• ион железа связывания • иона металла связывания • монооксигеназы активности • гем связывание • оксидоредуктазы активности, действуя на спаренных донорах, с включением или восстановлением молекулярного кислорода • оксидоредуктазы активность • витамин D3 25-гидроксилаза • стероидной гидроксилазной активности • оксидоредуктазы активности, действующая на парные доноры с включением или восстановлением молекулярного кислорода, восстановленным флавином или флавопротеином в качестве одного донора и включением одного атома кислорода
• ответ на ионизирующей радиации • процесс метаболизма витамина D • реакция на ион металла • витамина метаболического процесса • кальцитриол биосинтетического процесс от calciol • ответ на цезий ион • окислительно-восстановительный процесс • кислоты метаболический процесс органического • ксенобиотики метаболический процесс • экзогенный процесс катаболический наркотиков • процесс биосинтеза витамина D
Витамин D 25-гидроксилаза , также известная как цитохром Р450 2R1 представляет собой фермент , который у человека кодируется CYP2R1 геном . [5] [6] [7]
Содержание
1 Функция
2 Клиническое значение
2.1 Интерактивная карта проезда
3 Модельные организмы
4 ссылки
5 Дальнейшее чтение
6 Внешние ссылки
Функция [ править ]
Витамин D 25-гидроксилаза является членом суперсемейства ферментов цитохрома P450 . Белки цитохрома P450 представляют собой монооксигеназы, которые катализируют многие реакции, участвующие в метаболизме лекарств и синтезе холестерина, стероидов и других липидов. Этот фермент, обнаруженный в печени, представляет собой микросомальную гидроксилазу витамина D, которая превращает витамин D в 25-гидроксивитамин D (кальцидиол), который является основной циркулирующей формой витамина.
Клиническое значение [ править ]
Унаследованная мутация в гене CYP2R1 , которая приводит к замене пролина на остаток лейцина в кодоне 99, устраняет активность фермента и связана с витамин D-зависимым рахитом типа IB. Симптомы низкой циркулирующие уровни 25-гидроксивитамина D и классические симптомы дефицита витамина D . [6] Кодируемый им генный продукт, витамин D 25-гидроксилаза, был поэтому предложен в качестве ключевого фермента в превращении холекальциферола (витамин D 3 ) в кальцидиол . Кальцидиол впоследствии преобразуется под действием25-гидроксивитамин D3 1-альфа-гидроксилазы до кальцитриола , активной формы витамина D 3, которая связывается с рецептором витамина D (VDR), который опосредует большинство физиологических действий витамина. [6]
Превращение холекальциферола в кальцидиол, катализируемое CYP2R1.
Интерактивная карта проезда [ править ]
Нажмите на гены, белки и метаболиты ниже, чтобы ссылки на соответствующие статьи. [§ 1]
^ Интерактивную карту путей можно отредактировать на WikiPathways: "VitaminDSynthesis_WP1531" .
Модельные организмы [ править ]
Модельные организмы использовались в исследовании функции CYP2R1. Линия условно нокаутных мышей под названием Cyp2r1 tm1b (EUCOMM) Wtsi была создана в Wellcome Trust Sanger Institute . [8] Самцы и самки животных прошли стандартизированный фенотипический скрининг [9] для определения эффектов делеции. [10] [11] [12] [13] Проведены дополнительные проверки: - Углубленное иммунологическое фенотипирование [14]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000186104 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030670 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
↑ Nelson DR (декабрь 2002 г.). «Сравнение P450 от человека и фугу: 420 миллионов лет эволюции позвоночных P450». Arch Biochem Biophys . 409 (1): 18–24. DOI : 10.1016 / S0003-9861 (02) 00553-2 . PMID 12464240 .
^ a b c Cheng JB, Levine MA, Bell NH, Mangelsdorf DJ, Russell DW (18 мая 2004 г.). «Генетические доказательства того, что человеческий фермент CYP2R1 является ключевым витамином D 25-гидроксилазой» . Proc Natl Acad Sci USA . 101 (20): 7711–7715. Bibcode : 2004PNAS..101.7711C . DOI : 10.1073 / pnas.0402490101 . PMC 419671 . PMID 15128933 .
