EPH рецептор B2

EPHB2

Доступные конструкции

Ортолог поиск: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
1B4F , 1F0M , 2QBX , 3ZFM

Идентификаторы

Псевдонимы

EPHB2 , Ephb2, Cek5, Drt, ETECK, Erk, Hek5, Nuk, Prkm5, Qek5, Sek3, Tyro5, CAPB, EK5, EPHT3, PCBC, рецептор EPH B2, DRT, ERK, BDPLT22

Внешние идентификаторы

OMIM : 600997 MGI : 99611 HomoloGene : 37925 GeneCards : EphB2

Расположение гена ( человек )

Chr.	Хромосома 1 (человека) ^[1]

Группа	1п36.12	Начинать	22 710 839 п.н. ^[1]
Группа	1п36.12	Конец	22 921 500 п.н. ^[1]

Расположение гена ( Мышь )

Chr.	Хромосома 4 (мышь) ^[2]

Группа	4 D3 \| 4 69,0 см	Начинать	136 647 539 п.н. ^[2]
Группа	4 D3 \| 4 69,0 см	Конец	136 835 988 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• трансферазной активности • связывание нуклеотид • протеинкиназа активность • Активность трансмембранный рецептор-эфрин • активность киназы • ГО: связывание 0001948 белок • связывание идентичен белок • трансмембранный белок рецептора тирозинкиназы • протеин - тирозин - киназы • связывание рецептора • связывание АТФ • наведение аксонов активность рецептора • эфрин активности рецептора • связывание амилоид-бета • сигнализации активности рецептора • ГО: 0032403 макромолекулярных комплекс связывания
Сотовый компонент	• составной компонент мембраны • цитозоль • проекция клетки • мембрана • интегральный компонент плазматической мембраны • внеклеточная область • аксон • тело нервной клетки • дендрит • ядро клетки • клеточная мембрана • проекция нейрона • рецепторный комплекс • постсинапс • глутаматергический синапс • неотъемлемый компонент постсинаптическая мембрана • неотъемлемый компонент пресинаптической мембраны
Биологический процесс	• позитивная регуляция сборки синапсов • развитие неба • фосфорилирование • сигнальный путь трансмембранного рецептора протеин тирозинкиназы • морфогенез зрительного нерва • сигнальный путь рецептора эфрина • обучение • управление аксоном комиссурального нейрона • развитие нервной системы • развитие многоклеточного организма • регуляция аксоногенеза • дендритный позвоночник развитие • морфогенез дендритных шипов • негативная регуляция аксоногенеза • фосфорилирование белков • положительная регуляция долговременной синаптической пластичности нейронов • регуляция уровней жидкости в организме • морфогенез внутреннего уха • ангиогенез • клеточный морфогенез • морфогенез органов животных • регуляция синаптической пластичности нейронов • развитие мочеполовой системы • фосфорилирование пептидил-тирозина • развитие мозолистого тела • центральная нервная система системная проекция аксоногенез нейронов • фасцикуляция аксонов • морфогенез глаза камерного типа • управление аксонами ганглиозных клеток сетчатки • управление аксонами • транс-синаптическая передача сигналов посредством транс-синаптического комплекса, модулирующая синаптическую передачу • негативная регуляция фосфорилирования белков • обучение или память • позитивная регуляция экспрессии генов • позитивная регуляция синаптической пластичности • негативная регуляция передачи сигнала Ras-белка • инактивация активности MAPKK • регуляция сборки синапса • негативная регуляция каскада ERK1 и ERK2 • сборка постсинаптической мембраны • ретракция проекции нейрона • позитивная регуляция долговременной синаптической потенциации • положительное регулирование локализации белка на плазматической мембране • отрицательное регулирование активности рецептора глутамата NMDA • положительное регулирование активности рецептора глутамата NMDA
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


2048


13844

Ансамбль


ENSG00000133216


ENSMUSG00000028664

UniProt


P29323


P54763

RefSeq (мРНК)


NM_001309192 NM_001309193 NM_004442 NM_017449


NM_001290753 NM_010142

RefSeq (белок)


NP_001296121 NP_001296122 NP_004433 NP_059145


NP_001277682 NP_034272

Расположение (UCSC)

Chr 1: 22.71 - 22.92 Мб

Chr 4: 136,65 - 136,84 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Эфрин типа-B , рецептор 2 представляет собой белок , который у человека кодируется EphB2 гена . ^[5]

