Из Википедии, свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
DSC1
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

5IRY

Идентификаторы
ПсевдонимыDSC1 , CDHF1, DG2 / DG3, desmocollin 1
Внешние идентификаторыOMIM : 125643 MGI : 109173 HomoloGene : 22761 GeneCard : DSC1
Расположение гена ( человек )
Хромосома 18 (человек)
Chr.Хромосома 18 (человека) [1]
Хромосома 18 (человек)
Геномное расположение для DSC1
Геномное расположение для DSC1
Группа18q12.1Начинать31 129 236 п.н. [1]
Конец31 162 856 п.н. [1]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE DSC1 207324 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• связывание ионов кальция
• связывание ионов металлов
Сотовый компонент• интегральный компонент мембраны
• щелевое соединение
• клеточное соединение
• десмосома
• внеклеточная экзосома
• мембрана
• ороговевшая оболочка
• клеточная мембрана
• гранулярная мембрана, богатая фиколином-1
• межклеточное соединение
Биологический процесс• клеточная адгезия
• гомофильная клеточная адгезия через молекулы адгезии плазматической мембраны
• ороговение
• дегрануляция нейтрофилов
• ороговение
• межклеточная адгезия
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

1823 г.

13505

Ансамбль

ENSG00000134765

ENSMUSG00000044322

UniProt

Q08554

P55849

RefSeq (мРНК)

NM_024421
NM_004948

NM_001291804
NM_013504

RefSeq (белок)

NP_004939
NP_077739

NP_001278733
NP_038532

Расположение (UCSC)Chr 18: 31.13 - 31.16 Мбн / д
PubMed поиск[2][3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Desmocollin-1 представляет собой белок , который у человека кодируется DSC1 гена . [4] [5]

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой кальций-зависимый гликопротеин, который является членом подсемейства десмоколлинов суперсемейства кадгеринов. Эти члены семейства десмосом, наряду с десмоглеинами, обнаруживаются в основном в эпителиальных клетках, где они составляют адгезивные белки соединения десмосом между клетками и необходимы для адгезии клеток и образования десмосом. Члены десмосомного семейства расположены в два кластера на 18 хромосоме, занимая вместе менее 650 т.п.н. Альтернативный сплайсинг приводит к двум вариантам транскрипта, кодирующим разные изоформы. [5]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что DSC1 взаимодействует с десмоглеином 2 . [6]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000134765 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  3. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ Бакстон RS, Cowin P, Franke WW, Garrod DR, Green KJ, King IA, Koch PJ, Magee AI, Rees DA, Stanley JR, et al. (Июнь 1993 г.). «Номенклатура десмосомных кадгеринов» . J Cell Biol . 121 (3): 481–3. DOI : 10,1083 / jcb.121.3.481 . PMC 2119574 . PMID 8486729 .  
  5. ^ a b «Ген Энтреза: десмоколлин 1 DSC1» .
  6. ^ Читаев, Н.А.; Трояновский С.М. (июль 1997 г.). «Прямое Ca2 + -зависимое гетерофильное взаимодействие между десмосомальными кадгеринами, десмоглеином и десмоколлином, способствует межклеточной адгезии» . J. Cell Biol . 138 (1): 193–201. DOI : 10,1083 / jcb.138.1.193 . ISSN 0021-9525 . PMC 2139935 . PMID 9214392 .   

