CX3CL1

Доступные конструкции

Ортолог поиск: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
1B2T , 1F2L , 3ONA , 4XT1 , 4XT3

Идентификаторы

Псевдонимы

CX3CL1 , ABCD-3, C3Xkine, CXC3, CXC3C, NTN, NTT, SCYD1, фракталкин, нейротактин, хемокиновый лиганд 1 мотива C-X3-C

Внешние идентификаторы

OMIM: 601880 MGI: 1097153 HomoloGene: 2251 Генные карты : CX3CL1

Расположение гена (человек)

Chr.	Хромосома 16 (человека) ^[1]

Группа	16q21	Начинать	57 372 477 п.н. ^[1]
Группа	16q21	Конец	57 385 044 п.н. ^[1]

Расположение гена (Мышь)

Chr.	Хромосома 8 (мышь) ^[2]

Группа	8 C5 \| 8 46,79 см	Начинать	94 772 009 п.н. ^[2]
Группа	8 C5 \| 8 46,79 см	Конец	94 782 427 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Онтология генов
Молекулярная функция	• активность цитокинов • хемокинов активность • ГО: связывание белка 0001948 • CCR рецептора хемокина связывания • связывание рецептора • интегрин связывания • связывания с рецептором хемокинов CX3C
Сотовый компонент	• составной компонент мембраны • мембрана • клеточная мембрана • внеклеточная область • поверхность клетки • внеклеточная
Биологический процесс	• G-белком рецептор сигнального пути • защитную реакцию • положительное регулирование воспалительной реакции • хемотаксис моноцитов • цитокин-опосредованного сигнального пути • хемокинов-опосредованного сигнального пути • ангиогенез участвует в заживлении ран • клеточного ответа на фактор некроза опухоли • заживление ран • лейкоцитарного хемотаксис • хемотаксис нейтрофилов • позитивная регуляция ангиогенеза • позитивная регуляция продукции трансформирующего фактора роста бета1 • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase • клеточная адгезия • иммунный ответ • клеточный ответ на интерлейкин-1 • активация адгезии лейкоцитов • позитивная регуляция каскада ERK1 и ERK2 • клеточный ответ на интерферон-гамма • клеток хемотаксиса • лимфоцитов хемотаксиса • отрицательное регулирование внешней сигнального пути апоптоза в отсутствие лиганда • положительной регуляции кальций-независимой клеточной адгезии клеток • хемотаксис • интегрин активации • отрицательная регуляция миграции клеток • миграция лейкоцитов, участвующих в воспалительной реакции • хемотаксис макрофагов • регуляция активности рецепторов
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


6376


20312

Ансамбль


ENSG00000006210


ENSMUSG00000031778

UniProt


P78423


O35188

RefSeq (мРНК)


NM_002996 NM_001304392


NM_009142

RefSeq (белок)


NP_001291321 NP_002987


NP_033168

Расположение (UCSC)

Chr 16: 57.37 - 57.39 Мб

Chr 8: 94,77 - 94,78 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Фракталкин также известный как хемокинов (С-Х3-С мотив) лигандом 1 представляет собой белок , который у человека кодируется CX3CL1 гена .

Функция [ править ]

Фракталкин - это большой цитокиновый белок, состоящий из 373 аминокислот, он содержит несколько доменов и является единственным известным членом семейства хемокинов CX ₃ C. Он также широко известен под названиями фракталкин (у людей) и нейротактин (у мышей). ^[5]^[6] Полипептидная структура CX3CL1 отличается от типичной структуры других хемокинов. Например, различается расположение характерных N-концевых цистеинов ; есть три аминокислоты, разделяющие начальную пару цистеинов в CX3CL1, ни одной в хемокинах CC и только одну промежуточную аминокислоту в хемокинах CXC . CX3CL1 продуцируется в виде длинного белка (у человека из 373 аминокислот) с удлиненной муциноподобной ножкой и хемокиновым доменом наверху. Муциноподобный стебель позволяет ему связываться с поверхностью определенных клеток. Однако также наблюдалась растворимая (90 кДа) версия этого хемокина. Растворимый CX3CL1 сильно хемоаттрактирует Т-клетки и моноциты , в то время как связанный с клетками хемокин способствует прочной адгезии лейкоцитов к активированным эндотелиальным клеткам, где он в первую очередь экспрессируется. ^[6] CX3CL1 вызывает свои адгезивные и миграционные функции, взаимодействуя с хемокиновым рецептором CX3CR1 . ^[7] Его ген расположен на хромосоме 16 человека.наряду с некоторыми хемокинами CC, известными как CCL17 и CCL22 . ^[6]^[8]

