Ген DEK человека кодирует белок DEK . [5] [6]
DEK | |||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | ДЭК , D6S231E, протоонкоген ДЭК | ||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | OMIM : 125264 MGI : 1926209 HomoloGene : 2593 GeneCards : DEK | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ортологи | |||||||||||||||||||||||||
Разновидность | Человек | Мышь | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
|
| |||||||||||||||||||||||
Ансамбль |
|
| |||||||||||||||||||||||
UniProt |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (мРНК) |
|
| |||||||||||||||||||||||
RefSeq (белок) |
|
| |||||||||||||||||||||||
Расположение (UCSC) | Chr 6: 18.22 - 18.26 Мб | Chr 13: 47.08 - 47.11 Мб | |||||||||||||||||||||||
PubMed поиск | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Викиданные | |||||||||||||||||||||||||
|
Функция
Этот ген кодирует белок с одним доменом SAP. Белок связывается с крестообразной и суперспиральной ДНК и индуцирует положительные суперспирали в замкнутую кольцевую ДНК. Он также участвует в выборе сайта сплайсинга во время обработки мРНК . Хромосомные аберрации, затрагивающие эту область, увеличивают экспрессию этого гена, и наличие антител против этого белка связаны с различными заболеваниями. [6]
Взаимодействия
DEK взаимодействует с TFAP2A . [7]
Рекомендации
- ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000124795 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021377 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ фон Линдерн М., Форнерод М., ван Баал С., Йегле М., де Вит Т., Буйс А., Гросвельд Г. (апрель 1992 г.). «Транслокация (6; 9), связанная с конкретным подтипом острого миелоидного лейкоза, приводит к слиянию двух генов, dek и can, и к экспрессии химерной, специфичной для лейкемии мРНК dek-can» . Мол. Клетка. Биол . 12 (4): 1687–97. DOI : 10.1128 / mcb.12.4.1687 . PMC 369612 . PMID 1549122 .
- ^ а б «Ген Entrez: онкоген DEK DEK (связывание ДНК)» .
- ^ Кампильос М., Гарсия М.А., Вальдивьесо Ф., Васкес Дж. (Март 2003 г.). «Активация транскрипции AP-2alpha модулируется онкогеном DEK» . Nucleic Acids Res . 31 (5): 1571–5. DOI : 10.1093 / NAR / gkg247 . PMC 149840 . PMID 12595566 .
дальнейшее чтение
- фон Линдерн М., Форнерод М., Сукарман Н., ван Баал С., Йегле М., Хагемейер А., Бутсма Д., Гросвельд Г. (1992). «Транслокация t (6; 9) при остром нелимфоцитарном лейкозе приводит к образованию слитого гена DEK-CAN». Клиническая гематология Байера . 5 (4): 857–79. DOI : 10.1016 / s0950-3536 (11) 80049-1 . PMID 1308167 .
- Waldmann T, Scholten I, Kappes F, Hu HG, Knippers R (2004). «Белок DEK - распространенный и повсеместный компонент хроматина млекопитающих». Джин . 343 (1): 1–9. DOI : 10.1016 / j.gene.2004.08.029 . PMID 15563827 .
- Денисенко О.Н., О'Нил Б., Островски Дж., Ван Сёнинген И., Бомштык К. (1996). «Zik1, репрессор транскрипции, который взаимодействует с гетерогенным ядерным белком K частиц рибонуклеопротеина» . J. Biol. Chem . 271 (44): 27701–6. DOI : 10.1074 / jbc.271.44.27701 . PMID 8910362 .
- Фу Г.К., Гросвельд Г., Марковиц Д.М. (1997). «DEK, аутоантиген, участвующий в хромосомной транслокации при остром миелолейкозе, связывается с энхансером ВИЧ-2» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 94 (5): 1811–5. Bibcode : 1997PNAS ... 94.1811F . DOI : 10.1073 / pnas.94.5.1811 . PMC 19999 . PMID 9050861 .
- Мюррей К.Дж., Сзер В., Гром А.А., Доннелли П., Левинсон Дж. Э., Джаннини Э. Х., Гласс Д. Н., Сзер И. С. (1997). «Антитела к ядерному антигену DEK 45 кДа при малосуставном ювенильном ревматоидном артрите и иридоциклите: селективная ассоциация с геном MHC». J. Rheumatol . 24 (3): 560–7. PMID 9058666 .
- Фореро Л., Цвирнер Н. В., Финк К. В., Фернандес-Винья М. А., Стастны П. (1998). «Юношеский артрит, HLA-A2 и связывание онкогенов-пептидов DEK». Гм. Иммунол . 59 (7): 443–50. DOI : 10.1016 / S0198-8859 (98) 00034-2 . PMID 9684994 .
