Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
CTSE
Белок CTSE PDB 1tzs.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

1TZS

Идентификаторы
ПсевдонимыCTSE , Ctse, A430072O03Rik, C920004C08Rik, CE, CatE, катепсин E
Внешние идентификаторыOMIM : 116890 MGI : 107361 HomoloGene : 37551 GeneCards : CTSE
Расположение гена ( человек )
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человека) [1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение CTSE
Геномное расположение CTSE
Группа1q32.1Начинать206 008 535 б.п. [1]
Конец206 023 909 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 1 (мышь)
Chr.Хромосома 1 (мышь) [2]
Хромосома 1 (мышь)
Геномное расположение CTSE
Геномное расположение CTSE
Группа1 E4 | 1 57,14 смНачинать131 638 306 п.н. [2]
Конец131 675 505 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE CTSE 205927 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• пептидаза активность
• гидролазная активность
• белок гомодимеризация активность
• эндопептидаза активность аспарагинового типа
Сотовый компонент• эндосома
Биологический процесс• автопроцессинг белка
• катаболический процесс белка
• процессинг антигена и презентация экзогенного пептидного антигена через MHC класса II
• протеолиз
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

1510

13034

Ансамбль

ENSG00000196188

ENSMUSG00000004552

UniProt

P14091

P70269

RefSeq (мРНК)

NM_001910
NM_148964
NM_001317331

NM_007799

RefSeq (белок)

NP_001304260
NP_001901
NP_683865

NP_031825

Расположение (UCSC)Chr 1: 206.01 - 206.02 МбChr 1: 131.64 - 131.68 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши
Катепсин E
Идентификаторы
ЕС нет.3.4.23.34
№ CAS110910-42-4
Базы данных
IntEnzПросмотр IntEnz
BRENDABRENDA запись
ExPASyПросмотр NiceZyme
КЕГГЗапись в KEGG
MetaCycметаболический путь
ПРИАМпрофиль
Структуры PDB RCSB PDB PDBe PDBsum
Поиск
ЧВКстатьи
PubMedстатьи
NCBIбелки

Катепсина Е представляет собой фермент ( ЕС 3.4.23.34 ) , что в организме человека кодируется CTSE гена . [5] [6] [7] Фермент также известен как медленная протеиназа , аспарагиновая протеиназа мембраны эритроцитов , SMP , EMAP , непепсиновая протеиназа , катепсин D-подобная кислотная протеиназа , катепсин E-подобная кислотная протеиназа , катепсин D -типа протеиназы ) представляет собой фермент . [8] [9] [10] [11]

Катепсин E - это протеаза, обнаруженная у животных, а также у различных других организмов, которая принадлежит к группе аспарагиновых протеаз . У человека он кодируется геном CTSE , расположенным в 1q32 на хромосоме 1 . [12] [13] [11] [14] Это внутриклеточный нелизосомный гликопротеин, который в основном обнаруживается в коже и в иммунных клетках. [15] Белок представляет собой аспартилпротеазу, которая функционирует как гомодимер с дисульфидной связью и имеет олигосахаридную цепь высокоманнозного типа. [16] Он является членом семейства пептидаз A1 и, следовательно, обладает специфичностью, аналогичной специфичностиПепсина А и катепсина Д . Катепсин E является внутриклеточным ферментом и, по-видимому, не участвует в переваривании пищевых белков. В наибольшем количестве он обнаруживается на поверхности клеток эпителия желудка, производящей слизь. Это первая аспарагиновая протеаза, присутствующая в желудке плода, и она обнаруживается более чем в половине случаев рака желудка, что приводит к тому, что она является онкофетальным антигеном . Для этого гена существуют варианты транскриптов, использующие альтернативные сигналы полиаденилирования, и два варианта транскриптов, кодирующие разные изоформы . [14] [15]

Дефицит уровней катепсина E в организме может играть роль в воспалительных кожных заболеваниях, таких как атопический дерматит , лечение которых будет зависеть от исправления функциональности и уровней белка в организме. [17] Наряду с ренином и катепсином D, катепсин E является одной из немногих аспарагиновых протеаз, которые, как известно, вырабатываются в тканях человека, кроме тканей желудочно-кишечного тракта и репродуктивного тракта. [18]

