Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Coronaviridae
Коронавирус
Вирусы-07-01700-g002.jpg
Схема, электронная микрофотография и геном типов коронавируса .
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Царство :Рибовирия
Королевство:Орторнавиры
Тип:Писувирикота
Учебный класс:Pisoniviricetes
Заказ:Нидовиралес
Подотряд:Cornidovirineae
Семья:Coronaviridae
Подсемейства и роды

Coronaviridae семейство оболочечных , положительных прядей РНК - вирусов , которые заражают амфибий , птиц и млекопитающих . В группу входят подсемейства Letovirinae и Orthocoronavirinae ; члены последнего известны как коронавирусы .

Вирусный геном имеет длину 26–32 килобаз . Частицы обычно украшены большими (~ 20 нм) выступами в форме булавов или лепестков (« пепломеры » или «шипы»), которые на электронных микрофотографиях сферических частиц создают изображение, напоминающее солнечную корону . [1] [2]

Вирусология [ править ]

Цикл репликации коронавируса.

5 'и 3' концы генома имеют кэп и поли (А) тракт соответственно. Оболочка вируса , полученное почкование через мембрану в эндоплазматическом ретикулуме (ER) или аппарат Гольджи , неизменно содержит два вирус-указание (глико) видов белков, S и М. гликопротеин S содержат большую поверхность выступы, а М представляет собой тройное охватывающий трансмембранный белок. Торовирусы и избранная подгруппа коронавирусов (в частности, представители подгруппы A в роду Betacoronavirus ) обладают, помимо пепломеров, состоящих из S, вторым типом выступов на поверхности, состоящих из белка гемагглютинин-эстеразы. Еще одно важное структурноеБелок представляет собой фосфопротеин N, который отвечает за спиральную симметрию нуклеокапсида, в котором заключена геномная РНК. [3]

Генетическая рекомбинация может происходить, когда по крайней мере два вирусных генома присутствуют в одной и той же инфицированной клетке-хозяине. Рекомбинация РНК, по-видимому, является основной движущей силой эволюции коронавируса. Рекомбинация может определять генетическую изменчивость внутри вида CoV, способность видов CoV переходить от одного хозяина к другому и, нечасто, появление нового CoV. [4] Точный механизм рекомбинации в CoVs не известен, но, вероятно, включает переключение матрицы во время репликации генома. [4]

Таксономия [ править ]

Таксономия семейства Coronaviridae с видами, патогенными для человека.
Иллюстрация коронавируса

Семейство Coronaviridae разделено на 2 подсемейства, 5 родов, 26 подродов и 46 видов. [5] Дополнительные виды ожидаются или предположительно. [6]

  • Coronaviridae
    • Orthocoronavirinae [7]
    • Letovirinae
      • Альфалетовирус
        • Милековирус
          • Microhyla letovirus 1

Коронавирус [ править ]

Основная статья: Коронавирус

Коронавирус - это общее название для Coronaviridae и Orthocoronavirinae , также называемых Coronavirinae . [8] [9] Коронавирусы вызывают болезни у млекопитающих и птиц. У людей вирусы вызывают респираторные инфекции , включая простуду , которые обычно протекают в легкой форме, хотя более редкие формы, такие как SARS (включая тот, который вызывает COVID-19 ) и MERS, могут быть летальными. [10]Симптомы различаются у других видов: у кур они вызывают заболевание верхних дыхательных путей, а у коров и свиней коронавирусы вызывают диарею. За исключением Sars-Cov-2, нет вакцин или противовирусных препаратов для профилактики или лечения коронавирусных инфекций человека. Это вирусы с оболочкой с одноцепочечным геномом РНК с положительным смыслом и нуклеокапсидом спиральной симметрии. Размер генома коронавирусов колеблется от примерно 26 до 32 килобаз , что является одним из самых больших для РНК-вируса (уступает только нидовирусу размером 41 т.п.н., недавно обнаруженному у планарий ). [11]

Таксономия Orthocoronavirinae [ править ]

  • Ортокоронавирины
    • Альфакоронавирус
      • Колаковирус
        • Коронавирус летучих мышей CDPHE15
      • Декаковирус
        • Летучая мышь коронавирус HKU10
        • Rhinolophus ferrumequinum alphacoronavirus HuB-2013
      • Duvinacovirus
        • Коронавирус человека 229E
      • Лучаковирус
        • Крысиный коронавирус Lucheng Rn
      • Минаковирус
        • Норковый коронавирус 1
      • Минунаковирус
        • Miniopterus летучая мышь коронавирус 1
        • Коронавирус летучих мышей Miniopterus HKU8
      • Миотаковирус
        • Myotis ricketti alphacoronavirus Sax-2011
      • Никтаковирус
        • Nyctalus velutinus alphacoronavirus SC-2013
        • Pipistrellus kuhlii коронавирус 3398
      • Педаковирус
        • Вирус эпидемической диареи свиней
        • Коронавирус летучих мышей Scotophilus 512
      • Ринаковирус
        • Коронавирус летучих мышей Rhinolophus HKU2
      • Сетраковирус
        • Коронавирус человека NL63
        • Связанный с NL63 штамм коронавируса летучих мышей BtKYNL63-9b
      • Сораковирус
        • Коронавирус Sorex araneus T14
      • Сунаковирус
        • Suncus murinus коронавирус X74
      • Тегаковирус
        • Alphacoronavirus 1 - типовой вид
    • Бетакоронавирус
      • Эмбековирус
        • Бетакоронавирус 1
          • Коронавирус человека OC43
        • Китайский коронавирус Rattus HKU24
        • Коронавирус человека HKU1
        • Коронавирус мышей - типовые виды
        • Миоды коронавируса 2JL14
      • Hibecovirus
        • Летучая мышь Hp-betacoronavirus Zhejiang2013
      • Мербековирус
        • Ежик коронавирус 1
        • Коронавирус, связанный с ближневосточным респираторным синдромом (БВРС-КоВ)
        • Коронавирус летучих мышей Pipistrellus HKU5
        • Коронавирус летучих мышей Tylonycteris HKU4
      • Нобековирус
        • Коронавирус летучих мышей Эйдолона C704
        • Коронавирус летучих мышей Rousettus GCCDC1
        • Коронавирус летучих мышей Rousettus HKU9
      • Сарбековирус
        • Коронавирус, связанный с тяжелым острым респираторным синдромом
          • Коронавирус тяжелого острого респираторного синдрома (SARS-CoV)
          • Коронавирус 2 тяжелого острого респираторного синдрома (SARS-CoV-2, причина COVID-19)
    • Гаммакоронавирус
      • Брангаковирус
        • Гусь коронавирус CB17
      • Цегаковирус
        • Коронавирус белухи SW1
      • Игаковирус
        • Птичий коронавирус - типовые виды
        • Птичий коронавирус 9203
        • Утка коронавирус 2714
    • Дельтакоронавирус
      • Андековирус
        • Wigeon коронавирус HKU20
      • Бульдековирус
        • Коронавирус Бюльбюля HKU11 - типовой вид
        • Распространенный коронавирус мурхенов HKU21
        • Коронавирус HKU15
        • Коронавирус Munia HKU13
        • Коронавирус белых глаз HKU16
      • Гердековирус
        • Коронавирус ночной цапли HKU19

