Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
DCLK1
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

1MFW , 1MG4 , 1UF0

Идентификаторы
ПсевдонимыDCLK1 , CL1, CLICK1, DCAMKL1, DCDC3A, DCLK, даблкортиноподобная киназа 1
Внешние идентификаторыOMIM : 604742 MGI : 1330861 HomoloGene : 130530 GeneCards : DCLK1
Расположение гена ( человек )
Хромосома 13 (человек)
Chr.Хромосома 13 (человека) [1]
Хромосома 13 (человек)
Геномное расположение DCLK1
Геномное расположение DCLK1
Группа13q13.3Начинать35 768 652 п.н. [1]
Конец36 131 382 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 3 (мышь)
Chr.Хромосома 3 (мышь) [2]
Хромосома 3 (мышь)
Геномное расположение DCLK1
Геномное расположение DCLK1
Группа3 | 3 СНачинать55 242 364 п.н. [2]
Конец55 539 068 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE DCAMKL1 215303 в формате fs.png

PBB GE DCAMKL1 205399 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• трансферазной активность
• активность протеинкиназы
• связывание нуклеотида
• активность киназы
• связывание АТФ
• белок серин / треонин киназа
Сотовый компонент• неотъемлемый компонент плазматической мембраны
• внутриклеточный
• постсинаптическая плотность GO: 0097483, GO: 0097481
Биологический процесс• дифференцировка клеток
• аксоногенез
• морфогенез дендритов
• фосфорилирование
• ответ на вирус
• миграция нейронов
• развитие нервной системы
• развитие многоклеточных организмов
• эндосомный транспорт
• фосфорилирование белков
• развитие центральной нервной системы
• развитие мозга
• удлинение аксонов
• развитие переднего мозга
• проекция центральной нервной системы аксоногенез нейронов
• негативная регуляция локализации белка в ядре
• фосфорилирование пептидил-серина
• фосфорилирование пептидил-треонина
• передача внутриклеточного сигнала GO: 0007243
• морфогенез проекции нейронов
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

9201

13175

Ансамбль

ENSG00000133083

ENSMUSG00000027797

UniProt

O15075

Q9JLM8

RefSeq (мРНК)
NM_001195415
NM_001195416
NM_001195430
NM_004734
NM_001330071

NM_001330072

NM_001111051
NM_001111052
NM_001111053
NM_001195538
NM_001195539

NM_001195540
NM_019978
NM_001357466
NM_001357468
NM_001357469
NM_001357475
NM_001357476

RefSeq (белок)
NP_001182344
NP_001182345
NP_001182359
NP_001317000
NP_001317001

NP_004725

NP_001104521
NP_001104522
NP_001104523
NP_001182467
NP_001182468

NP_001182469
NP_064362
NP_001344395
NP_001344397
NP_001344398
NP_001344404
NP_001344405

Расположение (UCSC)Chr 13: 35.77 - 36.13 МбChr 3: 55,24 - 55,54 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Серин / треонин-протеинкиназа DCLK1 представляет собой фермент , который у человека кодируется DCLK1 геном . [5] [6] [7]

DCLK1 является маркером для пучков клеток .

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000133083 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027797 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Омори Y, Suzuki М, Озаки К, Харада Y, Накамура Y, Такахаши Е, Т Фудзивара (октябрь 1998 г.). «Экспрессия и хромосомная локализация KIAA0369, предполагаемой киназы, структурно связанной с Doublecortin» . J Hum Genet . 43 (3): 169–77. DOI : 10.1007 / s100380050063 . PMID 9747029 . 
  6. ^ Sossey-Alaoui K, Шривастава А.К. (май 1999). «DCAMKL1, специфический для мозга трансмембранный белок на 13q12.3, который подобен даблкортину (DCX)». Геномика . 56 (1): 121–6. DOI : 10.1006 / geno.1998.5718 . PMID 10036192 . 
  7. ^ «Энтрез Ген: двойной кортин DCAMKL1 и подобная киназе CaM 1» .

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Нагасе Т., Исикава К., Накадзима Д. и др. (1997). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. VII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro» . ДНК Res . 4 (2): 141–50. DOI : 10.1093 / dnares / 4.2.141 . PMID  9205841 .
  • Мацумото Н., Пилз Д.Т., Ледбеттер Д.Х. (1999). «Геномная структура, хромосомное картирование и образец экспрессии человеческого DCAMKL1 (KIAA0369), гомолога DCX (XLIS)». Геномика . 56 (2): 179–83. DOI : 10.1006 / geno.1998.5673 . PMID  10051403 .
  • Lin PT, Gleeson JG, Corbo JC и др. (2001). «DCAMKL1 кодирует протеинкиназу, гомологичную даблкортину, которая регулирует полимеризацию микротрубочек» . J. Neurosci . 20 (24): 9152–61. DOI : 10.1523 / JNEUROSCI.20-24-09152.2000 . PMID  11124993 .
  • Берджесс HA, Райнер O (2002). «Альтернативные варианты сплайсинга даблкортин-подобной киназы по-разному экспрессируются и обладают разными киназными активностями» . J. Biol. Chem . 277 (20): 17696–705. DOI : 10.1074 / jbc.M111981200 . PMID  11884394 .
  • Kim MH, Derewenda U, Devedjiev Y, et al. (2003). «Очистка и кристаллизация N-концевого домена из двойной кортиноподобной киназы человека». Acta Crystallogr. D . 59 (Pt 3): 502–5. DOI : 10.1107 / S0907444903000027 . PMID  12595708 .
  • Ким MH, Cierpicki T, Derewenda U и др. (2003). «Тандемы DCX-домена даблкортина и даблкортин-подобной киназы». Nat. Struct. Биол . 10 (5): 324–33. DOI : 10.1038 / nsb918 . PMID  12692530 .
  • Сит Л.Ф., Лю Н., Хансон Б.Дж., Хонг В. (2004). «Endofin рекрутирует TOM1 в эндосомы» . J. Biol. Chem . 279 (6): 4670–9. DOI : 10.1074 / jbc.M311228200 . PMID  14613930 .
  • Баллиф Б.А., Виллен Дж., Босолей С.А. и др. (2005). «Фосфопротеомный анализ развивающегося мозга мыши» . Мол. Клетка. Протеомика . 3 (11): 1093–101. DOI : 10.1074 / mcp.M400085-MCP200 . PMID  15345747 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : O15075 (серин / треонин-протеинкиназа DCLK1) в PDBe-KB .


  • v
  • т
  • е