^ Гердин AK (2010). «Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью». Acta Ophthalmologica . 88 : 925–7. DOI : 10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x . S2CID 85911512 .
^ a b «Международный консорциум по фенотипированию мышей» .
^ Skarnes туалет, Розен В, Уэст А.П., Koutsourakis М, Бушелл Вт, Ийер В, Мухика А.О., Томас М, борона Дж, Кокс Т, Джексон D, Северин Дж, Биггс Р, фу Дж, Нефедов М, де - Jong PJ, Стюарт А.Ф., Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши» . Природа . 474 (7351): 337–42. DOI : 10,1038 / природа10163 . PMC 3572410 . PMID 21677750 .
^ Долгин E (июнь 2011). "Библиотека мыши настроена на нокаут" . Природа . 474 (7351): 262–3. DOI : 10.1038 / 474262a . PMID 21677718 .
↑ Collins FS, Rossant J, Wurst W (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Cell . 128 (1): 9–13. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.12.018 . PMID 17218247 . S2CID 18872015 .
^ Белый Ю.К., Gerdin А.К., Карп Н.А., Райдера Е, Булян М, Bussell Ю.Н., Salisbury Дж, Clare S, Ингам штат Нью - Джерси, Podrini С, Houghton R, Estabel J, Боттомли JR, Мелвин Д.Г., Сунтер D, Адамс Северная Каролина, Зангер Институт генетики мышей Project, Tannahill D, Logan DW, Macarthur DG, Flint J, Mahajan VB, Tsang SH, Smyth I, Watt FM, Skarnes WC, Dougan G, Adams DJ, Ramirez-Solis R, Bradley A, Steel KP (2013 г. ). «Полногеномное поколение и систематическое фенотипирование мышей с нокаутом открывает новые роли для многих генов» . Cell . 154 (2): 452–64. DOI : 10.1016 / j.cell.2013.06.022 . PMC 3717207 . PMID 23870131 .
^ a b «Консорциум иммунофенотипирования инфекций и иммунитета (3i)» .
Дальнейшее чтение [ править ]
Рамос-Лопес Э., Брюк П., Янсен Т. и др. (2008). «Ген CYP2R1 (витамин D 25-гидроксилаза) связан с восприимчивостью к диабету 1 типа и уровнями витамина D у немцев». Метаб. Диабета. Res. Ред . 23 (8): 631–6. DOI : 10.1002 / dmrr.719 . PMID 17607662 . S2CID 376070 .
Рамос-Лопес Э., Брюк П., Янсен Т. и др. (2007). «Экспрессия мРНК CYP2R1, CYP27B1 и CYP24 у немецких пациентов с диабетом 1 типа». J. Steroid Biochem. Мол. Биол . 103 (3–5): 807–10. DOI : 10.1016 / j.jsbmb.2006.12.056 . PMID 17223345 . S2CID 23849431 .
Wjst M, Altmüller J, Faus-Kessler T. и др. (2006). «В семьях, страдающих астмой, наблюдается неравновесная передача вариантов генов в метаболизме витамина D и сигнальном пути» . Респир. Res . 7 : 60. DOI : 10,1186 / 1465-9921-7-60 . PMC 1508148 . PMID 16600026 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. DOI : 10.1101 / gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Шинкё Р., Сакаки Т., Камакура М. и др. (2004). «Метаболизм витамина D микросомальным CYP2R1 человека». Biochem. Биофиз. Res. Commun . 324 (1): 451–7. DOI : 10.1016 / j.bbrc.2004.09.073 . PMID 15465040 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. DOI : 10,1038 / нг1285 . PMID 14702039 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M . DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Внешние ссылки [ править ]
Расположение генома человека CYP2R1 и страница сведений о гене CYP2R1 в браузере генома UCSC .
vтеPDB галерея
vтеЦитохромы , оксигеназы : цитохром P450 (большинство из них относится к EC 1.14)