Фракталкин обычно обнаруживается по всему мозгу, особенно в нервных клетках, и его рецептор, как известно, присутствует на клетках микроглии. Также было обнаружено, что он необходим для миграции клеток микроглии. ^[9] CX3CL1 также активируется в гиппокампе во время короткого временного окна после пространственного обучения , цель которого может заключаться в регулировании опосредованного глутаматом тонуса нейротрансмиссии. Это указывает на возможную роль хемокина в процессе защитной пластичности синаптического масштабирования . ^[10]

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000006210 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031778 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
↑ Pan Y, Lloyd C, Zhou H, Dolich S, Deeds J, Gonzalo JA, Vath J, Gosselin M, Ma J, Dussault B, Woolf E, Alperin G, Culpepper J, Gutierrez-Ramos JC, Gearing D (1997) . «Нейротактин, заякоренный в мембране хемокин, активируемый при воспалении мозга». Природа . 387 (6633): 611–617. DOI : 10,1038 / 42491 . PMID 9177350 . S2CID 4307876 .
^ a b c Базан Дж. Ф., Бэкон К. Б., Хардиман Дж., Ван В., Су К., Росси Д., Гривз Д. Р., Злотник А., Шалл Т. Дж. (1997). «Новый класс мембраносвязанных хемокинов с мотивом CX3C». Природа . 385 (6617): 640–644. DOI : 10.1038 / 385640a0 . PMID 9024663 . S2CID 4322166 .
^ Имаи Т, Хиешима К., Хаскелл С, Баба М, Нагира М, Нисимура М, Какизаки М, Такаги С, Номияма Х, Шалл ТД, Йоши О (1997). «Идентификация и молекулярная характеристика фракталкинового рецептора CX3CR1, который опосредует миграцию и адгезию лейкоцитов». Cell . 91 (4): 521–530. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80438-9 . PMID 9390561 . S2CID 17281691 .
^ Nomiyama Н, Имаи Т, Кусуда Дж, Миура R, Каллен DF, Йоши O (1998). «Человеческие хемокины фракталкин (SCYD1), MDC (SCYA22) и TARC (SCYA17) сгруппированы на хромосоме 16q13». Cytogenet. Cell Genet . 81 (1): 10–11. DOI : 10.1159 / 000015000 . PMID 9691168 . S2CID 46851784 .
^ Maciejewski-Lenoir, D .; Chen, S .; Feng, L .; Maki, R .; Бэкон, КБ (1999-08-01). «Характеристика фракталкина в клетках мозга крыс: миграционные и активационные сигналы для микроглии, экспрессирующей CX3CR-1». Журнал иммунологии . 163 (3): 1628–1635. ISSN 0022-1767 . PMID 10415068 .
^ Шеридан GK, Wdowicz A, Пикеринг M, Уоттерс O, Хэлли P, О'Салливан NC, Муни C, О'Коннелл DJ, О'Коннор JJ, Мерфи KJ (2014). «CX3CL1 активируется в гиппокампе крысы во время связанной с памятью синаптической пластичности» . Front Cell Neurosci . 8 : 233. DOI : 10,3389 / fncel.2014.00233 . PMC 4130185 . PMID 25161610 .

Внешние ссылки [ править ]

Расположение генома человека CX3CL1 и страница сведений о гене CX3CL1 в браузере генома UCSC .

Дальнейшее чтение [ править ]

