Из Википедии, свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
EFNB2
Белок EFNB2 PDB 1iko.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

2HLE , 2I85 , 2VSK , 2VSM , 2WO2 , 3GXU , 4UF7

Идентификаторы
ПсевдонимыEFNB2 , EPLG5, HTKL, Htk-L, LERK5, эфрин B2
Внешние идентификаторыOMIM : 600527 MGI : 105097 HomoloGene : 3019 GeneCards : EFNB2
Расположение гена ( человек )
Хромосома 13 (человек)
Chr.Хромосома 13 (человека) [1]
Хромосома 13 (человек)
Геномное расположение EFNB2
Геномное расположение EFNB2
Группа13q33.3Начинать106 489 745 п.н. [1]
Конец106 535 662 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 8 (мышь)
Chr.Хромосома 8 (мышь) [2]
Хромосома 8 (мышь)
Геномное расположение EFNB2
Геномное расположение EFNB2
Группа8 A1.1 | 8 3,42 смНачинать8 617 434 п.н. [2]
Конец8 661 242 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК


Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• активность рецептора вируса
• GO: связывание белка 0001948
• рецептора связывания
• эфрин связывания рецептора
• протеин - тирозин - киназа
Сотовый компонент• неотъемлемый компонент мембраны
• мембрана
• очаговая адгезия
• клеточная мембрана
• неотъемлемый компонент плазматической мембраны
• коллатераль Шаффера - синапс CA1
• глутаматергический синапс
• неотъемлемый компонент пресинаптической мембраны
• неотъемлемый компонент мембраны постсинаптической плотности
Биологический процесс• дифференцировка клеток
• морфогенез кровеносных сосудов
• негативная регуляция пролиферации кератиноцитов
• регуляция хемотаксиса
• передача сигналов между клетками
• морфогенез анатомической структуры
• костимуляция Т-клеток
• развитие лимфатических сосудов
• развитие нервной системы
• миграция клеток, участвующих в прорастании ангиогенеза
• развитие многоклеточных организмов
• клеточная адгезия
• морфогенез нефрального протока
• ангиогенез
• морфогенез органов животных
• проникновение вируса
• положительное регулирование дифференциации сердечной мышцы клетки
• GO: 0022415 вирусного процесс
• венозного морфогенез кровеносных сосудов
• положительное регулирование аорты морфогенеза
• положительное регулирование пролиферации клеток
• эфрин рецептор сигнальный путь
• аксоны
• отрицательное регулирование развития проекции нейронов
• пептидил-фосфорилирование тирозина
• сборка пресинапса
• регуляция уровней постсинаптических мембранных рецепторов нейротрансмиттеров
• регуляция интернализации постсинаптических рецепторов нейротрансмиттеров
• позитивная регуляция гибели нейронов
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

1948 г.

13642

Ансамбль

ENSG00000125266

ENSMUSG00000001300

UniProt

P52799

P52800

RefSeq (мРНК)

NM_004093
NM_001372056
NM_001372057
NM_001372058

NM_010111
NM_001368299

RefSeq (белок)

NP_004084
NP_001358985
NP_001358986
NP_001358987

NP_034241
NP_001355228

Расположение (UCSC)Chr 13: 106,49 - 106,54 МбChr 8: 8.62 - 8.66 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Эфрин-В2 представляет собой белок , который у человека кодируется EFNB2 гена . [5]

Функция [ править ]

Этот ген кодирует члена семейства эфринов (EPH). Эфрины и рецепторы, связанные с EPH, составляют самое большое подсемейство рецепторных протеин-тирозинкиназ и участвуют в опосредовании событий развития, особенно в нервной системе и в эритропоэзе . Основываясь на их структуре и соотношении последовательностей, эфрины делятся на класс эфрина-A (EFNA), который прикреплен к мембране с помощью гликозилфосфатидилинозитоловой связи, и класс эфрина-B (EFNB), которые являются трансмембранными белками. Этот ген кодирует эфрин класса EFNB, который связывается с рецепторами EPHB4 и EPHA3 . [6]

Рак [ править ]

EFNB2 гена наблюдается постепенно подавляется в папилломы человека -позитивных неопластических кератиноцитов , полученных из шейки матки предраковых поражений на разных уровнях злокачественности. [7] По этой причине, EFNB2, вероятно, связан с онкогенезом и может быть потенциальным прогностическим маркером прогрессирования предопухолевых поражений шейки матки . [7]

Взаимодействия [ править ]

EFNB2, как было показано, взаимодействует с EPHA3 [8] [9] и EPHB1 при развитии перекреста зрительных нервов . [10]

