COPS6

Доступные конструкции

Ортолог поиск: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
4D10 , 4D18 , 4QFT , 4R14 , 4WSN

Идентификаторы

Псевдонимы

COPS6 , CSN6 , MOV34-34KD, COP9 сигнальная субъединица 6

Внешние идентификаторы

OMIM : 614729 MGI : 1349439 HomoloGene : 4977 GeneCards : COPS6

Расположение гена ( человек )

Chr.	Хромосома 7 (человек) ^[1]

Группа	7q22.1	Начинать	100 088 969 п.н. ^[1]
Группа	7q22.1	Конец	100 092 187 п.н. ^[1]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• Связывание с белком GO: 0001948
Сотовый компонент	• цитоплазма • сигналосома COP9 • ядро • нуклеоплазма • цитозоль
Биологический процесс	• эксцизионная репарация нуклеотидов, связанная с транскрипцией • Вирусный процесс GO: 0022415 • эксцизионная репарация нуклеотидов, распознавание повреждений ДНК • денддилирование белка • посттрансляционная модификация белка
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


10980


26893

Ансамбль


ENSG00000168090


ENSMUSG00000019494

UniProt


Q7L5N1


O88545

RefSeq (мРНК)


NM_006833


NM_012002

RefSeq (белок)


NP_006824


NP_036132

Расположение (UCSC)

Chr 7: 100.09 - 100.09 Мб

н / д

PubMed поиск

^[2]

^[3]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Сигналосома cop9 комплекс субъединица 6 представляет собой белок , который у человека кодируется COPS6 гена . ^[4]

Функция [ править ]

Белок, кодируемый этим геном, является одной из восьми субъединиц сигнаносомы COP9, высококонсервативного белкового комплекса, который функционирует как важный регулятор во множестве сигнальных путей. Сигналосома COP9 по структуре и функциям аналогична 19S-регуляторной частице 26S-протеасомы. Было показано, что сигналосома COP9 взаимодействует с убиквитинлигазами E3 SCF-типа и действует как положительный регулятор убиквитинлигаз E3. Этот белок принадлежит к суперсемейству фактора инициации трансляции 3 (eIF3). Он участвует в регуляции клеточного цикла и, вероятно, является клеточным кофактором для продукта вспомогательного гена ВИЧ-1 Vpr. ^[5]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что COPS6 взаимодействует с EIF3S6 . ^[6]

