Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
NR2F1
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

2EBL

Идентификаторы
ПсевдонимыNR2F1 , BBOAS, BBSOAS, COUP-TFI, EAR-3, EAR3, ERBAL3, NR2F2, SVP44, TCFCOUP1, TFCOUP1, подсемейство ядерных рецепторов 2, член 1 группы F, COUPTF1
Внешние идентификаторыOMIM : 132890 MGI : 1352451 HomoloGene : 21158 GeneCards : NR2F1
Расположение гена ( человек )
Хромосома 5 (человек)
Chr.Хромосома 5 (человека) [1]
Хромосома 5 (человек)
Геномное расположение NR2F1
Геномное расположение NR2F1
Группа5q15Начинать93 583 222 п.н. [1]
Конец93 594 611 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 13 (мышь)
Chr.Хромосома 13 (мышь) [2]
Хромосома 13 (мышь)
Геномное расположение NR2F1
Геномное расположение NR2F1
Группа13 C1 | 13 41,38 смНачинать78 188 973 п.н. [2]
Конец78 199 757 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE NR2F1 209505 в формате fs.png

PBB GE NR2F1 209506 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции
• Активность рецептора стероидного гормона
• Последовательное связывание ДНК
• Активность коактиватора транскрипции GO: 0001105
• Связывание ДНК
• GO: 0038050, GO: 0004886, GO: 0038051 активность ядерного рецептора
• Связывание с ионом цинка
• Связывание с белком GO: 0001948
• Связывание с ионом металла
• GO: 0000980 Связывание ДНК цис-регуляторной области РНК-полимеразы II, специфичное для последовательности
• GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, специфическая для РНК-полимеразы II
• GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфичность к РНК-полимеразе II
• Связывание элемента, чувствительного к ретиноевой кислоте
Сотовый компонент• ядро клетки
• нуклеоплазма
• цитозоль
Биологический процесс• инициации транскрипции от РНК - полимеразы II промотор
• регуляцию транскрипции ДНК-шаблонных
• негативной регуляции транскрипции с РНК - полимеразы II промотора
• транскрипцию ДНК-шаблонных
• трансдукции сигнала
• стероидный гормон , опосредованного сигнального пути
• внутриклеточного рецептора сигнального пути
• положительное регулирование транскрипция на основе нуклеиновых кислот
• развитие нервной системы
• негативная регуляция развития проекций нейронов
• позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

7025

13865

Ансамбль

ENSG00000175745

ENSMUSG00000069171

UniProt

P10589

Q60632

RefSeq (мРНК)

NM_005654

NM_010151
NM_001347538
NM_001347539

RefSeq (белок)

NP_005645

NP_001334467
NP_001334468
NP_034281

Расположение (UCSC)Chr 5: 93,58 - 93,59 МбChr 13: 78,19 - 78,2 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

ПЕРЕВОРОТ-TF1 ( ПЕРЕВОРОТ Т ranscription Р актер 1 ) , также известный как NR2F1 ( N uclear R eceptor подсемейство 2 , группа F , член 1 ) представляет собой белок , который у человека кодируется NR2F1 гена . [5] [6] Этот белок является членом ядерного рецептора гормона семейства рецепторов стероидных гормонов .

Функция [ править ]

Фактор транскрипции Coup ( вышестоящий промотор овальбумина курицы ) связывается с промотором овальбумина и в сочетании с другим белком ( S300-II ) стимулирует инициацию транскрипции . [7] [8] COUP-TF1 связывается как с прямыми повторами, так и с палиндромами мотива 5'-AGGTCA-3 '. [9]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что COUP-TFI взаимодействует с:

  • BCL11A , [10]
  • BCL11B , [10]
  • COPS2 , [11] и
  • ESR1 . [12]

Клинический [ править ]