Также было показано, что EFNB2 служит рецептором для вируса Хендра и вируса Нипах , опосредуя проникновение в клетку во время инфекции. [11]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000125266 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000001300 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Bonaldo МФ, Ю. М. Т., Jelenc Р, Коричневый S, Su L, L Лоутон, Deaven л, Efstratiadis А, D Уорбертон, Суариш МБ (сентябрь 1994). «Отбор кДНК с использованием геномных клонов, специфичных для хромосом: приложение к хромосоме 13 человека». Молекулярная генетика человека . 3 (9): 1663–73. DOI : 10.1093 / HMG / 3.9.1663 . PMID 7833926 . 
  6. ^ "Энтрез Ген: EFNB2 эфрин-B2" .
  7. ^ a b Rotondo JC, Bosi S, Bassi C, Ferracin M, Lanza G, Gafà R, Magri E, Selvatici R, Torresani S, Marci R, Garutti P, Negrini M, Tognon M, Martini F (апрель 2015 г.). «Изменения экспрессии генов при прогрессировании неоплазии шейки матки, выявленные с помощью микроматричного анализа неопластических кератиноцитов шейки матки». J. Cell Physiol . 230 (4): 802–812. DOI : 10.1002 / jcp.24808 . PMID 25205602 . 
  8. ^ Cerretti ДП, Вэнден Bos Т, Нельсон Н, Kozlosky CJ, Редди Р, Maraskovsky Е, Парк Л.С., Лайман С.Д., Copeland Н.Г., ди - джей Гилберта (ноябрь 1995). «Выделение LERK-5: лиганда eph-родственных рецепторных тирозинкиназ» . Молекулярная иммунология . 32 (16): 1197–205. DOI : 10.1016 / 0161-5890 (95) 00108-5 . PMID 8559144 . 
  9. ^ Lackmann M, Mann RJ, Кравец L, Смит FM, Bucci Т.А., Максвелл К.Ф., Хоулетт GJ, Олссон JE, Вэнден Bos T, Cerretti DP, Boyd AW (июнь 1997). «Лиганд для киназы, родственной EPH (LERK) 7, является предпочтительным лигандом с высоким сродством для рецептора HEK» . Журнал биологической химии . 272 (26): 16521–30. DOI : 10.1074 / jbc.272.26.16521 . PMID 9195962 . 
  10. ↑ Williams SE, Mann F, Erskine L, Sakurai T, Wei S, Rossi DJ, Gale NW, Holt CE, Mason CA, Henkemeyer M (сентябрь 2003 г.). «Эфрин-B2 и EphB1 опосредуют расхождение аксонов сетчатки при перекресте зрительных нервов». Нейрон . 39 (6): 919–35. DOI : 10.1016 / j.neuron.2003.08.017 . PMID 12971893 . 
  11. ^ Бонапарт М.И., Димитров А.С., Боссарт К.Н., Крамери Г., Мунгалл Б.А., Епископ К.А., Чоудри В., Димитров Д.С., Ван Л.Ф., Итон Б.Т., Бродер С.К. (июль 2005 г.). «Лиганд эфрина-B2 является функциональным рецептором вируса Хендра и вируса Нипах» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 102 (30): 10652–7. DOI : 10.1073 / pnas.0504887102 . PMC 1169237 . PMID 15998730 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Фланаган Дж. Г., Вандерхэген П. (1998). «Эфрины и рецепторы Eph в нервном развитии». Ежегодный обзор нейробиологии . 21 : 309–45. DOI : 10.1146 / annurev.neuro.21.1.309 . PMID  9530499 .
  • Чжоу Р. (март 1998 г.). «Рецепторы и лиганды семейства Eph». Фармакология и терапия . 77 (3): 151–81. DOI : 10.1016 / S0163-7258 (97) 00112-5 . PMID  9576626 .
  • Holder N, Klein R (май 1999 г.). «Рецепторы Eph и эфрины: эффекторы морфогенеза». Развитие . 126 (10): 2033–44. PMID  10207129 .
  • Уилкинсон Д.Г. (2000). «Рецепторы Eph и эфрины: регуляторы наведения и сборки». Международный обзор цитологии . 196 : 177–244. DOI : 10.1016 / S0074-7696 (00) 96005-4 . ISBN 9780123646002. PMID  10730216 .
  • Xu Q, Mellitzer G, Wilkinson DG (июль 2000 г.). «Роль рецепторов Eph и эфринов в сегментарном формировании паттерна» . Философские труды Лондонского королевского общества. Серия B, Биологические науки . 355 (1399): 993–1002. DOI : 10.1098 / rstb.2000.0635 . PMC  1692797 . PMID  11128993 .