Базан Дж. Ф., Бэкон К. Б., Хардиман Дж., Ван В., Су К., Росси Д., Гривз Д. Р., Злотник А., Шалл Т. Дж. (1997). «Новый класс мембраносвязанных хемокинов с мотивом CX3C». Природа . 385 (6617): 640–4. DOI : 10.1038 / 385640a0 . PMID 9024663 . S2CID 4322166 .
Combadiere C, Salzwedel K, Smith ED, Tiffany HL, Berger EA, Murphy PM (1998). «Идентификация CX3CR1. Хемотаксический рецептор фракталкина хемокина CX3C человека и корецептор слияния для ВИЧ-1» . J. Biol. Chem . 273 (37): 23799–804. DOI : 10.1074 / jbc.273.37.23799 . PMID 9726990 .
Меуччи О., Фататис А., Симен А.А., Бушелл Т.Дж., Грей П.В., Миллер Р.Дж. (1998). «Хемокины регулируют нейрональную передачу сигналов в гиппокампе и нейротоксичность gp120» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 95 (24): 14500–5. DOI : 10.1073 / pnas.95.24.14500 . PMC 24402 . PMID 9826729 .
Mizoue LS, Bazan JF, Johnson EC, Handel TM (1999). «Структура раствора и динамика хемокинового домена CX3C фракталкина и его взаимодействие с N-концевым фрагментом CX3CR1». Биохимия . 38 (5): 1402–14. DOI : 10.1021 / bi9820614 . PMID 9931005 .
Пападопулос Э.Дж., Сассетти К., Саеки Х., Ямада Н., Кавамура Т., Фитцхью Д.Д., Сараф М.А., Шалл Т., Блаувельт А., Розен С.Д., Хван ST (1999). «Фракталкин, хемокин CX3C, экспрессируется дендритными клетками и активируется при созревании дендритных клеток» . Евро. J. Immunol . 29 (8): 2551–9. DOI : 10.1002 / (SICI) 1521-4141 (199908) 29:08 <2551 :: AID-IMMU2551> 3.0.CO; 2-T . PMID 10458770 .
Лофтус Б.Дж., Ким Ю.Дж., Снеддон В.П., Калуш Ф., Брэндон Р., Фурманн Дж., Мейсон Т., Кросби М.Л., Барнстед М., Кронин Л., Деслаттес Мейс А., Цао И., Сюй RX, Канг Х.Л., Митчелл С., Эйхлер Э., Харрис ПК, Вентер Дж. К., Адамс Мэриленд (1999). «Дупликации генома и другие особенности в 12 Mb последовательности ДНК из хромосомы 16p и 16q человека». Геномика . 60 (3): 295–308. DOI : 10.1006 / geno.1999.5927 . PMID 10493829 .
Тонг Н., Перри С.В., Чжан К., Джеймс Х.Дж., Го Х., Брукс А., Бал Х., Киннер С.А., Файн С., Эпштейн Л.Г., Дайраги Д., Шалл Т.Дж., Гендельман Х.Э., Дьюхерст С., Акционер Л.Р., Гелбард Х.А. (2000) . «Экспрессия нейронального фракталкина при энцефалите ВИЧ-1: роль в рекрутировании макрофагов и нейропротекции в центральной нервной системе» . J. Immunol . 164 (3): 1333–9. DOI : 10.4049 / jimmunol.164.3.1333 . PMID 10640747 . S2CID 20616076 .
Фор С., Мейер Л., Костальола Д., Ваненсберг С., Генин Э, Отран Б., Дельфрэсси Дж. Ф., Макдермотт Д. Х., Мерфи П. М., Дебре П., Теодору И., Комбадьер С. (2000). «Быстрое развитие СПИДа у ВИЧ + людей со структурным вариантом хемокинового рецептора CX3CR1». Наука . 287 (5461): 2274–7. DOI : 10.1126 / science.287.5461.2274 . PMID 10731151 .
Гувер Д.М., Мизуэ Л.С., Гендель Т.М., Любковски Дж. (2000). «Кристаллическая структура хемокинового домена фракталкина демонстрирует новое четвертичное расположение» . J. Biol. Chem . 275 (30): 23187–93. DOI : 10.1074 / jbc.M002584200 . PMID 10770945 . S2CID 38835823 .
Меуччи О., Фататис А., Симен А.А., Миллер Р.Дж. (2000). «Экспрессия хемокиновых рецепторов CX3CR1 на нейронах и их роль в выживании нейронов» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 97 (14): 8075–80. DOI : 10.1073 / pnas.090017497 . PMC 16672 . PMID 10869418 .
Пападопулос Э.Дж., Фитцхью Д.Дж., Ткачик С., Гилфиллан А.М., Сассетти С., Меткалф Д.Д., Хванг ST (2000). «Тучные клетки мигрируют, но не дегранулируют, в ответ на фракталкин, связанный с мембраной хемокин, конститутивно экспрессируемый в различных клетках кожи». Евро. J. Immunol . 30 (8): 2355–61. DOI : 10.1002 / 1521-4141 (2000) 30: 8 <2355 :: АИД-IMMU2355> 3.0.CO; 2- # . PMID 10940926 .
Лукас А.Д., Чедвик Н., Уоррен Б.Ф., Джуэлл Д.П., Гордон С., Паури Ф., Гривз Д.Р. (2001). «Трансмембранная форма фракталкина хемокина CX3CL1 экспрессируется преимущественно эпителиальными клетками in vivo» . Являюсь. J. Pathol . 158 (3): 855–66. DOI : 10.1016 / S0002-9440 (10) 64034-5 . PMC 1850344 . PMID 11238035 .
Гартон К.Дж., Гоф П.Дж., Блобель С.П., Мерфи Дж., Гривз Д.Р., Демпси П.Дж., Рейнс Е.В. (2001). «Фермент, превращающий альфа-фактор некроза опухоли (ADAM17), опосредует расщепление и выделение фракталкина (CX3CL1)» . J. Biol. Chem . 276 (41): 37993–8001. DOI : 10.1074 / jbc.M106434200 . PMID 11495925 .
Умехара Х., Блум Э.Т., Окадзаки Т., Нагано Й., Йоши О, Имаи Т. (2004). «Фракталкин в биологии сосудов: от фундаментальных исследований к клиническому заболеванию» . Артериосклер. Тромб. Васк. Биол . 24 (1): 34–40. DOI : 10.1161 / 01.ATV.0000095360.62479.1F . PMID 12969992 . S2CID 6183022 .
Умэхара Х, Танака М, Саваки Т, Джин З. X, Хуанг Ч. Р., Донг Л, Каванами Т, Карасава Х, Масаки И, Фукусима Т, Хиросе Й, Окадзаки Т (2006). «Фракталкин при ревматоидном артрите и родственных ему состояниях». Mod Rheumatol . 16 (3): 124–30. DOI : 10.1007 / s10165-006-0471-9 . PMID 16767549 . S2CID 10199059 .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000006210 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031778 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[5] Pan Y, Lloyd C, Zhou H, Dolich S, Deeds J, Gonzalo JA, Vath J, Gosselin M, Ma J, Dussault B, Woolf E, Alperin G, Culpepper J, Gutierrez-Ramos JC, Gearing D (1997) . «Нейротактин, заякоренный в мембране хемокин, активируемый при воспалении мозга». Природа . 387 (6633): 611–617. DOI : 10,1038 / 42491 . PMID 9177350 . S2CID 4307876 .

