Из Википедии, свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
CTBP1
6cdf.jpg
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

1MX3 , 4LCE , 4U6Q

Идентификаторы
ПсевдонимыCTBP1 , C-концевой связывающий белок 1, BARS, HADDTS
Внешние идентификаторыOMIM : 602618 MGI : 1201685 HomoloGene : 1015 GeneCards : ctbp1
Расположение гена ( человек )
Хромосома 4 (человек)
Chr.Хромосома 4 (человек) [1]
Хромосома 4 (человек)
Геномное расположение CTBP1
Геномное расположение CTBP1
Группа4п16.3Начинать1 211 445 п.н. [1]
Конец1 249 953 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 5 (мышь)
Chr.Хромосома 5 (мышь) [2]
Хромосома 5 (мышь)
Геномное расположение CTBP1
Геномное расположение CTBP1
Группа5 B1 | 5 17,52 смНачинать33 247 723 п.н. [2]
Конец33 274 994 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE CTBP1 213980 s в формате fs.png

PBB GE CTBP1 212863 x at fs.png

PBB GE CTBP1 203392 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• оксидоредуктазная активность, действующая на группу CH-OH доноров, NAD или NADP в качестве акцептора
• GO: 0001106 активность корепрессора транскрипции
• специфическое связывание белкового домена
• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Связывание с ДНК активность фактора транскрипции
• NAD связывания
• транскрипционный фактор связывания
• белка С-конец связывания
• GO: связывание белка 0001948
• оксидоредуктазы активность
• подавление связывания фактора транскрипции
• связывание белка идентичен
• hydroxypyruvate редуктазы
• глиоксилат - редуктазы (НАДФ) активность
• активность гомодимеризации белков
Сотовый компонент• цитоплазма
• транскрипция регулятор комплекс
• транскрипционный комплекс репрессор
• нуклеоплазма
• ядро клетка
• цитозоль
• пресинаптических активной зона цитоплазматический компонент
• глутаматергические синапсы
• ГАКА-ергические синапсы
Биологический процесс• позитивная регуляция деацетилирования гистонов
• дифференцировка клеток
• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• вирусная репликация
• негативная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• транскрипция, ДНК-шаблон
• регуляция клеточного цикла
• негативная регуляция ацетилирования гистона H4
• белок фосфорилирование
• дифференцировка белых жировых клеток
• метаболизм
• вирусный процесс GO: 0022415
• негативная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• негативная регуляция ацетилирования гистонов
• окислительно-восстановительный процесс
• негативная регуляция пролиферации клеток
• организация хроматина, участвующая в негативной регуляции транскрипции
• замалчивание хроматина
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

1487

13016

Ансамбль

ENSG00000159692

ENSMUSG00000037373

UniProt

Q13363

O88712

RefSeq (мРНК)
NM_001012614
NM_001328
NM_001377186
NM_001377187
NM_001377188

NM_001377189
NM_001377190
NM_001377191
NM_001377192
NM_001377193

NM_001198859
NM_001198860
NM_001198861
NM_013502
NM_001310535

RefSeq (белок)
NP_001012632
NP_001319
NP_001364115
NP_001364116
NP_001364117

NP_001364118
NP_001364119
NP_001364120
NP_001364121
NP_001364122

NP_001185788
NP_001185789
NP_001185790
NP_001297464
NP_038530

Расположение (UCSC)Chr 4: 1.21 - 1.25 МбChr 5: 33,25 - 33,27 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

С-концевой-связывающий белок 1 , также известный как ctbp1 является белком , который в организме человека кодируется ctbp1 геном . [5] CtBP1 - один из двух белков CtBP, другой белок - CtBP2. [6]

Функция [ править ]

