Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
EIF4A2
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

3БОР

Идентификаторы
ПсевдонимыEIF4A2 , BM-010, DDX2B, EIF4A, EIF4F, eIF-4A-II, eIF4A-II, фактор инициации трансляции эукариот 4A2
Внешние идентификаторыOMIM: 601102 MGI: 106906 HomoloGene: 1487 Генные карты : EIF4A2
Расположение гена (человек)
Хромосома 3 (человек)
Chr.Хромосома 3 (человека) [1]
Хромосома 3 (человек)
Геномное расположение EIF4A2
Геномное расположение EIF4A2
Группа3q27.3Начинать186 783 205 п.н. [1]
Конец186 789 897 п.н. [1]
Расположение гена (Мышь)
Хромосома 16 (мышь)
Chr.Хромосома 16 (мышь) [2]
Хромосома 16 (мышь)
Геномное расположение EIF4A2
Геномное расположение EIF4A2
Группа16 B1 | 16 13,93 смНачинать23 107 444 п.н. [2]
Конец23 114 136 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE EIF4A2 200912 s at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• нуклеотид связывание
• активности фактора инициации трансляции
• GO: 0008026 хеликазной активности
• GO: 0001948 связывание белка
• связывание нуклеиновой кислоты
• гидролазы активности
• связывание АТФ
• активность АТФаза
• РНК - связывающей
Сотовый компонент• цитозоль
• перинуклеарная область цитоплазмы
• комплекс фактора инициации трансляции эукариот 4F
• ядрышко
Биологический процесс• мРНК поли ядерного транскрибируется (А) хвост укорочение
• РНК вторичная структура размотки
• ГО: 0022415 вирусный процесс
• негативная регуляция РНК-направленный 5'-3' РНК - полимераза активность
• белок биосинтеза
• регуляции инициации трансляции
• инициации трансляции
• сотовой ответ на фактор ингибирования лейкемии
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

1974 г.

13682

Ансамбль

ENSG00000156976

ENSMUSG00000022884

UniProt

Q14240

P10630

RefSeq (мРНК)

NM_001967

NM_001123037
NM_001123038
NM_013506
NM_001347179

RefSeq (белок)

NP_001958

NP_001116509
NP_001116510
NP_001334108
NP_038534

Расположение (UCSC)Chr 3: 186,78 - 186,79 МбChr 16: 23.11 - 23.11 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Фактор инициации эукариотического 4A-II представляет собой белок , который у человека кодируется EIF4A2 гена . [5] [6]


Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000156976 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022884 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Судо K, Takahashi E, Накамура Y (январь 1996). «Выделение и картирование гена EIF4A2 человека, гомологичного гену фактора инициации синтеза белка 4A-II Eif4a2 мыши». Cytogenet Cell Genet . 71 (4): 385–8. DOI : 10.1159 / 000134145 . PMID 8521730 . 
  6. ^ "Entrez Gene: EIF4A2 фактор инициации трансляции эукариот 4A, изоформа 2" .

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID  8125298 .
  • Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID  9373149 .
  • Ли В., Белшем Дж. Дж., Гордый К. Г. (2001). «Факторы инициации эукариот 4A (eIF4A) и 4G (eIF4G) взаимно взаимодействуют в соотношении 1: 1 in vivo» . J. Biol. Chem . 276 (31): 29111–5. DOI : 10.1074 / jbc.C100284200 . PMID  11408474 .
  • Кёно К., Мияширо М, Тагучи I (2002). «Человеческий эукариотический фактор инициации 4AII ассоциируется с белком NS5B вируса гепатита С in vitro». Biochem. Биофиз. Res. Commun . 292 (3): 659–66. DOI : 10.1006 / bbrc.2002.6702 . PMID  11922617 .
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932 .
  • Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта кДНК полной длины NIH: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Genome Res . 14 (10B): 2121–7. DOI : 10.1101 / gr.2596504 . PMC  528928 . PMID  15489334 .
  • Саркар М., Дас С., Бандйопадхая А. и др. (2005). «Повышение регуляции субъединицы 5 митохондриальной НАДН-дегидрогеназы человека в эпителиальных клетках кишечника регулируется патогенезом холерного вибриона». FEBS Lett . 579 (16): 3449–60. DOI : 10.1016 / j.febslet.2005.05.012 . PMID  15946665 . S2CID  25850943 .
  • Фэн П., Эверли Д. Н., Прочтите GS (2005). «Распад мРНК во время инфекций вируса простого герпеса (ВПГ): белок-белковые взаимодействия, вовлекающие белок выключения хозяина вириона ВПГ и факторы трансляции eIF4H и eIF4A» . J. Virol . 79 (15): 9651–64. DOI : 10,1128 / JVI.79.15.9651-9664.2005 . PMC  1181552 . PMID  16014927 .
  • Cheyssac C, Dina C, Leprêtre F и др. (2006). «EIF4A2 - это позиционный ген-кандидат в локусе 3q27, связанный с диабетом 2 типа во французских семьях» . Диабет . 55 (4): 1171–6. DOI : 10,2337 / diabetes.55.04.06.db05-1298 . PMID  16567544 .
  • Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии» . Мол. Syst. Биол . 3 (1): 89. DOI : 10.1038 / msb4100134 . PMC  1847948 . PMID  17353931 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q14240 (фактор инициации эукариот человека 4A-II (EIF4A2)) в PDBe-KB .