Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
D4Science
Логотип D4Science 600px (1) .png
НикD4Science
Штаб-квартираIstituto di Scienza e Tecnologie dell'Informazione , Пиза, Италия
ПродуктыВиртуальные исследовательские среды , научные шлюзы , облачные вычисления , электронная инфраструктура
Веб-сайтwww .d4science .org

D4Science - это организация, управляющая инфраструктурой данных, предлагающая широкий спектр услуг в виртуальных исследовательских средах, основанных на сообществе . В частности, он поддерживает сообщества практиков, желающих внедрять открытые научные практики . [1] Инфраструктура построена по системе системного подхода., где составляющие системы (поставщики услуг) предлагают «ресурсы» (а именно услуги и, соответственно, данные, вычисления, хранилище), собранные вместе для реализации общего набора сервисов D4Science. В частности, D4Science объединяет поставщиков услуг, не зависящих от предметной области, а также поставщиков услуг, ориентированных на конкретное сообщество, для создания единого пространства, в котором агрегированные ресурсы могут использоваться через виртуальные исследовательские среды и их сервисы.

Эта организация находится в Институте науки и технологий и информации .

В основе этой инфраструктуры лежит программное обеспечение с открытым исходным кодом под названием gCube system . [2]

Услуги [ править ]

D4Science предлагает широкий спектр услуг:

  • Виртуальная исследовательская среда как услуга, предоставляющая любому практикующему сообществу специальную рабочую среду, поддерживающую любой процесс производства знаний в сотрудничестве, фактически каждая VRE обеспечивает совместную работу с компьютерной поддержкойпо дизайну. VRE на основе D4Science - это сетевые, ориентированные на сообщества, совместные, удобные в использовании, открытые научные среды рабочие среды для ученых и практиков, желающих работать вместе для выполнения ряда (исследовательских) задач. С точки зрения конечного пользователя каждое VRE проявляется в унифицированном веб-приложении (и наборе интерфейсов прикладного программирования (API)): (а) состоит из нескольких приложений, организованных в определенные пункты меню, и (б) выполняется в обычном веб-браузере. Каждое приложение предоставляет пользователям VRE возможности, реализованные за счет использования одной или нескольких услуг, предоставляемых различными поставщиками. Среди основных сервисов, которыми оснащено каждое VRE:
    • область социальных сетей, позволяющая проводить совместные и открытые дискуссии по любой теме и распространять информацию, представляющую интерес для сообщества, например, наличие результатов исследования;
    • Workspace для хранения, организации и распространения любой версии исследовательского артефакта, включая набор данных и реализации модели;
    • панель управления пользователя для управления членством и ролями;
    • Catalog служба запись ценности активов публикуются таким образом , чтобы сделать возможным для других , чтобы быть информированными и использование делает из этих активов.
  • Научный шлюз как услуга, предоставляющий сообществу практиков специальный научный шлюз, на котором размещается выбранный набор виртуальных исследовательских сред .
  • Масштабная аналитика данных, предоставляющая участникам VRE широкий спектр решений для анализа данных, включая:
    • проприетарные аналитические данные платформы (DataMiner) [3] [4] , чтобы выполнить аналитические задачи , либо опираясь на методы , предоставляемые пользователем или другими лицами. Он наделен средствами импорта и совместного использования аналитических методов, реализованных в разнородных формах, включая R , Java , Python и KNIME . Платформа обеспечивает выполнение задач распределенной и гибридной вычислительной инфраструктурой. Более того, одной из заслуживающих внимания чертой этой платформы является ее открытая научность. Все встроенные в него методы аналитики доступны по стандартному протоколу (протокол OGC WPS) клиенты могут использовать для получения информации о доступных методах, а также для запуска процессов, отслеживания их выполнения и доступа к результатам. Каждая аналитическая задача, выполняемая платформой, автоматически создает запись происхождения, обеспечивающую воспроизводимость задачи ;
    • RStudio -А среда разработки для R , позволяющего выполнять статистические вычислительные задачи в облаке. Эта среда RStudio (i) предварительно сконфигурирована с библиотеками и пакетами для облегчения выполнения общих задач анализа данных, и (ii) обеспечивает беспрепятственный доступ к рабочему пространству VRE, позволяя совместно использовать ресурсы с другими членами той же рабочей среды.
    • Jupyter -А среда ноутбука для разработки и выполнения интерактивных вычислений с помощью JupyterLab экземпляров. Каждая JupyterLab (i) предварительно сконфигурирована с библиотеками и пакетами для облегчения выполнения общих задач анализа данных, и (ii) предоставляет доступ к рабочему пространству VRE, позволяя совместно использовать ресурсы с другими членами той же рабочей среды.