Функция [ править ]

Рецепторы эфрина и их лиганды , эфрины, опосредуют многочисленные процессы развития, особенно в нервной системе . Основываясь на их структуре и взаимосвязи последовательностей, эфрины делятся на класс эфрина-A (EFNA), который прикреплен к мембране с помощью гликозилфосфатидилинозитольной связи, и класс эфрина-B (EFNB), которые являются трансмембранными белками . Семейство рецепторов Eph делится на 2 группы на основании сходства последовательностей их внеклеточных доменов и их сродства к связыванию лигандов эфрина-A и эфрина-B. Рецепторы эфрина составляют самую большую подгруппу семейства рецепторных тирозинкиназ (RTK). Белок, кодируемый этим геном, является рецептором для членов семейства эфрина-B.^[6]

Исследования на животных [ править ]

EphB2 является частью NMDA сигнализации пути и восстановления Экспрессия спасает познавательную функцию в животной модели от болезни Альцгеймера . ^[7]

Рецессивный ген EphB2 отвечает за мутации хохлатая-перо в голубях . ^[8]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что рецептор B2 EPH взаимодействует с:

Ген Abl ^[9]
Активатор белка р21 RAS 1 ^[10]
Src ^[11]^[12]

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000133216 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028664 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
Перейти ↑ Chan J, Watt VM (август 1991). «eek и erk, новые члены подкласса eph рецепторных протеин-тирозинкиназ». Онкоген . 6 (6): 1057–61. PMID 1648701 .
^ «Энтрез Ген: EPHB2 EPH рецептор B2» .
^ Сиссе М, Halabisky В, Харрис Дж, Devidze Н, Dubal БД, вс В, ОРР А, Лотц G, Ким DH, Hamto Р, К Хо, Ю. GQ, Mucke л (январь 2011). «Обращение вспять истощения EphB2 спасает когнитивные функции в модели Альцгеймера» . Природа . 469 (7328): 47–52. Bibcode : 2011Natur.469 ... 47С . DOI : 10,1038 / природа09635 . PMC 3030448 . PMID 21113149 . Краткое содержание - NHS Choices .
^ Shapiro MD, Kronenberg Z, Li C, Domyan ET, Pan H, Campbell M, Tan H, Huff CD, Hu H, Vickrey AI, Nielsen SC, Stringham SA, Hu H, Willerslev E, Gilbert MT, Yandell M, Zhang Джи, Ван Дж (январь 2013 г.). «Геномное разнообразие и эволюция гребня у сизого голубя» . Наука . 339 (6123): 1063–7. Bibcode : 2013Sci ... 339.1063S . DOI : 10.1126 / science.1230422 . PMC 3778192 . PMID 23371554 . Краткое содержание - New York Times .
^ Ю. HH, Zisch AH, Dodelet VC, Pasquale EB (июль 2001). «Множественные сигнальные взаимодействия киназ Abl и Arg с рецептором EphB2» . Онкоген . 20 (30): 3995–4006. DOI : 10.1038 / sj.onc.1204524 . PMID 11494128 .
↑ Holland SJ, Gale NW, Gish GD, Roth RA, Songyang Z, Cantley LC, Henkemeyer M, Yancopoulos GD, Pawson T (июль 1997 г.). «Джакстамембранные остатки тирозина соединяют рецептор EphB2 / Nuk семейства Eph со специфическими белками домена SH2 в нейрональных клетках» . EMBO J . 16 (13): 3877–88. DOI : 10.1093 / emboj / 16.13.3877 . PMC 1170012 . PMID 9233798 .
^ Zisch AH, Кало MS, Chong LD, Pasquale EB (май 1998). «Для образования комплекса между EphB2 и Src необходимо фосфорилирование тирозина 611 в прилегающей к мембране области EphB2» . Онкоген . 16 (20): 2657–70. DOI : 10.1038 / sj.onc.1201823 . PMID 9632142 .
^ Zisch AH, Pazzagli C, Freeman AL, Schneller M, Hadman M, Smith JW, Ruoslahti E, Pasquale EB (январь 2000). «Замена двух консервативных тирозинов рецептора EphB2 на глутаминовую кислоту предотвращает связывание доменов SH2 без отмены киназной активности и биологических ответов» . Онкоген . 19 (2): 177–87. DOI : 10.1038 / sj.onc.1203304 . PMID 10644995 .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии .

Эта статья о мембранном белке незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000133216 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028664 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1648701-5] Перейти ↑ Chan J, Watt VM (август 1991). «eek и erk, новые члены подкласса eph рецепторных протеин-тирозинкиназ». Онкоген . 6 (6): 1057–61. PMID 1648701 .

[6] «Энтрез Ген: EPHB2 EPH рецептор B2» .

[pmid21113149-7] Сиссе М, Halabisky В, Харрис Дж, Devidze Н, Dubal БД, вс В, ОРР А, Лотц G, Ким DH, Hamto Р, К Хо, Ю. GQ, Mucke л (январь 2011). «Обращение вспять истощения EphB2 спасает когнитивные функции в модели Альцгеймера» . Природа . 469 (7328): 47–52. Bibcode : 2011Natur.469 ... 47С . DOI : 10,1038 / природа09635 . PMC 3030448 . PMID 21113149 . Краткое содержание - NHS Choices .

[pmid23371554-8] Shapiro MD, Kronenberg Z, Li C, Domyan ET, Pan H, Campbell M, Tan H, Huff CD, Hu H, Vickrey AI, Nielsen SC, Stringham SA, Hu H, Willerslev E, Gilbert MT, Yandell M, Zhang Джи, Ван Дж (январь 2013 г.). «Геномное разнообразие и эволюция гребня у сизого голубя» . Наука . 339 (6123): 1063–7. Bibcode : 2013Sci ... 339.1063S . DOI : 10.1126 / science.1230422 . PMC 3778192 . PMID 23371554 . Краткое содержание - New York Times .

[pmid11494128-9] Ю. HH, Zisch AH, Dodelet VC, Pasquale EB (июль 2001). «Множественные сигнальные взаимодействия киназ Abl и Arg с рецептором EphB2» . Онкоген . 20 (30): 3995–4006. DOI : 10.1038 / sj.onc.1204524 . PMID 11494128 .

[pmid9233798-10] Holland SJ, Gale NW, Gish GD, Roth RA, Songyang Z, Cantley LC, Henkemeyer M, Yancopoulos GD, Pawson T (июль 1997 г.). «Джакстамембранные остатки тирозина соединяют рецептор EphB2 / Nuk семейства Eph со специфическими белками домена SH2 в нейрональных клетках» . EMBO J . 16 (13): 3877–88. DOI : 10.1093 / emboj / 16.13.3877 . PMC 1170012 . PMID 9233798 .

[pmid9632142-11] Zisch AH, Кало MS, Chong LD, Pasquale EB (май 1998). «Для образования комплекса между EphB2 и Src необходимо фосфорилирование тирозина 611 в прилегающей к мембране области EphB2» . Онкоген . 16 (20): 2657–70. DOI : 10.1038 / sj.onc.1201823 . PMID 9632142 .

[pmid10644995-12] Zisch AH, Pazzagli C, Freeman AL, Schneller M, Hadman M, Smith JW, Ruoslahti E, Pasquale EB (январь 2000). «Замена двух консервативных тирозинов рецептора EphB2 на глутаминовую кислоту предотвращает связывание доменов SH2 без отмены киназной активности и биологических ответов» . Онкоген . 19 (2): 177–87. DOI : 10.1038 / sj.onc.1203304 . PMID 10644995 .

[1]

vтеФерменты
Мероприятия	Активный сайт Связывающий сайт Каталитическая триада Оксианионная дыра Ферментная неразборчивость Каталитически совершенный фермент Коэнзим Кофактор Ферментный катализ
Регулирование	Аллостерическая регуляция Сотрудничество Ингибитор ферментов Активатор ферментов
Классификация	Номер ЕС Ферментное суперсемейство Семейство ферментов Список ферментов
Кинетика	Кинетика ферментов Диаграмма Иди – Хофсти Заговор Ханеса – Вульфа Заговор Лайнуивера – Берка Кинетика Михаэлиса – Ментен
Типы	EC1 Оксидоредуктазы ( список ) EC2 Трансферазы ( список ) EC3 Гидролазы ( список ) EC4 Lyases ( список ) EC5 Изомеразы ( список ) Лигазы EC6 ( список ) EC7 Translocases ( список )