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Гаррод Д.Р., Мерритт А.Дж., Не З. (2003). «Десмосомальные кадгерины». Curr. Opin. Cell Biol . 14 (5): 537–45. DOI : 10.1016 / S0955-0674 (02) 00366-6 . PMID  12231347 .
  • Кинг И.А., Маги А.И., Рис Д.А., Бакстон Р.С. (1991). «Кератинизация связана с экспрессией нового белка, относящегося к десмосомным кадгеринам DGII / III». FEBS Lett . 286 (1–2): 9–12. DOI : 10.1016 / 0014-5793 (91) 80929-W . PMID  1713860 . S2CID  32870803 .
  • Кинг И.А., Салливан К.Х., Беннетт Р., Бакстон Р.С. (1995). «Десмоколлины эпидермиса крайней плоти человека: идентификация и хромосомная принадлежность третьего гена и паттерны экспрессии трех изоформ» . J. Invest. Дерматол . 105 (3): 314–21. DOI : 10.1111 / 1523-1747.ep12319935 . PMID  7665906 .
  • Трояновский С.М., Эшкинд Л.Г., Трояновский РБ и др. (1993). «Вклад цитоплазматических доменов кадгеринов десмосом в сборку десмосом и закрепление промежуточных филаментов». Cell . 72 (4): 561–74. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (93) 90075-2 . PMID  7679953 . S2CID  25724256 .
  • Трояновский С.М., Трояновский Р.Б., Эшкинд Л.Г. и др. (1994). «Идентификация мотивов аминокислотной последовательности в десмоколлине, десмосомном гликопротеине, которые необходимы для связывания плакоглобина и образования бляшек» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 91 (23): 10790–4. Bibcode : 1994PNAS ... 9110790T . DOI : 10.1073 / pnas.91.23.10790 . PMC  45111 . PMID  7971964 .
  • Кинг И.А., Арнеманн Дж., Спурр Н.К., Бакстон Р.С. (1994). «Клонирование кДНК (DSC1), кодирующей десмоколлин типа 1 человека, и ее отнесение к хромосоме 18». Геномика . 18 (2): 185–94. DOI : 10.1006 / geno.1993.1453 . PMID  8288219 .
  • Theis DG, Koch PJ, Franke WW (1993). «Дифференциальный синтез мРНК десмоколлина типа 1 и типа 2 в стратифицированном эпителии человека». Int. J. Dev. Биол . 37 (1): 101–10. PMID  8507556 .
  • Nuber UA, Schäfer S, Stehr S и др. (1997). «Паттерны синтеза десмоколлинов в эпителии человека: иммунолокализация десмоколлинов 1 и 3 в особом эпителии и в культивируемых клетках». Евро. J. Cell Biol . 71 (1): 1–13. PMID  8884173 .
  • Коули С.М., Симрак Д., Марсден М.Д. и др. (1997). «Контиг YAC, соединяющий локусы десмоколлина и десмоглеина на хромосоме 18 человека и упорядочение генов десмоколлина». Геномика . 42 (2): 208–16. DOI : 10.1006 / geno.1997.4718 . PMID  9192840 .
  • Читаев Н.А., Трояновский С.М. (1997). «Прямое Ca2 + -зависимое гетерофильное взаимодействие между десмосомальными кадгеринами, десмоглеином и десмоколлином, способствует межклеточной адгезии» . J. Cell Biol . 138 (1): 193–201. DOI : 10,1083 / jcb.138.1.193 . PMC  2139935 . PMID  9214392 .
  • Смит Э.А., Фукс Э. (1998). «Определение взаимодействий между промежуточными филаментами и десмосомами» . J. Cell Biol . 141 (5): 1229–41. DOI : 10.1083 / jcb.141.5.1229 . PMC  2137181 . PMID  9606214 .
  • Курцен Х., Молл И., Молл Р. и др. (1998). «Композиционно различные десмосомы в различных отделах волосяного фолликула человека». Дифференциация . 63 (5): 295–304. DOI : 10,1046 / j.1432-0436.1998.6350295.x . PMID  9810708 .
  • Хант Д.М., Сахота В.К., Тейлор К. и др. (2000). «Кластерные гены кадгерина: готовая последовательность для десмосомного локуса кадгерина на хромосоме 18 человека». Геномика . 62 (3): 445–55. DOI : 10.1006 / geno.1999.6036 . PMID  10644442 .
  • Уитток Н.В., Хант Д.М., Рикман Л. и др. (2000). «Геномная организация и амплификация человеческих генов десмосомных кадгеринов DSC1 и DSC3, кодирующих десмоколлин типов 1 и 3». Биохим. Биофиз. Res. Commun . 276 (2): 454–60. DOI : 10.1006 / bbrc.2000.3500 . PMID  11027496 .
  • Исии К., Норвелл С.М., Бэннон Л.Дж. и др. (2001). «Сборка десмосомальных кадгеринов в десмосомы зависит от изоформы». J. Invest. Дерматол . 117 (1): 26–35. DOI : 10,1046 / j.0022-202x.2001.01400.x . PMID  11442746 .
  • Чен Х, Бонне С., Хатцфельд М. и др. (2002). «Связывание белков и функциональная характеристика плакофилина 2. Доказательства его разнообразных ролей в десмосомах и передаче сигналов бета-катенина» . J. Biol. Chem . 277 (12): 10512–22. DOI : 10.1074 / jbc.M108765200 . PMID  11790773 .
  • Бонне С., Гилберт Б., Хацфельд М. и др. (2003). «Определение десмосомных взаимодействий плакофилина-3» . J. Cell Biol . 161 (2): 403–16. DOI : 10,1083 / jcb.200303036 . PMC  2172904 . PMID  12707304 .


  • v
  • т
  • е