Структура [ править ]

Структура катепсина E очень похожа на структуру катепсина D и BACE1 , и все 3 имеют почти идентичные области активного сайта. Различия между ними заключаются в микросреде, окружающей их активные центры.. Остатки DTG 96-98 и DTG 281-283 способствуют образованию активного центра фермента. Также имеются две пары дисульфидных связей при остатках Cys 272-276 и Cys 314-351. Два других остатка Cys в положениях 109 и 114 аминокислотной цепи расположены близко друг к другу в трехмерном пространстве, однако расстояние между их атомами серы составляет 3,53 Å, что слишком велико для образования надлежащей дисульфидной связи. В структуре также есть четыре водородные связи между остатками Asp активного центра и окружающими остатками. Отличительный фактор катепсина E по сравнению со структурой катепсина D и BACE1 можно увидеть в образовании дополнительной водородной связи между остатками Asp 96 и Ser 99 и отсутствии водородной связи с Leu / Met в Asp 281. [17]

Местоположение [ править ]

Фермент распределяется в клетках желудочно-кишечного тракта , лимфоидных тканях, клетках крови, мочевыводящих органах и микроглии . Его внутриклеточная локализация в различных клетках млекопитающих отличается от его аналога катепсина D. Катепсин E ассоциируется с мембранной тканью во внутриклеточных канальцах париетальных клеток желудка , желчных канальцах клеток печени, клетках проксимального канальца ринальной зоны в почках, эпителиальной ткани. клетки кишечника, трахеи и бронхов, остеокласты и даже эритроциты. Его локализацию в структурах эндосом можно увидеть во многих различных типах клеток, таких как антигенпрезентирующие В-клеточные лимфобласты., клетки желудка и микроглия. Его присутствие также обнаруживается в цистернах эндоплазматического ретикулума клетки . [16] [19]

Функция [ править ]

Катепсин E играет жизненно важную роль в деградации белка, процессинге антигена через путь MHC класса II [14] и генерации биоактивного белка. Также считается, что фермент участвует в реализации пути смерти нейронов, вызванной возрастом, а также в чрезмерной стимуляции рецепторов глутамата эксайтотоксинами и транзиторной ишемии переднего мозга . В эксперименте, проведенном на крысах, катепсин Е практически не обнаруживался в тканях мозга молодых крыс, однако у более старых крыс его уровень был значительно повышен в неостриатуме и коре головного мозга.. Фермент также экспрессировался на высоких уровнях в активированной микроглии области CA1 гиппокампа и в дегенерирующих нейронах в течение недели после временной ишемии переднего мозга. [19] Катепсин E может играть роль в развитии хорошо дифференцированной аденокарциномы из кишечной метаплазии . [16] Фермент также играет роль в ассоциации с дендритными клетками, где он генерирует репертуар CD4 в ответ на собственные и чужеродные белки. [20]

Посттрансляционная модификация [ править ]

Фермент гликозилирован . Различные типы клеток способствуют различию в природе углеводной цепи. В проферменте фибробластов наблюдается олигосахарид с высоким содержанием маннозы, однако зрелый фермент можно увидеть с олигосахаридом сложного типа. В мембранах эритроцитов зрелый фермент и профермент содержат олигосахариды сложного типа. Автокаталитическое расщепление дает две формы фермента: Форма 1 начинается с остатка Ile 54, а Форма 2 - с Thr 57. [21]

См. Также [ править ]

