Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
COX10
Идентификаторы
ПсевдонимыCOX10 , гем A: фарнезилтрансфераза, фактор сборки цитохром с оксидазы, фактор сборки цитохром с оксидазы, гем A: фарнезилтрансфераза MC4DN3
Внешние идентификаторыOMIM : 602125 MGI : 1917633 HomoloGene : 80170 GeneCards : COX10
Расположение гена ( человек )
Хромосома 17 (человек)
Chr.Хромосома 17 (человека) [1]
Хромосома 17 (человек)
Геномное расположение COX10
Геномное расположение COX10
Группа17p12Начинать14 069 490 п.н. [1]
Конец14 231 736 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 11 (мышь)
Chr.Хромосома 11 (мышь) [2]
Хромосома 11 (мышь)
Геномное расположение COX10
Геномное расположение COX10
Группа11 | 11 B3Начинать63 962 627 п.н. [2]
Конец64 079 468 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE COX10 203858 s на fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• трансферазной активности
• farnesyltranstransferase активности
• цитохром-с - оксидазы активности
• protoheme IX фарнезилтрансферазы активность
• трансферазной активности, передачи алкил или арил (кроме метил) групп
Сотовый компонент• составной компонент мембраны
• мембрана
• митохондриальная мембрана
• цитохромный комплекс
• внутренняя мембрана митохондрий
• ядрышко
• митохондрия
• цитозоль
Биологический процесс• сборка комплекса цитохрома
• деление митохондрий
• организация митохондрий
• процесс биосинтеза гема
• аэробное дыхание
• митохондриальный перенос электронов, цитохром c в кислород
• сборка IV комплекса дыхательной цепи
• клеточное дыхание
• процесс биосинтеза гема O
• процесс биосинтеза гема A
• трансмембранный транспорт протонов
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

1352

70383

Ансамбль

ENSG00000006695

ENSMUSG00000042148

UniProt

Q12887

Q8CFY5

RefSeq (мРНК)

NM_001303

NM_178379

RefSeq (белок)

NP_001294

NP_848466

Расположение (UCSC)Chr 17: 14.07 - 14.23 МбChr 11: 63.96 - 64.08 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Protoheme IX фарнезилтрансфераза, митохондриальный представляет собой фермент , который у человека кодируется COX10 геном . [5] [6] цитохром с оксидазы (ЦОГ), терминал компонент дыхательной цепи митохондрий , катализирующий на перенос электронов от пониженной цитохрома с к кислороду . Этот компонент представляет собой гетеромерный комплекс, состоящий из 3 каталитических субъединиц, кодируемых митохондриальными генами, и множества структурных субъединиц, кодируемых ядерными генами.. Субъединицы, кодируемые митохондриями, участвуют в переносе электронов, а субъединицы, кодируемые ядром, могут действовать в регуляции и сборке комплекса . Этот ядерный ген, СОХ10 , кодирует гем А : фарнезилтрансферазу , которая не является структурной субъединицей, но необходима для экспрессии функционального ЦОГ и функций при созревании простетической группы гема А ЦОГ. Ген мутации , которая приводит к замещению в виде лизина для аспарагина (N204K), идентифицирован , чтобы быть ответственным за цитохром с оксидазы дефицита. Кроме того, этот ген нарушен у пациентов с CMT1A. (Шарко-Мари-Тут типа 1А) дублирование и ГАЭС (наследственная невропатия с параличами ответственностью перед давлением) удаление . [6]

Структура [ править ]

Ген COX10 расположен на плече p хромосомы 17 в положении 12 и охватывает 139 277 пар оснований. [6] Ген производит белок 48,9 кДа, состоящий из 443 аминокислот . [7] [8] Этот ген имеет необычно длинную 3 'нетранслируемую область размером 1426 пар оснований по сравнению с открытой рамкой считывания из 1329 пар оснований . [9] Ген COX10 имеет 7 экзонов общей длиной 135 тысяч пар оснований. [10] Предполагается, что этот белок содержит 7-9 трансмембранных доменов, локализованных во внутренней мембране митохондрий .[6] Между трансмембранными доменами II / III и VI / VIIсуществуют гидрофильные петли . [11] Этот белок считается составной частью внутренней митохондриальной мембраны. [12]

Функция [ править ]

Белок , кодируемый COX10 представляет собой сборку фактор необходимо для синтеза ЦОГА, участвующий в первом шаге митохондриального гема A пути биосинтеза . Это катализирует фарнезилирование из винильной группы в положении С2 protoheme ( гем B ) и преобразует его в гем O . [10] [11]

