Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
FBLN1
Идентификаторы
ПсевдонимыFBLN1 , FBLN, FIBL1, фибулин 1
Внешние идентификаторыOMIM : 135820 MGI : 95487 HomoloGene : 21295 GeneCards : FBLN1
Расположение гена ( человек )
Хромосома 22 (человек)
Chr.Хромосома 22 (человека) [1]
Хромосома 22 (человек)
Геномное расположение FBLN1
Геномное расположение FBLN1
Группа22q13.31Начинать45 502 238 п.н. [1]
Конец45 601 135 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 15 (мышь)
Chr.Хромосома 15 (мышь) [2]
Хромосома 15 (мышь)
Геномное расположение FBLN1
Геномное расположение FBLN1
Группа15 | 15 E2Начинать85 205 949 п.н. [2]
Конец85 286 535 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE FBLN1 201787 в fs.png

PBB GE FBLN1 202995 s в формате fs.png

PBB GE FBLN1 207834 в fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• фибронектин связывание
• иона кальция связывание
• внеклеточный матрикс структурных составной
• связывание фибриногена
• интегрин связывания
• протеин С-конец связывания
• GO: связывание белка 0001948
• идентичного белка связывание
• активатор активность пептидазы
• GO: 0032403 макромолекулярного комплекс связывание
Сотовый компонент• эластичное волокно
• внеклеточный матрикс
• фибриноген
• базальная мембрана
• внеклеточная экзосома
• внеклеточная
• внеклеточная область
• внеклеточный матрикс, содержащий коллаген
Биологический процесс• негативная регуляция фосфорилирования белков
• негативная регуляция клеточной адгезии
• негативная регуляция пролиферации стволовых клеток
• позитивная регуляция пролиферации фибробластов
• позитивная регуляция субстрат-зависимой миграции клеток, прикрепление клеток к субстрату
• негативная регуляция подвижности клеток
• негативная регуляция трансформации клетки-хозяина вирусом
• позитивная регуляция активности пептидазы
• позитивная регуляция экспрессии генов
• негативная регуляция каскада ERK1 и ERK2
• опосредованный интегрином сигнальный путь
• свертывание крови, образование фибринового сгустка
• негативная регуляция распространения клеток, зависящая от адгезии субстрата
• вирусный процесс GO: 0022415
• имплантация эмбриона
• организация внеклеточного матрикса
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

2192

14114

Ансамбль

ENSG00000077942

ENSMUSG00000006369

UniProt

P23142

Q08879

RefSeq (мРНК)

NM_006487
NM_001996
NM_006485
NM_006486

NM_010180
NM_001347088

RefSeq (белок)

NP_001987
NP_006476
NP_006477
NP_006478

NP_001334017
NP_034310

Расположение (UCSC)Chr 22: 45,5 - 45,6 МбChr 15: 85.21 - 85.29 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

FBLN1 - это ген, кодирующий фибулин-1 , внеклеточный матрикс и белок плазмы. [5] [6] [7]

Функция [ править ]

Фибулин-1 представляет собой секретируемый гликопротеин, который обнаруживается в ассоциации со структурами внеклеточного матрикса, включая фибронектин- содержащие волокна, эластин- содержащие волокна и базальные мембраны . Фибулин-1 связывается с рядом компонентов внеклеточного матрикса, включая фибронектин , [7] нидоген-1 и протеогликан , версикан . [7] [8] Фибулин-1 также является белком крови, способным связываться с фибриногеном . [9]

Структура [ править ]

Фибулин-1 имеет модульную доменную структуру и включает серию из девяти модулей, подобных эпидермальному фактору роста, за которыми следует модуль типа фибулина , модуль, обнаруженный во всех членах семейства генов фибулина. [6]

Ген фибулина-1 человека, FBLN1, кодирует четыре варианта сплайсинга, обозначенные как фибулин-1A, B, C и D, которые различаются по своим карбоксиконцевым областям. У мышей, кур и нематод C. elegans продуцируются только два варианта фибулина-1: фибулин-1С и фибулин-1D. [5]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что FBLN1 взаимодействует с:

