CRMP1

Доступные конструкции

Ортолог поиск: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
4B3Z

Идентификаторы

Псевдонимы

CRMP1 , CRMP-1, DPYSL1, DRP-1, DRP1, ULIP-3, белок-медиатор ответа на коллапсин 1

Внешние идентификаторы

OMIM : 602462 MGI : 107793 HomoloGene : 20347 GeneCard : CRMP1

Расположение гена ( человек )

Chr.	Хромосома 4 (человек) ^[1]

Группа	4п16.2	Начинать	5 748 084 п.н. ^[1]
Группа	4п16.2	Конец	5 893 086 п.н. ^[1]

Расположение гена ( Мышь )

Chr.	Хромосома 5 (мышь) ^[2]

Группа	5 B3 \| 5 19,96 см	Начинать	37 241 940 п.н. ^[2]
Группа	5 B3 \| 5 19,96 см	Конец	37 292 133 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• ГО: связывание белка 0001948 • гидролазы активность • гидролазы активность, действующее на углерод-азот (но не пептид) облигаций • связывания filamin
Сотовый компонент	• веретено • цитоскелет • центр организации микротрубочек • цитоплазма • цитозоль • среднее тело • центросома • ядро клетки
Биологический процесс	• развитие нейрона • процесс метаболизма соединений, содержащих азотистые основания • организация цитоскелета микротрубочек • развитие нервной системы • управление аксонами • негативная регуляция связывания актиновых филаментов • негативная регуляция развития проекций нейронов
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


1400


12933

Ансамбль


ENSG00000072832


ENSMUSG00000029121

UniProt


Q14194


P97427

RefSeq (мРНК)


NM_001313 NM_001014809 NM_001288661 NM_001288662


NM_001136058 NM_007765

RefSeq (белок)


NP_001014809 NP_001275590 NP_001275591 NP_001304


NP_001129530 NP_031791

Расположение (UCSC)

Chr 4: 5,75 - 5,89 Мб

Chr 5: 37.24 - 37.29 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Медиаторный белок 1 ответа на коллапсин , кодируемый геном CRMP1 , является человеческим белком семейства CRMP . ^[5]

Этот ген кодирует член семейства цитозольных фосфопротеинов, экспрессируемых исключительно в нервной системе . Кодируемого белка , как полагают, является частью Semaphorin сигнала трансдукции замешан в семафорин-индуцированного роста конуса коллапса во время развития нервной системы . Альтернативный сплайсинг приводит к множеству вариантов транскрипции. ^[5]

CRMP1 обеспечивает передачу сигналов рилина при миграции корковых нейронов. ^{[6] У} мышей с дефицитом CRMP1 наблюдается нарушение долгосрочной потенциации и нарушение пространственного обучения и памяти . ^[7]

Ген CRMP1 перекрывается с другим геном, называемым EVC . ^[8]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что CRMP1 взаимодействует с DPYSL2 . ^[9]

