Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
E2F4
Белок E2F4 PDB 1cf7.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

1CF7

Идентификаторы
ПсевдонимыE2F4 , E2F-4, фактор транскрипции E2F 4
Внешние идентификаторыOMIM : 600659 MGI : 103012 HomoloGene : 1471 GeneCard : E2F4
Расположение гена ( человек )
Хромосома 16 (человек)
Chr.Хромосома 16 (человека) [1]
Хромосома 16 (человек)
Геномное расположение E2F4
Геномное расположение E2F4
Группа16q22.1Начинать67 192 155 п.н. [1]
Конец67 198 918 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 8 (мышь)
Chr.Хромосома 8 (мышь) [2]
Хромосома 8 (мышь)
Геномное расположение E2F4
Геномное расположение E2F4
Группа8 | 8 D3Начинать105 297 663 п.н. [2]
Конец105 305 370 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE E2F4 202248 в формате fs.png

PBB GE E2F4 38707 r в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• Связывание с ДНК
• Специфическое связывание с доменом белка
• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции
• GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 ДНК-связывающая активность активатора транскрипции, специфическая
для РНК-полимеразы II • связывание с фактором транскрипции
• GO: 0000980 Цис-регуляторная область РНК-полимеразы II, специфичное для последовательности связывание ДНК
• GO: 0001948 связывание с белком
• промотор-специфическое связывание с хроматином
• активность димеризации протеина
• GO : 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II
• GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, специфично
для РНК-полимеразы II • Последовательно-специфическое связывание ДНК
Сотовый компонент• комплекс регуляторов транскрипции
• нуклеоплазма
• ядерный хроматин
• ядро клетки
• комплекс факторов транскрипции РНК-полимераза II
Биологический процесс• регуляция размера клеток
• развитие эпителиальных клеток
• гомеостаз клеточного объема
• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• дифференцировка многоцелевых эпителиальных клеток
• транскрипция с промотора РНК-полимеразы II
• регуляция транскрипции, участвующая в переходе G1 / S митотического клеточного цикла
• кровообращение
• организация проекции клеток
• регуляция пролиферации клеток
• морфогенез органов животных
• клеточный цикл
• сборка подвижных ресничек
• сборка центриолей
• транскрипция, ДНК-шаблон
• митотический клеточный цикл GO: 0007067
• реакция на повреждение ДНК, передача сигнала медиатором класса p53, приводящая к остановке клеточного цикла
• позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• морфогенез ресничек
• негативная регуляция транскрипции с помощью РНК-полимеразы II промотор
• регуляция клеточного цикла
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

1874 г.

104394

Ансамбль

ENSG00000205250

ENSMUSG00000014859

UniProt

Q16254

Q8R0K9

RefSeq (мРНК)

NM_001950

NM_148952

RefSeq (белок)

NP_001941

NP_683754

Расположение (UCSC)Chr 16: 67.19 - 67,2 МбChr 8: 105,3 - 105,31 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Фактор транскрипции E2F4 является белком , который в организме человека кодируется E2F4 геном . [5] [6]

Функция [ править ]

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства факторов транскрипции E2F . Семейство E2F играет решающую роль в контроле клеточного цикла и действия белков-супрессоров опухолей, а также является мишенью трансформирующих белков небольших ДНК опухолевых вирусов. Этот белок связывается со всеми тремя белками-супрессорами опухолей pRB, p107 и p130, но с более высоким сродством к последним двум. Он играет важную роль в подавлении генов, связанных с пролиферацией, а его генная мутация и повышенная экспрессия могут быть связаны с раком человека. [7]

Структура [ править ]

Белки E2F содержат несколько эволюционно консервативных доменов, обнаруженных у большинства членов этого семейства. Эти домены включают ДНК-связывающий домен , домен димеризации, который определяет взаимодействие с регулируемыми дифференцировкой белками факторов транскрипции (DP), домен трансактивации, обогащенный кислыми аминокислотами ( Asp + Glu ), и домен ассоциации белков-супрессоров опухолей, который встроен в домен трансактивации.

