Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлено из DPYD )
Перейти к навигации Перейти к поиску
дигидропиримидиндегидрогеназа (НАДФ +)
1gte.jpg
Димер дигидропримидиндегидрогеназы, Sus scrofa
Идентификаторы
Номер ЕС1.3.1.2
Количество CAS9029-01-0
Альт. именаДигидротимин дегидрогеназа
Базы данных
IntEnzПросмотр IntEnz
BRENDABRENDA запись
ExPASyПросмотр NiceZyme
КЕГГЗапись в KEGG
MetaCycметаболический путь
ПРИАМпрофиль
Структуры PDB RCSB PDB PDBe PDBsum
Генная онтологияAmigo / QuickGO
Поиск
ЧВКстатьи
PubMedстатьи
NCBIбелки
DPYD
Белок DPYD PDB 1gt8.png
Идентификаторы
ПсевдонимыDPYD , DHP, DHPDHASE, DPD, дигидропиримидиндегидрогеназа
Внешние идентификаторыOMIM : 612779 MGI : 2139667 HomoloGene : 85 GeneCards : DPYD
Расположение гена ( человек )
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человека) [1]
Группа1п21.3Начинать97 077 743 п.н. [1]
Конец97 995 000 б.п. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Chr.Хромосома 3 (мышь) [2]
Группа3 | 3 G1Начинать118 562 129 п.н. [2]
Конец119 432 924 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• оксидоредуктазная активность, действующая на группу CH-CH доноров
• 4 связывания железа, 4 кластеров серы
• связывание нуклеотидов
• активность гомодимеризации белков
• связывание флавинаденин-динуклеотидов
• активность дигидропиримидиндегидрогеназы (НАДФ +)
• связывание кластеров железа и серы
• связывание ионов металлов
• Связывание с белками GO: 0001948
• каталитическая активность
• связывание NADP
• активность оксидоредуктазы
• связывание урацила
• активность NADH-дегидрогеназы
• активность дигидроурацилдегидрогеназы (NAD +)
Сотовый компонент• цитоплазма
• цитозоль
Биологический процесс• бета-аланин биосинтетических процесс
• урацил катаболического процесса
• пиримидинового нуклеозида катаболический процесс
• пиримидина нуклеотидных катаболический процесс
• тимидина катаболический процесс
• окислительно-восстановительный процесс
• пуриновых нуклеотидных катаболический процесс
• тимин катаболический процесс
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

1806 г.

99586

Ансамбль

ENSG00000188641

ENSMUSG00000033308

UniProt

Q12882

Q8CHR6

RefSeq (мРНК)

NM_000110
NM_001160301

NM_170778

RefSeq (белок)

NP_000101
NP_001153773

NP_740748

Расположение (UCSC)Chr 1: 97.08 - 98 МбChr 3: 118,56 - 119,43 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

В энзимологии , A дигидропиримидиндегидрогеназа (НАДФ +) ( ЕС 1.3.1.2 ) представляет собой фермент , который катализирует в химическую реакцию

5,6-дигидроурацил + НАДФ + урацил + НАДФН + Н +

Таким образом, двумя субстратами этого фермента являются 5,6-дигидроурацил и НАДФ + , тогда как его тремя продуктами являются урацил , НАДФН и Н + .

В организме человека фермент кодируется DPYD гена . [5] [6] Это начальный и лимитирующий этап катаболизма пиримидина. [ необходима цитата ] Он катализирует восстановление урацила и тимина . [7] Он также участвует в разложении химиотерапевтических препаратов 5-фторурацила и тегафура . [8] Он также принимает участие в бета-аланин метаболизма и пантотената и биосинтеза соа .

Терминология [ править ]

Систематическое название данного фермента класса 5,6-dihydrouracil: НАДФ + 5-оксидоредуктазы .
Другие широко используемые имена включают:

  • дигидротиминдегидрогеназа
  • дигидроурацилдегидрогеназа (НАДФ +)
  • 4,5-дигидротимин: оксидоредуктаза
  • DPD
  • DHPDH
  • дегидрогеназа, дигидроурацил (никотинамидадениндинуклеотид , фосфат)
  • DHU дегидрогеназа
  • гидропиримидиндегидрогеназа
  • дигидропиримидиндегидрогеназа (НАДФ +)

Структурные исследования [ править ]

По состоянию на конец 2007 г. было решено 5 структур для этого класса ферментов с кодами доступа PDB 1GT8 , 1GTE , 1GTH , 1H7W и 1H7X .

