Фактор инициации трансляции эукариот 4 гамма 1

EIF4G1

Доступные конструкции

Ортолог поиск: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
1LJ2 , 1UG3 , 2W97 , 4AZA , 4F02

Идентификаторы

Псевдонимы

EIF4G1 , EIF-4G1, EIF4F, EIF4G, EIF4GI, P220, PARK18, фактор инициации эукариотической трансляции 4 гамма, фактор инициации эукариотической трансляции 4 гамма 1

Внешние идентификаторы

OMIM: 600495 MGI: 2384784 ГомолоГен: 110725 Генные карты : EIF4G1

Расположение гена (человек)

Chr.	Хромосома 3 (человека) ^[1]

Группа	3q27.1	Начинать	184 314 495 п.н. ^[1]
Группа	3q27.1	Конец	184 335 358 п.н. ^[1]

Расположение гена (Мышь)

Chr.	Хромосома 16 (мышь) ^[2]

Группа	16 \| 16 B1	Начинать	20 668 313 п.н. ^[2]
Группа	16 \| 16 B1	Конец	20 692 884 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• инициации трансляции активности фактора • ГО: связывание 0001948 белок • связывания РНК • связывание мРНК • АТФ связывания • фактор перевода активности, связывания РНК • эукариотический фактор инициации 4Е связывания • фактор инициации трансляции связывания • GO: 0032947 молекулярная активность адаптера • кадгерин связывания • идентичные связывание с белками
Сотовый компонент	• цитозоль • мембрана • ядро клетки • цитоплазма • полисома • комплекс фактора инициации трансляции эукариот 4F • цитозольная малая субъединица рибосомы • постсинапс
Биологический процесс	• укорочение хвоста поли (A) мРНК с ядерной транскрипцией • регуляция стабильности мРНК • поведенческий ответ страха • позитивная регуляция дифференцировки нейронов • транскрибируемый ядерной мРНК катаболический процесс, нонсенс-опосредованный распад • вирусный процесс GO: 0022415 • регуляция трансляции • регуляция инициации трансляции • cap-зависимая инициация трансляции • биосинтез белка • инициация трансляции • организация митохондрий • положительная регуляция пролиферации клеток • отрицательная регуляция аутофагии • негативная регуляция фосфорилирования пептидил-треонина • позитивная регуляция роста клеток • позитивная регуляция процесса метаболизма клеточных белков • процесс развития • позитивная регуляция фосфорилирования пептидил-серина • процесс биосинтеза клеточных макромолекул • регуляция сайленсинга генов с помощью miRNA • регуляция клеточного ответа к стрессу • позитивная регуляция перехода G1 / S митотического клеточного цикла • негативная регуляция гибели нейронов • позитивная регуляция сборки комплекса эукариотического фактора инициации трансляции 4F • регуляция сборки пресинапса • позитивная регуляция связывания кэпа мРНК • позитивная регуляция опосредованного miRNA ингибирования трансляции • регуляция связывания полисом • позитивная регуляция гибели клеток • клеточный ответ на уровни питательных веществ • энергетический гомеостаз • развитие легких • ответ на этанол
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


1981 г.


208643

Ансамбль


ENSG00000114867


ENSMUSG00000045983

UniProt


Q04637


Q6NZJ6

RefSeq (мРНК)

NM_198244 NM_001194946 NM_001194947 NM_001291157 NM_004953
NM_182917 NM_198241 NM_198242


NM_001005331 NM_145941 NM_001304432

RefSeq (белок)

NP_001181875 NP_001181876 NP_001278086 NP_004944 NP_886553
NP_937884 NP_937885 NP_937887


NP_001291361 NP_666053

Расположение (UCSC)

Chr 3: 184.31 - 184.34 Мб

Chr 16: 20.67 - 20.69 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

Эукариот перевод фактора инициации 4 гамма - 1 представляет собой белок , который у человека кодируется EIF4G1 гена . ^[5]^[6]

Функция [ править ]

Белок, кодируемый этим геном, является компонентом белкового комплекса eIF4F , который участвует в распознавании кэпа мРНК, АТФ-зависимом раскручивании 5'-концевой вторичной структуры и рекрутировании мРНК на рибосому. Альтернативный сплайсинг приводит к пяти вариантам транскрипта, кодирующим четыре различные изоформы. ^[7] eIF4G служит каркасом, взаимодействуя с мРНК и другими компонентами комплекса eIF4F, а также с PABP и eIF3 .

