CDH11

Доступные конструкции

Ортолог поиск: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
2A4C , 2A4E

Идентификаторы

Псевдонимы

CDH11 , CAD11, CDHOB, OB, OSF-4, кадгерин 11, ESWS

Внешние идентификаторы

OMIM : 600023 MGI : 99217 HomoloGene : 1361 GeneCards : CDH11

Расположение гена ( человек )

Chr.	Хромосома 16 (человека) ^[1]

Группа	16q21	Начинать	64 943 753 п.н. ^[1]
Группа	16q21	Конец	65 126 112 п.н. ^[1]

Расположение гена ( Мышь )

Chr.	Хромосома 8 (мышь) ^[2]

Группа	8 D1 \| 8 50,44 см	Начинать	102 632 095 п.н. ^[2]
Группа	8 D1 \| 8 50,44 см	Конец	102 785 642 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• ион металла связывание • иона кальция связывания • цитоскелет связывание с белками • белок гомодимеризации активности • кадгерином связывания
Сотовый компонент	• клеточная мембрана • мембрана • цитоплазма • интегральный компонент мембраны • внеклеточная экзосома • поверхность клетки • комплекс катенина • синапс • коллатераль Шаффера - синапс CA1 • глутаматергический синапс
Биологический процесс	• гомофильной клеточной адгезии с помощью плазменной мембраны адгезии молекулы • развитие костной системы • слипчивых организации перехода • оссификации • Кортикоспинальных тракта морфогенез • клеточной адгезии • клеток морфогенез • клетка-клетка узел в сборе • кальций-зависимой клеточной адгезии-клеток с помощью плазматических мембран молекул клеточной адгезии • клеточная адгезия, опосредованная кадгерином • модуляция химической синаптической передачи • межклеточная адгезия
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


1009


12552

Ансамбль


ENSG00000140937


ENSMUSG00000031673

UniProt


P55287


P55288

RefSeq (мРНК)


NM_001308392 NM_001797 NM_001330576


NM_009866

RefSeq (белок)


NP_001295321 NP_001317505 NP_001788


NP_033996

Расположение (UCSC)

Chr 16: 64.94 - 65.13 Мб

Chr 8: 102,63 - 102,79 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Кадгерин-11 представляет собой белок , который у человека кодируется CDH11 гена . ^[5]^[6]

Функция [ править ]

Этот ген кодирует классический кадгерин типа II из суперсемейства кадгеринов, интегральные мембранные белки, которые опосредуют кальций-зависимую межклеточную адгезию. Зрелые белки кадгерина состоят из большого N-концевого внеклеточного домена, единственного трансмембранного домена и небольшого высококонсервативного C-концевого цитоплазматического домена. Кадгерины типа II (атипичные) определяются на основании отсутствия в них последовательности распознавания адгезии клеток HAV, специфичной для кадгеринов типа I. Экспрессия этого конкретного кадгерина в линиях остеобластических клеток и его активация во время дифференцировки предполагает особую функцию в развитии и поддержании костей. ^[6] Гомологи CDH-11 млекопитающих называют кальсинтенином . ^[7]

Связь с раком [ править ]

CDH11 сверхэкспрессируется в 15% случаев рака груди и кажется важным для прогрессирования опухоли при некоторых других типах рака. ^[8]^[9]

Взаимодействие с лекарствами [ править ]

Целекоксиб, лекарство от артрита, связывается с CDH11. ^[8]^[9]

Взаимодействия [ править ]

CDH11 взаимодействует с CDH2 . ^[10]

