Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
CTSC
Белок CTSC PDB 1k3b.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

4OEM , 1K3B , 2DJF , 2DJG , 3PDF , 4CDC , 4CDD , 4CDE , 4CDF , 4OEL

Идентификаторы
ПсевдонимыCTSC , CPPI, DPP-I, DPP1, DPPI, HMS, JP, JPD, PALS, PDON1, PLS, катепсин C
Внешние идентификаторыOMIM: 602365 MGI: 109553 HomoloGene: 1373 Генные карты : CTSC
Расположение гена (человек)
Хромосома 11 (человек)
Chr.Хромосома 11 (человека) [1]
Хромосома 11 (человек)
Геномное расположение CTSC
Геномное расположение CTSC
Группа11q14.2Начинать88 293 592 п.н. [1]
Конец88 337 761 п.н. [1]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE CTSC 201487 в fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• пептидазы активатор активность участвует в апоптотическом процессе
• связывание фосфатазы
• пептидазы активности цистеина типа
• связывание шаперона
• белок самосборки
• пептидазы активности
• GO: 0001948 связывания белка
• идентичного связывания с белками
• ион хлорида связывания
• цистеина типа эндопептидаза активность
• серина активность эндопептидазы -типа
• активность гидролазы
Сотовый компонент• Гольджи
• эндоплазматический ретикулум просвет
• мембраны
• эндоплазматический ретикулум
• COPII покрытием ЭР для Гольджи транспорта везикулы
• лизосом
• внеклеточного экзосом
• эндоплазматический ретикулум-Гольджи промежуточного отсека мембраны
• Гольджи мембраны
• внеклеточная область
• внеклеточного
• нуклеоплазма
• центросому
• азурофильных гранул Просвет
• внутриклеточная органелла, ограниченная мембраной
• внеклеточный матрикс, содержащий коллаген
• цитоплазма
Биологический процесс• старение
• позитивная регуляция протеолиза, участвующего в катаболическом процессе клеточного белка
• позитивная регуляция апоптотического сигнального пути
• ответ на органическое вещество
• протеолиз
• ER на перенос везикул Гольджи
• покрытие везикул COPII
• иммунный ответ
• протеолиз, участвующий в катаболическом процессе клеточного белка
• цитотоксичность, опосредованная Т-клетками
• процесс апоптоза
• дегрануляция нейтрофилов
• негативная регуляция миелинизации
• позитивная регуляция активации микроглиальных клеток
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

1075

13032

Ансамбль

ENSG00000109861

ENSMUSG00000030560

UniProt

P53634

P97821

RefSeq (мРНК)

NM_148170
NM_001114173
NM_001814

NM_009982
NM_001311790

RefSeq (белок)

NP_001107645
NP_001805
NP_680475

NP_001298719
NP_034112

Расположение (UCSC)Chr 11: 88.29 - 88.34 Мбн / д
PubMed поиск[2][3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши
Исключенный домен катепсина С
повторное определение нативной структуры дипептидилпептидазы i человека (катепсин c)
Идентификаторы
СимволКатепсинC_exc
PfamPF08773
ИнтерПроIPR014882
SCOP21k3b / СФЕРА / СУПФАМ
Доступные белковые структуры:
Pfam  структуры / ECOD  
PDBRCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumрезюме структуры

Катепсин C ( CTSC ), также известный как дипептидилпептидаза I ( DPP-I ), представляет собой лизосомальную экзоцистеиновую протеазу, принадлежащую к семейству пептидаз C1. В организме человека он кодируется CTSC гена . [4] [5]

Функция [ править ]

Катепсин C, по-видимому, является центральным координатором активации многих сериновых протеаз в иммунных / воспалительных клетках.

Катепсин C катализирует удаление дипептидов с N-конца белковых и пептидных субстратов, за исключением случаев, когда (i) аминогруппа N-конца заблокирована, (ii) сайт расщепления находится по обе стороны от остатка пролина, ( iii) N-концевой остаток представляет собой лизин или аргинин, или (iv) структура пептида или белка предотвращает дальнейшее расщепление с N-конца.