Взаимодействия [ править ]

Эукариотический фактор инициации трансляции 4 гамма взаимодействует с MKNK1 , ^[8] EIF4A1 , ^[9]^[10]^[11] EIF4E , ^[10]^[11]^[12]^[13]^[14] MKNK2 ^[15] и PABPC1 . ^[16]

См. Также [ править ]

Фактор инициации эукариот

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000114867 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000045983 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
↑ Yan R, Rychlik W, Etchison D, Rhoads RE (ноябрь 1992 г.). «Аминокислотная последовательность фактора инициации синтеза белка человека eIF-4 гамма». Журнал биологической химии . 267 (32): 23226–31. PMID 1429670 .
^ Imataka Н, Н Sonenberg (декабрь 1997). «Человеческий фактор инициации трансляции эукариот 4G (eIF4G) обладает двумя отдельными и независимыми сайтами связывания для eIF4A» . Молекулярная и клеточная биология . 17 (12): 6940–7. DOI : 10.1128 / mcb.17.12.6940 . PMC 232551 . PMID 9372926 .
^ «Энтрез Ген: фактор инициации эукариотической трансляции EIF4G1 4 гамма, 1» .
^ Pyronnet S, Imataka Н, Жингра переменный ток, Фукунаг Р, Т Хантер, Sonenberg Н (январь 1999). «Человеческий фактор инициации трансляции эукариот 4G (eIF4G) рекрутирует mnk1 для фосфорилирования eIF4E» . Журнал EMBO . 18 (1): 270–9. DOI : 10.1093 / emboj / 18.1.270 . PMC 1171121 . PMID 9878069 .
^ Юинга Р. М., Чу Р, Р Elisma, Ли Н, Р Тейлор, Клими S, McBroom-Cerajewski л, Робинсон М. Д., О'Коннор л, Ли М, R Тейлор, Dharsee М, Хо У, Heilbut А, Мур л, Чжан С., Орнатский О., Бухман Ю.В., Этье М., Шенг Й., Василеску Дж., Абу-Фарха М., Ламберт Дж. П., Дьювель Х.С., Стюарт II, Кюль Б., Хог К, Колвилл К., Глэдвиш К., Маскат Б., Кинах Р., Адамс С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейс Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии» . Молекулярная системная биология . 3 (1): 89. DOI : 10.1038 / msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .
^ a b Коннолли E, Браунштейн S, Форменти S, Шнайдер RJ (май 2006 г.). «Гипоксия подавляет синтез белка через 4E-BP1 и путь киназы фактора элонгации 2, контролируемый mTOR и не связанный в клетках рака груди» . Молекулярная и клеточная биология . 26 (10): 3955–65. DOI : 10.1128 / MCB.26.10.3955-3965.2006 . PMC 1489005 . PMID 16648488 .
^ a b Harris TE, Chi A, Shabanowitz J, Hunt DF, Rhoads RE, Lawrence JC (апрель 2006 г.). «mTOR-зависимая стимуляция ассоциации eIF4G и eIF3 инсулином» . Журнал EMBO . 25 (8): 1659–68. DOI : 10.1038 / sj.emboj.7601047 . PMC 1440840 . PMID 16541103 .
↑ Vary TC, Jefferson LS, Kimball SR (декабрь 1999 г.). «Аминокислотная стимуляция инициации трансляции в скелетных мышцах крысы». Американский журнал физиологии . 277 (6 Pt 1): E1077–86. DOI : 10.1152 / ajpendo.1999.277.6.E1077 . PMID 10600798 .
↑ Mader S, Lee H, Pause A, Sonenberg N (сентябрь 1995 г.). «Фактор инициации трансляции eIF-4E связывается с общим мотивом, общим для фактора трансляции eIF-4 gamma и репрессоров трансляции 4E-связывающих белков» . Молекулярная и клеточная биология . 15 (9): 4990–7. DOI : 10,1128 / MCB.15.9.4990 . PMC 230746 . PMID 7651417 .
Перейти ↑ Kumar V, Sabatini D, Pandey P, Gingras AC, Majumder PK, Kumar M, Yuan ZM, Carmichael G, Weichselbaum R, Sonenberg N, Kufe D, Kharbanda S (апрель 2000 г.). «Регулирование рапамицина и FKBP-мишени 1 / млекопитающих-мишеней рапамицина и кэп-зависимая инициация трансляции протеин-тирозинкиназой c-Abl» . Журнал биологической химии . 275 (15): 10779–87. DOI : 10.1074 / jbc.275.15.10779 . PMID 10753870 .
^ Шепер GC, Парра JL, Уилсон М., Ван Kollenburg B, Vertegaal AC, Хан З.Г., Гордый CG (август 2003). «N- и C-концы вариантов сплайсинга киназы Mnk2, взаимодействующей с митоген-активированной протеинкиназой человека, определяют активность и локализацию» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (16): 5692–705. DOI : 10.1128 / MCB.23.16.5692-5705.2003 . PMC 166352 . PMID 12897141 .
^ Imataka H, Гради A, Sonenberg N (декабрь 1998). «Недавно идентифицированная N-концевая аминокислотная последовательность eIF4G человека связывает поли (А) -связывающий белок и функционирует в поли (А) -зависимой трансляции» . Журнал EMBO . 17 (24): 7480–9. DOI : 10.1093 / emboj / 17.24.7480 . PMC 1171091 . PMID 9857202 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Gingras AC, Raught B, Sonenberg N (2000). «Факторы инициации eIF4: эффекторы рекрутирования мРНК в рибосомы и регуляторы трансляции». Ежегодный обзор биохимии . 68 : 913–63. DOI : 10.1146 / annurev.biochem.68.1.913 . PMID 10872469 .
Ян Р., Роадс Р. Э. (март 1995 г.). «Фактор инициации синтеза белка человека eIF-4 гамма кодируется одним геном (EIF4G), который отображается на хромосоме 3q27-qter». Геномика . 26 (2): 394–8. DOI : 10.1016 / 0888-7543 (95) 80227-D . PMID 7601469 .
Мадер С., Ли Х, Пауза А., Соненберг Н. (сентябрь 1995 г.). «Фактор инициации трансляции eIF-4E связывается с общим мотивом, общим для фактора трансляции eIF-4 gamma и репрессоров трансляции 4E-связывающих белков» . Молекулярная и клеточная биология . 15 (9): 4990–7. DOI : 10,1128 / MCB.15.9.4990 . PMC 230746 . PMID 7651417 .
Пауза А., Белшем Дж. Дж., Гинграс А. С., Донзе О., Лин Т. А., Лоуренс Дж. К., Соненберг Н. (октябрь 1994 г.). «Инсулинозависимая стимуляция синтеза белка путем фосфорилирования регулятора функции 5'-кэпа». Природа . 371 (6500): 762–7. DOI : 10.1038 / 371762a0 . PMID 7935836 . S2CID 4360955 .
Lamphear BJ, Yan R, Yang F, Waters D, Liebig HD, Klump H, Kuechler E, Skern T, Rhoads RE (сентябрь 1993 г.). «Картирование сайта расщепления в факторе инициации синтеза белка eIF-4 гамма протеаз 2A из вируса Коксаки и риновируса человека». Журнал биологической химии . 268 (26): 19200–3. PMID 8396129 .
Хагигхат А., Мадер С., Пауза А., Соненберг Н. (ноябрь 1995 г.). «Репрессия кэп-зависимой трансляции 4E-связывающим белком 1: конкуренция с p220 за связывание с эукариотическим фактором инициации-4E» . Журнал EMBO . 14 (22): 5701–9. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1995.tb00257.x . PMC 394685 . PMID 8521827 .
Боналду М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода к облегчению открытия генов» . Геномные исследования . 6 (9): 791–806. DOI : 10.1101 / gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
Lamphear BJ, Rhoads RE (декабрь 1996 г.). «Одно изменение аминокислоты в факторе инициации синтеза белка 4G делает кэп-зависимую трансляцию устойчивой к пикорнавирусным протеазам 2А». Биохимия . 35 (49): 15726–33. DOI : 10.1021 / bi961864t . PMID 8961935 .
Brass N, Heckel D, Sahin U, Pfreundschuh M, Sybrecht GW, Meese E (январь 1997 г.). «Фактор инициации трансляции eIF-4gamma кодируется амплифицированным геном и вызывает иммунный ответ при плоскоклеточной карциноме легкого» . Молекулярная генетика человека . 6 (1): 33–9. DOI : 10.1093 / HMG / 6.1.33 . PMID 9002667 .