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000140937 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031673 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Kremmidiotis G, E Baker, Кроуфорд J, Eyre HJ, Nahmias J, Каллен DF (август 1998). «Локализация генов кадгерина человека в областях хромосом, демонстрирующих связанную с раком потерю гетерозиготности». Геномика . 49 (3): 467–71. DOI : 10.1006 / geno.1998.5281 . PMID 9615235 .
^ a b «Ген Энтреза: CDH11 кадгерин 11, тип 2, OB-кадгерин (остеобласт)» .
^ Вет л, Шримпф С.П., Meskenaite В, Фришкнехт R, Kinter J, Леон DP, Циглер U, Сондеррегер P (2001). «Кальсинтенин-1, протеолитически процессируемый белок постсинаптической мембраны с цитоплазматическим кальцийсвязывающим доменом». Мол. Клетка. Neurosci . 17 (1): 151–66. DOI : 10.1006 / mcne.2000.0937 . PMID 11161476 . S2CID 30856590 .
^ a b «Новый терапевтический подход может бороться как с раком, так и с артритом» . 15 ноя 2013.
^ a b Assefnia S, Dakshanamurthy S, Guidry Auvil JM, Hampel C, Anastasiadis PZ, Kallakury B, Uren A, Foley DW, Brown ML, Shapiro L, Brenner M, Haigh D, Byers SW (март 2014 г.). «Кадгерин-11 при злокачественных новообразованиях с плохим прогнозом и ревматоидном артрите: общая цель, общие методы лечения» . Oncotarget . 5 (6): 1458–74. DOI : 10.18632 / oncotarget.1538 . PMC 4039224 . PMID 24681547 .
^ Straub BK, Boda J, Kuhn C, Schnoelzer M, Korf U, Kempf T, Spring H, Hatzfeld M, Franke WW (декабрь 2003 г.). «Новая система межклеточного соединения: мозаика коры adhaerens из клеток волокна хрусталика» . J. Cell Sci . 116 (Pt 24): 4985–95. DOI : 10,1242 / jcs.00815 . PMID 14625392 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Сузуки С., Сано К., Танихара Х (1991). «Разнообразие семейства кадгеринов: данные о восьми новых кадгеринах в нервной ткани» . Cell Regul . 2 (4): 261–70. DOI : 10.1091 / mbc.2.4.261 . PMC 361775 . PMID 2059658 .
Танихара Х., Сано К., Хеймарк Р.Л., Сент-Джон Т., Сузуки С. (1995). «Клонирование пяти человеческих кадгеринов проясняет характерные особенности внеклеточного домена кадгерина и предоставляет дополнительные доказательства двух структурно различных типов кадгерина». Сотовые клеи. Commun . 2 (1): 15–26. DOI : 10.3109 / 15419069409014199 . PMID 7982033 .
Окадзаки М., Такешита С., Кавай С., Кикуно Р., Цудзимура А., Кудо А., Аманн Е. (1994). «Молекулярное клонирование и характеристика OB-кадгерина, нового члена семейства кадгеринов, экспрессируемого в остеобластах». J. Biol. Chem . 269 (16): 12092–8. PMID 8163513 .
Getsios S, Chen GT, Stephenson MD, Leclerc P, Blaschuk OW, MacCalman CD (1998). «Регулируемая экспрессия кадгерина-6 и кадгерина-11 в железистых эпителиальных и стромальных клетках эндометрия человека» . Dev. Дин . 211 (3): 238–47. DOI : 10.1002 / (SICI) 1097-0177 (199803) 211: 3 <238 :: AID-AJA5> 3.0.CO; 2-I . PMID 9520111 .
Пишваян MJ, Feltes CM, Thompson P, Bussemakers MJ, Schalken JA, Byers SW (1999). «Кадгерин-11 экспрессируется в клеточных линиях инвазивного рака груди». Cancer Res . 59 (4): 947–52. PMID 10029089 .
Кавагути Дж., Такешита С., Кашима Т., Имаи Т., Машинами Р., Кудо А. (1999). «Экспрессия и функция варианта сплайсинга гена кадгерина-11 человека в подчинении интактному кадгерину-11». J. Bone Miner. Res . 14 (5): 764–75. DOI : 10,1359 / jbmr.1999.14.5.764 . PMID 10320525 . S2CID 12829659 .
Браунгарт Э., Шумахер Ц., Хартманн Э., Некарда Х., Беккер К.Ф., Хёфлер Х., Аткинсон М.Дж. (2000). «Функциональная потеря аллелей E-кадгерина и кадгерина-11 на хромосоме 16q22 при раке толстой кишки». J. Pathol . 187 (5): 530–4. DOI : 10.1002 / (SICI) 1096-9896 (199904) 187: 5 <530 :: AID-PATH293> 3.0.CO; 2-C . PMID 10398117 .
Кашима Т., Кавагути Дж., Такешита С., Курода М., Таканаши М., Хориучи Х., Имамура Т., Исикава Ю., Исида Т., Мори С., Мачинами Р., Кудо А. (1999). «Аномальная экспрессия кадгерина при остеосаркоме. Возможные связи с метастазами и морфогенезом» . Являюсь. J. Pathol . 155 (5): 1549–55. DOI : 10.1016 / S0002-9440 (10) 65471-5 . PMC 1866957 . PMID 10550312 .
Леканда Ф., Ченг С.Л., Шин С.С., Дэвидсон М.К., Варлоу П., Авиоли Л.В., Чивителли Р. (2000). «Дифференциальная регуляция кадгеринов дексаметазоном в клетках остеобластов человека». J. Cell. Биохим . 77 (3): 499–506. DOI : 10.1002 / (SICI) 1097-4644 (20000601) 77: 3 <499 :: AID-JCB14> 3.0.CO; 2-0 . PMID 10760957 .
Браунгарт Э., Хартман Э., Бехлер К., Хёфлер Х., Аткинсон М.Дж. (2002). «Внутриклеточный домен кадгерина-11 не требуется для индукции агрегации клеток, адгезии или образования щелевых соединений». Cell Commun. Клеи . 8 (1): 15–27. DOI : 10.3109 / 15419060109080704 . PMID 11775026 . S2CID 23322445 .
Штрауб Б.К., Бода Дж., Кун С., Шноельцер М., Корф Ю., Кемпф Т., Спринг Х., Хацфельд М., Франке В.В. (2004). «Новая система межклеточного соединения: мозаика коры adhaerens из клеток волокна хрусталика» . J. Cell Sci . 116 (Pt 24): 4985–95. DOI : 10,1242 / jcs.00815 . PMID 14625392 .
Моримото А.М., Тан Н., Вест К., МакАртур Дж., Тонер ГК, Мэннинг В.С., Смолич Б.Д., Черрингтон Дж. М. (2004). «Профили экспрессии генов опухолей ксенотрансплантата толстой кишки человека после лечения SU11248, многоцелевого ингибитора тирозинкиназы» . Онкоген . 23 (8): 1618–26. DOI : 10.1038 / sj.onc.1207268 . PMID 14985702 .
Марчонг М.Н., Чен Д., Корсон Т.В., Ли К., Хармандаян М., Боулз Э., Чен Н., Галли Б.Л. (2005). «Минимальная потеря генома 16q предполагает участие кадгерина-11 в ретинобластоме». Мол. Cancer Res . 2 (9): 495–503. PMID 15383628 .
Oliveira AM, Perez-Atayde AR, Inwards CY, Medeiros F, Derr V, Hsi BL, Gebhardt MC, Rosenberg AE, Fletcher JA (2004). «Онкогены USP6 и CDH11 идентифицируют неопластические клетки в первичных аневризматических костных кистах и отсутствуют в так называемых вторичных аневризматических костных кистах» . Являюсь. J. Pathol . 165 (5): 1773–80. DOI : 10.1016 / S0002-9440 (10) 63432-3 . PMC 3278819 . PMID 15509545 .
Кинер Х.П., Бреннер МБ (2005). «Создание синовиальной оболочки: кадгерин-11 опосредует межклеточную адгезию синовиоцитов, подобных фибробластам» . Исследования и терапия артрита . 7 (2): 49–54. DOI : 10,1186 / ar1495 . PMC 1065331 . PMID 15743489 .
Кинер Х.П., Ли Д.М., Агарвал С.К., Бреннер МБ (2006). «Кадгерин-11 побуждает синовиоциты, подобные фибробластам, при ревматоидном артрите образовывать выстилающие слои in vitro» . Являюсь. J. Pathol . 168 (5): 1486–99. DOI : 10,2353 / ajpath.2006.050999 . PMC 1606584 . PMID 16651616 .

