Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
ДНПЭП
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

4DYO

Идентификаторы
ПсевдонимыDNPEP , ASPEP, DAP, аспартиламинопептидаза
Внешние идентификаторыOMIM: 611367 MGI: 1278328 HomoloGene: 6110 Генные карты : DNPEP
Расположение гена (человек)
Хромосома 2 (человек)
Chr.Хромосома 2 (человека) [1]
Хромосома 2 (человек)
Геномное расположение DNPEP
Геномное расположение DNPEP
Группа2q35Начинать219 373 527 п.н. [1]
Конец219 400 022 п.н. [1]
Расположение гена (Мышь)
Хромосома 1 (мышь)
Chr.Хромосома 1 (мышь) [2]
Хромосома 1 (мышь)
Геномное расположение DNPEP
Геномное расположение DNPEP
Группа1 | 1 C4Начинать75 307 896 п.н. [2]
Конец75 317 990 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE DNPEP 217604 at fs.png

PBB GE DNPEP 201937 s at fs.png

PBB GE DNPEP 38703 at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• активность пептидазы
• связывание с ионами цинка
• активность аминопептидазы
• связывание с белками GO: 0001948
• активность гидролазы
• активность металлопептидазы
• связывание ионов металлов
• активность металлоаминопептидазы
• идентичное связывание с белками
Сотовый компонент• микрочастица крови
• ядро клетки
• цитозоль
• цитоплазма
• внеклеточная область
Биологический процесс• протеолиз
• пептидный метаболический процесс
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

23549

13437

Ансамбль

ENSG00000123992

ENSMUSG00000026209

UniProt

Q9ULA0

Q9Z2W0

RefSeq (мРНК)
NM_012100
NM_001319116
NM_001319117
NM_001319118
NM_001319119

NM_001319120
NM_001319121
NM_001319122

NM_001110831
NM_016878

RefSeq (белок)
NP_001306045
NP_001306046
NP_001306047
NP_001306048
NP_001306049

NP_001306050
NP_001306051
NP_036232
NP_001306050.1
NP_001306051.1

NP_001104301
NP_058574

Расположение (UCSC)Chr 2: 219.37 - 219.4 МбChr 1: 75.31 - 75.32 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Аспартить аминопептидаза представляет собой фермент , который у человека кодируется DNPEP ген . [5] [6]

Функция [ править ]

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой аминопептидазу, которая предпочитает кислые аминокислоты и, в частности, отдает предпочтение аспарагиновой кислоте, а не глутаминовой кислоте. Считается, что это цитозольный белок, участвующий в общем метаболизме внутриклеточных белков. [6]

Модельные организмы [ править ]

Модельные организмы были использованы при изучении функции DNPEP. Линия условно нокаутных мышей под названием Dnpep tm1e (EUCOMM) Wtsi была создана в Wellcome Trust Sanger Institute . [7] Самцы и самки животных прошли стандартизированный фенотипический скрининг [8] для определения эффектов делеции. [9] [10] [11] [12] Проведены дополнительные проверки: Углубленное иммунологическое фенотипирование. [13]

Фенотип мышей с нокаутом Dnpep
ХарактеристикаФенотип
Все данные доступны на сайте. [8] [13]
Лейкоциты периферической крови 6 недельНормальный
ИнсулинНормальный
Гематология 6 недельНормальный
Гомозиготная жизнеспособность на P14Нормальный
Гомозиготная фертильностьНормальный
Масса телаНормальный
Неврологический осмотрНормальный
Сила захватаНормальный
ДисморфологияНормальный
Косвенная калориметрияНормальный
Тест толерантности к глюкозеНормальный
Слуховой ответ ствола мозгаНормальный
DEXAНормальный
РентгенографияНормальный
Морфология глазаНормальный
Клиническая химияНормальный
Гематология 16 недельНормальный
Лейкоциты периферической крови 16 недельНормальный
Вес сердцаНормальный
Сальмонеллезная инфекцияНормальный
Функция цитотоксических Т-клетокНормальный
Иммунофенотипирование селезенкиНормальный
Иммунофенотипирование мезентериальных лимфатических узловНормальный
Иммунофенотипирование костного мозгаНормальный
Состав эпидермального иммунитетаНормальный
Тричурис вызовНормальный