  • NOV / CCN3 , [10]
  • белок-предшественник амилоида , [11]
  • энтактин , [12] [13] [14]
  • фибриноген , [9] и
  • фибронектин . [15]

См. Также [ править ]

  • Синполидактилия

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000077942 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000006369 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ a b «Ген Энтреза: FBLN1 фибулин 1» .
  6. ^ а б Аргрейв WS, Тран Х, Берджесс У.С., Дикерсон К. (декабрь 1990 г.). «Фибулин - внеклеточный матрикс и гликопротеин плазмы с повторяющейся доменной структурой» . Журнал клеточной биологии . 111 (6 Pt 2): 3155–64. DOI : 10,1083 / jcb.111.6.3155 . PMC 2116371 . PMID 2269669 .  
  7. ^ a b c Balbona K, Tran H, Godyna S, Ingham KC, Strickland DK, Argraves WS (октябрь 1992 г.). «Фибулин связывается сам с собой и с карбоксиконцевой гепарин-связывающей областью фибронектина» . Журнал биологической химии . 267 (28): 20120–5. PMID 1400330 . 
  8. ^ Timpl R, Sasaki T, G Костко, Chu ML (июнь 2003). «Фибулины: универсальное семейство белков внеклеточного матрикса». Обзоры природы Молекулярная клеточная биология . 4 (6): 479–89. DOI : 10.1038 / nrm1130 . PMID 12778127 . 
  9. ^ a b Аргрейвс WS, Танака A, Смит EP, Twal WO, Argraves KM, Fan D, Haudenschild CC (ноябрь 2009 г.). «Фибулин-1 и фибриноген при атеросклеротических поражениях человека». Гистохимия и клеточная биология . 132 (5): 559–65. DOI : 10.1007 / s00418-009-0628-7 . PMID 19693531 . 
  10. ^ Perbal B, C Martinerie, Sainson R, Вернер M, Он B, Ройзман B (февраль 1999). «С-концевой домен регуляторного белка NOVH достаточен, чтобы способствовать взаимодействию с фибулином 1С: ключ к разгадке роли NOVH в передаче сигналов клеточной адгезии» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (3): 869–74. DOI : 10.1073 / pnas.96.3.869 . PMC 15317 . PMID 9927660 .  
  11. ^ Осава I, Takamura C, Kohsaka S (март 2001). «Фибулин-1 связывает амино-концевую головку белка-предшественника бета-амилоида и модулирует его физиологическую функцию» . Журнал нейрохимии . 76 (5): 1411–20. DOI : 10.1046 / j.1471-4159.2001.00144.x . PMID 11238726 . 
  12. ^ Адам S, Göhring Вт, Видеман Н, Чу М.Л., Timpl R, G Костко (сентябрь 1997). «Связывание фибулина-1 с нидогеном зависит от его C-концевого глобулярного домена и специфического набора кальций-связывающих модулей, подобных эпидермальному фактору роста (EG)». Журнал молекулярной биологии . 272 (2): 226–36. DOI : 10.1006 / jmbi.1997.1244 . PMID 9299350 . 
  13. ^ Tran Н, VanDusen WJ, Argraves WS (сентябрь 1997). «Сайты самоассоциации и связывания фибронектина фибулина-1 отображаются на кальций-связывающих доменах, подобных эпидермальному фактору роста» . Журнал биологической химии . 272 (36): 22600–6. DOI : 10.1074 / jbc.272.36.22600 . PMID 9278415 . 
  14. ^ Пань ТС, Клудж М, Чжан Р., Майер U, Timpl R, Чу ML (август 1993 г.). «Последовательность внеклеточного мышиного белка BM-90 / фибулина и его кальций-зависимое связывание с другими лигандами базальной мембраны». Европейский журнал биохимии / FEBS . 215 (3): 733–40. DOI : 10.1111 / j.1432-1033.1993.tb18086.x . PMID 8354280 . 
  15. ^ Deeney JT, Tornheim К, Корчак НМ, Прентки М, Corkey В (октябрь 1992 г.). «Сложные эфиры ацил-КоА модулируют внутриклеточную обработку Ca2 + проницаемыми клональными бета-клетками поджелудочной железы». Журнал биологической химии . 267 (28): 19840–5. PMID 1400300 . 