Структура [ править ]

КДНК, кодирующие крысиный, человеческий, мышиный, коровий, собачий и два шистосомных катепсина Cs, были клонированы и секвенированы, и они показали, что фермент является высококонсервативным. [6] кДНК катепсина C человека и крысы кодируют предшественники (препрокатепсин C), содержащие сигнальные пептиды из 24 остатков, про-области из 205 (катепсин C) или 206 (катепсин C человека) остатков и каталитические домены из 233 остатков, которые содержат каталитические остатки , и на 30-40% идентичны зрелой аминокислотные последовательности папаина и ряд других катепсинов включая катепсины, B , H , K , L и S . [7]

Транслированный препрокатепсин C процессируется в зрелую форму по меньшей мере за четыре отщепления полипептидной цепи. Сигнальный пептид удаляется во время транслокации или секреции профермента (прокатепсина C), и большой N-концевой фрагмент прорегиона (также известный как домен исключения) [8], который сохраняется в зрелом ферменте, разделяется из каталитического домена путем удаления минорной С-концевой части про-области, называемой активационным пептидом. Тяжелая цепь из примерно 164 остатков и легкая цепь из примерно 69 остатков образуются в результате расщепления каталитического домена.

В отличие от других членов семейства папаина , зрелый катепсин С состоит из четырех субъединиц, каждая из которых состоит из N-концевого фрагмента прорегиона, тяжелой цепи и легкой цепи. И про-фрагмент области, и тяжелая цепь гликозилированы.

Клиническое значение [ править ]

Дефекты в кодируемого белка , как было показано , чтобы быть причиной болезни Мотылек-Лефевр , [9] [10] аутосомно - рецессивное заболевание , характеризующееся Palmoplantar кератоз и периодонтит .

Катепсин C функционирует как ключевой фермент в активации сериновых пептидаз гранул в воспалительных клетках, таких как эластаза и катепсин G в клетках нейтрофилов и химаза и триптаза в тучных клетках. При многих воспалительных заболеваниях, таких как ревматоидный артрит, хроническая обструктивная болезнь легких (ХОБЛ), воспалительное заболевание кишечника, астма, сепсис и муковисцидоз, значительная часть патогенеза обусловлена ​​повышенной активностью некоторых из этих воспалительных протеаз. После активации катепсином С протеазы способны разрушать различные компоненты внеклеточного матрикса, что может привести к повреждению тканей и хроническому воспалению.

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000109861 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  3. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Entrez Gene: CTSC катепсин C" .
  5. ^ Париж, Strukelj В, Pungercar Дж, Ренько МЫ, Доленц I, V Турка (август 1995 г.). «Молекулярное клонирование и анализ последовательности человеческого препрокатепсина C» . Письма FEBS . 369 (2–3): 326–30. DOI : 10.1016 / 0014-5793 (95) 00777-7 . PMID 7649281 . S2CID 45737414 .  
  6. ^ Хол-Jamriska л, Деликтное ДФ, Дальтон JP, День SR, Вентилятор J, J Aaskov, Бриндлите PJ (август 1998 г.). «Катепсин С из Schistosoma japonicum - кДНК, кодирующая препроэнзим и его филогенетические отношения» . Европейский журнал биохимии / FEBS . 255 (3): 527–34. DOI : 10.1046 / j.1432-1327.1998.2550527.x . PMID 9738890 . 
  7. ^ Kominami Е, Ишидо К, Му D, Сат N (июль 1992). «Первичная структура и тканевое распределение катепсина С». Биологическая химия Хоппе-Зейлер . 373 (7): 367–73. DOI : 10.1515 / bchm3.1992.373.2.367 . PMID 1515062 . 
  8. ^ Турка Д, Янич В, Стерн я, Podobnik М, Ламба D, Dahl SW, Лауритцен С, Педерсен Дж, Турка В, В Турка (декабрь 2001). «Структура дипептидилпептидазы I (катепсин С) человека: домен исключения, добавленный к каркасу эндопептидазы, создает машину для активации гранулярных сериновых протеаз» . Журнал EMBO . 20 (23): 6570–82. DOI : 10.1093 / emboj / 20.23.6570 . PMC 125750 . PMID 11726493 .  
  9. ^ Вани А.А., Devkar N, Patole MS, Shouche YS (февраль 2006). «Описание двух новых мутаций гена катепсина С у пациентов с синдромом Папийона-Лефевра». Журнал пародонтологии . 77 (2): 233–7. DOI : 10,1902 / jop.2006.050124 . PMID 16460249 . 
  10. ^ Meade JL де Wynter EA, Бретт P, Sharif С.М., Woods CG, Маркем AF, Cook GP (май 2006). «Семья с синдромом Папийона-Лефевра выявляет потребность в катепсине С для активации гранзима В и цитолитической активности NK-клеток» . Кровь . 107 (9): 3665–8. DOI : 10.1182 / кровь-2005-03-1140 . PMID 16410452 . 