Ссылки [ править ]

  1. ^ Король, Эндрю MQ; Адамс, Майкл Дж .; Карстенс, Эрик Б .; Лефковиц, Эллиот Дж., Ред. (2012-01-01), «Порядок - Nidovirales» , Таксономия вирусов , Elsevier, стр. 784–794, ISBN 978-0-12-384684-6, получено 08.06.2020
  2. ^ Бухари, Хулуд; Малли, Джеральдин; Гуляева Анастасия А .; Чжао, Ланьинг; Шу, Гочэн; Цзян, Цзяньпин; Нойман, Бенджамин В. (2018-11-01). «Описание и первоначальная характеристика метатранскриптомных нидовирусоподобных геномов из предложенного нового семейства Abyssoviridae и из сестринской группы Coronavirinae, предлагаемого рода Alphaletovirus» . Вирусология . 524 : 160–171. DOI : 10.1016 / j.virol.2018.08.010 . ISSN 0042-6822 . PMC 7112036 . PMID 30199753 .   
  3. ↑ McBride R, van Zyl M, Fielding BC (август 2014 г.). «Нуклеокапсид коронавируса - это многофункциональный белок» . Вирусы . 6 (8): 2991–3018. DOI : 10,3390 / v6082991 . PMC 4147684 . PMID 25105276 .  
  4. ^ а б Су С, Вонг Дж., Ши В., Лю Дж., Лай АКК, Чжоу Дж., Лю В., Би Й, Гао Г. Ф. Эпидемиология, генетическая рекомбинация и патогенез коронавирусов. Trends Microbiol. 2016 июн; 24 (6): 490-502. DOI: 10.1016 / j.tim.2016.03.003. Epub 2016 21 марта. Обзор. PMID 27012512 
  5. ^ «Таксономия вирусов: выпуск 2019» . talk.ictvonline.org . Международный комитет по таксономии вирусов . Дата обращения 11 мая 2020 .
  6. ^ Gorbalenya А, Бейкер S, Baric R, De Groot R, Дростен C, Гуляева A, Haagmans B, Lauber C, Леонтовича A, Neuman B, Penzar D, Perlman S, Poon L, Самборский D, Сидоров I, Sola I, Зибур Дж (2020). «Виды коронавируса, связанного с тяжелым острым респираторным синдромом: классификация 2019-nCoV и присвоение ему названия SARS-CoV-2» (PDF) . Природная микробиология . 5 (4): 536–44. DOI : 10.1038 / s41564-020-0695-Z . PMC 7095448 . PMID 32123347 .   
  7. ↑ Fan Y, Zhao K, Shi ZL, Zhou P (март 2019). «Коронавирусы летучих мышей в Китае» . Вирусы . 11 (3): 210. DOI : 10,3390 / v11030210 . PMC 6466186 . PMID 30832341 .  
  8. ^ "2017.012-015S" (xlsx) . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Октябрь 2018. Архивировано 14 мая 2019 года . Проверено 24 января 2020 года .
  9. ^ "История таксономии ICTV: Orthocoronavirinae " . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Проверено 24 января 2020 года .
  10. ^ «Пандемия нового коронавируса 2019–2020 (тяжелый острый респираторный синдром, коронавирус 2): Объединенный Американский колледж международной академической медицины - Всемирный академический совет по экстренной медицине, многопрофильный консенсусный документ рабочей группы по COVID ‑ 19» . ResearchGate . Проверено 16 мая 2020 года .
  11. ^ Сабери А, Гуляева А. А., Brubacher JL, Ньюмарка PA, Gorbalenya AE (ноябрь 2018). Стэнли П. (ред.). «Планарийный нидовирус расширяет пределы размера генома РНК» . PLOS Патогены . 14 (11): e1007314. DOI : 10.1371 / journal.ppat.1007314 . PMC 6211748 . PMID 30383829 .  

Внешние ссылки [ править ]

  • Ресурс базы данных и анализа вирусных патогенов (ViPR): Coronaviridae
  • Архивная веб-страница 2006 года о коронавирусах
  • Сосредоточьтесь на коронавирусах (сообщение в блоге микробиологии от 2007 г.)
  • Вирусная зона: Coronaviridae
  • Международный комитет по таксономии вирусов