Контакты в 2

CNTN2

Доступные конструкции

Ортолог поиск: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
2ОМ5

Идентификаторы

Псевдонимы

CNTN2 , AXT, FAME5, TAG-1, TAX, TAX1, контактин 2, транзиторный аксональный гликопротеин-1

Внешние идентификаторы

OMIM : 190197 MGI : 104518 HomoloGene : 3720 GeneCards : CNTN2

Расположение гена ( человек )

Chr.	Хромосома 1 (человека) ^[1]

Группа	1q32.1	Начинать	205 042 937 п.н. ^[1]
Группа	1q32.1	Конец	205 078 289 п.н. ^[1]

Расположение гена ( Мышь )

Chr.	Хромосома 1 (мышь) ^[2]

Группа	1 \| 1 E4	Начинать	132 509 427 п.н. ^[2]
Группа	1 \| 1 E4	Конец	132 543 256 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• самоассоциация белков • идентичное связывание с белками • связывание углеводов • связывание белков, участвующих в клеточной адгезии
Сотовый компонент	• мембрана • миелиновая оболочка • комплекс потенциалзависимых калиевых каналов • клеточная мембрана • узел Ранвье • синапс • интегральный компонент плазматической мембраны • поверхность клетки • аксон • тело нейрональной клетки • закрепленный компонент мембраны • проекция нейрона • юкстапаранодная область аксона • закрепленный компонент постсинаптической мембраны
Биологический процесс	• кластеризация потенциалзависимых калиевых каналов • негативная регуляция дифференцировки нейронов • миелинизация центральной нервной системы • интернализация рецепторов • миграция нейронов • обучение • организация пресинаптической мембраны • регуляция дифференцировки астроцитов • регуляция диаметра аксона • клеточная адгезия • положительная регуляция процессинга белка • установление локализации белка в юкстапаранодной области аксона • позитивная регуляция сигнального пути аденозинового рецептора • Кора головного мозга ГАМК интерней- миграция • регулирование нейронов синаптической пластичности • локализации белка в juxtaparanode области аксона • регуляции клеточного морфогенеза , участвующих в дифференцировке • развитие проекции нейрон • аксонов подрагивание • микротрубочек цитоскелета организация • ходьба поведение взрослых • аксонов • развитие нервной системы • гомофильная клеточная адгезия через молекулы адгезии плазматической мембраны • самоуничтожение дендритов
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


6900


21367

Ансамбль


ENSG00000184144


ENSMUSG00000053024

UniProt


Q02246


Q61330

RefSeq (мРНК)


NM_005076 NM_001346083


NM_011531 NM_177129

RefSeq (белок)


NP_001333012 NP_005067


NP_796103

Расположение (UCSC)

Chr 1: 205.04 - 205.08 Мб

Chr 1: 132,51 - 132,54 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Contactin-2 представляет собой белок , который у человека кодируется CNTN2 гена . ^[5]^[6]^[7]

Функция [ править ]

Белок, кодируемый этим геном, является членом суперсемейства иммуноглобулинов. Это заякоренный гликозилфосфатидилинозитол (GPI) белок нейрональной мембраны, который функционирует как молекула клеточной адгезии. Это может играть роль в формировании аксонных связей в развивающейся нервной системе. Он также может участвовать в глиальном онкогенезе и может служить потенциальной мишенью для терапевтического вмешательства. ^[7]

Взаимодействия [ править ]

CNTN2, как было показано, взаимодействует с CNTNAP2 ^[8] и NFYB . ^[9]

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000184144 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000053024 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Tsiotra ПК, Karagogeos D, Теодоракису К, Michaelidis ТМ, Моди WS, Ферли AJ, Джесселл ТМ, Papamatheakis J (декабрь 1993). «Выделение кДНК и хромосомная локализация гена (TAX1), кодирующего аксональный гликопротеин человека TAG-1». Геномика . 18 (3): 562–7. DOI : 10.1016 / S0888-7543 (05) 80357-X . PMID 8307567 .
↑ Yoshihara Y, Kawasaki M, Tamada A, Nagata S, Kagamiyama H, Mori K (сентябрь 1995 г.). «Перекрытие и дифференциальная экспрессия BIG-2, BIG-1, TAG-1 и F3: четырех членов подгруппы молекул адгезии связанных с аксоном клеток суперсемейства иммуноглобулинов». Журнал нейробиологии . 28 (1): 51–69. DOI : 10.1002 / neu.480280106 . PMID 8586965 .
^ a b «Ген Энтреза: CNTN2 контактин 2 (аксональный)» .
^ Traka M, Goutebroze L, Denisenko N, Bessa M, Nifli A, Havaki S, Iwakura Y, Fukamauchi F, Watanabe K, Soliven B, Girault JA, Karagogeos D (сентябрь 2003 г.). «Ассоциация TAG-1 с Caspr2 важна для молекулярной организации юкстапаранодальных областей миелинизированных волокон» . Журнал клеточной биологии . 162 (6): 1161–72. DOI : 10,1083 / jcb.200305078 . PMC 2172849 . PMID 12975355 .
^ Глинобитными-Masison СА, Диттмер Дж, Клеменс К.Е., Брейди Ю.Н. (март 1997). «Физическое и функциональное взаимодействие между человеческим Т-клеточным лимфотропным вирусом 1 типа Tax1 и CCAAT-связывающим белком NF-Y» . Молекулярная и клеточная биология . 17 (3): 1236–43. DOI : 10.1128 / mcb.17.3.1236 . PMC 231848 . PMID 9032250 .