Мутации в этом гене были связаны с синдромом оптической атрофии Боша-Бунстра-Шаафа . [13]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000175745 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000069171 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ «Энтрез Ген: подсемейство 2 ядерных рецепторов NR2F1, группа F, член 1» .
  6. ↑ Qiu Y, Krishnan V, Zeng Z, Gilbert DJ, Copeland NG, Gibson L, Yang-Feng T, Jenkins NA, Tsai MJ, Tsai SY (сентябрь 1995 г.). «Выделение, характеристика и хромосомная локализация генов COUP-TF I и II мыши и человека». Геномика . 29 (1): 240–6. DOI : 10.1006 / geno.1995.1237 . PMID 8530078 . 
  7. Перейти ↑ Sagami I, Tsai SY, Wang H, Tsai MJ, O'Malley BW (декабрь 1986). «Идентификация двух факторов, необходимых для транскрипции гена овальбумина» . Молекулярная и клеточная биология . 6 (12): 4259–67. DOI : 10,1128 / MCB.6.12.4259 . PMC 367207 . PMID 3796602 .  
  8. ^ Tsai SY, Сосю I, Ван H, Tsai MJ, О'Мэлли BW (август 1987). «Взаимодействие между ДНК-связывающим фактором транскрипции (COUP) и не-ДНК-связывающим фактором (S300-II)». Cell . 50 (5): 701–9. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (87) 90328-X . PMID 3040258 . S2CID 25136877 .  
  9. ^ Tsai SY, Tsai MJ (апрель 1997). "Факторы транскрипции переднего промотора овальбумина цыпленка (COUP-TF): достижение зрелости". Эндокринные обзоры . 18 (2): 229–40. DOI : 10,1210 / er.18.2.229 . PMID 9101138 . 
  10. ^ a b Avram D, Fields A, Pretty On Top K, Nevrivy DJ, Ishmael JE, Leid M (апрель 2000 г.). «Выделение нового семейства белков цинковых пальцев C (2) H (2), участвующих в репрессии транскрипции, опосредованной куриным овальбумином, вышестоящим промоторным рецептором транскрипции фактора транскрипции (COUP-TF)» . Журнал биологической химии . 275 (14): 10315–22. DOI : 10.1074 / jbc.275.14.10315 . PMC 2819356 . PMID 10744719 .  
  11. ^ Dressel U, Thormeyer D, Altincicek B, Paululat A, Eggert M, Schneider S, Tenbaum SP, Renkawitz R, Baniahmad A (май 1999). «Чужой, высококонсервативный белок с характеристиками корепрессора для членов суперсемейства ядерных гормонов» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (5): 3383–94. DOI : 10.1128 / mcb.19.5.3383 . PMC 84131 . PMID 10207062 .  
  12. ^ Метивие Р, Гей Ф., Хюбнер М.Р., Flouriot G, G Salbert, Ганнон Р, Кахи О, Pakdel Р (июль 2002). «Образование комплекса hER альфа-COUP-TFI усиливает hER альфа AF-1 за счет фосфорилирования Ser118 с помощью MAPK» . Журнал EMBO . 21 (13): 3443–53. DOI : 10,1093 / emboj / cdf344 . PMC 126093 . PMID 12093745 .  
  13. ^ Hobbs MM, Wolters WC, Rayapati AO (2020) Синдром оптической атрофии Боша-Бунстра-Шаафа, проявляющийся как впервые возникший психоз у 32-летнего мужчины: отчет о болезни и обзор литературы. J Psychiatr Pract 26 (1): 58-62

Внешние ссылки [ править ]

  • Расположение генома человека NR2F1 и страница сведений о гене NR2F1 в браузере генома UCSC .
  • Расположение генома человека NR2F2 и страница сведений о гене NR2F2 в браузере генома UCSC .

