1390 Генные карты : COL4A2
Расположение гена (человек)
Хромосома 13 (человек)
Chr.Хромосома 13 (человека) [1]
Хромосома 13 (человек)
Геномное расположение COL4A2
Геномное расположение COL4A2
Группа13q34Начинать110 305 812 п.н. [1]
Конец110 513 209 п.н. [1]
Расположение гена (Мышь)
Хромосома 8 (мышь)
Chr.Хромосома 8 (мышь) [2]
Хромосома 8 (мышь)
Геномное расположение COL4A2
Геномное расположение COL4A2
Группа8 A1.1 | 8 5,62 смНачинать11 312 805 п.н. [2]
Конец11 449 287 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE COL4A2 211964 в fs.png

PBB GE COL4A2 211966 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Онтология генов
Молекулярная функция• структурный компонент внеклеточного матрикса
• связывание с белками GO: 0001948
• структурный компонент внеклеточного матрикса, придающий прочность на разрыв
Сотовый компонент• внеклеточный матрикс
• внеклеточная область
• базальная мембрана
• коллаген
• тример коллагена IV типа
• просвет эндоплазматического ретикулума
• внеклеточная экзосома
• внеклеточная
• внеклеточная матрица, содержащая коллаген
Биологический процесс• катаболический процесс коллагена
• негативная регуляция ангиогенеза
• клеточный ответ на бета-стимул трансформирующего фактора роста
• организация внеклеточного матрикса
• дифференцировка энтодермальных клеток
• ангиогенез
• транскрипция, ДНК-шаблон
• сигнальный путь рецептора тирозинкиназы, активируемый коллагеном
• старение
• реакция на активность
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

1284

12827

Ансамбль

ENSG00000134871

ENSMUSG00000031503

UniProt

P08572

P08122

RefSeq (мРНК)

NM_001846

NM_009932

RefSeq (белок)

NP_001837

NP_034062

Расположение (UCSC)Chr 13: 110.31 - 110.51 МбChr 8: 11.31 - 11.45 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Коллаген альфа-2 (IV) , цепь представляет собой белок , который у человека кодируется COL4A2 гена . [5] [6] [7]

Этот ген кодирует одну из шести субъединиц коллагена IV типа , основного структурного компонента базальных мембран . С-концевая часть белка, известная как канстатин, является ингибитором ангиогенеза и роста опухоли . Подобно другим членам семейства генов коллагена IV типа, этот ген организован в конформации «голова к голове» с другим геном коллагена IV типа, так что каждая пара генов имеет общий промотор. [7]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000134871 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031503 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ↑ Myers JC, Howard PS, Jelen AM, Dion AS, Macarak EJ (август 1987). «Дупликация COOH-концевых повторов коллагена IV типа и видоспецифическая экспрессия генов коллагена альфа 1 (IV) и альфа 2 (IV)». J Biol Chem . 262 (19): 9231–8. PMID 2439508 . 
  6. ^ Griffin CA, Emanuel BS, Hansen JR, Cavenee WK, Майерс JC (февраль 1987). «Гены человеческого коллагена, кодирующие альфа 1 (IV) и альфа 2 (IV) цепи базальной мембраны, картируются в дистальном длинном плече хромосомы 13» . Proc Natl Acad Sci USA . 84 (2): 512–6. DOI : 10.1073 / pnas.84.2.512 . PMC 304239 . PMID 3025878 .  
  7. ^ a b «Ген Энтреза: коллаген COL4A2, тип IV, альфа 2» .