- Донг X, Мишелис М.А., Ван Дж., Бозе Р., ДеЛанж Т., Ривз WH (1998). «Аутоантитела к онкопротеину DEK у пациента с системной красной волчанкой и саркоидозом» . Ревматоидный артрит . 41 (8): 1505–10. DOI : 10.1002 / 1529-0131 (199808) 41: 8 <1505 :: АИД-ART23> 3.0.CO; 2-N . PMID 9704652 .
- Вичманн I, Гарсия-Лозано-младший, Респалдиза Н., Гонсалес-Эскрибано М.Ф., Нуньес-Ролдан А. (1999). «Аутоантитела к белкам регуляции транскрипции DEK и ALY у пациента с системной красной волчанкой». Гм. Иммунол . 60 (1): 57–62. DOI : 10.1016 / S0198-8859 (98) 00085-8 . PMID 9952027 .
- Алексиадис В., Вальдманн Т., Андерсен Дж., Манн М., Книпперс Р., Грусс С. (2000). «Белок, кодируемый протоонкогеном DEK, изменяет топологию хроматина и снижает эффективность репликации ДНК специфичным для хроматина образом» . Genes Dev . 14 (11): 1308–12. PMC 316669 . PMID 10837023 .
- МакГарви Т., Розонина Е., Маккракен С., Ли К., Арнаут Р., Миентжес Е., Никерсон Дж. А., Ори Д., Гринблатт Дж., Гросвельд Г., Бленкоу Б. «Белок, связанный с острым миелоидным лейкозом, DEK, образует зависимое от сплайсинга взаимодействие с комплексами экзон-продукт» . J. Cell Biol . 150 (2): 309–20. DOI : 10,1083 / jcb.150.2.309 . PMC 2180225 . PMID 10908574 .
- Grottke C, Mantwill K, Dietel M, Schadendorf D, Lage H (2000). «Идентификация дифференциально экспрессируемых генов в клетках меланомы человека с приобретенной устойчивостью к различным противоопухолевым препаратам». Int. J. Рак . 88 (4): 535–46. DOI : 10.1002 / 1097-0215 (20001115) 88: 4 <535 :: АИД-IJC4> 3.0.CO; 2-V . PMID 11058868 .
- Le Hir H, Izaurralde E, Maquat LE, Moore MJ (2000). «Сплайсосома откладывает множество белков на 20-24 нуклеотида выше соединений экзон-экзон мРНК» . EMBO J . 19 (24): 6860–9. DOI : 10.1093 / emboj / 19.24.6860 . PMC 305905 . PMID 11118221 .
- Каппес Ф., Бургер К., Баак М., Факельмайер Ф.О., Грусс С. (2001). «Субклеточная локализация протоонкогенного белка человека DEK» . J. Biol. Chem . 276 (28): 26317–23. DOI : 10.1074 / jbc.M100162200 . PMID 11333257 .
- Вальдманн Т., Экерих К., Баак М., Грюсс С. (2002). «Повсеместно распространенный белок хроматина DEK изменяет структуру ДНК путем введения положительных суперспиралей» . J. Biol. Chem . 277 (28): 24988–94. DOI : 10.1074 / jbc.M204045200 . PMID 11997399 .
- Ларраменди М.Л., Ниини Т., Элонен Э., Надь Б., Оллила Дж., Вихинен М., Кнуутила С. (2002). «Сверхэкспрессия связанных с транслокацией гибридных генов FGFRI, MYC, NPMI и DEK, но отсутствие транслокаций при остром миелоидном лейкозе. Анализ микроматрицы». Haematologica . 87 (6): 569–77. PMID 12031912 .
- Холленбах А.Д., Макферсон С.Дж., Ментес Э.Дж., Айенгар Р., Гросвельд Г. (2002). «Daxx и гистондеацетилаза II связываются с хроматином посредством взаимодействия с коровыми гистонами и ассоциированным с хроматином белком Dek». J. Cell Sci . 115 (Pt 16): 3319–30. PMID 12140263 .
- Критивас А., Фудзимуро М., Вайднер М., Янг Д. Б., Хейворд С. Д. (2002). «Белковые взаимодействия, направленные на связанный с латентным периодом ядерный антиген герпесвируса Капоши, связанный с саркомой, к клеточным хромосомам» . J. Virol . 76 (22): 11596–604. DOI : 10.1128 / JVI.76.22.11596-11604.2002 . PMC 136775 . PMID 12388720 .
Внешние ссылки
- PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для Human Protein DEK.