Белок CtBP1 был первоначально идентифицирован как белок человека, который связывал мотив PLDLS на С-конце белков аденовируса E1A. Позже было показано, что он и родственный белок CTBP2 функционируют как корепрессоры транскрипции . [7] То есть регуляторные белки, которые связываются с ДНК-связывающими белками, специфичными для последовательности, и помогают выключить гены. CtBPs делают это путем набора ферментов, модифицирующих гистоны, которые добавляют репрессивные гистоновые метки и удаляют активирующие метки. Белки CtBP также могут самоассоциироваться и, по-видимому, объединять генные регуляторные комплексы. [8]

CtBP1 широко экспрессируется от эмбриона до взрослого, тогда как CtBP2 имеет несколько более ограниченный паттерн экспрессии. CtBP выполняют множество биологических ролей и, по-видимому, играют наиболее важную роль в регуляции перехода эпителия в мезенхиму, а также влияют на метаболизм. Они делают последнее, связывая НАДН, а не НАД +, тем самым определяя соотношение НАДН / НАД + . При связывании он претерпевает конформационное изменение, которое позволяет ему димеризоваться и связываться со своими белками-партнерами и заглушать определенные гены.

Во время развития скелета и Т-клеток CtBP1 и CtBP2 связываются с доменом PLDLSL δEF1, клеточного белка гомеодомена цинкового пальца, и тем самым усиливают индуцированное δEF1 подавление транскрипции. CtBP также связывает семейство Kruppel-подобных факторов белков цинковых пальцев KLF3 , KLF8 и KLF12.. Кроме того, CtBP комплексы с CtIP, белком 125 кДа, который распознает явно отличные от CtBP белковые мотивы. CtIP связывается с повторами BRCT в гене рака груди BRCA1 и позволяет CtBP влиять на активность BRCA1. Оба белка могут также взаимодействовать с комплексом белков поликомб-группы, который участвует в регуляции экспрессии генов во время развития. Альтернативный сплайсинг транскриптов из этого гена приводит к множеству вариантов транскриптов. [9]

Белок, взаимодействующий с C-концевым связывающим белком (CtIP), является партнером по связыванию с CtBP, который способствует репрессии транскрипции и регуляции клеточного цикла и играет роль в клеточном ответе на повреждение ДНК . [10]

Взаимодействия [ править ]

CTBP1 взаимодействует с:

