• обработка РНКА • РНК вторичной структура размотки • регуляция транскрипции ДНК-шаблонный • транскрипция ДНК-шаблонные • регуляции скелетных дифференцировки мышечных клеток • положительная регуляцию транскрипции с помощью РНК - полимеразы II , • регуляции альтернативного сплайсинга мРНКа, с помощью сплайсосомой • альтернативой мРНК сплайсинг через сплайсосомы • регуляция транскрипции с помощью РНК-полимеразы II • метаболический процесс миРНК • внутриклеточный сигнальный путь рецептора эстрогена • сигнальный путь андрогенного рецептора • эпителиальные к мезенхимальных перехода • миобластов дифференцировки • системный процесс иммунной • Обработка рРНК • обработка мРНК • РНК сплайсинг • молчание генов с помощью РНК • обороны ответ на вирус
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность
Человек
Мышь
Entrez
10521
67040
Ансамбль
ENSG00000100201
ENSMUSG00000055065
UniProt
Q92841
Q501J6
RefSeq (мРНК)
NM_030881 NM_001098504 NM_001098505 NM_006386
NM_001040187 NM_152806 NM_199079 NM_199080
RefSeq (белок)
NP_001091974 NP_006377
NP_001035277 NP_690019 NP_951061 NP_951062
Расположение (UCSC)
Chr 22: 38,48 - 38,51 Мб
Chr 15: 79,53 - 79,55 Мб
PubMed поиск
[3]
[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека
Просмотр / редактирование мыши
Возможная АТФ-зависимая РНК - хеликазы ddx17 (р72) представляет собой фермент , который у человека кодируется ddx17 геном . [5] [6]
СОДЕРЖАНИЕ
1 Функция
2 взаимодействия
3 ссылки
4 Дальнейшее чтение
Функция [ править ]
Белки DEAD-бокса, характеризующиеся консервативным мотивом Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), являются предполагаемыми РНК-геликазами. Они участвуют в ряде клеточных процессов, включающих изменение вторичной структуры РНК, таких как инициация трансляции, ядерный и митохондриальный сплайсинг, а также рибосомы и сплайсосомы.сборка. Основываясь на паттернах их распространения, считается, что некоторые члены этого семейства участвуют в эмбриогенезе, сперматогенезе, а также в росте и делении клеток. Этот ген кодирует белок DEAD-бокса, который является АТФазой, активируемой различными видами РНК, но не дцДНК. Этот белок и белок, кодируемый геном DDX5, более тесно связаны друг с другом, чем с любым другим членом семейства DEAD-боксов. Альтернативный сплайсинг этого гена генерирует 2 варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы, причем более длинный транскрипт, как сообщается, также инициирует трансляцию в стартовом сайте, отличном от AUG (CUG). [6]
Взаимодействия [ править ]
Было показано, что DDX17 взаимодействует с:
DDX5 (стр. 68) , [7]
DHX9 (РНК-геликаза A) , [8]
HDAC1 , [9]
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000100201 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000055065 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
↑ Ламм GM, Николь С.М., Фуллер-Пейс Ф.В., Ламонд А.И. (декабрь 1996 г.). «p72: ядерный белок DEAD-бокса человека, очень связанный с p68» . Nucleic Acids Res . 24 (19): 3739–47. DOI : 10.1093 / NAR / 24.19.3739 . PMC 146168 . PMID 8871553 .
^ a b "Ген Entrez: DDX17 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) полипептид 17" .
^ Огилви VC, Wilson BJ, Никол С.М., Morrice Н.А., Сондерс LR, Barber Г.Н., Фуллер-Pace FV (2003). «Родственные DEAD-бокс-РНК-геликазы p68 и p72 существуют в клетках как гетеродимеры» . Nucleic Acids Res . 31 (5): 1470–80. DOI : 10.1093 / NAR / gkg236 . PMC 149829 . PMID 12595555 .
^ Wilson BJ, Giguere V (ноябрь 2007). «Идентификация новых партнеров пути p68 и p72 РНК-геликаз с помощью метаанализа Oncomine» . BMC Genomics . 8 : 419. DOI : 10.1186 / 1471-2164-8-419 . PMC 3225811 . PMID 18005418 .
^ Wilson BJ, Bates GJ, Никол С.М., Грегори DJ, Perkins ND, Фуллер-Pace FV (август 2004). «РНК-геликазы DEAD-бокса p68 и p72 взаимодействуют с HDAC1 и репрессируют транскрипцию промотор-специфическим образом» . BMC Mol. Биол . 5 : 11. DOI : 10,1186 / 1471-2199-5-11 . PMC 514542 . PMID 15298701 .
Дальнейшее чтение [ править ]
Люкинг А, Шталь У, Шмидт У (1998). «Белковое семейство РНК-геликаз». Крит. Rev. Biochem. Мол. Биол . 33 (4): 259–96. DOI : 10.1080 / 10409239891204233 . PMID 9747670 .
Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Ю.Ю., Лю В., Гиббс Р.А. (1996). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный. Биохим . 236 (1): 107–13. DOI : 10.1006 / abio.1996.0138 . PMID 8619474 .
Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. К., Музни Д. М., Дин Й., Лю В., Рикафренте Д. Ю., Вентланд М. А., Леннон Г., Гиббс Р. А. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК» . Genome Res . 7 (4): 353–8. DOI : 10.1101 / gr.7.4.353 . PMC 139146 . PMID 9110174 .
Данхэм И., Шимидзу Н., Роу Б.А., Чиссо С., Хант А.Р., Коллинз Дж. Э., Брускевич Р., Беар Д.М., Зажим М., Сминк Л.Дж., Эйнскау Р., Алмейда Дж. П., Бэббидж А., Баггулей С., Бейли Дж., Барлоу К., Бейтс К.Н. , Бисли О., Берд С. П., Блейки С., Бриджман А. М., Бак Д., Берджесс Дж., Беррилл В. Д., О'Брайен КП (1999). «Последовательность ДНК хромосомы 22 человека» . Природа . 402 (6761): 489–95. DOI : 10.1038 / 990031 . PMID 10591208 .
Ульманн-Шиффлер Х, Рёсслер О.Г., Шталь Х (2002). «МРНК DEAD-бокса белка p72 альтернативно транслируется в 82-кДа РНК-геликазу» . J. Biol. Chem . 277 (2): 1066–75. DOI : 10.1074 / jbc.M107535200 . PMID 11675387 .
Хениг А., Обёф Д., Паркер М.М., О'Мэлли Б.В., Бергет С.М. (2002). «Регулирование альтернативного сплайсинга с помощью АТФ-зависимой DEAD-Box РНК-геликазы p72» . Мол. Клетка. Биол . 22 (16): 5698–707. DOI : 10.1128 / MCB.22.16.5698-5707.2002 . PMC 133985 . PMID 12138182 .
Охта С., Сиоми Ю., Сугимото К., Обусе С., Цуримото Т. (2002). «Протеомический подход к идентификации белков, связывающих ядерный антиген пролиферирующих клеток (PCNA), в лизатах клеток человека. Идентификация человеческого комплекса CHL12 / RFCs2-5 как нового белка, связывающего PCNA» . J. Biol. Chem . 277 (43): 40362–7. DOI : 10.1074 / jbc.M206194200 . PMID 12171929 .
Ли CG (2002). «RH70, двунаправленная РНК-геликаза, очищается совместно с U1snRNP» . J. Biol. Chem . 277 (42): 39679–83. DOI : 10.1074 / jbc.C200337200 . PMID 12193588 .
Огилви В.К., Уилсон Б.Дж., Никол С.М., Моррис Н.А., Сондерс Л.Р., Барбер Г.Н., Фуллер-Пейс Ф.В. (2003). «Родственные DEAD-бокс-РНК-геликазы p68 и p72 существуют в клетках как гетеродимеры» . Nucleic Acids Res . 31 (5): 1470–80. DOI : 10.1093 / NAR / gkg236 . PMC 149829 . PMID 12595555 .
Фудзита Т., Кобаяси Ю., Вада О, Татейши Ю., Китада Л., Ямамото Ю., Такашима Н., Мураяма А., Яно Т., Баба Т., Като С., Кавабе И., Янагисава Дж. (2003). «Полная активация альфа-активации рецептора эстрогена вызывает пролиферацию клеток рака груди» . J. Biol. Chem . 278 (29): 26704–14. DOI : 10.1074 / jbc.M301031200 . PMID 12738788 .
Ли Дж., Хокинс И.С., Харви К.Д., Дженнингс Дж. Л., Линк А. Дж., Паттон Дж. Г. (2003). «Регулирование альтернативного сплайсинга с помощью SRrp86 и его взаимодействующих белков» . Мол. Клетка. Биол . 23 (21): 7437–47. DOI : 10.1128 / MCB.23.21.7437-7447.2003 . PMC 207616 . PMID 14559993 .
Джин Дж., Смит Ф. Д., Старк С., Уэллс К. Д., Фосетт Дж. П., Кулкарни С., Метальников П., О'Доннелл П., Тейлор П., Тейлор Л., Зугман А., Вудгетт Дж. Р., Лангеберг Л. К., Скотт Д. Д., Поусон Т. (2004). «Протеомный, функциональный и доменный анализ in vivo 14-3-3 связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации». Curr. Биол . 14 (16): 1436–50. DOI : 10.1016 / j.cub.2004.07.051 . PMID 15324660 .
Судзуки Ю., Ямасита Р., Широта М., Сакакибара Ю., Чиба Дж., Мидзусима-Сугано Дж., Накай К., Сугано С. (2004). «Сравнение последовательностей генов человека и мыши выявляет гомологичную блочную структуру в промоторных областях» . Genome Res . 14 (9): 1711–8. DOI : 10.1101 / gr.2435604 . PMC 515316 . PMID 15342556 .
Коллинз Дж. Э., Райт К. Л., Эдвардс Калифорния, Дэвис М. П., Гринхэм Дж. А., Коул К. Г., Говард М. Е., Агуадо Б., Малля М., Мокраб И., Хакл Е. Д., Биэр Д. М., Данхэм I. (2005). «Основанный на аннотации генома подход к клонированию ORFeome человека» . Genome Biol . 5 (10): R84. DOI : 10.1186 / GB-2004-5-10-R84 . PMC 545604 . PMID 15461802 .
Эта статья о гене на 22-й хромосоме человека - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .