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000072832 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029121 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ a b «Ген Entrez: белок-медиатор ответа коллапсина CRMP1 1» .
^ Ямашита N, Утида Y, Ohshima Т, S Хираи, Накамура Ж, Танигучи М, Mikoshiba К, Honnorat Дж, Kolattukudy Р, Thomasset Н, Такеи К, Т Такахаши, Goshima Y (декабрь 2006 г.). «Медиаторный белок 1 ответа на коллапсин опосредует передачу сигналов рилина при миграции корковых нейронов» . J. Neurosci. 26 (51): 13357–62. DOI : 10.1523 / JNEUROSCI.4276-06.2006 . PMC 6674993 . PMID 17182786 .
^ Су К.Ю., Чиен В.Л., Фу В.М., Ю И.С., Хуанг Х.П., Хуанг П.Х., Линь С.Р., Ши Дж.Й., Лин Ю.Л., Сюэ Ю.П., Ян ПК, Линь С.В. (март 2007 г.). «Мыши, дефицитные по медиаторному белку-1 коллапсинового ответа, демонстрируют нарушение долгосрочной потенциации и нарушение пространственного обучения и памяти» . J. Neurosci. 27 (10): 2513–24. DOI : 10.1523 / JNEUROSCI.4497-06.2007 . PMC 6672508 . PMID 17344389 .
^ Руис-Перес В.Л., Иде С.Е., Стром TM, Лоренц Б., Уилсон Д., Вудс К., Кинг Л., Франкомано С., Фрайзингер П., Спрангер С., Марино Б., Даллапиккола Б., Райт М., Мейтингер Т., Полимеропулос М. Х., Гудшип Дж. (Март 2000 г.). «Мутации в новом гене при синдроме Эллиса-ван Кревельда и акродентальном дизостозе Вейерса». Nat. Genet. 24 (3): 283–6. DOI : 10.1038 / 73508 . PMID 10700184 . S2CID 1391136 .
^ Люнг, Томас; Нг Ивонн; Чеонг Альберт; Нг Чонг Хан; Тан Иван; Холл Кристин; Лим Луис (декабрь 2002 г.). «Связывающий белок p80 ROKalpha представляет собой новый сплайсинговый вариант CRMP-1, который связывается с CRMP-2 и модулирует индуцированную RhoA морфологию нейронов» . FEBS Lett . 532 (3): 445–9. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (02) 03736-5 . ISSN 0014-5793 . PMID 12482610 . S2CID 45499981 .

Внешние ссылки [ править ]

Расположение генома человека CRMP1 и страница сведений о гене CRMP1 в браузере генома UCSC .

Дальнейшее чтение [ править ]

Shih JY, Lee YC, Yang SC и др. (2003). "Медиаторный белок-1 ответа на коллапсин: новый ген-супрессор инвазии". Clin. Exp. Метастаз . 20 (1): 69–76. DOI : 10,1023 / A: 1022598604565 . PMID 12650609 . S2CID 25005489 .
Хамадзима Н., Мацуда К., Саката С. и др. (1997). «Новое семейство генов, определяемое дигидропиримидиназой человека и тремя родственными белками с различным распределением в тканях». Джин . 180 (1–2): 157–63. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (96) 00445-3 . PMID 8973361 .
Торрес Р., Полимеропулос М. Х. (1999). «Геномная организация и локализация человеческого гена CRMP-1» . ДНК Res . 5 (6): 393–5. DOI : 10.1093 / dnares / 5.6.393 . PMID 10048489 .
Shih JY, Yang SC, Hong TM и др. (2001). «Медиаторный белок-1 ответа на коллапсин и инвазия и метастазирование раковых клеток» . J. Natl. Cancer Inst . 93 (18): 1392–400. DOI : 10.1093 / JNCI / 93.18.1392 . PMID 11562390 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Леунг Т., Нг И, Чеонг А. и др. (2003). «Связывающий белок p80 ROKalpha представляет собой новый сплайсинговый вариант CRMP-1, который связывается с CRMP-2 и модулирует индуцированную RhoA морфологию нейронов» . FEBS Lett . 532 (3): 445–9. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (02) 03736-5 . PMID 12482610 . S2CID 45499981 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. DOI : 10,1038 / нг1285 . PMID 14702039 .
Чанг СС, Ши Дж.Й., Дженг Ю.М. и др. (2004). «Фактор роста соединительной ткани и его роль в инвазии и метастазировании аденокарциномы легких» . J. Natl. Cancer Inst . 96 (5): 364–75. DOI : 10,1093 / JNCI / djh059 . PMID 14996858 .
Баллиф Б.А., Виллен Дж., Босолей С.А. и др. (2005). «Фосфопротеомный анализ развивающегося мозга мыши» . Мол. Клетка. Протеомика . 3 (11): 1093–101. DOI : 10.1074 / mcp.M400085-MCP200 . PMID 15345747 .
Goehler H, Lalowski M, Stelzl U, et al. (2004). «Сеть взаимодействия белков связывает GIT1, усилитель агрегации хантингтина, с болезнью Хантингтона». Мол. Cell . 15 (6): 853–65. DOI : 10.1016 / j.molcel.2004.09.016 . PMID 15383276 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта кДНК полной длины NIH: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. DOI : 10.1101 / gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Сивакумаран Т.А., Лесперанс М.М. (2005). «Анализ гаплотипа и неравновесия по сцеплению генов CRMP1 и EVC». Int. J. Mol. Med . 14 (5): 903–7. DOI : 10.3892 / ijmm.14.5.903 . PMID 15492864 .
Stelzl U, Worm U, Lalowski M, et al. (2005). «Сеть взаимодействия белок-белок человека: ресурс для аннотирования протеома» . Cell . 122 (6): 957–68. DOI : 10.1016 / j.cell.2005.08.029 . hdl : 11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0 . PMID 16169070 . S2CID 8235923 .
Коул А.Р., Козерет Ф., Ядырги Г. и др. (2006). «Определенные прайминговые киназы способствуют дифференциальной регуляции белков-медиаторов ответа на коллапсин с помощью киназы-3 гликоген-синтазы in vivo» . J. Biol. Chem . 281 (24): 16591–8. DOI : 10.1074 / jbc.M513344200 . PMC 1805471 . PMID 16611631 .
Weidemann W, Stelzl U, Lisewski U, et al. (2007). «Медиаторный белок 1 ответа на коллапсин (CRMP-1) и белок цинкового пальца промиелоцитарного лейкоза (PLZF) связываются с UDP-N-ацетилглюкозамин-2-эпимеразой / N-ацетилманнозаминазой (GNE), ключевым ферментом биосинтеза сиаловой кислоты» . FEBS Lett . 580 (28–29): 6649–54. DOI : 10.1016 / j.febslet.2006.11.015 . PMID 17118363 . S2CID 25369336 .

