COQ7

Идентификаторы

COQ7 , CAT5, CLK-1, CLK1, COQ10D8, кофермент Q7, гидроксилаза

Внешние идентификаторы

OMIM: 601683 MGI: 107207 HomoloGene: 6953 GeneCards: COQ7

Расположение гена (человек)

Chr.	Хромосома 16 (человека) ^[1]

Группа	16п12.3	Начинать	19 067 614 п.н. ^[1]
Группа	16п12.3	Конец	19 080 095 п.н. ^[1]

Расположение гена (Мышь)

Chr.	Хромосома 7 (мышь) ^[2]

Группа	7 F1 \| 7 63,44 см	Начинать	118 509 659 п.н. ^[2]
Группа	7 F1 \| 7 63,44 см	Конец	118 533 356 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• оксидоредуктазная активность • связывание с хроматином • связывание с белком GO: 0001948 • связывание с ионами металлов • монооксигеназная активность • оксидоредуктазная активность, действующая на парных доноров, с включением или восстановлением молекулярного кислорода, NAD (P) H в качестве одного донора и включения одного атома кислорода • Активность 2-октопренил-3-метил-6-метокси-1,4-бензохинон гидроксилазы
Сотовый компонент	• внутренняя мембрана митохондрий • митохондрия • ядро клетки • мембрана • внешний компонент внутренней мембраны митохондрий
Биологический процесс	• негативная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • окислительно-восстановительный процесс • регуляция метаболического процесса активных форм кислорода • позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • процесс биосинтеза убихинона • транспорт электронов, связанный с синтезом АТФ в митохондриях • определение продолжительности жизни взрослого человека • ответ на лекарство • регуляция экспрессии генов
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


10229


12850

Ансамбль


ENSG00000167186


ENSMUSG00000030652

UniProt


Q99807


P97478

RefSeq (мРНК)


NM_001190983 NM_016138


NM_009940 NM_001304758

RefSeq (белок)

NP_001177912 NP_057222 NP_001357418 NP_001357419 NP_001357420
NP_001357421 NP_001357422 NP_001357423 NP_001357424


NP_001291687 NP_034070

Расположение (UCSC)

Chr 16: 19.07 - 19.08 Мб

Chr 7: 118,51 - 118,53 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Митохондриальная 5-demethoxyubiquinone гидроксилаза ( DMQ гидроксилаза ), также известная как кофермент Q7, гидроксилазы , является ферментом , который в организме человека кодируется COQ7 геном . Ген clk-1 ( clock-1 ) кодирует этот белок, который необходим для биосинтеза убихинона у червя Caenorhabditis elegans и других эукариот . Мыши вариант гена называется MCLK-1 , а человек, плодовая мушка и дрожжевой гомолог COQ7 (кофермент Q биосинтеза белка 7). ^[5]^[6]

CLK-1 не следует путать с неродственным человеческим белком CLK1, который играет роль в сплайсинге РНК .

Структура [ править ]

Белок имеет два повтора из примерно 90 аминокислот , которые содержат два консервативных мотива, которые, как предполагается, важны для координации железа. Структура и функция гена высоко консервативны у разных видов. ^[7]

В C. Элеганс белок содержит 187 аминокислотных остатков (20 кДа ), человеческий гомологов 217 аминокислотных остатков (24 кДа, ген , состоящий из шести экзонов , охватывающих 11 кб и расположенный на хромосоме 16 ). ^[8]

Митохондриальная функция [ править ]

Убихинон представляет собой небольшой редокс-активный липид, который содержится в большинстве клеточных мембран, где он действует как кофактор во многих клеточных окислительно-восстановительных процессах, включая транспорт митохондрий электронов . В качестве кофактора убихинон часто участвует в процессах, которые производят активные формы кислорода (АФК). Кроме того, убихинон является одним из основных эндогенных антиоксидантов клетки. Фермент CLK-1 отвечает за гидроксилирование 5-деметоксиубихинона до 5-гидроксиубихинона.

Было показано, что мутации в гене связаны с увеличением продолжительности жизни . ^[5]^[7] Дефекты гена замедляют различные процессы развития и физиологические процессы, включая клеточный цикл, эмбриогенез, постэмбриональный рост, ритмическое поведение и старение. ^[9]

Ядерная функция [ править ]

CLK-1 и COQ7 преимущественно локализуются в митохондриях, чтобы участвовать в пути биосинтеза убихинона, который там находится. Однако небольшой пул CLK-1 и COQ7 перемещается в ядро в ответ на продукцию ROS нормально функционирующими митохондриями как в клетках червей, так и в клетках человека соответственно. ^[10] Транслокация CLK-1 и COQ7 представляет собой ретроградный путь передачи сигналов от митохондрий к ядру, который подавляет митохондриальные стрессовые реакции. Считается, что митохондриальный и ядерный пулы CLK-1 независимо вносят вклад в регуляцию продолжительности жизни червей. Считается, что ядерная форма CLK-1 и COQ7 регулирует экспрессию генов посредством неустановленного механизма.