Эберле Дж., Красагакис К., Орфанос К.Э. (май 1997 г.). «МРНК фактора инициации трансляции eIF-4A1 постоянно сверхэкспрессируется в клетках меланомы человека in vitro». Международный журнал рака . 71 (3): 396–401. DOI : 10.1002 / (SICI) 1097-0215 (19970502) 71: 3 <396 :: AID-IJC16> 3.0.CO; 2-E . PMID 9139875 .
Гради А., Иматака Х., Свиткин Ю. В., Ром Э, Рот Б., Морино С., Соненберг Н. (январь 1998 г.). «Новый функциональный фактор инициации трансляции человеческих эукариот 4G» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (1): 334–42. DOI : 10.1128 / mcb.18.1.334 . PMC 121501 . PMID 9418880 .
Пирон М., Ванде П., Коэн Дж., Понсе Д. (октябрь 1998 г.). «Ротавирусный РНК-связывающий белок NSP3 взаимодействует с eIF4GI и вытесняет поли (А) связывающий белок из eIF4F» . Журнал EMBO . 17 (19): 5811–21. DOI : 10.1093 / emboj / 17.19.5811 . PMC 1170909 . PMID 9755181 .
Иматака Х, Гради А, Зоненберг Н (декабрь 1998 г.). «Недавно идентифицированная N-концевая аминокислотная последовательность eIF4G человека связывает поли (А) -связывающий белок и функционирует в поли (А) -зависимой трансляции» . Журнал EMBO . 17 (24): 7480–9. DOI : 10.1093 / emboj / 17.24.7480 . PMC 1171091 . PMID 9857202 .
Pyronnet S, Imataka H, Gingras AC, Fukunaga R, Hunter T, Sonenberg N (январь 1999 г.). «Человеческий фактор инициации трансляции эукариот 4G (eIF4G) рекрутирует mnk1 для фосфорилирования eIF4E» . Журнал EMBO . 18 (1): 270–9. DOI : 10.1093 / emboj / 18.1.270 . PMC 1171121 . PMID 9878069 .
Лароя Дж., Куэста Р., Брюер Дж., Шнайдер Р. Дж. (Апрель 1999 г.). «Контроль распада мРНК путем теплового шока-убиквитин-протеасома». Наука . 284 (5413): 499–502. DOI : 10.1126 / science.284.5413.499 . PMID 10205060 .
Вэри Т.К., Джефферсон Л.С., Кимбалл С.Р. (декабрь 1999 г.). «Аминокислотная стимуляция инициации трансляции в скелетных мышцах крысы». Американский журнал физиологии . 277 (6 Pt 1): E1077–86. DOI : 10.1152 / ajpendo.1999.277.6.E1077 . PMID 10600798 .
Cuesta R, Laroia G, Schneider RJ (июнь 2000 г.). «Шаперон hsp27 ингибирует трансляцию во время теплового шока, связывая eIF4G и облегчая диссоциацию комплексов инициации кэпа» . Гены и развитие . 14 (12): 1460–70. PMC 316692 . PMID 10859165 .
Chartier-Harlin MC, Dachsel JC, Vilariño-Güell C, Lincoln SJ, Leprêtre F, Hulihan MM, Kachergus J, Milnerwood AJ, Tapia L, Song MS, Le Rhun E, Mutez E, Larvor L, Duflot A, Vanbesien-Mailliot С., Крейслер А., Росс О. А., Нисиока К., Сото-Ортолаза А. И., Кобб С. А., Мелроуз Х. Л., Бехруз Б., Килинг Б. Х., Бэкон Д. А., Хентати Е., Уильямс Л., Янагия А., Соненберг Н., Локхарт П. Дж., Зубайр А. С., Уитти RJ, Aasly JO, Krygowska-Wajs A, Opala G, Wszolek ZK, Frigerio R, Maraganore DM, Gosal D, Lynch T, Hutchinson M, Bentivoglio AR, Valente EM, Nichols WC, Pankratz N, Foroud T, Gibson RA, Hentati F, Диксон Д.В., Дести А., Фаррер MJ (сентябрь 2011 г.). «Мутации инициатора трансляции EIF4G1 при семейной болезни Паркинсона» . Американский журнал генетики человека . 89 (3): 398–406. Дои: 10.1016 / j.ajhg.2011.08.009 . PMC 3169825 . PMID 21907011 .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000114867 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000045983 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1429670-5] Yan R, Rychlik W, Etchison D, Rhoads RE (ноябрь 1992 г.). «Аминокислотная последовательность фактора инициации синтеза белка человека eIF-4 гамма». Журнал биологической химии . 267 (32): 23226–31. PMID 1429670 .