Клиническое значение [ править ]

Мутации в гене COX10 могут приводить к многочисленным клиническим фенотипам , от тубулопатии и лейкодистрофии до синдрома Ли и фатальной детской кардиомиопатии до французско-канадской формы синдрома Ли. Сообщалось о большом разнообразии симптомов, охватывающих весь спектр симптомов дефицита ЦОГ, включая атаксию , гипотонию , птоз , лактоацидоз , проксимальную тубулопатию, анемию , миопатию , гипертрофическую кардиомиопатию , нейросенсорную тугоухость и лейкодистрофию.[11] [9]

Кроме того, этот ген нарушен у пациентов с дупликацией CMT1A (тип 1А Шарко-Мари-Тута) и с делецией HNPP (наследственная невропатия со склонностью к параличам от сдавливания). [6]

Взаимодействия [ править ]

Этот белок взаимодействует с FAM136A . [13]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000006695 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000042148 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Мураками T, Reiter LT, Лапски JR (май 1997). «Геномная структура и экспрессия гена человеческого гема А: фарнезилтрансферазы (COX10)». Геномика . 42 (1): 161–4. DOI : 10.1006 / geno.1997.4711 . PMID 9177788 . 
  6. ^ a b c d e «Ген Entrez: гомолог COX10 COX10, сборочный белок цитохром с оксидазы, гем A: фарнезилтрансфераза (дрожжи)» . Эта статья включает текст из этого источника, который находится в общественном достоянии .
  7. ↑ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss Дж., Дуан Х., Улен М., Йетс Дж. Р., Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии кардиального протеома и медицины с помощью специализированной базы знаний» . Циркуляционные исследования . 113 (9): 1043–53. DOI : 10,1161 / CIRCRESAHA.113.301151 . PMC 4076475 . PMID 23965338 .  
  8. ^ "COX10 - Фарнезилтрансфераза Protoheme IX, митохондриальная" . Атлас кардиоорганических белков (COPaKB) .[ постоянная мертвая ссылка ]
  9. ^ a b Валнот I, фон Клейст-Ретцов JC, Барриентос A, Горбатюк M, Taanman JW, Mehaye B, Rustin P, Tzagoloff A, Munnich A, Rötig A (май 2000 г.). «Мутация в гене гема А: фарнезилтрансферазы человека (COX10) вызывает дефицит цитохром с оксидазы» . Молекулярная генетика человека . 9 (8): 1245–9. DOI : 10.1093 / HMG / 9.8.1245 . PMID 10767350 . 
  10. ^ a b Онлайн-менделевское наследование у человека (OMIM): Фактор сборки цитохром-с-оксидазы COX10 - 602125
  11. ^ a b c Антоника Х., Лири С. К., Гверчин Г. Х., Агар Дж. Н., Хорват Р., Кеннауэй Н. Г., Хардинг СО, Якш М., Шубридж Е. А. (октябрь 2003 г.). «Мутации в COX10 приводят к дефекту биосинтеза митохондриального гема A и объясняют множественные клинические фенотипы с ранним началом, связанные с изолированным дефицитом COX» . Молекулярная генетика человека . 12 (20): 2693–702. DOI : 10,1093 / HMG / ddg284 . PMID 12928484 . 
  12. ^ Williams SL, Valnot I, Растин P, Taanman JW (февраль 2004). «Подгруппы цитохром с оксидазы в культурах фибробластов от пациентов, несущих мутации в COX10, SCO1 или SURF1» . Журнал биологической химии . 279 (9): 7462–9. DOI : 10.1074 / jbc.M309232200 . PMID 14607829 . 
  13. ^ Тайерс М. "Резюме результатов COX10 | BioGRID" . thebiogrid.org n . Проверено 7 августа 2018 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Расположение генома человека COX10 и страница сведений о гене COX10 в браузере генома UCSC .