  • Катепсин

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000196188 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000004552 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Куврёр JM, Адзума Т, Миллер Д., Rocchi М, Мохандас ТК, Boudi ФА, Таггарт РТ (август 1990 г.). «Отнесение катепсина E (CTSE) к области хромосомы человека 1q31 путем гибридизации in situ и анализа гибридов соматических клеток». Цитогенетика и клеточная генетика . 53 (2–3): 137–9. DOI : 10.1159 / 000132914 . PMID 2369841 . 
  6. Перейти ↑ Azuma T, Pals G, Mohandas TK, Couvreur JM, Taggart RT (октябрь 1989 г.). «Человеческий желудочный катепсин E. Предсказанная последовательность, локализация в хромосоме 1 и гомология последовательности с другими аспарагиновыми протеиназами» . Журнал биологической химии . 264 (28): 16748–53. DOI : 10.1016 / S0021-9258 (19) 84768-3 . PMID 2674141 . 
  7. ^ "Entrez Gene: CTSE катепсин E" .
  8. ^ Lapresle С, Puizdar В, Porchon-Bertolotto С, Е Жуков, Турка V (июнь 1986). «Структурные различия между катепсином E кролика и катепсином D». Биологическая химия Хоппе-Зейлер . 367 (6): 523–6. DOI : 10.1515 / bchm3.1986.367.1.523 . PMID 3741628 . 
  9. ^ Ёнэдзава S, Фуджи К, Maejima Y, Tamoto К, Мори Y, Муто N (ноябрь 1988). «Дальнейшие исследования катепсина Е крысы: субклеточная локализация и существование активной формы субъединицы». Архивы биохимии и биофизики . 267 (1): 176–83. DOI : 10.1016 / 0003-9861 (88) 90021-5 . PMID 3058036 . 
  10. ^ Юпп RA, Ричардс AD, Кей J, Dunn BM, Викофф JB, Samloff IM, Yamamoto K (сентябрь 1988). «Идентификация аспарагиновых протеиназ из мембран эритроцитов человека и слизистой оболочки желудка (медленная протеиназа) как каталитически эквивалентных катепсину E» . Биохимический журнал . 254 (3): 895–8. DOI : 10.1042 / bj2540895 . PMC 1135167 . PMID 3058118 .  
  11. ^ а б Адзума Т., Пальс Г., Мохандас Т.К., Куврёр Дж. М., Таггарт RT (октябрь 1989 г.). «Человеческий желудочный катепсин E. Предсказанная последовательность, локализация в хромосоме 1 и гомология последовательности с другими аспарагиновыми протеиназами» . Журнал биологической химии . 264 (28): 16748–53. DOI : 10.1016 / S0021-9258 (19) 84768-3 . PMID 2674141 . 
  12. ^ "CTSE катепсин E [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI" . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 16 октября 2016 .
  13. ^ Куврёр JM, Адзума Т, Миллер Д., Rocchi М, Мохандас ТК, Boudi ФА, Таггарт РТ (1990). «Отнесение катепсина E (CTSE) к области хромосомы человека 1q31 путем гибридизации in situ и анализа гибридов соматических клеток». Цитогенетика и клеточная генетика . 53 (2–3): 137–9. DOI : 10.1159 / 000132914 . PMID 2369841 . 
  14. ^ a b c Zaidi N, Kalbacher H (март 2008 г.). «Катепсин E: мини-обзор». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 367 (3): 517–22. DOI : 10.1016 / j.bbrc.2007.12.163 . PMID 18178150 . 
  15. ^ а б Ясуда Й, Кагеяма Т., Акамине А, Шибата М., Коминами Э., Учияма Ю., Ямамото К. (июнь 1999 г.). «Характеристика новых флуорогенных субстратов для быстрого и чувствительного анализа катепсина E и катепсина D». Журнал биохимии . 125 (6): 1137–43. DOI : 10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a022396 . PMID 10348917 . 
  16. ^ a b c Саку Т, Сакаи Х, Сибата Й, Като Й, Ямамото К. (декабрь 1991 г.). «Иммуноцитохимическое исследование четкой внутриклеточной локализации катепсина E и катепсина D в клетках желудка человека и различных клетках крыс». Журнал биохимии . 110 (6): 956–64. DOI : 10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a123696 . PMID 1794985 . 
  17. ^ a b Chou KC (май 2005 г.). «Моделирование третичной структуры катепсина-Е человека». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 331 (1): 56–60. DOI : 10.1016 / j.bbrc.2005.03.123 . PMID 15845357 . 
  18. ^ Лис WE, Калинка S, Мич J, Capper SJ, Кук Н.Д., Кей J (октябрь 1990). «Генерация человеческого эндотелина катепсином Е» . Письма FEBS . 273 (1–2): 99–102. DOI : 10.1016 / 0014-5793 (90) 81060-2 . PMID 2226872 . 
  19. ^ a b Цукуба Т., Окамото К., Ясуда Ю., Морикава В., Наканиси Н., Ямамото К. (декабрь 2000 г.). «Новые функциональные аспекты катепсина D и катепсина E». Молекулы и клетки . 10 (6): 601–11. DOI : 10.1007 / s10059-000-0601-8 . PMID 11211863 . S2CID 20761872 .  
  20. ^ Сеть BM, Free P, P Medd, Swetman C, Табор AB, Terrazzini N (февраль 2005). «Экспрессия и функция катепсина E в дендритных клетках» . Журнал иммунологии . 174 (4): 1791–800. DOI : 10.4049 / jimmunol.174.4.1791 . PMID 15699105 . 
  21. ^ «CTSE - предшественник катепсина E - Homo sapiens (человек) - ген и белок CTSE» . www.uniprot.org . Проверено 16 октября 2016 .