  • Wilkinson DG (март 2001 г.). «Множественные роли рецепторов EPH и эфринов в развитии нервной системы». Обзоры природы. Неврология . 2 (3): 155–64. DOI : 10.1038 / 35058515 . PMID  11256076 .
  • Беннетт Б.Д., Зейглер ФК, Гу К., Фендли Б., Годдард А.Д., Джиллет Н., Мэтьюз В. (март 1995 г.). «Молекулярное клонирование лиганда EPH-родственного рецептора протеин-тирозинкиназы Htk» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 92 (6): 1866–70. DOI : 10.1073 / pnas.92.6.1866 . PMC  42383 . PMID  7534404 .
  • Черретти Д.П., Ванден Бос Т., Нельсон Н., Козлоски С.Дж., Редди П., Марасковский Е., Парк Л.С., Лайман С.Д., Коупленд Н.Г., Гилберт Д.Д. (ноябрь 1995 г.). «Выделение LERK-5: лиганда eph-родственных рецепторных тирозинкиназ» . Молекулярная иммунология . 32 (16): 1197–205. DOI : 10.1016 / 0161-5890 (95) 00108-5 . PMID  8559144 .
  • Черретти Д.П., Лайман С.Д., Козлоски С.Дж., Коупленд Н.Г., Гилберт Д.Д., Дженкинс Н.А., Валентин В., Кирстейн М.Н., Шапиро Д.Н., Моррис С.В. (апрель 1996 г.). «Гены, кодирующие связанные с рецептором eph лиганды тирозинкиназы LERK-1 (EPLG1, Epl1), LERK-3 (EPLG3, Epl3) и LERK-4 (EPLG4, Epl4), сгруппированы на хромосоме 1 человека и хромосоме 3 мыши» . Геномика . 33 (2): 277–82. DOI : 10.1006 / geno.1996.0192 . PMID  8660976 .
  • Gale NW, Holland SJ, Valenzuela DM, Flenniken A, Pan L, Ryan TE, Henkemeyer M, Strebhardt K, Hirai H, Wilkinson DG, Pawson T., Davis S, Yancopoulos GD (июль 1996 г.). «Рецепторы и лиганды Eph включают два основных подкласса специфичности и взаимно компартментализируются во время эмбриогенеза». Нейрон . 17 (1): 9–19. DOI : 10.1016 / S0896-6273 (00) 80276-7 . PMID  8755474 .
  • Холланд С.Дж., Гейл Н.В., Мбамалу Г., Янкопулос Г.Д., Хенкемейер М., Поусон Т. (октябрь 1996 г.). «Двунаправленная передача сигналов через рецептор Nuk семейства EPH и его трансмембранные лиганды». Природа . 383 (6602): 722–5. DOI : 10.1038 / 383722a0 . hdl : 1807/9444 . PMID  8878483 .
  • Ephnomenclaturecommittee (август 1997 г.). «Единая номенклатура рецепторов семейства Eph и их лигандов, эфринов. Номенклатурный комитет Eph». Cell . 90 (3): 403–4. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80500-0 . PMID  9267020 .
  • Фогт Т., Штольц В., Валлийский Дж., Юнг Б., Кербель Р.С., Кобаяши Х., Ландталер М., Макклелланд М. (март 1998 г.). «Сверхэкспрессия матричной РНК Lerk-5 / Eplg5: новый маркер повышенной онкогенности и метастатического потенциала в злокачественных меланомах человека». Клинические исследования рака . 4 (3): 791–7. PMID  9533549 .
  • Ван ХЮ, Чен З.Ф., Андерсон Диджей (май 1998 г.). «Молекулярное различие и ангиогенное взаимодействие между эмбриональными артериями и венами, выявленное эфрином-B2 и его рецептором Eph-B4». Cell . 93 (5): 741–53. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 81436-1 . PMID  9630219 .
  • Николова З., Джонов В., Цуэрчер Г., Андрес А.С., Зиемецки А. (сентябрь 1998 г.). «Клеточно-специфическая и эстроген-зависимая экспрессия рецепторной тирозинкиназы EphB4 и ее лиганда эфрина-B2 во время морфогенеза молочной железы». Журнал клеточной науки . 111 (18): 2741–51. PMID  9718367 .
  • Торрес Р., Файрестайн Б.Л., Донг Х., Штаудингер Дж., Олсон Э.Н., Хуганир Р.Л., Бредт Д.С., Гейл Н.В., Янкопулос Г.Д. (декабрь 1998 г.). «Белки PDZ связываются, группируются и синаптически колокализуются с рецепторами Eph и их лигандами эфрина». Нейрон . 21 (6): 1453–63. DOI : 10.1016 / S0896-6273 (00) 80663-7 . PMID  9883737 .
  • Лин Д., Гиш Г. Д., Сонъян З., Поусон Т. (февраль 1999 г.). «Карбоксильный конец эфринов класса B составляет мотив связывания домена PDZ» . Журнал биологической химии . 274 (6): 3726–33. DOI : 10.1074 / jbc.274.6.3726 . PMID  9920925 .


  • v
  • т
  • е