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000167186 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030652 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ a b Ewbank JJ, Barnes TM, Lakowski B, Lussier M, Bussey H, Hekimi S (февраль 1997 г.). «Структурное и функциональное сохранение гена времени clk-1 Caenorhabditis elegans». Наука . 275 (5302): 980–3. DOI : 10.1126 / science.275.5302.980 . PMID 9020081 . S2CID 32191959 .
^ «Ген Entrez: гомолог кофермента Q7 COQ7, убихинон (дрожжи)» .
^ а б Лю Х, Цзян Н., Хьюз Б., Биграс Э, Шубридж Э, Хекими С. (октябрь 2005 г.). «Эволюционное сохранение clk-1-зависимого механизма долголетия: потеря mclk1 увеличивает клеточную пригодность и продолжительность жизни у мышей» . Genes Dev . 19 (20): 2424–34. DOI : 10,1101 / gad.1352905 . PMC 1257397 . PMID 16195414 .
^ Asaumi S, Kuroyanagi Н, Н Секи, Shirasawa Т (июнь 1999 г.). "Ортологи гена долголетия Caenorhabditis elegans clk-1 у мышей и людей". Геномика . 58 (3): 293–301. DOI : 10.1006 / geno.1999.5838 . PMID 10373327 .
^ Felkai S, Эубанк JJ, Лемье J, Лаббе JC, Коричневый GG, Hekimi S (апрель 1999). «CLK-1 контролирует дыхание, поведение и старение нематоды Caenorhabditis elegans» . EMBO J . 18 (7): 1783–92. DOI : 10.1093 / emboj / 18.7.1783 . PMC 1171264 . PMID 10202142 .
Перейти ↑ Monaghan RM, Barnes RG, Fisher K, Andreou T, Rooney N, Poulin GB, Whitmarsh AJ (июнь 2015 г.). «Ядерная роль респираторного фермента CLK-1 в регуляции митохондриальных стрессовых реакций и долголетия» . Природа клеточной биологии . 17 (6): 782–92. DOI : 10.1038 / ncb3170 . PMC 4539581 . PMID 25961505 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
Йонассен Т., Профт М., Рандес-Гил Ф. и др. (1998). «Гомолог дрожжевого Clk-1 (Coq7 / Cat5) представляет собой митохондриальный белок, участвующий в синтезе кофермента Q» . J. Biol. Chem . 273 (6): 3351–7. DOI : 10.1074 / jbc.273.6.3351 . PMID 9452453 .
Асауми С., Куроянаги Х., Секи Н., Ширасава Т. (1999). "Ортологи гена долголетия Caenorhabditis elegans clk-1 у мышей и людей". Геномика . 58 (3): 293–301. DOI : 10.1006 / geno.1999.5838 . PMID 10373327 .
Вайо З., Кинг Л. М., Йонассен Т. и др. (2000). «Сохранение гена времени clk-1 Caenorhabditis elegans от дрожжей до человека: ген, необходимый для биосинтеза убихинона с потенциальными последствиями для старения». Мамм. Геном . 10 (10): 1000–4. DOI : 10.1007 / s003359901147 . PMID 10501970 . S2CID 13800512 .
Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Genome Res . 10 (11): 1788–95. DOI : 10.1101 / gr.143000 . PMC 310948 . PMID 11076863 .
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека» . Genome Res . 11 (3): 422–35. DOI : 10.1101 / гр . GR1547R . PMC 311072 . PMID 11230166 .
Симпсон Дж. К., Велленройтер Р., Поустка А. и др. (2001). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК» . EMBO Rep . 1 (3): 287–92. DOI : 10.1093 / embo-reports / kvd058 . PMC 1083732 . PMID 11256614 .
Стенмарк П., Грюнлер Дж., Матссон Дж. И др. (2001). «Новый член семейства белков карбоксилата железа. Coq7 (clk-1), мембраносвязанная гидроксилаза, участвующая в биосинтезе убихинона» . J. Biol. Chem . 276 (36): 33297–300. DOI : 10.1074 / jbc.C100346200 . PMID 11435415 .
Такахаши М., Асауми С., Хонда С. и др. (2001). «Мышиный ортолог coq7 / clk-1 спас замедленное ритмическое поведение и увеличил продолжительность жизни мутанта clk-1 longevity у Caenorhabditis elegans». Biochem. Биофиз. Res. Commun . 286 (3): 534–40. DOI : 10.1006 / bbrc.2001.5439 . PMID 11511092 .
Ри С. (2002). «CLK-1 / Coq7p - это монооксигеназа DMQ и новый член семейства белков карбоксилата железа» . FEBS Lett . 509 (3): 389–94. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (01) 03099-X . PMID 11749961 . S2CID 28650687 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. DOI : 10,1038 / нг1285 . PMID 14702039 .
Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики» . Genome Res . 14 (10B): 2136–44. DOI : 10.1101 / gr.2576704 . PMC 528930 . PMID 15489336 .
Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году» . Nucleic Acids Res . 34 (выпуск базы данных): D415–8. DOI : 10.1093 / NAR / gkj139 . PMC 1347501 . PMID 16381901 .