  • ACTL6B , [11]
  • АРФ , [12]
  • EVI1 [13] [14]
  • FOXP2 , [15]
  • HDAC1 , [16] [17] [18]
  • IKZF1 , [19]
  • IKZF4 , [20]
  • KLF3 , [7]
  • KLF8 , [21]
  • Mdm2 , [22]
  • MLL , [23]
  • NRIP1 , [24] [25]
  • Пинин , [26]
  • RBBP8 , [5] [27] и
  • TGIF1 . [17]
  • GATA1 . [28] [29]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000159692 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037373 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ a b Schaeper U, Subramanian T, Lim L, Boyd JM, Chinnadurai G (апрель 1998 г.). «Взаимодействие между клеточным белком, который связывается с С-концевой областью аденовируса E1A (CtBP), и новым клеточным белком нарушается E1A через консервативный мотив PLDLS» . J. Biol. Chem . 273 (15): 8549–52. DOI : 10.1074 / jbc.273.15.8549 . PMID 9535825 . 
  6. ^ Дин В, Юань Р, Damle ПК, Гроссман SR (2020). «CtBP определяет судьбу раковых клеток яичников посредством репрессии рецепторов смерти» . Смерть клетки и болезнь . 11 (4): 286. DOI : 10.1038 / s41419-020-2455-7 . PMC 7181866 . PMID 32332713 .  
  7. ^ a b Тернер Дж, Кроссли М (сентябрь 1998 г.). «Клонирование и характеристика mCtBP2, корепрессора, который ассоциируется с основным Krüppel-подобным фактором и другими регуляторами транскрипции млекопитающих» . EMBO J . 17 (17): 5129–40. DOI : 10.1093 / emboj / 17.17.5129 . PMC 1170841 . PMID 9724649 .  
  8. ^ Chinnadurai G (2002). «CtBP, нетрадиционный корепрессор транскрипции в развитии и онкогенезе». Мол. Cell . 9 (2): 213–24. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (02) 00443-4 . PMID 11864595 . 
  9. ^ "Entrez Gene: CTBP1 C-терминальный связывающий белок 1" .
  10. ^ Bruton РК, Расти M, Mapp KL, Гранд R (2007). «Белок, взаимодействующий с С-концевым связывающим белком, связывается непосредственно с ранней областью 1А аденовируса через свою N-концевую область и консервативную область 3» . Онкоген . 26 (53): 7467–7479. DOI : 10.1038 / sj.onc.1210551 . PMID 17546052 . 
  11. ^ Ома Y, Нисимори K, Harata M (февраль 2003). «Специфический для мозга актин-родственный белок ArpN-альфа взаимодействует с транскрипционным ко-репрессором CtBP». Биохим. Биофиз. Res. Commun . 301 (2): 521–8. DOI : 10.1016 / S0006-291X (02) 03073-5 . PMID 12565893 . 
  12. ^ Paliwal S, S Панде, Кови RC, Шарплесс NE, Bardeesy N, Гроссман SR (март 2006). «Нацеливание на C-концевой связывающий белок (CtBP) с помощью ARF приводит к p53-независимому апоптозу» . Мол. Клетка. Биол . 26 (6): 2360–72. DOI : 10.1128 / MCB.26.6.2360-2372.2006 . PMC 1430274 . PMID 16508011 .  
  13. ^ Чакраборти S, Сенюк В, Sitailo S, Чи Y, Nucifora G (ноябрь 2001 года). «Взаимодействие EVI1 с цАМФ-чувствительным элементом, связывающим белок-связывающий белок (CBP) и p300 / CBP-ассоциированный фактор (P / CAF), приводит к обратимому ацетилированию EVI1 и совместной локализации в ядерных спеклах» . J. Biol. Chem . 276 (48): 44936–43. DOI : 10.1074 / jbc.M106733200 . PMID 11568182 . 
  14. ^ Izutsu К, М Курокава, Имаи Y, маки К, Митаните К, Хираи Н (май 2001 г.). «Корепрессор CtBP взаимодействует с Evi-1, подавляя передачу сигналов трансформирующего фактора роста бета» . Кровь . 97 (9): 2815–22. DOI : 10.1182 / blood.V97.9.2815 . PMID 11313276 . 