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что E2F4 взаимодействует со Smad3 . [8]

См. Также [ править ]

  • E2F

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000205250 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000014859 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ↑ Ginsberg D, Vairo G, Chittenden T, Xiao ZX, Xu G, Wydner KL, DeCaprio JA, Lawrence JB, Livingston DM (декабрь 1994). «E2F-4, новый член семейства факторов транскрипции E2F, взаимодействует с p107» . Genes Dev . 8 (22): 2665–79. DOI : 10,1101 / gad.8.22.2665 . PMID 7958924 . 
  6. ^ Sardet С, М Видал, Cobrinik D, Гэн Y, Onufryk С, Чен, Вайнберг РА (апрель 1995 г.). «E2F-4 и E2F-5, два члена семейства E2F, экспрессируются на ранних фазах клеточного цикла» . Proc Natl Acad Sci USA . 92 (6): 2403–7. Bibcode : 1995PNAS ... 92.2403S . DOI : 10.1073 / pnas.92.6.2403 . PMC 42492 . PMID 7892279 .  
  7. ^ «Энтрез Ген: фактор транскрипции E2F4 E2F 4, связывание p107 / p130» .
  8. ^ Chen CR Кан Y, Siegel PM, Массаге J (июль 2002). «E2F4 / 5 и p107 как кофакторы Smad, связывающие рецептор TGFbeta с репрессией c-myc». Cell . 110 (1): 19–32. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (02) 00801-2 . PMID 12150994 . S2CID 8945574 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Bandyopadhyay D, Timchenko N, Suwa T, et al. (2001). «Человеческий меланоцит: модельная система для изучения сложности клеточного старения и трансформации нефибробластических клеток». Exp. Геронтол . 36 (8): 1265–75. DOI : 10.1016 / S0531-5565 (01) 00098-5 . PMID  11602203 . S2CID  26041753 .
  • Бейерсберген Р.Л., Керховен Р.М., Жу Л. и др. (1994). «E2F-4, новый член семейства генов E2F, обладает онкогенной активностью и ассоциируется с p107 in vivo» . Genes Dev . 8 (22): 2680–90. DOI : 10,1101 / gad.8.22.2680 . PMID  7958925 .
  • Сяо ZX, Гинзберг Д., Юэн М., Ливингстон Д.М. (1996). «Регулирование белка р107, связанного с белком ретинобластомы, с помощью G1-циклин-ассоциированных киназ» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 93 (10): 4633–7. Bibcode : 1996PNAS ... 93.4633X . DOI : 10.1073 / pnas.93.10.4633 . PMC  39330 . PMID  8643455 .
  • Моберг К., Старз М.А., Лис Дж. А. (1996). «E2F-4 переключается с p130 на p107 и pRB в ответ на повторный вход в клеточный цикл» . Мол. Клетка. Биол . 16 (4): 1436–49. DOI : 10.1128 / mcb.16.4.1436 . PMC  231128 . PMID  8657117 .
  • Видаль М., Брахманн Р.К., Фаттей А. и др. (1996). «Обратные двугибридные и одногибридные системы для обнаружения диссоциации белок-белковых и ДНК-белковых взаимодействий» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 93 (19): 10315–20. Bibcode : 1996PNAS ... 9310315V . DOI : 10.1073 / pnas.93.19.10315 . PMC  38381 . PMID  8816797 .
  • Уильямс С.Д., Линч Д.К., Соренсен Т.С. и др. (1997). «Преобладающий комплекс E2F в первичных гемопоэтических клетках человека и в бластах AML содержит E2F-4, DP-1 и p130» . Br. J. Haematol . 96 (4): 688–96. DOI : 10.1046 / j.1365-2141.1997.d01-2086.x . PMID  9074408 . S2CID  23265759 .
  • Линдеман Г.Дж., Гаубац С., Ливингстон Д.М., Гинзберг Д. (1997). «Субклеточная локализация E2F-4 зависит от клеточного цикла» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 94 (10): 5095–100. Bibcode : 1997PNAS ... 94.5095L . DOI : 10.1073 / pnas.94.10.5095 . PMC  24637 . PMID  9144196 .
