Фактор инициации трансляции 6 эукариот ( EIF6 ), также известный как связывающий белок интегрин бета 4 ( ITGB4BP ), является геном человека . [5]
Гемидесмосомы - это структуры, которые связывают базальную пластинку с цитоскелетом промежуточных филаментов . Важным функциональным компонентом гемидесмосом является субъединица бета-4 интегрина ( ITGB4 ), белок, содержащий два домена фибронектина III типа. Белок, кодируемый этим геном, связывается с доменами фибронектина III типа ITGB4 и может помочь связать ITGB4 с цитоскелетом промежуточных филаментов. Кодируемый белок, который является нерастворимым и обнаруживается как в ядре, так и в цитоплазме , может действовать как фактор инициации трансляции и катализирует ассоциацию рибосом 40S и 60S. субъединицы вместе с eIF5 связаны с GTP. Для этого гена было обнаружено множество вариантов транскриптов, кодирующих несколько различных изоформ . [5]
EIF6 играет важную роль в образовании 80S рибосом эукариот, росте клеток и экспрессии генов. Рибосома 80S, которая может разделяться на субъединицы 40S и 60S. EIF6 помогает защитить зрелую 60-ю субъединицу, и тогда EIF6 должен диссоциировать с 60-й субъединицей, чтобы он мог связываться с 40-й субъединицей с образованием рибосомы. Поддержание баланса EIF6 важно для организма: небольшое количество EIF6 помогает синтезу нормальной рибосомы, в то время как большое количество EIF6 ингибирует 60-е субъединицы, связывающиеся с 40-ю субъединицами. [6]
СОДЕРЖАНИЕ
1 Функция
2 Выражение
3 взаимодействия
4 См. Также
5 ссылки
6 Дальнейшее чтение
Функция [ править ]
EIF6 существует как в ядрышке, так и в цитоплазме. В ядрышке эукариот пре-рибосомный комплекс 90S разделяется на пре-рибосомный комплекс 60S и пре-рибосомный комплекс 40S, которые участвуют в синтезе зрелой рибосомы. EIF6 незаменим в биогенезе субъединицы 60S, а делеция EIF6 имеет летальный эффект. Частичная делеция eIF6 приводит к уменьшению количества свободной 60S субъединицы рибосомы, что означает, что она выводит из равновесия соотношение субъединиц 40S / 60S и ограничивает скорость синтеза белка. Прерибосомный комплекс 60S, связанный с шаттлом eIF6 из ядрышка в цитоплазму, а затем диссоциированный eIF6 с пре-60S, так что субъединица 60S может связываться с субъединицей 40S и продолжается до последующего продвижения. EIF6 может действовать как фактор инициации трансляции, ограничивающий скорость, и уровни его экспрессии влияют на скорость трансляции.Немногие из eIF6 в малых количествах ускоряют трансляцию белка, в то время как большая часть из eIF6 блокирует процесс трансляции, подавляя продукцию рибосом.[7] Активность eIF6 также вызывает гликолиз и синтез жирных кислот, контролируя трансляцию мРНК. [8]
Выражение [ править ]
EIF6 имеет разный уровень экспрессии в разных тканях и клетках. EIF6 имеет высокий уровень экспрессии в стволовых и циклических клетках, тогда как в постмитотических клетках его нет; высокий уровень в мозге и эпителии, низкий уровень в мышцах. [9]
Взаимодействия [ править ]
Было показано, что EIF6 взаимодействует с FHL2 , [10] ITGB4 [11] и GNB2L1 . [12]
EIF6 играет важную роль в образовании 80S рибосом, росте клеток и экспрессии генов. [13]
См. Также [ править ]
Фактор инициации эукариот
Большая рибосомная субъединица эукариот (60S)
Ссылки [ править ]
^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000242372 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027613 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ a b «Ген Entrez: белок, связывающий интегрин бета 4 ITGB4BP» .
^ Brina D, S - Гросу, Miluzio A, Biffo S (октябрь 2011). «Трансляционный контроль за счет образования 80S и доступности 60S: центральная роль eIF6, фактора ограничения скорости в прогрессии клеточного цикла и туморогенезе» . Клеточный цикл . 10 (20): 3441–6. DOI : 10.4161 / cc.10.20.17796 . PMID 22031223 .