  15. ↑ Li S, Weidenfeld J, Morrisey EE (январь 2004 г.). «Транскрипционная и ДНК-связывающая активность семейства Foxp1 / 2/4 модулируется гетеротипическими и гомотипическими взаимодействиями белков» . Мол. Клетка. Биол . 24 (2): 809–22. DOI : 10.1128 / MCB.24.2.809-822.2004 . PMC 343786 . PMID 14701752 .  
  16. ^ Чжан CL, McKinsey TA, Lu JR, Olson EN (январь 2001). «Ассоциация COOH-концевого связывающего белка (CtBP) и взаимодействующего с MEF2 репрессора транскрипции (MITR) способствует репрессии транскрипции фактора транскрипции MEF2» . J. Biol. Chem . 276 (1): 35–9. DOI : 10.1074 / jbc.M007364200 . PMID 11022042 . 
  17. ^ a b Мелхуиш Т.А., Уоттон Д. (декабрь 2000 г.). «Взаимодействие белка, связывающего карбоксильный конец, с корепрессором Smad TGIF нарушается мутацией голопрозэнцефалии в TGIF» . J. Biol. Chem . 275 (50): 39762–6. DOI : 10,1074 / jbc.C000416200 . PMID 10995736 . 
  18. ^ Sundqvist A, Sollerbrant K, Свенссон C (июнь 1998). «Карбокси-концевая область аденовируса E1A активирует транскрипцию посредством нацеливания на С-концевой связывающий белок-гистон-деацетилазный комплекс» . FEBS Lett . 429 (2): 183–8. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (98) 00588-2 . PMID 9650586 . S2CID 20660291 .  
  19. ^ Koipally J, K Георгопулоса (июнь 2000). «Взаимодействия Ikaros с CtBP выявляют механизм репрессии, который не зависит от активности гистондеацетилазы» . J. Biol. Chem . 275 (26): 19594–602. DOI : 10.1074 / jbc.M000254200 . PMID 10766745 . 
  20. ^ Пердомо J, Crossley M (декабрь 2002). «Белок семейства Ikaros Eos ассоциируется с корепрессорами C-концевого связывающего белка». Евро. J. Biochem . 269 (23): 5885–92. DOI : 10.1046 / j.1432-1033.2002.03313.x . PMID 12444977 . 
  21. ^ Ван Влита J, Turner J, Crossley M (май 2000). «Человеческий Krüppel-подобный фактор 8: белок связывания CACCC-бокса, который связывается с CtBP и подавляет транскрипцию» . Nucleic Acids Res . 28 (9): 1955–62. DOI : 10.1093 / nar / 28.9.1955 . PMC 103308 . PMID 10756197 .  
  22. ^ Мирнезами AH, Кэмпбелл SJ, Дарли M, Примроуз JN, Джонсон PW, Blaydes JP (июль 2003 г.). «Hdm2 привлекает корепрессор, чувствительный к гипоксии, чтобы отрицательно регулировать р53-зависимую транскрипцию» (PDF) . Curr. Биол . 13 (14): 1234–9. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (03) 00454-8 . PMID 12867035 . S2CID 2451241 .   
  23. ^ Ся З. Б., Андерсон М., Диас М. О., Железник-Ле, штат Нью-Джерси (июль 2003 г.). «Домен репрессии MLL взаимодействует с гистоновыми деацетилазами, белками поликомбовой группы HPC2 и BMI-1, а также с корепрессорным C-концевым связывающим белком» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 100 (14): 8342–7. DOI : 10.1073 / pnas.1436338100 . PMC 166231 . PMID 12829790 .  
  24. ^ Castet А, Boulahtouf А, Versini G, Bonnet S, Ожеро Р, Р Виньон, Khochbin S, S Jalaguier, Cavaillès В (2004). «Множественные домены белка 140, взаимодействующего с рецептором, способствуют ингибированию транскрипции» . Nucleic Acids Res . 32 (6): 1957–66. DOI : 10.1093 / NAR / gkh524 . PMC 390375 . PMID 15060175 .  
  25. ^ Perissi В, Scafoglio С, Чжан Дж, Ohgi К.А., Роза DW, Стекло СК, Розенфельд М. (март 2008 г.). «Фосфорилирование TBL1 и TBLR1 на промоторах регулируемых генов преодолевает двойные контрольные точки репрессии транскрипции CtBP и NCoR / SMRT» . Мол. Cell . 29 (6): 755–66. DOI : 10.1016 / j.molcel.2008.01.020 . PMC 2364611 . PMID 18374649 .  