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Макгуайр MJ, Lipsky PE, Thiele DL (июнь 1992 г.). «Очистка и характеристика дипептидилпептидазы I из селезенки человека». Архивы биохимии и биофизики . 295 (2): 280–8. DOI : 10.1016 / 0003-9861 (92) 90519-3 . PMID  1586157 .
  • Париж А., Струкель Б., Пунгеркар Дж., Ренко М., Доленц И., Тюрк V (август 1995 г.). «Молекулярное клонирование и анализ последовательности человеческого препрокатепсина C» . Письма FEBS . 369 (2–3): 326–30. DOI : 10.1016 / 0014-5793 (95) 00777-7 . PMID  7649281 . S2CID  45737414 .
  • Доленц I, Тюрк Б, Пунгерчич Дж, Ритонья А, Тюрк V (сентябрь 1995 г.). «Олигомерная структура и субстрат вызывают ингибирование катепсина С человека» . Журнал биологической химии . 270 (37): 21626–31. DOI : 10.1074 / jbc.270.37.21626 . PMID  7665576 .
  • Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID  8125298 .
  • Рао Н.В., Рао Г.В., Хойдал-младший (апрель 1997 г.). «Человеческая дипептидил-пептидаза I. Характеристика, локализация и экспрессия генов» . Журнал биологической химии . 272 (15): 10260–5. DOI : 10.1074 / jbc.272.15.10260 . PMID  9092576 .
  • Фишер Дж., Бланше-Бардон К., Прюдхомм Дж. Ф., Павек С., Стейлен П. М., Дубертрет Л., Вайссенбах Дж. (1997). «Картирование синдрома Папийона-Лефевра в области хромосомы 11q14». Европейский журнал генетики человека . 5 (3): 156–60. DOI : 10.1159 / 000484751 . ЛВП : 2066/24363 . PMID  9272739 .
  • Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID  9373149 .
  • Цигич Б., Крижай И., Краль Б., Тюрк В., Пейн Р.Х. (январь 1998 г.). «Стехиометрия и гетерогенность про-региональной цепи в тетрамерном катепсине С человека». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура белка и молекулярная энзимология . 1382 (1): 143–50. DOI : 10.1016 / S0167-4838 (97) 00173-8 . PMID  9507095 .
  • Тумс К., Джеймс Дж., Вуд А.Дж., Ву К.Л., Маккормик Д., Ленч Н., Хьюитт К., Мойнихан Л., Робертс Э., Вудс К.Г., Маркхэм А., Вонг М., Видмер Р., Гаффар К.А., Пембертон М., Хусейн И.Р., Темтами С.А. , Дэвис Р., Рид А. П., Слоан П., Диксон М. Дж., Таккер Н. С. (декабрь 1999 г.). «Мутации с потерей функции в гене катепсина C приводят к заболеваниям пародонта и ладонно-подошвенному кератозу» . Генетика природы . 23 (4): 421–4. DOI : 10.1038 / 70525 . PMID  10581027 . S2CID  11433166 .
  • Hart TC, Hart PS, Bowden DW, Michalec MD, Callison SA, Walker SJ, Zhang Y, Firatli E (декабрь 1999 г.). «Мутации гена катепсина С ответственны за синдром Папийона-Лефевра» . Журнал медицинской генетики . 36 (12): 881–7. doi : 10.1136 / jmg.36.12.881 (неактивен 2021-01-14). PMC  1734286 . PMID  10593994 .CS1 maint: DOI неактивен с января 2021 г. ( ссылка )
  • Hart TC, Hart PS, Michalec MD, Zhang Y, Firatli E, Van Dyke TE, Stabholz A, Zlotogorski A, Shapira L, Soskolne WA, Zlorogorski A (февраль 2000 г.). «Синдром Хаима-Мунка и синдром Папийона-Лефевра представляют собой аллельные мутации катепсина С» . Журнал медицинской генетики . 37 (2): 88–94. DOI : 10.1136 / jmg.37.2.88 . PMC  1734521 . PMID  10662807 .