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Бальбона К., Тран Х., Година С., Ингам К.С., Стрикленд Д.К., Аргрейвс WS (октябрь 1992 г.). «Фибулин связывается сам с собой и с карбоксиконцевой гепарин-связывающей областью фибронектина». Журнал биологической химии . 267 (28): 20120–5. PMID  1400330 .
  • Argraves WS, Tran H, Burgess WH, Dickerson K (декабрь 1990 г.). «Фибулин - внеклеточный матрикс и гликопротеин плазмы с повторяющейся доменной структурой» . Журнал клеточной биологии . 111 (6 Pt 2): 3155–64. DOI : 10,1083 / jcb.111.6.3155 . PMC  2116371 . PMID  2269669 .
  • Argraves WS, Dickerson K, Burgess WH, Ruoslahti E (август 1989 г.). «Фибулин, новый белок, который взаимодействует с цитоплазматическим доменом бета-субъединицы рецептора фибронектина». Cell . 58 (4): 623–9. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (89) 90097-4 . PMID  2527614 .
  • Sasaki T, Göhring W, Pan TC, Chu ML, Timpl R (декабрь 1995 г.). «Связывание фибулина-2 мыши и человека с лигандами внеклеточного матрикса». Журнал молекулярной биологии . 254 (5): 892–9. DOI : 10.1006 / jmbi.1995.0664 . PMID  7500359 .
  • Рорк EF, Кин Д.Р., Haudenschild CC, Godyna S, Little CD, Argraves WS (апрель 1995 г.). «Связь человеческого фибулина-1 с эластическими волокнами: иммуногистологическое, ультраструктурное и РНК исследование» . Журнал гистохимии и цитохимии . 43 (4): 401–11. DOI : 10.1177 / 43.4.7534784 . PMID  7534784 .
  • Тран Х., Танака А., Литвинович С.В., Медведь Л.В., Ходеншильд С.К., Аргрейвс В.С. (август 1995 г.). «Взаимодействие фибулина-1 с фибриногеном. Возможная роль в гемостазе и тромбозах» . Журнал биологической химии . 270 (33): 19458–64. DOI : 10.1074 / jbc.270.33.19458 . PMID  7642629 .
  • Маттей М.Г., Пан Т.С., Чжан Р.З., Тимпл Р., Чу М.Л. (июль 1994 г.). «Ген фибулина-1 (FBLN1) расположен на хромосоме 22 человека и на хромосоме 15 мыши». Геномика . 22 (2): 437–8. DOI : 10.1006 / geno.1994.1406 . PMID  7806231 .
  • Коренберг-младший, Чен XN, Тран Х., Аргрейв WS (1995). «Локализация человеческого гена фибулина-1 (FBLN1) в полосе хромосомы 22q13.3». Цитогенетика и клеточная генетика . 68 (3–4): 192–3. DOI : 10.1159 / 000133911 . PMID  7842734 .
  • Браун Дж. К., Видеманн Х, Тимпл Р. (январь 1994 г.) «Свойства связывания с белками и клеточной адгезии двух изоформ ламинина (AmB1eB2e, AmB1sB2e) из плаценты человека». Журнал клеточной науки . 107 (1): 329–38. PMID  8175920 .
  • Pan TC, Kluge M, Zhang RZ, Mayer U, Timpl R, Chu ML (август 1993 г.). «Последовательность внеклеточного мышиного белка BM-90 / фибулина и его кальций-зависимое связывание с другими лигандами базальной мембраны». Европейский журнал биохимии / FEBS . 215 (3): 733–40. DOI : 10.1111 / j.1432-1033.1993.tb18086.x . PMID  8354280 .
  • Clinton GM, Rougeot C, Derancourt J, Roger P, Defrenne A, Godyna S, Argraves WS, Rochefort H (январь 1996 г.). «Эстрогены увеличивают экспрессию фибулина-1, белка внеклеточного матрикса, секретируемого клетками рака яичников человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 93 (1): 316–20. DOI : 10.1073 / pnas.93.1.316 . PMC  40229 . PMID  8552629 .