  26. ^ Алпатов R, Munguba GC, Катон P, Joo JH, Ши Y, Ши Y, Hunt ME, Sugrue SP (декабрь 2004). «Связанный с ядерными спеклами белок Pnn / DRS связывается с транскрипционным корепрессором CtBP и снимает опосредованную CtBP репрессию гена E-кадгерина» . Мол. Клетка. Биол . 24 (23): 10223–35. DOI : 10.1128 / MCB.24.23.10223-10235.2004 . PMC 529029 . PMID 15542832 .  
  27. ^ Ли С., Чен П.Л., Субраманиан Т., Чиннадурай Г., Томлинсон Г., Осборн К.К., Шарп З.Д., Ли WH (апрель 1999 г.). «Связывание CtIP с BRCT-повторами BRCA1, участвующими в регуляции транскрипции p21, нарушается при повреждении ДНК» . J. Biol. Chem . 274 (16): 11334–8. DOI : 10.1074 / jbc.274.16.11334 . PMID 10196224 . 
  28. ^ Снег JW, Ким J, Карри CR, Xu J, Orkin SH (сентябрь 2010). «Сумоилирование регулирует взаимодействие FOG1 с C-концевым связывающим белком (CTBP)» . Журнал биологической химии . 285 (36): 28064–75. DOI : 10.1074 / jbc.M109.096909 . PMC 2934671 . PMID 20587419 .  
  29. ^ Katsumura KR, Bresnick EH (апрель 2017). «Революция фактора GATA в гематологии» . Кровь . 129 (15): 2092–2102. DOI : 10,1182 / кровь 2016-09-687871 . PMC 5391619 . PMID 28179282 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Чиннадурай G (2002). «CtBP, нетрадиционный корепрессор транскрипции в развитии и онкогенезе». Мол. Cell . 9 (2): 213–24. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (02) 00443-4 . PMID  11864595 .
  • Шапер У., Бойд Дж. М., Верма С. и др. (1995). «Молекулярное клонирование и характеристика клеточного фосфопротеина, который взаимодействует с консервативным C-концевым доменом аденовируса E1A, участвующим в отрицательной модуляции онкогенной трансформации» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 92 (23): 10467–71. DOI : 10.1073 / pnas.92.23.10467 . PMC  40632 . PMID  7479821 .
  • Бойд Дж. М., Субраманиан Т., Шапер У. и др. (1993). «Участок на С-конце белка E1a аденовируса 2/5 необходим для ассоциации с клеточным фосфопротеином и важен для отрицательной модуляции трансформации, опосредованной T24-ras, туморогенеза и метастазирования» . EMBO J . 12 (2): 469–78. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1993.tb05679.x . PMC  413230 . PMID  8440238 .
  • Шапер У., Субраманиан Т., Лим Л. и др. (1998). «Взаимодействие между клеточным белком, который связывается с С-концевой областью аденовируса E1A (CtBP), и новым клеточным белком нарушается E1A через консервативный мотив PLDLS» . J. Biol. Chem . 273 (15): 8549–52. DOI : 10.1074 / jbc.273.15.8549 . PMID  9535825 .
  • Сундквист А., Соллербрант К., Свенссон С. (1998). «Карбокси-концевая область аденовируса E1A активирует транскрипцию посредством нацеливания на С-концевой связывающий белок-гистон-деацетилазный комплекс» . FEBS Lett . 429 (2): 183–8. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (98) 00588-2 . PMID  9650586 . S2CID  20660291 .
  • Фукс Ф., Милнер Дж., Кузаридес Т. (1998). «BRCA2 ассоциируется с ацетилтрансферазной активностью при связывании с P / CAF» . Онкоген . 17 (19): 2531–4. DOI : 10.1038 / sj.onc.1202475 . PMID  9824164 .
  • Sewalt RG, Gunster MJ, van der Vlag J, et al. (1999). «C-концевой связывающий белок является репрессором транскрипции, который взаимодействует со специфическим классом белков Polycomb позвоночных» . Мол. Клетка. Биол . 19 (1): 777–87. DOI : 10,1128 / MCB.19.1.777 . PMC  83934 . PMID  9858600 .