^ Брина D, Miluzio А, Рикарди S, S Biffo (июль 2015). «Антиассоциативная активность eIF6 необходима для биогенеза рибосом, контроля трансляции и прогрессирования опухоли». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - механизмы регуляции генов . 1849 (7): 830–5. DOI : 10.1016 / j.bbagrm.2014.09.010 . PMID 25252159 .
^ Biffo S, N Manfrini, Рикарди S (февраль 2018). «Перекрестки между трансляцией и метаболизмом при раке». Текущее мнение в области генетики и развития . 48 : 75–81. DOI : 10.1016 / j.gde.2017.10.011 . PMID 29153483 .
^ Miluzio A, Beugnet A, Volta V, Biffo S (май 2009). «Фактор инициации эукариот 6 обеспечивает непрерывную связь между биогенезом и трансляцией рибосомы 60S» . EMBO Reports . 10 (5): 459–65. DOI : 10.1038 / embor.2009.70 . PMC 2680881 . PMID 19373251 .
^ Wixler V, Geerts D, Laplantine E, Westhoff D, Smyth N, Aumailley M, Sonnenberg A, Paulsson M (октябрь 2000 г.). «Только LIM-белок DRAL / FHL2 связывается с цитоплазматическим доменом нескольких цепей альфа и бета интегринов и рекрутируется в адгезионные комплексы» . Журнал биологической химии . 275 (43): 33669–78. DOI : 10.1074 / jbc.M002519200 . PMID 10906324 .
^ Biffo S, Sanvito F, Costa S, L Preve, Пигнателли R, L Spinardi, Маркизио PC (ноябрь 1997). «Выделение нового связывающего интегрин бета4 белка (p27 (BBP)), высоко экспрессируемого в эпителиальных клетках» . Журнал биологической химии . 272 (48): 30314–21. DOI : 10.1074 / jbc.272.48.30314 . PMID 9374518 .
^ Ceci M, Gaviraghi C, Gorrini C, Sala LA, Offenhauser N, Маркизио PC, Biffo S (декабрь 2003). «Высвобождение eIF6 (p27BBP) из субъединицы 60S позволяет сборку 80S рибосомы». Природа . 426 (6966): 579–84. DOI : 10,1038 / природа02160 . PMID 14654845 . S2CID 2431706 .
^ Brina D, S - Гросу, Miluzio A, Biffo S (октябрь 2011). «Трансляционный контроль за счет образования 80S и доступности 60S: центральная роль eIF6, фактора ограничения скорости в прогрессии клеточного цикла и туморогенезе» . Клеточный цикл . 10 (20): 3441–6. DOI : 10.4161 / cc.10.20.17796 . PMID 22031223 .
Дальнейшее чтение [ править ]
Biffo S, Sanvito F, Costa S, Preve L, Pignatelli R, Spinardi L, Marchisio PC (ноябрь 1997 г.). «Выделение нового связывающего интегрин бета4 белка (p27 (BBP)), высоко экспрессируемого в эпителиальных клетках» . Журнал биологической химии . 272 (48): 30314–21. DOI : 10.1074 / jbc.272.48.30314 . PMID 9374518 .
Си К., Чаудхури Дж., Чевешич Дж., Майтра У. (декабрь 1997 г.). «Молекулярное клонирование и функциональная экспрессия человеческой кДНК, кодирующей фактор инициации трансляции 6» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (26): 14285–90. DOI : 10.1073 / pnas.94.26.14285 . PMC 24943 . PMID 9405604 .
Мао М, Фу Джи, Ву Дж.С., Чжан К.Х., Чжоу Дж., Кан LX, Хуан К.Х., Хе К.Л., Гу Б.В., Хан З.Г., Шен Й, Гу Дж, Юй Ю, Сюй Ш, Ван YX, Чэнь С. (Июль 1998 г.). «Идентификация генов, экспрессируемых в человеческих CD34 (+) гематопоэтических стволовых / клетках-предшественниках, с помощью тегов экспрессируемой последовательности и эффективного клонирования кДНК полной длины» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (14): 8175–80. DOI : 10.1073 / pnas.95.14.8175 . PMC 20949 . PMID 9653160 .