  • Hart TC, Hart PS, Michalec MD, Zhang Y, Marazita ML, Cooper M, Yassin OM, Nusier M, Walker S (февраль 2000 г.). «Локализация гена препубертатного периодонтита на хромосоме 11q14 и идентификация мутации гена катепсина C» . Журнал медицинской генетики . 37 (2): 95–101. DOI : 10.1136 / jmg.37.2.95 . PMC  1734516 . PMID  10662808 .
  • Сузуки Ю., Исихара Д., Сасаки М., Накагава Х., Хата Х, Цунода Т., Ватанабэ М., Комацу Т., Ота Т., Исогай Т., Суяма А., Сугано С. (март 2000 г.). «Статистический анализ 5'-нетранслируемой области мРНК человека с использованием библиотек кДНК« олиго-кэпированных »». Геномика . 64 (3): 286–97. DOI : 10.1006 / geno.2000.6076 . PMID  10756096 .
  • Цигич Б., Даль С.В., Пейн Р.Х. (октябрь 2000 г.). «Остаточная про-часть катепсина С удовлетворяет критериям, необходимым для внутримолекулярного шаперона в сворачивании и стабилизации профермента человека». Биохимия . 39 (40): 12382–90. DOI : 10.1021 / bi0008837 . PMID  11015218 .
  • Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геномные исследования . 10 (11): 1788–95. DOI : 10.1101 / gr.143000 . PMC  310948 . PMID  11076863 .
  • Hart PS, Zhang Y, Firatli E, Uygur C, Lotfazar M, Michalec MD, Marks JJ, Lu X, Coates BJ, Seow WK, Marshall R, Williams D, Reed JB, Wright JT, Hart TC (декабрь 2000 г.). «Идентификация мутаций катепсина C у пациентов с синдромом папийона-Лефевра различного этнического происхождения» . Журнал медицинской генетики . 37 (12): 927–32. DOI : 10.1136 / jmg.37.12.927 . PMC  1734492 . PMID  11106356 .
  • Чжан Ю., Лундгрен Т., Ренверт С., Татакис Д. Н., Фиратли Э, Уйгур К., Харт П. С., Горри М. С., Маркс Дж. Дж., Харт Т.С. (февраль 2001 г.). «Доказательства эффекта основателя для четырех мутаций гена катепсина С у пациентов с синдромом Папийона-Лефевра» . Журнал медицинской генетики . 38 (2): 96–101. DOI : 10.1136 / jmg.38.2.96 . PMC  1734811 . PMID  11158173 .
  • Накано А., Номура К., Накано Х., Оно Ю., ЛаФорджиа С., Пулккинен Л., Хашимото И., Уитто Дж. (Февраль 2001 г.). «Синдром Папийона-Лефевра: мутации и полиморфизмы в гене катепсина С». Журнал следственной дерматологии . 116 (2): 339–43. DOI : 10.1046 / j.1523-1747.2001.01244.x . PMID  11180012 .
  • Альенде Л.М., Гарсиа-Перес М.А., Морено А., Корелл А., Карасол М., Мартинес-Канут П., Арнаис-Вильена А. (февраль 2001 г.). «Ген катепсина C: первый сложный гетерозиготный пациент с синдромом Папийона-Лефевра и новой бессимптомной мутацией». Мутация человека . 17 (2): 152–3. DOI : 10.1002 / 1098-1004 (200102) 17: 2 <152 :: АИД-HUMU10> 3.0.CO; 2- # . PMID  11180601 .
  • Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Обермайер Б., Тампе Дж., Хойбнер Д., Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Поустка А. (март 2001 г.). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека» . Геномные исследования . 11 (3): 422–35. DOI : 10.1101 / гр . GR1547R . PMC  311072 . PMID  11230166 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Merops онлайновой базы данных для пептидазы и их ингибиторов: C01.070
  • Катепсин + C в Национальных медицинских предметных рубриках США (MeSH)