Внешние ссылки [ править ]

Расположение человеческого гена CDH11 в браузере генома UCSC .
Подробная информация о человеческом гене CDH11 в браузере генома UCSC .

Эта статья о гене в хромосоме 16 человека - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000140937 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031673 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9615235-5] Kremmidiotis G, E Baker, Кроуфорд J, Eyre HJ, Nahmias J, Каллен DF (август 1998). «Локализация генов кадгерина человека в областях хромосом, демонстрирующих связанную с раком потерю гетерозиготности». Геномика . 49 (3): 467–71. DOI : 10.1006 / geno.1998.5281 . PMID 9615235 .

[entrez-6] «Ген Энтреза: CDH11 кадгерин 11, тип 2, OB-кадгерин (остеобласт)» .

[pmid11161476-7] Вет л, Шримпф С.П., Meskenaite В, Фришкнехт R, Kinter J, Леон DP, Циглер U, Сондеррегер P (2001). «Кальсинтенин-1, протеолитически процессируемый белок постсинаптической мембраны с цитоплазматическим кальцийсвязывающим доменом». Мол. Клетка. Neurosci . 17 (1): 151–66. DOI : 10.1006 / mcne.2000.0937 . PMID 11161476 . S2CID 30856590 .

[ge2014-8] «Новый терапевтический подход может бороться как с раком, так и с артритом» . 15 ноя 2013.

[Assefnia_2014-9] Assefnia S, Dakshanamurthy S, Guidry Auvil JM, Hampel C, Anastasiadis PZ, Kallakury B, Uren A, Foley DW, Brown ML, Shapiro L, Brenner M, Haigh D, Byers SW (март 2014 г.). «Кадгерин-11 при злокачественных новообразованиях с плохим прогнозом и ревматоидном артрите: общая цель, общие методы лечения» . Oncotarget . 5 (6): 1458–74. DOI : 10.18632 / oncotarget.1538 . PMC 4039224 . PMID 24681547 .

[pmid14625392-10] Straub BK, Boda J, Kuhn C, Schnoelzer M, Korf U, Kempf T, Spring H, Hatzfeld M, Franke WW (декабрь 2003 г.). «Новая система межклеточного соединения: мозаика коры adhaerens из клеток волокна хрусталика» . J. Cell Sci . 116 (Pt 24): 4985–95. DOI : 10,1242 / jcs.00815 . PMID 14625392 .

[1]