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Цукуба Т., Ямамото К. (июль 2003 г.). «[Атопический дерматит и катепсин E]» . Нихон Якуригаку Засши. Folia Pharmacologica Japonica . 122 (1): 15–20. DOI : 10.1254 / fpj.122.15 . PMID  12843568 .
  • Флинн Т.Дж., Дешмук Д.С., Пиеринджер Р.А. (август 1977 г.). «Влияние измененной функции щитовидной железы на метаболизм галактозилдиацилглицерина в миелинизирующем мозге крыс» . Журнал биологической химии . 252 (16): 5864–70. DOI : 10.1016 / S0021-9258 (17) 40103-7 . PMID  195962 .
  • Адзума Т., Лю WG, Вандер Лаан DJ, Bowcock AM, Taggart RT (январь 1992 г.). «Ген желудочного катепсина Е человека. Множественные транскрипты являются результатом альтернативного полиаденилирования первичных транскриптов одного локуса гена в 1q31-q32» . Журнал биологической химии . 267 (3): 1609–14. DOI : 10.1016 / S0021-9258 (18) 45989-3 . PMID  1370478 .
  • Саку Т., Сакаи Х, Сибата Й, Като Й, Ямамото К. (декабрь 1991 г.). «Иммуноцитохимическое исследование четкой внутриклеточной локализации катепсина E и катепсина D в клетках желудка человека и различных клетках крыс». Журнал биохимии . 110 (6): 956–64. DOI : 10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a123696 . PMID  1794985 .
  • Атауда С.Б., Такахаши Т., Иноуэ Х., Ичиносе М., Такахаши К. (ноябрь 1991 г.). «Протеолитическая активность и специфичность расщепления катепсина E при физиологическом pH, как исследовали в отношении B-цепи окисленного инсулина» . Письма FEBS . 292 (1-2): 53-6. DOI : 10.1016 / 0014-5793 (91) 80832-N . PMID  1959628 .
  • Лис В.Е., Калинка С., Мич Дж., Кэппер С.Дж., Кук Н.Д., Кей Дж. (Октябрь 1990 г.). «Генерация человеческого эндотелина катепсином Е» . Письма FEBS . 273 (1–2): 99–102. DOI : 10.1016 / 0014-5793 (90) 81060-2 . PMID  2226872 .
  • Атауда С.Б., Мацузаки О., Кагеяма Т., Такахаши К. (апрель 1990 г.). «Структурные данные для двух изоферментных форм и сайта связывания углеводов желудочного катепсина E человека». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 168 (2): 878–85. DOI : 10.1016 / 0006-291X (90) 92403-M . PMID  2334440 .
  • Фаулер С.Д., Кей Дж., Данн Б.М., Татнелл П.Дж. (июнь 1995 г.). «Мономерный катепсин Е человека». Письма FEBS . 366 (1): 72–4. DOI : 10.1016 / 0014-5793 (95) 00501-Y . PMID  7789521 . S2CID  38970367 .
  • Finley EM, Kornfeld S (декабрь 1994 г.). «Субклеточная локализация и нацеливание катепсина Е» . Журнал биологической химии . 269 (49): 31259–66. DOI : 10.1016 / S0021-9258 (18) 47417-0 . PMID  7983070 .