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Kliewer SA, Umesono K, Heyman RA, Mangelsdorf DJ, Dyck JA, Evans RM (февраль 1992 г.). «Взаимодействия рецептора ретиноида X-COUP-TF модулируют передачу сигналов ретиноевой кислоты» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 89 (4): 1448–52. Bibcode : 1992PNAS ... 89.1448K . DOI : 10.1073 / pnas.89.4.1448 . PMC  48468 . PMID  1311101 .
  • Берродин Т.Дж., Маркс М.С., Озато К., Линни Э., Лазар М.А. (сентябрь 1992 г.). «Гетеродимеризация рецептора тироидного гормона, рецептора ретиноевой кислоты, рецептора ретиноида X, фактора транскрипции вышестоящего промотора куриного овальбумина и эндогенного белка печени». Молекулярная эндокринология . 6 (9): 1468–78. DOI : 10,1210 / me.6.9.1468 . PMID  1331778 .
  • Ing NH, Beekman JM, Tsai SY, Tsai MJ, O'Malley BW (сентябрь 1992 г.). «Члены суперсемейства рецепторов стероидных гормонов взаимодействуют с TFIIB (S300-II)». Журнал биологической химии . 267 (25): 17617–23. PMID  1517211 .
  • Ван Л.Х., Цай С.Ю., Кук Р.Г., Битти В.Г., Цай М.Дж., О'Мэлли Б.В. (июль 1989 г.). «Фактор транскрипции COUP является членом суперсемейства стероидных рецепторов». Природа . 340 (6229): 163–6. Bibcode : 1989Natur.340..163W . DOI : 10.1038 / 340163a0 . PMID  2739739 . S2CID  4364164 .
  • Миядзима Н., Кадоваки Ю., Фукусигэ С., Симидзу С., Семба К., Яманаси Ю., Мацубара К., Тоошима К., Ямамото Т. (декабрь 1988 г.). «Идентификация двух новых членов суперсемейства erbA путем молекулярного клонирования: генные продукты этих двух тесно связаны друг с другом» . Исследования нуклеиновых кислот . 16 (23): 11057–74. DOI : 10.1093 / NAR / 16.23.11057 . PMC  338996 . PMID  2905047 .
  • Савая Б. Е., Рор О., Аунис Д., Шеффер Е. (сентябрь 1996 г.). «Фактор транскрипции вышестоящего промотора куриного овальбумина, активатор транскрипции экспрессии гена ВИЧ-1 в клетках мозга человека» . Журнал биологической химии . 271 (38): 23572–6. DOI : 10.1074 / jbc.271.38.23572 . PMID  8798567 .
  • Рор О., Онис Д., Шеффер Э. (декабрь 1997 г.). «COUP-TF и Sp1 взаимодействуют и кооперируются в активации транскрипции длинного концевого повтора вируса иммунодефицита человека типа 1 в клетках микроглии человека» . Журнал биологической химии . 272 (49): 31149–55. DOI : 10.1074 / jbc.272.49.31149 . PMID  9388268 .
  • Dressel U, Thormeyer D, Altincicek B, Paululat A, Eggert M, Schneider S, Tenbaum SP, Renkawitz R, Baniahmad A (май 1999 г.). «Чужой, высококонсервативный белок с характеристиками корепрессора для членов суперсемейства ядерных гормонов» . Молекулярная и клеточная биология . 19 (5): 3383–94. DOI : 10.1128 / mcb.19.5.3383 . PMC  84131 . PMID  10207062 .
  • Klinge CM, Kaur K, Swanson HI (январь 2000 г.). «Арилуглеводородный рецептор взаимодействует с рецептором эстрогена альфа и сиротскими рецепторами COUP-TFI и ERRalpha1». Архивы биохимии и биофизики . 373 (1): 163–74. DOI : 10.1006 / abbi.1999.1552 . PMID  10620335 .
  • Рор О., Шварц С., Хери С., Онис Д., Тардье М., Шеффер Э. (январь 2000 г.). «Ядерный рецептор куриного овальбумина, вышестоящий промоторный фактор транскрипции, взаимодействует с Tat ВИЧ-1 и стимулирует репликацию вируса в клетках микроглии человека» . Журнал биологической химии . 275 (4): 2654–60. DOI : 10.1074 / jbc.275.4.2654 . PMID  10644726 .
  • Сугияма Т., Ван Дж.С., Скотт Д.К., Граннер Д.К. (февраль 2000 г.). «Активация транскрипции орфанным ядерным рецептором, куриным овальбумином выше промотора-фактора транскрипции I (COUP-TFI). Определение домена, участвующего в глюкокортикоидном ответе гена фосфоенолпируваткарбоксикиназы» . Журнал биологической химии . 275 (5): 3446–54. DOI : 10.1074 / jbc.275.5.3446 . PMID  10652338 .
  • Vlahou A, Flytzanis CN (февраль 2000 г.). «Субклеточный транспорт ядерного рецептора COUP-TF в раннем эмбриональном клеточном цикле». Биология развития . 218 (2): 284–98. DOI : 10,1006 / dbio.1999.9456 . PMID  10656770 .
  • Аврам Д., Филдс А., Pretty On Top K, Невривой DJ, Измаил Дж. Э., Лейд М. (апрель 2000 г.). «Выделение нового семейства белков цинковых пальцев C (2) H (2), участвующих в репрессии транскрипции, опосредованной куриным овальбумином, вышестоящим промоторным рецептором транскрипции фактора транскрипции (COUP-TF)» . Журнал биологической химии . 275 (14): 10315–22. DOI : 10.1074 / jbc.275.14.10315 . PMC  2819356 . PMID  10744719 .
  • Гей F, Anglade I, Gong Z, Salbert G (октябрь 2000 г.). «LIM / гомеодоменный белок islet-1 модулирует функции рецептора эстрогена» . Молекулярная эндокринология . 14 (10): 1627–48. DOI : 10,1210 / me.14.10.1627 . PMID  11043578 .
  • Ю М., Фишер М., Чо В.К., Крабб Д. (февраль 2002 г.). «Транскрипционный контроль промотора альдегиддегидрогеназы 2 человека с помощью ядерного фактора гепатоцита 4: ингибирование циклическими факторами транскрипции AMP и COUP». Архивы биохимии и биофизики . 398 (1): 79–86. DOI : 10,1006 / abbi.2001.2713 . PMID  11811951 .
  • Линь Ф, Коллури СК, Чен ГК, Чжан ХК (июнь 2002 г.). «Регулирование индуцированного ретиноевой кислотой ингибирования активности AP-1 с помощью орфанного рецептора куриного овальбумина выше промотора фактора транскрипции» . Журнал биологической химии . 277 (24): 21414–22. DOI : 10.1074 / jbc.M201885200 . PMID  11934895 .
  • Métivier R, Gay FA, ​​Hübner MR, Flouriot G, Salbert G, Gannon F, Kah O, Pakdel F (июль 2002 г.). «Образование комплекса hER альфа-COUP-TFI усиливает hER альфа AF-1 за счет фосфорилирования Ser118 с помощью MAPK» . Журнал EMBO . 21 (13): 3443–53. DOI : 10,1093 / emboj / cdf344 . PMC  126093 . PMID  12093745 .
  • Yu X, Mertz JE (февраль 2003 г.). «Отличные способы регуляции транскрипции вируса гепатита В ядерными рецепторами HNF4alpha и COUP-TF1» . Журнал вирусологии . 77 (4): 2489–99. DOI : 10,1128 / JVI.77.4.2489-2499.2003 . PMC  141100 . PMID  12551987 .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии .