EDF1

Доступные конструкции

Ортолог поиск: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
1X57

Идентификаторы

Псевдонимы

EDF1 , EDF-1, MBF1, CFAP280, фактор 1, связанный с эндотелиальной дифференцировкой

Внешние идентификаторы

OMIM: 605107 MGI: 1891227 HomoloGene: 2809 Генные карты : EDF1

Расположение гена (человек)

Chr.	Хромосома 9 (человека) ^[1]

Группа	9q34.3	Начинать	136 862 119 п.н. ^[1]
Группа	9q34.3	Конец	136 866 308 п.н. ^[1]

Расположение гена (Мышь)

Chr.	Хромосома 2 (мышь) ^[2]

Группа	2 \| 2 A3	Начинать	25 557 847 п.н. ^[2]
Группа	2 \| 2 A3	Конец	25 562 082 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• метилтрансферазы активность • последовательность конкретное связывание ДНК • ДНК связывание • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 ДНК-связывающего фактор активности транскрипции • ГО: коактиватора активность 0001105 транскрипции • кальмодулиным связывания • гистонацетилтрансферазой активности • GO : 0001948 связывание с белками • связывание с РНК • связывание с факторами транскрипции класса TFIID
Сотовый компонент	• цитоплазма • комплекс фактора транскрипции TFIID • внутриклеточное • ядрышко • внеклеточная экзосома • ядро клетки • цитозоль
Биологический процесс	• клеточная дифференцировка • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция, ДНК-шаблон • развитие многоклеточных организмов • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регуляция липидного метаболического процесса • дифференцировка эндотелиальных клеток • позитивная регуляция связывания ДНК
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


8721


59022

Ансамбль


ENSG00000107223


ENSMUSG00000015092

UniProt


O60869


Q9JMG1

RefSeq (мРНК)


NM_153200 NM_001281297 NM_001281298 NM_001281299 NM_003792


NM_021519

RefSeq (белок)


NP_001268226 NP_001268227 NP_001268228 NP_003783 NP_694880


NP_067494

Расположение (UCSC)

Chr 9: 136,86 - 136,87 Мб

Chr 2: 25,56 - 25,56 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Дифференцировки эндотелия , связанные с фактором 1 представляет собой белок , который у человека кодируется EDF1 гена . ^[5]^[6]^[7]

Функция [ править ]

Этот ген кодирует белок, который может регулировать дифференцировку эндотелиальных клеток. Было высказано предположение, что белок функционирует как мостиковая молекула, которая связывает регуляторные белки и базальный транскрипционный аппарат, тем самым модулируя транскрипцию генов, участвующих в дифференцировке эндотелия. Было также обнаружено, что этот белок действует как коактиватор транскрипции, связывая элемент-связывающий белок общего фактора транскрипции ТАТА (TBP) и ген-специфические активаторы. Для этого гена были обнаружены два альтернативно сплайсированных транскрипта, которые кодируют разные белки. ^[7]

Взаимодействия [ править ]

EDF1 взаимодействует с:

Х-рецептор печени альфа , ^[8]
Гамма рецепторов, активируемых пролифератором пероксисом , ^[8] и
Связывающий ТАТА белок . ^[8]^[9]^[10]