  • Миосге Н., Гетц В., Сасаки Т., Чу М.Л., Тимпл Р., Херкен Р. (февраль 1996 г.). «Белки внеклеточного матрикса фибулин-1 и фибулин-2 в раннем эмбрионе человека». Гистохимический журнал . 28 (2): 109–16. DOI : 10.1007 / BF02331415 . PMID  8737292 .
  • Годына С., Диас-Рикарт М., Аргрейвс В.С. (октябрь 1996 г.). «Фибулин-1 опосредует адгезию тромбоцитов через мостик из фибриногена». Кровь . 88 (7): 2569–77. PMID  8839849 .
  • Тран Х., Маттей М., Годына С., Аргрейвс В.С. (март 1997 г.). «Фибулин-1D человека: молекулярное клонирование, экспрессия и сходство с белком S1-5, новым членом семейства генов фибулина». Матричная биология . 15 (7): 479–93. DOI : 10.1016 / S0945-053X (97) 90021-4 . PMID  9106159 .
  • Тран Х., ВанДусен В.Дж., Аргрейв С.С. (сентябрь 1997 г.) «Сайты самоассоциации и связывания фибронектина фибулина-1 отображаются на кальций-связывающих доменах, подобных эпидермальному фактору роста» . Журнал биологической химии . 272 (36): 22600–6. DOI : 10.1074 / jbc.272.36.22600 . PMID  9278415 .
  • Adam S, Göhring W., Wiedemann H, Chu ML, Timpl R, Kostka G (сентябрь 1997 г.). «Связывание фибулина-1 с нидогеном зависит от его C-концевого глобулярного домена и специфического набора кальций-связывающих модулей, подобных эпидермальному фактору роста (EG)». Журнал молекулярной биологии . 272 (2): 226–36. DOI : 10.1006 / jmbi.1997.1244 . PMID  9299350 .
  • Цин Дж., Махер В.М., Тран Х., Аргрейвс В.С., Данстан Р.В., Маккормик Дж. Дж. (Октябрь 1997 г.). «Подавление независимого от закрепления роста и инвазии матригеля и задержка образования опухоли за счет повышенной экспрессии фибулина-1D в линиях клеток, происходящих от фибросаркомы человека» . Онкоген . 15 (18): 2159–68. DOI : 10.1038 / sj.onc.1201385 . PMID  9393974 .
  • Hayashido Y, Lucas A, Rougeot C, Godyna S, Argraves WS, Rochefort H (февраль 1998 г.). «Эстрадиол и фибулин-1 подавляют подвижность клеток рака яичников и груди человека, индуцированную фибронектином» . Международный журнал рака . 75 (4): 654–8. DOI : 10.1002 / (SICI) 1097-0215 ​​(19980209) 75: 4 <654 :: AID-IJC26> 3.0.CO; 2-7 . PMID  9466671 .
  • Роджер П., Пужоль П., Лукас А., Бальдет П., Рошфор Н. (ноябрь 1998 г.). «Повышенное иммунное окрашивание фибулина-1, эстроген-регулируемого белка в строме эпителиальных опухолей яичников человека» . Американский журнал патологии . 153 (5): 1579–88. DOI : 10.1016 / S0002-9440 (10) 65746-X . PMC  1853396 . PMID  9811350 .
  • Пербал Б., Мартинери С., Сэйнсон Р., Вернер М., Хе Б., Ройзман Б. (февраль 1999 г.). «С-концевой домен регуляторного белка NOVH достаточен, чтобы способствовать взаимодействию с фибулином 1С: ключ к разгадке роли NOVH в передаче сигналов клеточной адгезии» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (3): 869–74. DOI : 10.1073 / pnas.96.3.869 . PMC  15317 . PMID  9927660 .