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000168090 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, Derge JG, Klausner RD, Collins FS, Wagner L, Shenmen CM, Schuler GD, Altschul SF, Zeeberg B, Buetow KH, Schaefer CF, Bhat NK, Hopkins RF, Jordan H, Moore T. , Макс С.И., Ван Дж., Се Ф., Дьяченко Л., Марусина К., Фармер А.А., Рубин Г.М., Хонг Л., Стэплтон М., Соарес МБ, Боналдо М.Ф., Казавант Т.Л., Шитц Т.Э., Браунштейн М.Дж., Усдин Т.Б., Тошиюки С., Карнинчи P, Prange C, Raha SS, Loquellano NA, Peters GJ, Abramson RD, Mullahy SJ, Bosak SA, McEwan PJ, McKernan KJ, Malek JA, Gunaratne PH, Richards S, Worley KC, Hale S, Garcia AM, Gay LJ, Hulyk SW, Villalon DK, Muzny DM, Sodergren EJ, Lu X, Gibbs RA, Fahey J, Helton E, Ketteman M, Madan A, Rodrigues S, Sanchez A, Whiting M, Madan A, Young AC, Shevchenko Y, Bouffard GG , Blakesley RW, Touchman JW, Green ED, Dickson MC, Rodriguez AC, Grimwood J, Schmutz J, Myers RM, Butterfield YS,Кшивинский М.И., Скальска У., Смаилус Д.Е., Шнерч А., Шейн Дж.Э., Джонс С.Дж., Марра М.А. (декабрь 2002 г.).«Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc Natl Acad Sci USA . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
^ "Энтрез Ген: COPS6 COP9 конститутивная фотоморфогенная субъединица гомолога 6 (Arabidopsis)" .
^ Hoareau Алвеш К, Bochard В, Rety S, Jalinot Р (сентябрь 2002). «Ассоциация протоонкопротеина млекопитающих Int-6 с тремя белковыми комплексами eIF3, сигнаносомой COP9 и протеасомой 26S» . FEBS Lett . 527 (1–3): 15–21. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (02) 03147-2 . PMID 12220626 . S2CID 39308598 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Вольф Д.А., Чжоу С., Ви С. (2004). «Сигналосома COP9: платформа для сборки и обслуживания лигаз убиквитина cullin?». Nat. Cell Biol . 5 (12): 1029–33. DOI : 10.1038 / ncb1203-1029 . PMID 14647295 . S2CID 37458780 .
Muthumani K, Choo AY, Premkumar A, Hwang DS, Thieu KP, Desai BM, Weiner DB (2006). "Vpr-регулируемая гибель клеток вируса иммунодефицита человека типа 1 (ВИЧ-1): понимание механизма" . Смерть клетки отличается . 12 Дополнение 1: 962–70. DOI : 10.1038 / sj.cdd.4401583 . PMID 15832179 .
Миттмейер HJ (1976). «[Распределение трупного окоченения в различных областях суставов]». Beitr. Gerichtl. Med . 33 : 85–96. PMID 1222062 .
He J, Choe S, Walker R, Di Marzio P, Morgan DO, Landau NR (1995). «Вирусный белок R (Vpr) вируса иммунодефицита человека 1 типа задерживает клетки в фазе G2 клеточного цикла, ингибируя активность p34cdc2» . J. Virol . 69 (11): 6705–11. DOI : 10,1128 / JVI.69.11.6705-6711.1995 . PMC 189580 . PMID 7474080 .
Re F, Braaten D, Franke EK, Luban J (1995). «Vpr вируса иммунодефицита человека типа 1 останавливает клеточный цикл в G2, ингибируя активацию p34cdc2-циклина B» . J. Virol . 69 (11): 6859–64. DOI : 10,1128 / JVI.69.11.6859-6864.1995 . PMC 189600 . PMID 7474100 .
Ди Марцио П., Чое С., Эбрайт М., Кноблаух Р., Ландау Н.Р. (1996). «Мутационный анализ остановки клеточного цикла, ядерной локализации и упаковки вирионов вируса иммунодефицита человека типа 1 Vpr» . J. Virol . 69 (12): 7909–16. DOI : 10,1128 / JVI.69.12.7909-7916.1995 . PMC 189735 . PMID 7494303 .
Джоветт Дж.Б., Planelles V, Пун Б., Шах Н.П., Чен М.Л., Чен И.С. (1995). «Ген vpr вируса иммунодефицита человека типа 1 задерживает инфицированные Т-клетки в фазе G2 + M клеточного цикла» . J. Virol . 69 (10): 6304–13. DOI : 10,1128 / JVI.69.10.6304-6313.1995 . PMC 189529 . PMID 7666531 .
Чжао Л.Дж., Мукерджи С., Нараян О. (1994). «Биохимический механизм функции Vpr ВИЧ-I. Специфическое взаимодействие с клеточным белком». J. Biol. Chem . 269 (22): 15577–82. PMID 8195203 .
Пун Б., Джоветт Дж. Б., Стюарт С.А., Армстронг Р.В., Риштон Г.М., Чен И.С. (1997). «Ген vpr вируса иммунодефицита человека типа 1 вызывает фенотипические эффекты, аналогичные эффектам алкилирующего агента ДНК, азотистого иприта» . J. Virol . 71 (5): 3961–71. DOI : 10,1128 / JVI.71.5.3961-3971.1997 . PMC 191548 . PMID 9094673 .
Asano K, Vornlocher HP, Richter-Cook NJ, Merrick WC, Hinnebusch AG, Hershey JW (1997). «Структура кДНК, кодирующих субъединицы фактора 3 инициации эукариот человека. Возможные роли в связывании РНК и сборке макромолекул» . J. Biol. Chem . 272 (43): 27042–52. DOI : 10.1074 / jbc.272.43.27042 . PMID 9341143 .
Махалингам С., Айаву В., Патель М., Кибер-Эммонс Т., Као Г. Д., Мушель Р. Дж., Вайнер Д. Б. (1998). «Vpr ВИЧ-1 взаимодействует с человеческим гомологом mov34 массой 34 кДа, клеточным фактором, связанным с фазовым переходом G2 / M клеточного цикла млекопитающих» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 95 (7): 3419–24. DOI : 10.1073 / pnas.95.7.3419 . PMC 19851 . PMID 9520381 .
Сигер М., Крафт Р., Феррелл К., Беч-Отсшир Д., Дамди Р., Шаде Р., Гордон С., Науманн М., Дубиль В. (1998). «Новый белковый комплекс, участвующий в передаче сигнала, обладающий сходством с субъединицами 26S протеасомы». FASEB J . 12 (6): 469–78. DOI : 10.1096 / fasebj.12.6.469 . PMID 9535219 . S2CID 25424324 .
Вэй Н, Цуге Т., Серино Дж., Дохмае Н., Такио К., Мацуи М., Дэн XW (1998). «Комплекс COP9 сохраняется у растений и млекопитающих и связан с регуляторным комплексом протеасомы 26S». Curr. Биол . 8 (16): 919–22. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (07) 00372-7 . PMID 9707402 . S2CID 13873982 .
Старейшина RT, Ю М., Чен М., Эдельсон С., Чжао Ю. (2000). «Остановка клеточного цикла G2, индуцированная Vpr ВИЧ-1 у делящихся дрожжей (Schizosaccharomyces pombe), не зависит от гибели клеток и ранних генов в контрольной точке повреждения ДНК». Virus Res . 68 (2): 161–73. DOI : 10.1016 / S0168-1702 (00) 00167-2 . PMID 10958988 .
Раманатан MP, Ayyavoo V, Weiner DB (2001). «Выбор вектора экспрессии изменяет локализацию клеточного белка человека». ДНК Cell Biol . 20 (2): 101–5. DOI : 10,1089 / 104454901750070300 . PMID 11244567 .
Бех-Отшир Д., Крафт Р., Хуанг Х, Хенкляйн П., Капелари Б., Поллманн С., Дубиль В. (2001). «Фосфорилирование, специфичное для сигнаносомы COP9, направлено на расщепление р53 системой убиквитина» . EMBO J . 20 (7): 1630–9. DOI : 10.1093 / emboj / 20.7.1630 . PMC 145508 . PMID 11285227 .
Ляпина С., Коуп Г., Шевченко А., Серино Г., Цуге Т., Чжоу С., Вольф Д.А., Вей Н., Шевченко А., Дешайс Р.Дж. (2001). «Содействие расщеплению конъюгата NEDD-CUL1 сигнаносомой COP9». Наука . 292 (5520): 1382–5. DOI : 10.1126 / science.1059780 . PMID 11337588 . S2CID 14224920 .
Старейшина RT, Ю М., Чен М., Чжу X, Янагида М., Чжао Ю. (2001). «Vpr ВИЧ-1 вызывает остановку клеточного цикла G2 у делящихся дрожжей (Schizosaccharomyces pombe) посредством пути, включающего регуляторные и каталитические субъединицы PP2A и действующего как на Wee1, так и на Cdc25». Вирусология . 287 (2): 359–70. DOI : 10.1006 / viro.2001.1007 . PMID 11531413 .
Hrimech M, Yao XJ, Branton PE, Cohen EA (2002). «Отзыв» . EMBO J . 21 (14): 3918. DOI : 10,1093 / emboj / cdf420 . PMC 126131 . PMID 12110603 .