  • Такэда-Эзаки М., Ямамото К. (август 1993 г.). «Выделение и биохимическая характеристика прокатепсина E из мембран эритроцитов человека». Архивы биохимии и биофизики . 304 (2): 352–8. DOI : 10.1006 / abbi.1993.1361 . PMID  8346912 .
  • Шульц Т.Ф., Ривз Дж. Д., Хоад Дж. Г., Портной С., Стивенс П., Клементс Дж., Ортлепп С., Пейдж К. А., Мур Дж. П., Вайс Р. А. (февраль 1993 г.). «Влияние мутаций в петле V3 gp120 ВИЧ-1 на инфекционность и восприимчивость к протеолитическому расщеплению». Исследования СПИДа и ретровирусы человека . 9 (2): 159–66. DOI : 10,1089 / aid.1993.9.159 . PMID  8457383 .
  • Finzi G, Cornaggia M, Capella C, Fiocca R, Bosi F, Solcia E, Samloff IM (март 1993). «Катепсин E в связанном с фолликулом эпителии кишечника и миндалин: локализация в М-клетках и возможная роль в процессинге антигена». Гистохимия . 99 (3): 201–11. DOI : 10.1007 / BF00269138 . PMID  8491674 . S2CID  6045937 .
  • Адзума Т., Хираи М., Ито С., Ямамото К., Таггарт Р. Т., Мацуба Т., Ясукава К., Уно К., Хаякумо Т., Накадзима М. (август 1996 г.). «Экспрессия катепсина E в поджелудочной железе: возможный онкомаркер для поджелудочной железы, предварительный отчет». Международный журнал рака . 67 (4): 492–7. DOI : 10.1002 / (SICI) 1097-0215 ​​(19960807) 67: 4 <492 :: AID-IJC5> 3.0.CO; 2-N . PMID  8759606 .
  • Сили Л., Мота Ф, Реймент Н., Татнелл П., Кей Дж., Цепь В (август 1996 г.). «Регулирование экспрессии катепсина E во время дифференцировки В-клеток человека in vitro». Европейский журнал иммунологии . 26 (8): 1838–43. DOI : 10.1002 / eji.1830260826 . PMID  8765029 . S2CID  29006370 .
  • Бернштейн Х.Г., Райхенбах А., Видерандерс Б. (январь 1998 г.). «Иммунореактивность катепсина Е в тканях глаза человека: влияние старения и патологических состояний». Письма неврологии . 240 (3): 135–8. DOI : 10.1016 / S0304-3940 (97) 00946-4 . PMID  9502222 . S2CID  9176410 .
  • Кук М., Касвелл Р. Дж., Ричардс Р. Дж., Кей Дж., Татнелл П. Дж. (Май 2001 г.). «Регулирование экспрессии гена прокатепсина E человека и мыши». Европейский журнал биохимии . 268 (9): 2658–68. DOI : 10.1046 / j.1432-1327.2001.02159.x . PMID  11322887 .
  • Сузуки Й, Цунода Т, Сесе Дж, Тайра Х, Мидзусима-Сугано Дж, Хата Х, Ота Т, Исогай Т, Танака Т, Накамура Й, Суяма А, Сакаки Й, Моришита С., Окубо К., Сугано С. (май 2001 г.) . «Идентификация и характеристика потенциальных промоторных областей 1031 вида генов человека» . Геномные исследования . 11 (5): 677–84. DOI : 10.1101 / gr.gr-1640r . PMC  311086 . PMID  11337467 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Merops онлайновой базы данных для пептидазы и их ингибиторов: A01.010
  • Cathepsin + E в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)