Инфраструктура D4Science обслуживает тысячи пользователей (более 15 000 зарегистрированных пользователей в апреле 2021 года ) с помощью 165 активных виртуальных реставраций, предлагаемых через 19 шлюзов Science .

История [ править ]

Инициатива D4Science была разработана и поддержана несколькими европейскими проектами.

DILIGENT (2004-2007 гг.) В Шестой рамочной программе исследований и технологического развития был предшественником, где была задумана и разработана инфраструктура испытательного стенда, построенная путем интеграции технологий и ресурсов цифровой библиотеки и грид-вычислений, для удовлетворения потребностей сообществ практикующих, участвующих в развитии знаний. . [5]

В контексте Седьмой рамочной программы исследований, технологического развития и демонстрации разработка инициативы D4Science началась при поддержке D4Science (2008-2009), D4Science-II (2009-2011), ENVRI (2011-2014), EUBrazilOpenBio (2011-2013), iMarine (2011-2014). В этот период была создана и развита инфраструктура для обслуживания сообществ специалистов из различных областей, от наук о Земле до наук о море, с охватом всего мира [6]

В контексте программы исследований и инноваций H2020 уровень зрелости инфраструктуры D4Science был достаточно высок, чтобы позволить большому и очень разнообразному кругу практикующих сообществ получать выгоду от нее и ее услуг и вносить дальнейший вклад в ее развитие. Более того, услуги, предлагаемые инфраструктурой, были разработаны для поддержки практики открытой науки . [1] Следующие проекты внесли свой вклад в разработку D4Science: BlueBRIDGE (2015-2018), EGIEngage (2015-2017), ENVRIplus (2015-2019), Parthenos (2015-2019), SoBigData (2015-2019), AGINFRAplus (2017- 2019), PerformFish (2017-2022), ARIADNEplus (2019-2022), EOSC-Pillar (2019-2022), DESIRA (2019-2023), RISIS2 (2019-2022). Поддерживаемые сообщества и случаи варьируются от Agri-food [7]к социальным наукам о данных [8] , наукам о Земле [9] и морским наукам. [10]

См. Также [ править ]

  • European Open Science Cloud - европейская инициатива по созданию среды для размещения и обработки данных исследований и продвижения открытой науки.
  • European Grid Infrastructure - электронная инфраструктура, созданная для предоставления передовых вычислений и услуг анализа данных для исследований и инноваций.
  • OpenAIRE - европейская инициатива, направленная на изменение научного общения в сторону открытости и прозрачности, а также на содействие инновационным способам общения и мониторинга исследований.

Внешние ссылки [ править ]