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Хинек А (1995). «Природа и многочисленные функции связывающего эластин / ламинин белка 67 кДа». Сотовые клеи. Commun . 2 (3): 185–93. DOI : 10.3109 / 15419069409004436 . PMID  7827955 .
  • Штендер М., Науманн Ю., Вик В., Веллер М. (1999). «Трансформирующий фактор роста-бета и p-21: множественные молекулярные мишени опосредованного декорином подавления неопластического роста». Cell Tissue Res . 296 (2): 221–7. DOI : 10.1007 / s004410051283 . PMID  10382266 .
  • Курпакус Уитер М, Кернаки К.А., Хазлетт Л.Д. (1999). «Белки клеток роговицы и патология глазной поверхности». Биотехника и гистохимия . 74 (3): 146–59. DOI : 10.3109 / 10520299909047967 . PMID  10416788 .
  • Каллури Р., Сухатме В.П. (2000). «Фиброз и ангиогенез». Curr. Мнение. Нефрол. Гипертензии . 9 (4): 413–8. DOI : 10.1097 / 00041552-200007000-00013 . PMID  10926178 .
  • Ghebrehiwet B, Peerschke EI, Hong Y, et al. (1992). «Короткие аминокислотные последовательности, происходящие от рецептора C1q (C1q-R), демонстрируют гомологию с альфа-цепями рецепторов фибронектина и витронектина и коллагена типа IV». J. Leukoc. Биол . 51 (6): 546–56. DOI : 10.1002 / jlb.51.6.546 . PMID  1377218 .
  • Гупта С., Батчу РБ, Датта К. (1992). «Очистка, частичная характеристика связывающего гиалуроновую кислоту белка почки крысы и его локализация на поверхности клетки». Евро. J. Cell Biol . 56 (1): 58–67. PMID  1724753 .
  • Паралкар В.М., Нандедкар А.К., Пойнтер Р.Х. и др. (1990). «Взаимодействие остеогенина, гепарин-связывающего костного морфогенетического белка, с коллагеном IV типа». J. Biol. Chem . 265 (28): 17281–4. PMID  2211625 .
  • Эрнандес М.Р., Иго Ф., Нойфельд А.Х. (1986). «Внеклеточный матрикс головки зрительного нерва человека». Являюсь. J. Ophthalmol . 102 (2): 139–48. DOI : 10.1016 / 0002-9394 (86) 90134-0 . PMID  2426947 .
  • Зибольд Б., Дойцманн Р., Кюн К. (1988). «Расположение внутри- и межмолекулярных дисульфидных связей в карбоксиконцевой, неколлагеновой агрегации и сшивающем домене коллагена типа IV базальной мембраны». Евро. J. Biochem . 176 (3): 617–24. DOI : 10.1111 / j.1432-1033.1988.tb14321.x . PMID  2844531 .
  • Пёшль Э, Поллнер Р., Кюн К. (1988). «Гены альфа 1 (IV) и альфа 2 (IV) цепей человеческого коллагена базальной мембраны типа IV расположены друг к другу и разделены двунаправленным промотором уникальной структуры» . EMBO J . 7 (9): 2687–95. PMC  457057 . PMID  2846280 .
  • Мурата К., Мотаяма Т., Котаке С. (1986). «Типы коллагена в различных слоях аорты человека и их изменения при атеросклеротическом процессе». Атеросклероз . 60 (3): 251–62. DOI : 10.1016 / 0021-9150 (86) 90172-3 . PMID  3089234 .
  • Сойнинен Р., Хуотари М., Хостикка С.Л. и др. (1988). «Структурные гены альфа-1 и альфа-2 цепей коллагена человека IV типа дивергентно кодируются на противоположных цепях ДНК и имеют перекрывающуюся промоторную область». J. Biol. Chem . 263 (33): 17217–20. PMID  3182844 .
  • Hostikka SL, Tryggvason K (1989). «Полная первичная структура альфа 2 цепи человеческого коллагена IV типа и сравнение с альфа 1 (IV) цепью». J. Biol. Chem . 263 (36): 19488–93. PMID  3198637 .
  • Brazel D, Pollner R, Oberbäumer I, Kühn K (1988). «Коллаген базальной мембраны человека (тип IV). Аминокислотная последовательность цепи альфа 2 (IV) и ее сравнение с цепью альфа 1 (IV) выявляют делеции в цепи альфа 1 (IV)». Евро. J. Biochem . 172 (1): 35–42. DOI : 10.1111 / j.1432-1033.1988.tb13852.x . PMID  3345760 .
  • Хостикка С.Л., Куркинен М., Трюггвасон К. (1987). «Нуклеотидная последовательность, кодирующая кДНК альфа 2 цепи коллагена типа IV человека, обнаруживает обширную гомологию с доменом NC-1 альфа 1 (IV), но не с коллагеновым доменом или 3'-нетранслируемой областью» . FEBS Lett . 216 (2): 281–6. DOI : 10.1016 / 0014-5793 (87) 80706-8 . PMID  3582677 .
  • Killen PD, Francomano CA, Yamada Y, et al. (1988). «Частичная структура цепи человеческого альфа 2 (IV) коллагена и хромосомная локализация гена (COL4A2)». Гм. Genet . 77 (4): 318–24. DOI : 10.1007 / BF00291418 . PMID  3692475 .
  • Glant TT, Hadházy C, Mikecz K, Sipos A (1985). «Внешний вид и устойчивость фибронектина в хрящах. Специфическое взаимодействие фибронектина с коллагеном II типа». Гистохимия . 82 (2): 149–58. DOI : 10.1007 / bf00708199 . PMID  3997552 .
  • Усканга Л., Кеннеди Р.Х., Стокер С. и др. (1984). «Иммунолокализация типов коллагена, ламинина и фибронектина в нормальной поджелудочной железе человека». Пищеварение . 30 (3): 158–64. DOI : 10.1159 / 000199100 . PMID  6389236 .