  • Ли С., Чен П.Л., Субраманиан Т. и др. (1999). «Связывание CtIP с BRCT-повторами BRCA1, участвующими в регуляции транскрипции p21, нарушается при повреждении ДНК» . J. Biol. Chem . 274 (16): 11334–8. DOI : 10.1074 / jbc.274.16.11334 . PMID  10196224 .
  • Постиго А.А., декан округа Колумбия (1999). «ZEB подавляет транскрипцию посредством взаимодействия с корепрессором CtBP» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 96 (12): 6683–8. DOI : 10.1073 / pnas.96.12.6683 . PMC  21975 . PMID  10359772 .
  • Criqui-Filipe P, Ducret C, Maira SM, Wasylyk B (1999). «Net, негативный Ras-переключаемый TCF, содержит второй домен ингибирования, CID, который опосредует репрессию через взаимодействия с CtBP и деацетилирование» . EMBO J . 18 (12): 3392–403. DOI : 10.1093 / emboj / 18.12.3392 . PMC  1171419 . PMID  10369679 .
  • Холмс М., Тернер Дж., Фокс А. и др. (1999). «hFOG-2, новый белок цинкового пальца, связывает корепрессор mCtBP2 и модулирует GATA-опосредованную активацию» . J. Biol. Chem . 274 (33): 23491–8. DOI : 10.1074 / jbc.274.33.23491 . PMID  10438528 .
  • Фурусава Т, Морибе Х, Кондо Х, Хигаси Й (2000). «Идентификация CtBP1 и CtBP2 как корепрессоров цинкового пальца-гомеодомена фактора δEF1» . Мол. Клетка. Биол . 19 (12): 8581–90. DOI : 10.1128 / mcb.19.12.8581 . PMC  84984 . PMID  10567582 .
  • Ю X, Бэр Р. (2000). «Ядерная локализация и специфическая для клеточного цикла экспрессия CtIP, белка, который ассоциируется с опухолевым супрессором BRCA1» . J. Biol. Chem . 275 (24): 18541–9. DOI : 10.1074 / jbc.M909494199 . PMID  10764811 .
  • Койпалли Дж, Георгопулос К. (2000). «Взаимодействия Ikaros с CtBP выявляют механизм репрессии, который не зависит от активности гистондеацетилазы» . J. Biol. Chem . 275 (26): 19594–602. DOI : 10.1074 / jbc.M000254200 . PMID  10766745 .
  • Мелхуиш Т.А., Уоттон Д. (2001). «Взаимодействие белка, связывающего карбоксильный конец, с корепрессором Smad TGIF нарушается мутацией голопрозэнцефалии в TGIF» . J. Biol. Chem . 275 (50): 39762–6. DOI : 10,1074 / jbc.C000416200 . PMID  10995736 .
  • Чжан С.Л., МакКинси Т.А., Лу Дж. Р., Олсон Э. Н. (2001). «Ассоциация COOH-концевого связывающего белка (CtBP) и взаимодействующего с MEF2 репрессора транскрипции (MITR) способствует репрессии транскрипции фактора транскрипции MEF2» . J. Biol. Chem . 276 (1): 35–9. DOI : 10.1074 / jbc.M007364200 . PMID  11022042 .
  • Идзуцу К., Курокава М., Имаи Ю. и др. (2001). «Корепрессор CtBP взаимодействует с Evi-1, подавляя передачу сигналов трансформирующего фактора роста бета» . Кровь . 97 (9): 2815–22. DOI : 10.1182 / blood.V97.9.2815 . PMID  11313276 .
  • Палмер С., Бруйе Дж. П., Килби А. и др. (2001). «Трансформирующая и репрессорная активности Evi-1 опосредуются корепрессорными белками CtBP» . J. Biol. Chem . 276 (28): 25834–40. DOI : 10.1074 / jbc.M102343200 . PMID  11328817 .
  • Schuierer M, Hilger-Eversheim K, Dobner T, et al. (2001). «Индукция экспрессии AP-2alpha аденовирусной инфекцией включает инактивацию корепрессора транскрипции AP-2rep CtBP1» . J. Biol. Chem . 276 (30): 27944–9. DOI : 10.1074 / jbc.M100070200 . PMID  11373277 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Человек ctbp1 место генома и ctbp1 ген подробно страницу в браузере УСК генома .
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q13363 (C-концевой связывающий белок 1) в PDBe-KB .