Внешние ссылки [ править ]

Расположение генома человека CNTN2 и страница сведений о гене CNTN2 в браузере генома UCSC .

Дальнейшее чтение [ править ]

Уолш Ф.С., Доэрти П. (ноябрь 1991 г.). «Гликозилфосфатидилинозитол заякоренные молекулы узнавания, которые функционируют в фасцикуляции аксонов, росте и управлении в нервной системе». Международные отчеты по клеточной биологии . 15 (11): 1151–66. DOI : 10.1016 / 0309-1651 (91) 90061-M . PMID 1838307 .
Kuhn TB, Stoeckli ET, Condrau MA, Rathjen FG, Sonderegger P (ноябрь 1991 г.). «Рост нейритов на иммобилизованном аксонине-1 опосредован гетерофильным взаимодействием с L1 (G4)» . Журнал клеточной биологии . 115 (4): 1113–26. DOI : 10,1083 / jcb.115.4.1113 . PMC 2289947 . PMID 1720120 .
Додд Дж., Мортон С.Б., Карагогеос Д., Ямамото М., Джессел Т.М. (апрель 1988 г.). «Пространственная регуляция экспрессии аксональных гликопротеинов на подмножествах эмбриональных спинномозговых нейронов». Нейрон . 1 (2): 105–16. DOI : 10.1016 / 0896-6273 (88) 90194-8 . PMID 3272160 . S2CID 36629050 .
Kenwrick S, Leversha M, Rooke L, Hasler T, Sonderegger P (сентябрь 1993 г.). «Локализация человеческого гена TAX-1 в 1q32.1: область, связанная с микроцефалией и синдромом Ван дер Вуд» (PDF) . Молекулярная генетика человека . 2 (9): 1461–2. DOI : 10.1093 / HMG / 2.9.1461 . PMID 8242070 .
Рейдер С., Стоекли Е.Т., Циглер Ю., Остервальдер Т., Кунц Б., Сондереггер П. (июль 1993 г.). «Межклеточная адгезия путем гомофильного взаимодействия нейрональной молекулы распознавания аксонина-1» . Европейский журнал биохимии / FEBS . 215 (1): 133–41. DOI : 10.1111 / j.1432-1033.1993.tb18015.x . PMID 8344273 .
Hasler TH, Rader C, Stoeckli ET, Zuellig RA, Sonderegger P (январь 1993 г.). «Клонирование кДНК, структурные особенности и эукариотическая экспрессия человеческого TAG-1 / аксонина-1». Европейский журнал биохимии / FEBS . 211 (1–2): 329–39. DOI : 10.1111 / j.1432-1033.1993.tb19902.x . PMID 8425542 .
Козлов С.В., Гигер Р.Дж., Хаслер Т., Корватска Э., Шордерет Д.Ф., Сондереггер П. (ноябрь 1995 г.). «Ген TAX1 человека, кодирующий молекулу адгезии ассоциированных с аксонами клеток TAG-1 / аксонин-1: геномная структура и основной промотор». Геномика . 30 (2): 141–8. DOI : 10.1006 / geno.1995.9892 . PMID 8586412 .
Милев П., Маурел П., Херинг М., Марголис Р.К., Марголис РУ (июнь 1996 г.). «ТАГ-1 / аксонин-1 представляет собой высокоаффинный лиганд нейрокана, фосфакана / протеин-тирозинфосфатазы-дзета / бета и N-CAM» . Журнал биологической химии . 271 (26): 15716–23. DOI : 10.1074 / jbc.271.26.15716 . PMID 8663515 .
Pise-Masison CA, Dittmer J, Clemens KE, Brady JN (март 1997 г.). «Физическое и функциональное взаимодействие между человеческим Т-клеточным лимфотропным вирусом 1 типа Tax1 и CCAAT-связывающим белком NF-Y» . Молекулярная и клеточная биология . 17 (3): 1236–43. DOI : 10.1128 / mcb.17.3.1236 . PMC 231848 . PMID 9032250 .
Уильямс Х., Шахнер М., Ван Б., Кенврик С. (ноябрь 1997 г.). «Радиационное гибридное картирование генов тенасцина-R (TNR), фосдуцина (PDC), ламинина C1 (LAMC1) и TAX в 1q25-q32». Геномика . 46 (1): 165–6. DOI : 10.1006 / geno.1997.4994 . PMID 9403076 .
Малхотра Дж. Д., Циотра П., Карагогеос Д., Хорч М. (декабрь 1998 г.). «Цис-активация L1-опосредованного рекрутирования анкирина за счет адгезии гомофильных клеток TAG-1» . Журнал биологической химии . 273 (50): 33354–9. DOI : 10.1074 / jbc.273.50.33354 . PMID 9837910 .
Freigang J, Proba K, Leder L, Diederichs K, Sonderegger P, Welte W. (май 2000 г.). «Кристаллическая структура модуля связывания лиганда аксонина-1 / TAG-1 предполагает механизм« застежки-молнии »для адгезии нервных клеток» (PDF) . Cell . 101 (4): 425–33. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80852-1 . PMID 10830169 . S2CID 15440572 .
Рикман Д.С., Тьяги Р., Чжу XX, Бобек М.П., Сонг С., Блайвас М., Мисек Д.Э., Израиль М.А., Курнит Д.М., Росс Д.А., Киш ЧП, Ханаш С.М. (март 2001 г.). «Ген молекулы адгезии аксональных клеток TAX-1 амплифицируется и аномально экспрессируется в злокачественных глиомах». Исследования рака . 61 (5): 2162–8. PMID 11280781 .
Павлу О., Теодоракис К., Фальк Дж., Куче М., Шахнер М., Фейвр-Сарраилх К., Карагогеос Д. (июль 2002 г.). «Анализ взаимодействий молекулы адгезии TAG-1 и ее доменов с другими членами суперсемейства иммуноглобулинов». Молекулярная и клеточная нейронауки . 20 (3): 367–81. DOI : 10.1006 / mcne.2002.1105 . PMID 12139915 . S2CID 714233 .
Traka M, Goutebroze L, Denisenko N, Bessa M, Nifli A, Havaki S, Iwakura Y, Fukamauchi F, Watanabe K, Soliven B, Girault JA, Karagogeos D (сентябрь 2003 г.). «Ассоциация TAG-1 с Caspr2 важна для молекулярной организации юкстапаранодальных областей миелинизированных волокон» . Журнал клеточной биологии . 162 (6): 1161–72. DOI : 10,1083 / jcb.200305078 . PMC 2172849 . PMID 12975355 .
Нагараджа GM, Кандпал Р.П. (январь 2004 г.). «Кодируемый хромосомой 13q12 белок, активирующий ГТФазу Rho, подавляет рост клеток карциномы груди, и двухгибридный дрожжевой скрининг показывает его взаимодействие с несколькими белками». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 313 (3): 654–65. DOI : 10.1016 / j.bbrc.2003.12.001 . PMID 14697242 .