Внешние ссылки [ править ]

Расположение генома человека COPS6 и страница сведений о гене COPS6 в браузере генома UCSC .

Эта статья о гене в хромосоме 7 человека - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000168090 - Ensembl , май 2017 г.

[2] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[3] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid12477932-4] Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, Derge JG, Klausner RD, Collins FS, Wagner L, Shenmen CM, Schuler GD, Altschul SF, Zeeberg B, Buetow KH, Schaefer CF, Bhat NK, Hopkins RF, Jordan H, Moore T. , Макс С.И., Ван Дж., Се Ф., Дьяченко Л., Марусина К., Фармер А.А., Рубин Г.М., Хонг Л., Стэплтон М., Соарес МБ, Боналдо М.Ф., Казавант Т.Л., Шитц Т.Э., Браунштейн М.Дж., Усдин Т.Б., Тошиюки С., Карнинчи P, Prange C, Raha SS, Loquellano NA, Peters GJ, Abramson RD, Mullahy SJ, Bosak SA, McEwan PJ, McKernan KJ, Malek JA, Gunaratne PH, Richards S, Worley KC, Hale S, Garcia AM, Gay LJ, Hulyk SW, Villalon DK, Muzny DM, Sodergren EJ, Lu X, Gibbs RA, Fahey J, Helton E, Ketteman M, Madan A, Rodrigues S, Sanchez A, Whiting M, Madan A, Young AC, Shevchenko Y, Bouffard GG , Blakesley RW, Touchman JW, Green ED, Dickson MC, Rodriguez AC, Grimwood J, Schmutz J, Myers RM, Butterfield YS,Кшивинский М.И., Скальска У., Смаилус Д.Е., Шнерч А., Шейн Дж.Э., Джонс С.Дж., Марра М.А. (декабрь 2002 г.).«Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc Natl Acad Sci USA . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .

[entrez-5] "Энтрез Ген: COPS6 COP9 конститутивная фотоморфогенная субъединица гомолога 6 (Arabidopsis)" .

[pmid12220626-6] Hoareau Алвеш К, Bochard В, Rety S, Jalinot Р (сентябрь 2002). «Ассоциация протоонкопротеина млекопитающих Int-6 с тремя белковыми комплексами eIF3, сигнаносомой COP9 и протеасомой 26S» . FEBS Lett . 527 (1–3): 15–21. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (02) 03147-2 . PMID 12220626 . S2CID 39308598 .

[1]