[bazan-6] Базан Дж. Ф., Бэкон К. Б., Хардиман Дж., Ван В., Су К., Росси Д., Гривз Д. Р., Злотник А., Шалл Т. Дж. (1997). «Новый класс мембраносвязанных хемокинов с мотивом CX3C». Природа . 385 (6617): 640–644. DOI : 10.1038 / 385640a0 . PMID 9024663 . S2CID 4322166 .

[7] Имаи Т, Хиешима К., Хаскелл С, Баба М, Нагира М, Нисимура М, Какизаки М, Такаги С, Номияма Х, Шалл ТД, Йоши О (1997). «Идентификация и молекулярная характеристика фракталкинового рецептора CX3CR1, который опосредует миграцию и адгезию лейкоцитов». Cell . 91 (4): 521–530. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80438-9 . PMID 9390561 . S2CID 17281691 .

[8] Nomiyama Н, Имаи Т, Кусуда Дж, Миура R, Каллен DF, Йоши O (1998). «Человеческие хемокины фракталкин (SCYD1), MDC (SCYA22) и TARC (SCYA17) сгруппированы на хромосоме 16q13». Cytogenet. Cell Genet . 81 (1): 10–11. DOI : 10.1159 / 000015000 . PMID 9691168 . S2CID 46851784 .

[9] Maciejewski-Lenoir, D .; Chen, S .; Feng, L .; Maki, R .; Бэкон, КБ (1999-08-01). «Характеристика фракталкина в клетках мозга крыс: миграционные и активационные сигналы для микроглии, экспрессирующей CX3CR-1». Журнал иммунологии . 163 (3): 1628–1635. ISSN 0022-1767 . PMID 10415068 .

[pmid25161610-10] Шеридан GK, Wdowicz A, Пикеринг M, Уоттерс O, Хэлли P, О'Салливан NC, Муни C, О'Коннелл DJ, О'Коннор JJ, Мерфи KJ (2014). «CX3CL1 активируется в гиппокампе крысы во время связанной с памятью синаптической пластичности» . Front Cell Neurosci . 8 : 233. DOI : 10,3389 / fncel.2014.00233 . PMC 4130185 . PMID 25161610 .

[1]