Внешние ссылки [ править ]

Расположение человеческого гена COQ7 в браузере генома UCSC .
Подробная информация о гене человека COQ7 в браузере генома UCSC .

Эта статья о гене в хромосоме 16 человека - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000167186 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030652 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[Ewbank_1997-5] Ewbank JJ, Barnes TM, Lakowski B, Lussier M, Bussey H, Hekimi S (февраль 1997 г.). «Структурное и функциональное сохранение гена времени clk-1 Caenorhabditis elegans». Наука . 275 (5302): 980–3. DOI : 10.1126 / science.275.5302.980 . PMID 9020081 . S2CID 32191959 .

[entrez-6] «Ген Entrez: гомолог кофермента Q7 COQ7, убихинон (дрожжи)» .

[Liu_2005-7] а б Лю Х, Цзян Н., Хьюз Б., Биграс Э, Шубридж Э, Хекими С. (октябрь 2005 г.). «Эволюционное сохранение clk-1-зависимого механизма долголетия: потеря mclk1 увеличивает клеточную пригодность и продолжительность жизни у мышей» . Genes Dev . 19 (20): 2424–34. DOI : 10,1101 / gad.1352905 . PMC 1257397 . PMID 16195414 .

[Asaumi_1999-8] Asaumi S, Kuroyanagi Н, Н Секи, Shirasawa Т (июнь 1999 г.). "Ортологи гена долголетия Caenorhabditis elegans clk-1 у мышей и людей". Геномика . 58 (3): 293–301. DOI : 10.1006 / geno.1999.5838 . PMID 10373327 .

[Felkai_1999-9] Felkai S, Эубанк JJ, Лемье J, Лаббе JC, Коричневый GG, Hekimi S (апрель 1999). «CLK-1 контролирует дыхание, поведение и старение нематоды Caenorhabditis elegans» . EMBO J . 18 (7): 1783–92. DOI : 10.1093 / emboj / 18.7.1783 . PMC 1171264 . PMID 10202142 .

[10] Перейти ↑ Monaghan RM, Barnes RG, Fisher K, Andreou T, Rooney N, Poulin GB, Whitmarsh AJ (июнь 2015 г.). «Ядерная роль респираторного фермента CLK-1 в регуляции митохондриальных стрессовых реакций и долголетия» . Природа клеточной биологии . 17 (6): 782–92. DOI : 10.1038 / ncb3170 . PMC 4539581 . PMID 25961505 .

[1]

vтеОксидоредуктазы : монооксигеназы ( EC 1.13)
1.13.11 : два атома кислорода	липоксигеназа : арахидонат-5-липоксигеназа Арахидонат-12-липоксигеназа / ALOX12 Арахидонат-8-липоксигеназа Арахидонат-15-липоксигеназа / ALOX15 Линолеат 11-липоксигеназа другая диоксигеназа: катехолдиоксигеназа Гомогентизат 1,2-диоксигеназа Цистеиндиоксигеназа 4-гидроксифенилпируват диоксигеназа Индолеамин 2,3-диоксигеназа Хлоритдисмутаза
1.13.12 : один атом кислорода	Люцифераза светлячка
1.13.99 : другое	Инозитол оксигеназа

vтеФерменты
Мероприятия	Активный сайт Сайт привязки Каталитическая триада Оксианионная дыра Ферментная распущенность Каталитически совершенный фермент Коэнзим Кофактор Ферментный катализ
Регулирование	Аллостерическая регуляция Сотрудничество Ингибитор ферментов Активатор ферментов
Классификация	Номер ЕС Ферментное суперсемейство Семейство ферментов Список ферментов
Кинетика	Кинетика ферментов Диаграмма Иди – Хофсти Заговор Ханеса – Вульфа Заговор Лайнуивера – Берка Кинетика Михаэлиса – Ментен
Типы	EC1 Оксидоредуктазы ( список ) EC2 Трансферазы ( список ) EC3 Гидролазы ( список ) EC4 Lyases ( список ) EC5 Изомеразы ( список ) Лигазы EC6 ( список ) EC7 Translocases ( список )