[pmid9372926-6] Imataka Н, Н Sonenberg (декабрь 1997). «Человеческий фактор инициации трансляции эукариот 4G (eIF4G) обладает двумя отдельными и независимыми сайтами связывания для eIF4A» . Молекулярная и клеточная биология . 17 (12): 6940–7. DOI : 10.1128 / mcb.17.12.6940 . PMC 232551 . PMID 9372926 .

[7] «Энтрез Ген: фактор инициации эукариотической трансляции EIF4G1 4 гамма, 1» .

[pmid9878069-8] Pyronnet S, Imataka Н, Жингра переменный ток, Фукунаг Р, Т Хантер, Sonenberg Н (январь 1999). «Человеческий фактор инициации трансляции эукариот 4G (eIF4G) рекрутирует mnk1 для фосфорилирования eIF4E» . Журнал EMBO . 18 (1): 270–9. DOI : 10.1093 / emboj / 18.1.270 . PMC 1171121 . PMID 9878069 .

[pmid17353931-9] Юинга Р. М., Чу Р, Р Elisma, Ли Н, Р Тейлор, Клими S, McBroom-Cerajewski л, Робинсон М. Д., О'Коннор л, Ли М, R Тейлор, Dharsee М, Хо У, Heilbut А, Мур л, Чжан С., Орнатский О., Бухман Ю.В., Этье М., Шенг Й., Василеску Дж., Абу-Фарха М., Ламберт Дж. П., Дьювель Х.С., Стюарт II, Кюль Б., Хог К, Колвилл К., Глэдвиш К., Маскат Б., Кинах Р., Адамс С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейс Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии» . Молекулярная системная биология . 3 (1): 89. DOI : 10.1038 / msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .

[pmid16648488-10] Коннолли E, Браунштейн S, Форменти S, Шнайдер RJ (май 2006 г.). «Гипоксия подавляет синтез белка через 4E-BP1 и путь киназы фактора элонгации 2, контролируемый mTOR и не связанный в клетках рака груди» . Молекулярная и клеточная биология . 26 (10): 3955–65. DOI : 10.1128 / MCB.26.10.3955-3965.2006 . PMC 1489005 . PMID 16648488 .

[pmid16541103-11] Harris TE, Chi A, Shabanowitz J, Hunt DF, Rhoads RE, Lawrence JC (апрель 2006 г.). «mTOR-зависимая стимуляция ассоциации eIF4G и eIF3 инсулином» . Журнал EMBO . 25 (8): 1659–68. DOI : 10.1038 / sj.emboj.7601047 . PMC 1440840 . PMID 16541103 .

[pmid10600798-12] Vary TC, Jefferson LS, Kimball SR (декабрь 1999 г.). «Аминокислотная стимуляция инициации трансляции в скелетных мышцах крысы». Американский журнал физиологии . 277 (6 Pt 1): E1077–86. DOI : 10.1152 / ajpendo.1999.277.6.E1077 . PMID 10600798 .

[pmid7651417-13] Mader S, Lee H, Pause A, Sonenberg N (сентябрь 1995 г.). «Фактор инициации трансляции eIF-4E связывается с общим мотивом, общим для фактора трансляции eIF-4 gamma и репрессоров трансляции 4E-связывающих белков» . Молекулярная и клеточная биология . 15 (9): 4990–7. DOI : 10,1128 / MCB.15.9.4990 . PMC 230746 . PMID 7651417 .

[pmid10753870-14] Перейти ↑ Kumar V, Sabatini D, Pandey P, Gingras AC, Majumder PK, Kumar M, Yuan ZM, Carmichael G, Weichselbaum R, Sonenberg N, Kufe D, Kharbanda S (апрель 2000 г.). «Регулирование рапамицина и FKBP-мишени 1 / млекопитающих-мишеней рапамицина и кэп-зависимая инициация трансляции протеин-тирозинкиназой c-Abl» . Журнал биологической химии . 275 (15): 10779–87. DOI : 10.1074 / jbc.275.15.10779 . PMID 10753870 .

[pmid12897141-15] Шепер GC, Парра JL, Уилсон М., Ван Kollenburg B, Vertegaal AC, Хан З.Г., Гордый CG (август 2003). «N- и C-концы вариантов сплайсинга киназы Mnk2, взаимодействующей с митоген-активированной протеинкиназой человека, определяют активность и локализацию» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (16): 5692–705. DOI : 10.1128 / MCB.23.16.5692-5705.2003 . PMC 166352 . PMID 12897141 .

[pmid9857202-16] Imataka H, Гради A, Sonenberg N (декабрь 1998). «Недавно идентифицированная N-концевая аминокислотная последовательность eIF4G человека связывает поли (А) -связывающий белок и функционирует в поли (А) -зависимой трансляции» . Журнал EMBO . 17 (24): 7480–9. DOI : 10.1093 / emboj / 17.24.7480 . PMC 1171091 . PMID 9857202 .

[1]