Функция [ править ]

Белок представляет собой катаболический фермент пиримидина и является исходным и ограничивающим скорость фактором в пути катаболизма урацила и тимидина . Генетический дефицит этого фермента приводит к ошибке метаболизма пиримидина, связанной с тимин-урацилурией, и повышенному риску токсичности у онкологических больных, получающих химиотерапию 5-фторурацилом . [6]

Интерактивная карта проезда [ править ]

Нажмите на гены, белки и метаболиты ниже, чтобы ссылки на соответствующие статьи. [§ 1]

  1. ^ Интерактивную карту путей можно редактировать на WikiPathways: "FluoropyrimidineActivity_WP1601" .

См. Также [ править ]

  • Дефицит дигидропиримидиндегидрогеназы , генетическое заболевание
  • Фармакогеномика рака

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000188641 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033308 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Такай S, Fernandez-Салгуэро P, S Кимура, Гонсалес FJ, Ямада K (декабрь 1994). «Отнесение гена дигидропиримидиндегидрогеназы человека (DPYD) к области 1p22 хромосомы путем флуоресцентной гибридизации in situ» . Геномика . 24 (3): 613–4. DOI : 10.1006 / geno.1994.1680 . PMID 7713523 . 
  6. ^ a b «Ген Entrez: дигидропиримидиндегидрогеназа DPYD» .
  7. ↑ Chung T, Na J, Kim YI, Chang DY, Kim YI, Kim H, Moon HE, Kang KW, Lee DS, Chung JK, Kim SS, Suh-Kim H, Paek SH, Youn H (2016). «Дигидропиримидиндегидрогеназа является прогностическим маркером для опосредованного мезенхимальными стволовыми клетками гена цитозиндезаминазы и пролекарства 5-фторцитозина для лечения рецидивирующих глиом» . Тераностика . 6 (10): 1477–90. DOI : 10.7150 / thno.14158 . PMC 4955049 . PMID 27446484 .  
  8. ^ Caudle KE, Thorn CF, Klein TE, Свен JJ, Маклеод HL, Diasio RB, Schwab M (декабрь 2013). «Рекомендации Консорциума по внедрению клинической фармакогенетики для определения генотипа дигидропиримидиндегидрогеназы и дозирования фторпиримидина» . Клиническая фармакология и терапия . 94 (6): 640–5. DOI : 10.1038 / clpt.2013.172 . PMC 3831181 . PMID 23988873 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Hoff PM, Royce M, Medgyesy D, Brito R, Pazdur R (декабрь 1999 г.). «Фторопоиримидины пероральные». Семинары по онкологии . 26 (6): 640–6. PMID  10606257 .
  • Шнайдер Х. Б., Беккер Х (май 2003 г.). «Влияние дигидропиримидиндегидрогеназы на лечение 5-фторурацилом у онкологических больных». Европейский журнал медицинских исследований . 8 (5): 226–8. PMID  12844478 .
  • Омура К. (июнь 2003 г.). «Клинические последствия активности дигидропиримидиндегидрогеназы (DPD) в химиотерапии на основе 5-FU: мутации в гене DPD и фторпиримидины, ингибирующие DPD». Международный журнал клинической онкологии . 8 (3): 132–8. DOI : 10.1007 / s10147-003-0330-Z . PMID  12851836 . S2CID  22593228 .
  • Ли В., Локхарт А.С., Ким Р.Б., Ротенберг М.Л. (февраль 2005 г.). «Фармакогеномика рака: мощные инструменты в химиотерапии рака и разработке лекарств». Онколог . 10 (2): 104–11. DOI : 10.1634 / теонколог.10-2-104 . PMID  15709212 .
  • Лу Чж, Чжан Р., Диасио РБ (август 1992 г.). «Очистка и характеристика дигидропиримидиндегидрогеназы из печени человека». Журнал биологической химии . 267 (24): 17102–9. PMID  1512248 .
  • Портер DJ, Chestnut WG, Merrill BM, Spector T (март 1992 г.). «Механизм инактивации дигидропиримидиндегидрогеназы 5-этинилурацилом». Журнал биологической химии . 267 (8): 5236–42. PMID  1544906 .
  • Дюпюи А., Скехель Дж. М., Уокер Дж. Э. (март 1991 г.). «Гомолог кодируемой ядром белковой субъединицы железо-сера бычьего митохондриального комплекса I кодируется в геномах хлоропластов». Биохимия . 30 (11): 2954–60. DOI : 10.1021 / bi00225a032 . PMID  1901022 .