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000107223 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000015092 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Дракони I, Мариотти M, Consalez Г.Г., Сория MR, Maier JA (декабрь 1998). «EDF-1, новый генный продукт, подавляющий дифференцировку эндотелиальных клеток человека» . J Biol Chem . 273 (47): 31119–24. DOI : 10.1074 / jbc.273.47.31119 . PMID 9813014 .
^ Баллабио E, Мариотти M, De БЕНЕДИКТИС L, Maier JA (апрель 2004). «Двойная роль фактора-1, связанного с дифференцировкой эндотелия, в цитозоле и ядре: модуляция протеинкиназой А». Cell Mol Life Sci . 61 (9): 1069–74. DOI : 10.1007 / s00018-004-4016-0 . PMID 15112053 . S2CID 861006 .
^ a b «Ген Энтреза: фактор 1, связанный с дифференцировкой эндотелия EDF1» .
^ a b c Брендель С., Гельман Л., Ауверкс Дж. (июнь 2002 г.). «Мультибелковый мостиковый фактор-1 (MBF-1) является кофактором ядерных рецепторов, регулирующих липидный обмен» . Мол. Эндокринол . 16 (6): 1367–77. DOI : 10.1210 / mend.16.6.0843 . PMID 12040021 .
^ Мариотти M, De БЕНЕДИКТИС L, Avon E, Maier JA (август 2000). «Взаимодействие между фактором-1, связанным с дифференцировкой эндотелия, и кальмодулином in vitro и in vivo» . J. Biol. Chem . 275 (31): 24047–51. DOI : 10.1074 / jbc.M001928200 . PMID 10816571 .
^ Kabe Y, Гото М, Shima D, Имаи Т, Т Вада, Морохаш Кий, Сиракав М, Такефус S, Ханда Н (ноябрь 1999 года). «Роль человеческого MBF1 как транскрипционного коактиватора» . J. Biol. Chem . 274 (48): 34196–202. DOI : 10.1074 / jbc.274.48.34196 . PMID 10567391 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Ли Ф.К., Уэда Х, Хиросе С. (1994). «Медиаторы активации транскрипции гена fushi tarazu с помощью BmFTZ-F1» . Мол. Клетка. Биол . 14 (5): 3013–21. DOI : 10.1128 / mcb.14.5.3013 . PMC 358669 . PMID 8164657 .
Одзаки Дж., Такемару К.И., Икегами Т., Мисима М., Уэда Х., Хиросе С., Кабе Й., Ханда Х., Сиракава М. (1999). «Идентификация основного домена и вторичной структуры транскрипционного коактиватора MBF1». Гены клеток . 4 (7): 415–24. DOI : 10.1046 / j.1365-2443.1999.00267.x . PMID 10469174 . S2CID 17825943 .
Мариотти М., Де Бенедиктис Л., Эйвон Э, Майер Дж. А. (2000). «Взаимодействие между фактором-1, связанным с дифференцировкой эндотелия, и кальмодулином in vitro и in vivo» . J. Biol. Chem . 275 (31): 24047–51. DOI : 10.1074 / jbc.M001928200 . PMID 10816571 .
Брендель С., Гельман Л., Ауверкс Дж. (2003). «Мультибелковый мостиковый фактор-1 (MBF-1) является кофактором ядерных рецепторов, регулирующих липидный обмен» . Мол. Эндокринол . 16 (6): 1367–77. DOI : 10.1210 / mend.16.6.0843 . PMID 12040021 .
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Милштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот П.П., Видаль М. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. DOI : 10,1038 / природа04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .
Bolognese F, Pitarque-Martì M, Lo Cicero V, Mantovani R, Maier JA (2006). «Характеристика минимального промотора EDF-1 человека: участие NFY и Sp1 в регуляции базовой транскрипции». Джин . 374 : 87–95. DOI : 10.1016 / j.gene.2006.01.030 . PMID 16567061 .

Эта статья о гене в хромосоме 9 человека - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000107223 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000015092 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9813014-5] Дракони I, Мариотти M, Consalez Г.Г., Сория MR, Maier JA (декабрь 1998). «EDF-1, новый генный продукт, подавляющий дифференцировку эндотелиальных клеток человека» . J Biol Chem . 273 (47): 31119–24. DOI : 10.1074 / jbc.273.47.31119 . PMID 9813014 .

[pmid15112053-6] Баллабио E, Мариотти M, De БЕНЕДИКТИС L, Maier JA (апрель 2004). «Двойная роль фактора-1, связанного с дифференцировкой эндотелия, в цитозоле и ядре: модуляция протеинкиназой А». Cell Mol Life Sci . 61 (9): 1069–74. DOI : 10.1007 / s00018-004-4016-0 . PMID 15112053 . S2CID 861006 .

[entrez-7] «Ген Энтреза: фактор 1, связанный с дифференцировкой эндотелия EDF1» .

[pmid12040021-8] Брендель С., Гельман Л., Ауверкс Дж. (июнь 2002 г.). «Мультибелковый мостиковый фактор-1 (MBF-1) является кофактором ядерных рецепторов, регулирующих липидный обмен» . Мол. Эндокринол . 16 (6): 1367–77. DOI : 10.1210 / mend.16.6.0843 . PMID 12040021 .

[pmid10816571-9] Мариотти M, De БЕНЕДИКТИС L, Avon E, Maier JA (август 2000). «Взаимодействие между фактором-1, связанным с дифференцировкой эндотелия, и кальмодулином in vitro и in vivo» . J. Biol. Chem . 275 (31): 24047–51. DOI : 10.1074 / jbc.M001928200 . PMID 10816571 .

[pmid10567391-10] Kabe Y, Гото М, Shima D, Имаи Т, Т Вада, Морохаш Кий, Сиракав М, Такефус S, Ханда Н (ноябрь 1999 года). «Роль человеческого MBF1 как транскрипционного коактиватора» . J. Biol. Chem . 274 (48): 34196–202. DOI : 10.1074 / jbc.274.48.34196 . PMID 10567391 .

[1]