Санвито Ф., Арриго Дж., Зуффарди О, Аньелли М., Маркизио П.С., Бифо С. (август 1998 г.). «Локализация гена связывающего белка р27 бета4 (ITGB4BP) в области хромосомы человека 20q11.2». Геномика . 52 (1): 111–2. DOI : 10.1006 / geno.1998.5403 . PMID 9740680 .
Sanvito F, Piatti S, Villa A, Bossi M, Lucchini G, Marchisio PC, Biffo S (март 1999 г.). «Интегрин бета4-интегрина р27 (BBP / eIF6) является важным белком ядерного матрикса, участвующим в сборке 60S рибосомной субъединицы» . Журнал клеточной биологии . 144 (5): 823–37. DOI : 10.1083 / jcb.144.5.823 . PMC 2148184 . PMID 10085284 .
Wixler V, Geerts D, Laplantine E, Westhoff D, Smyth N, Aumailley M, Sonnenberg A, Paulsson M (октябрь 2000 г.). «Только LIM-белок DRAL / FHL2 связывается с цитоплазматическим доменом нескольких цепей альфа и бета интегринов и рекрутируется в адгезионные комплексы» . Журнал биологической химии . 275 (43): 33669–78. DOI : 10.1074 / jbc.M002519200 . PMID 10906324 .
Чжан QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Ху GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (октябрь 2000 г.). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее неопределенных генов, экспрессируемых в CD34 + гематопоэтических стволовых / предшественниках» . Геномные исследования . 10 (10): 1546–60. DOI : 10.1101 / gr.140200 . PMC 310934 . PMID 11042152 .
Donadini A, Giodini A, Sanvito F, Marchisio PC, Biffo S (март 2001 г.). «Ген ITGB4BP человека конститутивно экспрессируется in vitro, но сильно модулируется in vivo». Джин . 266 (1–2): 35–43. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (01) 00370-5 . PMID 11290417 .
Андерсен Дж. С., Лион CE, Фокс А. Х., Люнг А. К., Лам Ю. В., Стин Х, Манн М., Ламонд А. И. (январь 2002 г.). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека». Текущая биология . 12 (1): 1–11. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9 . PMID 11790298 . S2CID 14132033 .
Басу У, Си К., Дэн Х, Майтра У (сентябрь 2003 г.). «Фосфорилирование фактора инициации трансляции эукариот 6 млекопитающих и его гомолога Saccharomyces cerevisiae Tif6p: доказательства того, что фосфорилирование Tif6p регулирует его нуклеоцитоплазматическое распределение и необходимо для роста дрожжевых клеток» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (17): 6187–99. DOI : 10.1128 / MCB.23.17.6187-6199.2003 . PMC 180954 . PMID 12917340 .
Ceci M, Gaviraghi C, Gorrini C, Sala LA, Offenhäuser N, Marchisio PC, Biffo S (декабрь 2003 г.). «Высвобождение eIF6 (p27BBP) из субъединицы 60S позволяет сборку 80S рибосомы». Природа . 426 (6966): 579–84. DOI : 10,1038 / природа02160 . PMID 14654845 . S2CID 2431706 .
Россо П., Кортесина Дж., Санвито Ф., Донадини А., Ди Бенедетто Б., Бифо С., Маркизио ПК (май 2004 г.). «Сверхэкспрессия p27BBP в карциномах головы и шеи и их метастазах в лимфатических узлах». Голова и шея . 26 (5): 408–17. CiteSeerX 10.1.1.503.9652 . DOI : 10.1002 / hed.10401 . PMID 15122657 . S2CID 39531947 .
Ленер Б., Сандерсон К.М. (июль 2004 г.). «Структура взаимодействия белков для деградации мРНК человека» . Геномные исследования . 14 (7): 1315–23. DOI : 10.1101 / gr.2122004 . PMC 442147 . PMID 15231747 .
Раш Дж., Мориц А., Ли К.А., Го А., Госс В.Л., Спек Э.Дж., Чжан Х., Чжа Х.М., Полакевич Р.Д., Гребень М.Дж. (январь 2005 г.). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Природа Биотехнологии . 23 (1): 94–101. DOI : 10.1038 / nbt1046 . PMID 15592455 . S2CID 7200157 .