  • Сайт D4Science
  • Шлюзы D4Science
  • D4Science для разработчиков и практиков

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b Assante, M .; Candela, L .; Castelli, D .; Cirillo, R .; Coro, G .; Frosini, L .; Lelii, L .; Mangiacrapa, F .; Pagano, P .; Panichi, G .; Синибальди, Ф. (2019). «Введение открытой науки D4Science». Компьютерные системы будущего поколения . 101 : 555–563. DOI : 10.1016 / j.future.2019.05.0633 .
  2. ^ Assante, M .; Candela, L .; Castelli, D .; Cirillo, R .; Coro, G .; Frosini, L .; Lelii, L .; Mangiacrapa, F .; Мариоли, В .; Pagano, P .; Panichi, G .; Perciante, C .; Синибальди, Ф. (2019). «Система gCube: предоставление виртуальных исследовательских сред как услуга». Компьютерные системы будущего поколения . 95 : 445–453. DOI : 10.1016 / j.future.2018.10.035 .
  3. ^ Коро, G .; Panichi, G .; Scarponi, P .; Пагано, П. (2017). «Облачные вычисления в распределенной электронной инфраструктуре с использованием стандарта службы веб-обработки». Параллелизм и вычисления: практика и опыт . 29 : e4219. DOI : 10.1002 / cpe.4219 .
  4. ^ Candela, L .; Coro, G .; Lelii, L .; Pagano, P .; Паничи, Г. (2020). «Обработка данных и аналитика для наук о данных». Ин Чжао, З .; Hellström, M. (ред.). На пути к интероперабельной исследовательской инфраструктуре для наук об окружающей среде и о Земле . 12003 . С. 176–191. DOI : 10.1007 / 978-3-030-52829-4_10 .
  5. ^ Candela, L .; Akal, F .; Avancini, H .; Castelli, D .; Fusco, L .; Guidetti, V .; Langguth, C .; Manzi, A .; Pagano, P .; Schuldt, H .; Simi, M .; Springmann, M .; Войку, Л. (2007). «DILIGENT: интеграция цифровой библиотеки и грид-технологий в новую исследовательскую инфраструктуру наблюдения Земли». Международный журнал электронных библиотек . 7 : 59–80. DOI : 10.1007 / s00799-007-0023-8 .
  6. ^ Amaral, R .; Бадиа, РМ; Blanquer, I .; Брага ‐ Нето, Р .; Candela, L .; Castelli, D .; Flann, C .; De Giovanni, R .; Серый, Вашингтон; Jones, A .; Lezzi, D .; Pagano, P .; Perez ‐ Canhos, V .; Quevedo, F .; Rafanell, R .; Rebello, V .; Соуза-Баэна, MS; Торрес, Э. (2015). «Поддержка исследований биоразнообразия с помощью инфраструктуры гибридных данных EUBrazilOpenBio». Параллелизм и вычисления: практика и опыт . 27 : 376–394. DOI : 10.1002 / cpe.3238 .
  7. ^ Assante, M .; Boizet, A .; Candela, L .; Castelli, D .; Cirillo, R .; Coro, G .; Fernández, E .; Фильтр, М .; Frosini, L .; Георгиев, Т .; Kakaletris, G .; Кацивелис, П .; Knapen, R .; Lelii, L .; Локерс, РМ; Mangiacrapa, F .; Manouselis, N .; Pagano, P .; Panichi, G .; Пенев, Л .; Синибальди, Ф. (2020). «Создание виртуальной исследовательской среды для агропродовольственного сообщества: опыт AGINFRA PLUS». Параллелизм и вычисления: практика и опыт . na : na doi : 10.1002 / cpe.6087 .
  8. ^ Grossi, V .; Giannotti, F .; Педрески, Д .; Manghi, P .; Pagano, P .; Ассанте, М. (2021). «Наука о данных: революция в науке и инновациях». Международный журнал науки о данных и аналитики . 11 : 263–278. DOI : 10.1007 / s41060-020-00240-2 .
  9. ^ Джеффри, К .; Candela, L .; Глэйвс, Э. (2020). «Виртуальные среды для исследований в области наук об окружающей среде и о Земле: подходы и опыт». Ин Чжао, З .; Hellström, M. (ред.). На пути к интероперабельной исследовательской инфраструктуре для наук об окружающей среде и о Земле . 12003 . С. 272–289. DOI : 10.1007 / 978-3-030-52829-4_15 .
  10. ^ Коро, G .; Gonzalez Vilas, L .; Magliozzi, C .; Ellenbroek, A .; Scarponi, P .; Пагано, П. (2018). «Прогнозирование продолжающегося вторжения Lagocephalus sceleratus в Средиземное море». Экологическое моделирование . 371 : 37–49. DOI : 10.1016 / j.ecolmodel.2018.01.007 .