  • Eggink G, Engel H, Vriend G, Terpstra P, Witholt B (март 1990 г.). «Рубредоксинредуктаза Pseudomonas oleovorans. Структурная связь с другими оксидоредуктазами флавопротеинов на основе одного NAD и двух отпечатков пальцев FAD». Журнал молекулярной биологии . 212 (1): 135–42. DOI : 10.1016 / 0022-2836 (90) 90310-I . PMID  2319593 .
  • Tuchman M, Roemeling RV, Hrushesky WA, Южный РБ, О'Ди РФ (1989). «Активность дигидропиримидиндегидрогеназы в мононуклеарных клетках крови человека». Фермент . 42 (1): 15–24. DOI : 10.1159 / 000469002 . PMID  2528450 .
  • Диасио РБ, Биверс Т.Л., Карпентер Дж.Т. (январь 1988 г.). «Семейный дефицит дигидропиримидиндегидрогеназы. Биохимическая основа семейной пиримидинемии и тяжелой токсичности, вызванной 5-фторурацилом» . Журнал клинических исследований . 81 (1): 47–51. DOI : 10.1172 / JCI113308 . PMC  442471 . PMID  3335642 .
  • Йокота Х., Фернандес-Сальгуэро П., Фуруя Х., Лин К., МакБрайд О.В., Подшун Б., Шнакерц К.Д., Гонсалес Ф.Дж. (сентябрь 1994 г.). «Клонирование кДНК и картирование хромосом дигидропиримидиндегидрогеназы человека, фермента, связанного с токсичностью 5-фторурацила и врожденной тиминурацилурией». Журнал биологической химии . 269 (37): 23192–6. PMID  8083224 .
  • Лу З., Чжан Р., Диасио РБ (ноябрь 1993 г.). «Активность дигидропиримидиндегидрогеназы в мононуклеарных клетках периферической крови человека и печени: популяционные характеристики, недавно выявленные пациенты с дефицитом и клиническое значение в химиотерапии 5-фторурацилом». Исследования рака . 53 (22): 5433–8. PMID  8221682 .
  • Vreken P, Van Kuilenburg AB, Meinsma R, Smit GP, Bakker HD, De Abreu RA, van Gennip AH (1997). «Точечная мутация в инвариантном донорском сайте сплайсинга приводит к пропуску экзона у двух неродственных голландских пациентов с дефицитом дигидропиримидиндегидрогеназы». Журнал наследственных метаболических заболеваний . 19 (5): 645–54. DOI : 10.1007 / BF01799841 . PMID  8892022 . S2CID  10835574 .
  • Джонсон М.Р., Ван К., Тиллманнс С., Альбин Н., Диасио РБ (май 1997 г.). «Структурная организация гена дигидропиримидиндегидрогеназы человека». Исследования рака . 57 (9): 1660–3. PMID  9135003 .
  • Фернандес-Сальгуэро П.М., Сапоне А., Вей Х, Холт-младший, Джонс С., Айдл-Дж. «Отсутствие корреляции между фенотипом и генотипом для полиморфно экспрессируемой дигидропиримидиндегидрогеназы в семье пакистанского происхождения». Фармакогенетика . 7 (2): 161–3. DOI : 10.1097 / 00008571-199704000-00012 . PMID  9170156 .
  • Врекен П., Ван Куйленбург А.Б., Мейнсма Р., ван Геннип А.Х. (июль 1997 г.). «Идентификация новых точечных мутаций в гене дигидропиримидиндегидрогеназы» (PDF) . Журнал наследственных метаболических заболеваний . 20 (3): 335–8. DOI : 10,1023 / A: 1005357307122 . PMID  9266349 . S2CID  3060557 .
  • Врекен П., Ван Куйленбург А.Б., Мейнсма Р., ван Геннип А.Х. (декабрь 1997 г.). «Дефицит дигидропиримидиндегидрогеназы (DPD): идентификация и экспрессия миссенс-мутаций C29R, R886H и R235W» . Генетика человека . 101 (3): 333–8. DOI : 10.1007 / s004390050637 . PMID  9439663 . S2CID  24362516 .
  • Огура К., Нишияма Т., Такубо Х., Като А., Окуда Х., Аракава К., Фукусима М., Нагаяма С., Кавагути Ю., Ватабе Т. (январь 1998 г.). «Суицидная инактивация дигидропиримидиндегидрогеназы человека с помощью (E) -5- (2-бромовинил) урацила, полученного из противовирусного, соривудина». Письма о раке . 122 (1–2): 107–13. DOI : 10.1016 / S0304-3835 (97) 00377-7 . PMID  9464498 .
  • ФРИЦСОН П. (1960). «Свойства и анализ дигидроурацилдегидрогеназы печени крысы». J. Biol. Chem . 235 : 719–25. PMID  13825299 .
  • Шиотани Т., Вебер Г. (1981). «Очистка и свойства дигидротиминдегидрогеназы из печени крысы». J. Biol. Chem . 256 (1): 219–24. PMID  7451435 .


  • v
  • т
  • е