Эта статья о гене на хромосоме 1 человека - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000184144 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000053024 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8307567-5] Tsiotra ПК, Karagogeos D, Теодоракису К, Michaelidis ТМ, Моди WS, Ферли AJ, Джесселл ТМ, Papamatheakis J (декабрь 1993). «Выделение кДНК и хромосомная локализация гена (TAX1), кодирующего аксональный гликопротеин человека TAG-1». Геномика . 18 (3): 562–7. DOI : 10.1016 / S0888-7543 (05) 80357-X . PMID 8307567 .

[pmid8586965-6] Yoshihara Y, Kawasaki M, Tamada A, Nagata S, Kagamiyama H, Mori K (сентябрь 1995 г.). «Перекрытие и дифференциальная экспрессия BIG-2, BIG-1, TAG-1 и F3: четырех членов подгруппы молекул адгезии связанных с аксоном клеток суперсемейства иммуноглобулинов». Журнал нейробиологии . 28 (1): 51–69. DOI : 10.1002 / neu.480280106 . PMID 8586965 .

[entrez-7] «Ген Энтреза: CNTN2 контактин 2 (аксональный)» .

[pmid12975355-8] Traka M, Goutebroze L, Denisenko N, Bessa M, Nifli A, Havaki S, Iwakura Y, Fukamauchi F, Watanabe K, Soliven B, Girault JA, Karagogeos D (сентябрь 2003 г.). «Ассоциация TAG-1 с Caspr2 важна для молекулярной организации юкстапаранодальных областей миелинизированных волокон» . Журнал клеточной биологии . 162 (6): 1161–72. DOI : 10,1083 / jcb.200305078 . PMC 2172849 . PMID 12975355 .

[pmid9032250-9] Глинобитными-Masison СА, Диттмер Дж, Клеменс К.Е., Брейди Ю.Н. (март 1997). «Физическое и функциональное взаимодействие между человеческим Т-клеточным лимфотропным вирусом 1 типа Tax1 и CCAAT-связывающим белком NF-Y» . Молекулярная и клеточная биология . 17 (3): 1236–43. DOI : 10.1128 / mcb.17.3.1236 . PMC 231848 . PMID 9032250 .

[1]