  • Ван Х, Шао Н., Дин К.М. и др. (1997). «Белки BRCA1 транспортируются в ядро ​​в отсутствие сыворотки и вариантов сплайсинга. BRCA1a, BRCA1b представляют собой тирозинфосфопротеины, которые связываются с E2F, циклинами и циклинзависимыми киназами» . Онкоген . 15 (2): 143–57. DOI : 10.1038 / sj.onc.1201252 . PMID  9244350 .
  • Мюллер Х., Морони М.К., Виго Э. и др. (1997). «Индукция входа в S-фазу факторами транскрипции E2F зависит от их ядерной локализации» . Мол. Клетка. Биол . 17 (9): 5508–20. DOI : 10.1128 / mcb.17.9.5508 . PMC  232399 . PMID  9271426 .
  • Пирс А.М., Шнайдер-Бруссард Р., Филхауэр Дж. Л., Джонсон Д. Г. (1998). «Дифференциальная активность членов семейства E2F: уникальные функции в регуляции транскрипции». Мол. Канцерогенный . 22 (3): 190–8. DOI : 10.1002 / (SICI) 1098-2744 (199807) 22: 3 <190 :: AID-MC7> 3.0.CO; 2-П . PMID  9688145 .
  • Феррейра Р., Магнаги-Джаулин Л., Робин П. и др. (1998). «Три члена семейства карманных белков обладают общей способностью подавлять активность E2F за счет привлечения гистондеацетилазы» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 95 (18): 10493–8. Bibcode : 1998PNAS ... 9510493F . DOI : 10.1073 / pnas.95.18.10493 . PMC  27922 . PMID  9724731 .
  • Тимченко Н.А., Уайльд М., Дарлингтон Г.Дж. (1999). «C / EBPalpha регулирует образование комплексов E2F-p107, специфичных для S-фазы, в печени новорожденных мышей» . Мол. Клетка. Биол . 19 (4): 2936–45. DOI : 10.1128 / mcb.19.4.2936 . PMC  84088 . PMID  10082561 .
  • Чжэн Н., Френкель Э, Пабо КО, Павлетич Н.П. (1999). «Структурные основы распознавания ДНК гетеродимерным фактором транскрипции клеточного цикла E2F-DP» . Genes Dev . 13 (6): 666–74. DOI : 10,1101 / gad.13.6.666 . PMC  316551 . PMID  10090723 .
  • Фурукава Ю., Ивасе С., Кикучи Дж. И др. (1999). «Репрессия транскрипции гена E2F-1 интерфероном-альфа опосредуется индукцией комплексов E2F-4 / pRB и E2F-4 / p130» . Онкоген . 18 (11): 2003–14. DOI : 10.1038 / sj.onc.1202500 . PMID  10208422 .
  • Лам Э.В., Глассфорд Дж., Ван дер Смман Дж. И др. (1999). «Модуляция активности E2F в первичных В-клетках мыши после стимуляции через поверхностные рецепторы IgM и CD40» . Евро. J. Immunol . 29 (10): 3380–9. DOI : 10.1002 / (SICI) 1521-4141 (199910) 29:10 <3380 :: AID-IMMU3380> 3.0.CO; 2-C . PMID  10540350 .
  • Чжун Х, Хемми Х, Койке Дж и др. (2000). «Различные числа повторов AGC в кодирующей области гена фактора транскрипции E2F-4 человека». Гм. Мутат . 15 (3): 296–7. DOI : 10.1002 / (SICI) 1098-1004 (200003) 15: 3 <296 :: AID-HUMU18> 3.0.CO; 2-X . PMID  10679953 .
  • Такахаши Ю., Рэйман Дж. Б., Dynlacht BD (2000). «Анализ связывания промоторов семейств E2F и pRB in vivo: различные белки E2F опосредуют активацию и репрессию» . Genes Dev . 14 (7): 804–16. doi : 10.1101 / gad.14.7.804 (неактивный 2021-01-14). PMC  316494 . PMID  10766737 .CS1 maint: DOI неактивен с января 2021 г. ( ссылка )
  • Schwemmle S, Pfeifer GP (2000). «Геномная структура и мутационный скрининг гена E2F4 в опухолях человека» . Int. J. Рак . 86 (5): 672–7. DOI : 10.1002 / (SICI) 1097-0215 ​​(20000601) 86: 5 <672 :: AID-IJC11> 3.0.CO; 2-X . PMID  10797289 .

Внешние ссылки [ править ]

  • E2F4 + белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
  • FactorBook E2F4
  • PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для фактора транскрипции человека E2F4.

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии .



  • v
  • т
  • е