См. Также [ править ]

  •  Биологический портал

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000123992 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026209 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ↑ Wilk S, Wilk E, Magnusson RP (июнь 1998 г.). «Очистка, характеристика и клонирование цитозольной аспартиламинопептидазы» . Журнал биологической химии . 273 (26): 15961–70. DOI : 10.1074 / jbc.273.26.15961 . PMID 9632644 . 
  6. ^ a b «Ген Entrez: аспартиламинопептидаза DNPEP» .
  7. ^ Гердин AK (2010). «Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью». Acta Ophthalmologica . 88 : 925–7. DOI : 10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x . S2CID 85911512 . 
  8. ^ a b «Международный консорциум по фенотипированию мышей» .
  9. ^ Skarnes туалет, Розен В, Уэст А.П., Koutsourakis М, Бушелл Вт, Ийер В, Мухика А.О., Томас М, борона Дж, Кокс Т, Джексон D, Северин Дж, Биггс Р, фу Дж, Нефедов М, де - Jong PJ, Стюарт А.Ф., Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши» . Природа . 474 (7351): 337–42. DOI : 10,1038 / природа10163 . PMC 3572410 . PMID 21677750 .  
  10. ^ Долгин E (июнь 2011). "Библиотека мыши настроена на нокаут" . Природа . 474 (7351): 262–3. DOI : 10.1038 / 474262a . PMID 21677718 . 
  11. ↑ Collins FS, Rossant J, Wurst W (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Cell . 128 (1): 9–13. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.12.018 . PMID 17218247 . S2CID 18872015 .  
  12. ^ Белый Ю.К., Gerdin А.К., Карп Н.А., Райдера Е, Булян М, Bussell Ю.Н., Salisbury Дж, Clare S, Ингам штат Нью - Джерси, Podrini С, Houghton R, Estabel J, Боттомли JR, Мелвин Д.Г., Сунтер D, Адамс Северная Каролина, Таннахилл D, Logan DW, Macarthur DG, Flint J, Mahajan VB, Tsang SH, Smyth I, Watt FM, Skarnes WC, Dougan G, Adams DJ, Ramirez-Solis R, Bradley A, Steel KP (июль 2013 г.). «Полногеномное поколение и систематическое фенотипирование мышей с нокаутом открывает новые роли для многих генов» . Cell . 154 (2): 452–64. DOI : 10.1016 / j.cell.2013.06.022 . PMC 3717207 . PMID 23870131 .  
  13. ^ a b «Консорциум иммунофенотипирования инфекций и иммунитета (3i)» .

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., Макбрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии» . Молекулярная системная биология . 3 (1): 89. DOI : 10.1038 / msb4100134 . PMC  1847948 . PMID  17353931 .
  • Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Милштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY , Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. DOI : 10,1038 / природа04209 . PMID  16189514 . S2CID  4427026 .
  • Прието I, Эрмосо Ф., де Гаспаро М., Варгас Ф., Альба Ф., Сегарра А.Б., Банегас И., Рамирес М. (май 2003 г.). «Активность ангиотензиназы в почках крыс с реноваскулярной гипертензией». Пептиды . 24 (5): 755–60. CiteSeerX  10.1.1.379.1582 . DOI : 10.1016 / S0196-9781 (03) 00121-9 . PMID  12895663 . S2CID  16379232 .
  • Вилк С., Вилк Е., Магнуссон Р.П. (ноябрь 2002 г.). «Идентификация остатков гистидина, важных в катализе и структуре аспартиламинопептидазы». Архивы биохимии и биофизики . 407 (2): 176–83. DOI : 10.1016 / S0003-9861 (02) 00494-0 . PMID  12413488 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Merops онлайновой базы данных для пептидазы и их ингибиторов: M18.002
  • PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для аспартиламинопептидазы человека (DNPEP)