Эта статья о гене в хромосоме 4 человека - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000072832 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029121 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] «Ген Entrez: белок-медиатор ответа коллапсина CRMP1 1» .

[pmid17182786-6] Ямашита N, Утида Y, Ohshima Т, S Хираи, Накамура Ж, Танигучи М, Mikoshiba К, Honnorat Дж, Kolattukudy Р, Thomasset Н, Такеи К, Т Такахаши, Goshima Y (декабрь 2006 г.). «Медиаторный белок 1 ответа на коллапсин опосредует передачу сигналов рилина при миграции корковых нейронов» . J. Neurosci. 26 (51): 13357–62. DOI : 10.1523 / JNEUROSCI.4276-06.2006 . PMC 6674993 . PMID 17182786 .

[pmid17344389-7] Су К.Ю., Чиен В.Л., Фу В.М., Ю И.С., Хуанг Х.П., Хуанг П.Х., Линь С.Р., Ши Дж.Й., Лин Ю.Л., Сюэ Ю.П., Ян ПК, Линь С.В. (март 2007 г.). «Мыши, дефицитные по медиаторному белку-1 коллапсинового ответа, демонстрируют нарушение долгосрочной потенциации и нарушение пространственного обучения и памяти» . J. Neurosci. 27 (10): 2513–24. DOI : 10.1523 / JNEUROSCI.4497-06.2007 . PMC 6672508 . PMID 17344389 .

[pmid10700184-8] Руис-Перес В.Л., Иде С.Е., Стром TM, Лоренц Б., Уилсон Д., Вудс К., Кинг Л., Франкомано С., Фрайзингер П., Спрангер С., Марино Б., Даллапиккола Б., Райт М., Мейтингер Т., Полимеропулос М. Х., Гудшип Дж. (Март 2000 г.). «Мутации в новом гене при синдроме Эллиса-ван Кревельда и акродентальном дизостозе Вейерса». Nat. Genet. 24 (3): 283–6. DOI : 10.1038 / 73508 . PMID 10700184 . S2CID 1391136 .

[pmid12482610-9] Люнг, Томас; Нг Ивонн; Чеонг Альберт; Нг Чонг Хан; Тан Иван; Холл Кристин; Лим Луис (декабрь 2002 г.). «Связывающий белок p80 ROKalpha представляет собой новый сплайсинговый вариант CRMP-1, который связывается с CRMP-2 и модулирует индуцированную RhoA морфологию нейронов» . FEBS Lett . 532 (3): 445–9. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (02) 03736-5 . ISSN 0014-5793 . PMID 12482610 . S2CID 45499981 .

[1]