Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлено с COL5A3 )
Перейти к навигации Перейти к поиску
COL5A3
Идентификаторы
ПсевдонимыCOL5A3 , альфа-3 цепь коллагена V типа
Внешние идентификаторыOMIM : 120216 MGI : 1858212 HomoloGene : 9253 GeneCards : COL5A3
Расположение гена ( человек )
Хромосома 19 (человек)
Chr.Хромосома 19 (человека) [1]
Хромосома 19 (человек)
Геномное расположение COL5A3
Геномное расположение COL5A3
Группа19p13.2Начинать9 959 561 п.н. [1]
Конец10 010 504 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 9 (мышь)
Chr.Хромосома 9 (мышь) [2]
Хромосома 9 (мышь)
Геномное расположение COL5A3
Геномное расположение COL5A3
Группа9 | 9 A3Начинать20 770 050 п.н. [2]
Конец20 815 067 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE COL5A3 52255 s в формате fs.png

PBB GE COL5A3 218975 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• связывание гепарина
• структурный компонент внеклеточного матрикса
• связывание коллагена
• структурный компонент внеклеточного матрикса, придающий прочность на разрыв
• связывание протеогликана
Сотовый компонент• тример коллагена типа V
• внеклеточная область
• тример коллагена
• просвет эндоплазматического ретикулума
• внеклеточный матрикс GO: 0005578
• внеклеточное пространство
• внеклеточный матрикс, содержащий коллаген
Биологический процесс• катаболический процесс коллагена
• адгезия клеточного матрикса
• организация внеклеточного матрикса
• развитие кожи
• организация фибрилл коллагена
• адгезия клеток
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

50509

53867

Ансамбль

ENSG00000080573

ENSMUSG00000004098

UniProt

P25940

Q9JLI2

RefSeq (мРНК)

NM_015719

NM_016919
NM_001317388

RefSeq (белок)

NP_056534

NP_001304317
NP_058615

Расположение (UCSC)Chr 19: 9.96 - 10.01 МбChr 9: 20,77 - 20,82 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Коллаген альфа-3 (V) , цепь представляет собой белок , который у человека кодируется COL5A3 гена . [5] [6]

Этот ген кодирует альфа-цепь одного из фибриллярных коллагенов с низким содержанием. Молекулы фибриллярного коллагена представляют собой тримеры, которые могут состоять из одного или нескольких типов альфа-цепей. Коллаген V типа обнаруживается в тканях, содержащих коллаген I типа, и, по-видимому, регулирует сборку гетеротипических волокон, состоящих как из коллагена I, так и V типа. Этот генный продукт тесно связан с коллагеном типа XI, и возможно, что цепи коллагена типов V и XI составляют один тип коллагена с тканеспецифическими комбинациями цепей. Считается, что мутации в этом гене ответственны за симптомы подгруппы пациентов с синдромом Элерса-Данлоса типа III. Сообщения нескольких размеров могут быть обнаружены в нозерн-блотах, но информация о последовательности не может подтвердить идентичность более коротких сообщений. [6]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000080573 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000004098 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. Перейти ↑ Imamura Y, Scott IC, Greenspan DS (апрель 2000). «Цепь коллагена про-альфа3 (V). Полная первичная структура, домены экспрессии во взрослых и развивающихся тканях, и сравнение со структурами и доменами экспрессии других цепей проколлагена V и XI типов» . J Biol Chem . 275 (12): 8749–59. DOI : 10.1074 / jbc.275.12.8749 . PMID 10722718 . 
  6. ^ a b «Ген Энтреса: коллаген COL5A3, тип V, альфа 3» .

Дальнейшее чтение [ править ]

  • ван дер Рест М., Гарроне Р. (1991). «Коллагеновое семейство белков». FASEB J . 5 (13): 2814–23. DOI : 10.1096 / fasebj.5.13.1916105 . PMID  1916105 . S2CID  11261357 .
  • Фичард А., Клеман Дж. П., Руджеро Ф (1996). «Еще один взгляд на молекулы коллагена V и XI». Matrix Biol . 14 (7): 515–31. DOI : 10.1016 / S0945-053X (05) 80001-0 . PMID  8535602 .
  • Манн К. (1992). «Выделение альфа-3-цепи человеческого коллагена V типа и характеристика путем частичного секвенирования». Биол. Chem. Хоппе-Зейлер . 373 (2): 69–75. DOI : 10.1515 / bchm3.1992.373.1.69 . PMID  1571108 .
  • Нийибизи С., Фицек П.П., ван дер Рест М. (1984). «Коллагены плаценты человека типа V. Доказательства существования молекулы коллагена альфа 1 (V) альфа 2 (V) альфа 3 (V)». J. Biol. Chem . 259 (22): 14170–4. PMID  6501291 .
  • Абедин MZ, Ayad S, Weiss JB (1982). «Выделение и естественная характеристика богатых цистеином коллагенов из тканей плаценты и матки крупного рогатого скота и их связь с типами IV и V коллагенов». Biosci. Rep . 2 (7): 493–502. DOI : 10.1007 / BF01115247 . PMID  7115902 . S2CID  22620593 .
  • Родс Р.К., Миллер Э.Дж. (1982). «Доказательства существования молекулы коллагена альфа 1 (V) альфа 2 (V) альфа 3 (V) в ткани плаценты человека». Coll. Relat. Res . 1 (4): 337–43. DOI : 10.1016 / S0174-173X (81) 80010-6 . PMID  7346227 .
  • Кипреос К.Е., Соненшейн Г.Е. (1998). «Основной фактор роста фибробластов снижает экспрессию коллагена типа V / XI в культивируемых клетках гладких мышц аорты крупного рогатого скота». J. Cell. Биохим . 68 (2): 247–58. DOI : 10.1002 / (SICI) 1097-4644 (19980201) 68: 2 <247 :: AID-JCB11> 3.0.CO; 2-C . PMID  9443080 .
  • Chanut-Delalande H, Fichard A., Bernocco S, et al. (2001). «Контроль образования гетеротипических фибрилл коллагеном V определяется стехиометрией цепи» . J. Biol. Chem . 276 (26): 24352–9. DOI : 10.1074 / jbc.M101182200 . PMID  11423559 .
  • Гопалакришнан Б., Ван В. М., Гринспен Д. С. (2004). «Биосинтетический процессинг проколлагенового гетеротримера Pro-alpha1 (V) Pro-alpha2 (V) Pro-alpha3 (V)» . J. Biol. Chem . 279 (29): 30904–12. DOI : 10.1074 / jbc.M402252200 . PMID  15136578 .
  • Нагато Х., Мацуо Н., Сумиёси Х. и др. (2004). «Фактор транскрипции CCAAT-связывающий фактор CBF / NF-Y и два репрессора регулируют основной промотор гена коллагена про-альфа3 (V) человека (COL5A3)» . J. Biol. Chem . 279 (45): 46373–83. DOI : 10.1074 / jbc.M406069200 . PMID  15316020 .


  • v
  • т
  • е