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Питситли Р.Д., Таанман Дж. В., Рахман С., Менье Б., Садовски М., Цирак С. и др. (Декабрь 2013). «Мутации COX10, приводящие к сложному мультисистемному митохондриальному заболеванию, которое остается стабильным в зрелом возрасте» . JAMA Neurology . 70 (12): 1556–61. DOI : 10,1001 / jamaneurol.2013.3242 . PMID  24100867 .
  • Glerum DM, Tzagoloff A (август 1994 г.). «Выделение кДНК человека для гема А: фарнезилтрансферазы путем функциональной комплементации мутанта дрожжевого cox10» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (18): 8452–6. DOI : 10.1073 / pnas.91.18.8452 . PMC  44624 . PMID  8078902 .
  • Reiter LT, Murakami T., Koeuth T., Gibbs RA, Lupski JR (сентябрь 1997 г.). «Ген COX10 человека разрушается во время гомологичной рекомбинации между проксимальным и дистальным CMT1A-REP размером 24 т.п.н.» . Молекулярная генетика человека . 6 (9): 1595–603. DOI : 10.1093 / HMG / 6.9.1595 . PMID  9285799 .
  • Кеннерсон М.Л., Нассиф Н.Т., Докинз Дж. Л., ДеКрун Р. М., Ян Дж. Г., Николсон Г. А. (ноябрь 1997 г.). «Бинарный повтор Шарко-Мари-Тута содержит ген, транскрибируемый с противоположной цепи частично дублированной области гена COX10». Геномика . 46 (1): 61–9. DOI : 10.1006 / geno.1997.5012 . PMID  9403059 .
  • Кеннерсон М.Л., Нассиф Н.Т., Николсон Г.А. (октябрь 1998 г.). «Геномная структура и физическое картирование C17orf1: гена, связанного с проксимальным элементом бинарного повтора CMT1A-REP». Геномика . 53 (1): 110–2. DOI : 10.1006 / geno.1998.5453 . PMID  9787083 .
  • Валнот I, фон Клейст-Рецов Дж. К., Барриентос А., Горбатюк М., Таанман Дж. В., Мехай Б., Растин П., Цаголофф А., Мюнних А., Ретиг А. (май 2000 г.). «Мутация в гене гема А: фарнезилтрансферазы человека (COX10) вызывает дефицит цитохром с оксидазы» . Молекулярная генетика человека . 9 (8): 1245–9. DOI : 10.1093 / HMG / 9.8.1245 . PMID  10767350 .
  • Бозетти Ф., Бриззи Ф., Бароги С., Манкузо М., Сицилиано Дж., Тенди Э.А., Мурри Л., Рапопорт С.И., Солаини Г. (2002). «Активность цитохром-с-оксидазы и митохондриальной F1F0-АТФазы (АТФ-синтазы) в тромбоцитах и ​​головном мозге пациентов с болезнью Альцгеймера». Нейробиология старения . 23 (3): 371–6. DOI : 10.1016 / S0197-4580 (01) 00314-1 . PMID  11959398 . S2CID  5621542 .
  • Антоника Х., Лири С.К., Гверчин Г.Х., Агар Дж. Н., Хорват Р., Кеннауэй Н.Г., Хардинг СО, Якш М., Шубридж Е.А. (октябрь 2003 г.). «Мутации в COX10 приводят к дефекту биосинтеза митохондриального гема A и объясняют множественные клинические фенотипы с ранним началом, связанные с изолированным дефицитом COX» . Молекулярная генетика человека . 12 (20): 2693–702. DOI : 10,1093 / HMG / ddg284 . PMID  12928484 .
  • Уильямс С.Л., Валнот I, Растин П., Таанман Дж. У. (февраль 2004 г.). «Подгруппы цитохром с оксидазы в культурах фибробластов от пациентов, несущих мутации в COX10, SCO1 или SURF1» . Журнал биологической химии . 279 (9): 7462–9. DOI : 10.1074 / jbc.M309232200 . PMID  14607829 .
  • Коенен М.Дж., ван ден Хеувел Л.П., Угальде С., Тен Бринке М., Нийтманс Л.Г., Трайбелс Ф.Дж., Бебло С., Майер Е.М., Мунтау А.С., Смейтинк Д.А. (октябрь 2004 г.). «Биогенез цитохромоксидазы у пациента с мутацией в гене COX10». Анналы неврологии . 56 (4): 560–4. DOI : 10.1002 / ana.20229 . PMID  15455402 . S2CID  2348661 .
  • Велутакал Р., Каур Х., Голстоун М., Ковлуру А. (январь 2007 г.). «Доминантно-отрицательная альфа-субъединица фарнезил- и геранилтрансферазы ингибирует стимулированную глюкозой, но не стимулированную KCl секрецию инсулина в клетках INS 832/13». Диабет . 56 (1): 204–10. DOI : 10,2337 / db06-0668 . PMID  17192483 . S2CID  25460768 .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии .