FBXO7

Доступные конструкции

Ортолог поиск: PDBe RCSB

Список идентификационных кодов PDB
4L9C , 4L9H

Идентификаторы

Псевдонимы

FBXO7 , FBX, FBX07, FBX7, PARK15, PKPS, белок F-бокса 7

Внешние идентификаторы

OMIM : 605648 MGI : 1917004 HomoloGene : 8136 GeneCards : FBXO7

Расположение гена ( человек )

Chr.	Хромосома 22 (человека) ^[1]

Группа	22q12.3	Начинать	32 474 676 п.н. ^[1]
Группа	22q12.3	Конец	32 498 829 п.н. ^[1]

Расположение гена ( Мышь )

Chr.	Хромосома 10 (мышь) ^[2]

Группа	10 \| 10 C1	Начинать	86 021 972 п.н. ^[2]
Группа	10 \| 10 C1	Конец	86 051 873 п.н. ^[2]

Паттерн экспрессии РНК

Дополнительные данные эталонного выражения

Генная онтология
Молекулярная функция	• GO: 0001948 связывание белка • убиквитин-протеин трансферазы активности • протеинкиназа связывания • убиквитин белка лигазы связывания • убиквитин связывания • белок гетеродимеризации активности
Сотовый компонент	• цитоплазма • убиквитинлигаз комплекс • митохондрия • ядро клетка • цитозоль • SCF убиквитинлигаз комплекс • глиальное цитоплазматическое включение • классическое тельца Левите • Льюй аксоны • ядро телец Леви • коронные тельца Леви • макромолекулярный комплекс
Биологический процесс	• негативная регуляция перехода G1 / S митотического клеточного цикла • нацеливание белка на митохондрии • негативная регуляция дифференцировки лимфоцитов • митофагия • регуляция стабильности протеина • негативная регуляция активности циклин-зависимой протеин-серин / треонинкиназы • регуляция локомоции • полиубиквитинирование протеина • регуляция развития проекций нейронов • убиквитинирование белков • негативная регуляция гибели нейронов, вызванная окислительным стрессом • негативная регуляция гибели нейронов • позитивная регуляция аутофагии митохондрии • негативная регуляция гибели нейронов, вызванной перекисью водорода • посттрансляционная модификация • убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс
Источники: Amigo / QuickGO

Ортологи

Разновидность

Человек

Мышь

Entrez


25793


69754

Ансамбль


ENSG00000100225


ENSMUSG00000001786

UniProt


Q9Y3I1


Q3U7U3

RefSeq (мРНК)


NM_001033024 NM_001257990 NM_012179


NM_153195 NM_001310745 NM_001347151

RefSeq (белок)


NP_001028196 NP_001244919 NP_036311


NP_001297674 NP_001334080 NP_694875

Расположение (UCSC)

Chr 22: 32,47 - 32,5 Мб

Chr 10: 86.02 - 86.05 Мб

PubMed поиск

^[3]

^[4]

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

F-бокс единственный белок 7 представляет собой белок , который у человека кодируется FBXO7 гена . ^[5]^[6]^[7]^[8] Мутации в FBXO7 были связаны с болезнью Паркинсона. ^[9]^[10]

Функция [ править ]

Этот ген кодирует член семейства белков F-бокса, который характеризуется мотивом приблизительно из 40 аминокислот, F-боксом. Белки F-бокса составляют одну из четырех субъединиц убиквитинового протеин-лигазного комплекса, называемых SCF (SKP1-cullin-F-box), которые функционируют в зависимом от фосфорилирования убиквитинировании. Белки F-бокса делятся на 3 класса: Fbws, содержащие домены WD-40, Fbws, содержащие повторы, богатые лейцином, и Fbxs, содержащие либо различные модули взаимодействия белок-белок, либо не распознаваемые мотивы. Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к классу Fbxs и может играть роль в регуляции кроветворения. Альтернативно сплайсированные варианты транскриптов этого гена были идентифицированы, при этом была определена полноразмерная природа только некоторых вариантов. ^[8]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что FBXO7 взаимодействует с SKP1A , ^[11] CUL1 , ^[5]^[12] CDK6 , ^[13] p27 , ^[13] PI31 , ^[12] Parkin , ^[14] и PINK1 . ^[14]

Ссылки [ править ]

^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000100225 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000001786 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ a b Cenciarelli C, Chiaur DS, Guardavaccaro D, Parks W, Vidal M, Pagano M (октябрь 1999 г.). «Идентификация семейства белков человеческого F-бокса». Текущая биология . 9 (20): 1177–9. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (00) 80020-2 . PMID 10531035 .
↑ Winston JT, Koepp DM, Zhu C, Elledge SJ, Harper JW (октябрь 1999 г.). «Семейство белков F-бокса млекопитающих». Текущая биология . 9 (20): 1180–2. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (00) 80021-4 . PMID 10531037 .
^ Ди Фонзо А., Деккер М.С., Монтанья П., Баруцци А., Йонова Э.Х., Коррейя Гедес Л., Щербинска А., Чжао Т., Дуббель-Хулсман Л.О., Воутерс СН, де Граафф Е., Ойен В.Дж., Саймонс Е.Дж., Бридвелд Г.Дж., Остра Б.А. , Хорстинк М.В., Бонифати V (январь 2009 г.). «Мутации FBXO7 вызывают аутосомно-рецессивный паркинсоно-пирамидный синдром с ранним началом». Неврология . 72 (3): 240–5. DOI : 10.1212 / 01.wnl.0000338144.10967.2b . PMID 19038853 .
^ a b «Ген Entrez: FBXO7 F-box белок 7» .
^ Shojaee S, Син F, Banihosseini С.С., Казее МН, Kalhor R, Шахидите Г.А., Fakhrai-Rad Н, Ronaghi М, Элахи Е (июнь 2008 г.). «Полногеномный анализ сцепления родословной паркинсонического пирамидного синдрома с помощью массивов из 500 K SNP» . Американский журнал генетики человека . 82 (6): 1375–84. DOI : 10.1016 / j.ajhg.2008.05.005 . PMC 2427312 . PMID 18513678 .
^ Ди Фонзо А., Деккер М.С., Монтанья П., Баруцци А., Йонова Э.Х., Коррейя Гедес Л., Щербинска А., Чжао Т., Дуббель-Хулсман Л.О., Воутерс СН, де Граафф Е., Ойен В.Дж., Саймонс Е.Дж., Бридвелд Г.Дж., Остра Б.А. , Хорстинк М.В., Бонифати V (январь 2009 г.). «Мутации FBXO7 вызывают аутосомно-рецессивный паркинсоно-пирамидный синдром с ранним началом». Неврология . 72 (3): 240–5. DOI : 10.1212 / 01.wnl.0000338144.10967.2b . PMID 19038853 .
^ Cenciarelli C, Chiaur DS, Guardavaccaro D, парки W, Vidal M, Пагано M (октябрь 1999). «Идентификация семейства белков человеческого F-бокса». Текущая биология . 9 (20): 1177–9. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (00) 80020-2 . PMID 10531035 .
^ a b Кирк Р., Ламан Х., Ноулз П.П., Мюррей-Раст Дж., Ломоносов М., Мезиан эль К., Макдональд Н.К. (август 2008 г.). «Структура консервативного домена димеризации в F-бокс-белке Fbxo7 и ингибиторе протеасомы PI31» . Журнал биологической химии . 283 (32): 22325–35. DOI : 10.1074 / jbc.M709900200 . PMID 18495667 .
^ a b Ламан Х, Фунес Дж. М., Йе Х, Хендерсон С., Галинанес-Гарсия Л., Хара Е., Ноулз П., Макдональд Н., Бошофф С. (сентябрь 2005 г.). «Трансформирующая активность Fbxo7 опосредуется специфически через регуляцию циклина D / cdk6» . Журнал EMBO . 24 (17): 3104–16. DOI : 10.1038 / sj.emboj.7600775 . PMC 1201355 . PMID 16096642 .
^ a b Берчелл В.С., Нельсон Д.Е., Санчес-Мартинес А., Дельгадо-Кампруби М., Иватт Р.М., Погсон Дж. Х., Рэндл С. Дж., Рэй С., Льюис П. А., Холден Г., Абрамов А. Ю., Харди Дж., Вуд Н. В., Уитворт А. Дж., Ламан H, Plun-Favreau H (сентябрь 2013 г.). «Белки, связанные с болезнью Паркинсона Fbxo7 и Parkin, взаимодействуют, опосредуя митофагию» . Природа Неврологии . 16 (9): 1257–65. DOI : 10.1038 / nn.3489 . PMC 3827746 . PMID 23933751 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Данхэм И., Шимидзу Н., Роу Б.А., Чиссо С., Хант А.Р., Коллинз Дж. Э., Брускевич Р., Беар Д.М., Зажим М., Сминк Л.Дж., Эйнскау Р., Алмейда Дж. П., Бэббидж А., Баггулей С., Бейли Дж., Барлоу К., Бейтс К.Н. , Бисли О., Берд С.П., Блейки С., Бриджман А.М., Бак Д., Берджесс Дж., Беррилл В.Д., О'Брайен КП (декабрь 1999 г.). «Последовательность ДНК хромосомы 22 человека» . Природа . 402 (6761): 489–95. DOI : 10.1038 / 990031 . PMID 10591208 .
Диас Нето Э., Корреа Р.Г., Верджовски-Алмейда С., Брионес М.Р., Нагаи М.А., да Силва В., Заго М.А., Бордин С., Коста Ф.Ф., Голдман Г.Х., Карвалью А.Ф., Мацукума А., Байя Г.С., Симпсон Д.Х., Брунштейн А., де Оливейра П.С., Бучер П., Джонженель К.В., О'Хара М.Дж., Соарес Ф., Брентани Р.Р., Рейс Л.Ф., де Соуза С.Дж., Симпсон А.Дж. (март 2000 г.). «Shotgun секвенирование человеческого транскриптома с помощью тегов последовательности, экспрессируемой ORF» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (7): 3491–6. DOI : 10.1073 / pnas.97.7.3491 . PMC 16267 . PMID 10737800 .
Ильин Г.П., Риалланд М., Голубь С., Гуген-Гийозо С. (июль 2000 г.). «Клонирование кДНК и анализ экспрессии новых членов семейства белков F-бокса млекопитающих». Геномика . 67 (1): 40–7. DOI : 10.1006 / geno.2000.6211 . PMID 10945468 .
Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геномные исследования . 10 (11): 1788–95. DOI : 10.1101 / gr.143000 . PMC 310948 . PMID 11076863 .
Цоу AP, Ян CW, Хуанг CY, Yu RC, Lee YC, Chang CW, Chen BR, Chung YF, Fann MJ, Chi CW, Chiu JH, Chou CK (январь 2003 г.). «Идентификация нового гена, регулируемого клеточным циклом, HURP, сверхэкспрессированного в гепатоцеллюлярной карциноме человека» . Онкоген . 22 (2): 298–307. DOI : 10.1038 / sj.onc.1206129 . PMID 12527899 .
Коллинз Дж. Э., Говард М. Э., Коул К. Г., Сминк Л. Дж., Хакл Е. Дж., Ноулз С., Пока Дж. М., Биэр Д.М., Данхэм I. (январь 2003 г.). «Переоценка аннотации человеческого гена: анализ второго поколения хромосомы 22» . Геномные исследования . 13 (1): 27–36. DOI : 10.1101 / gr.695703 . PMC 430954 . PMID 12529303 .
Hsu JM, Lee YC, Yu CT, Huang CY (июль 2004 г.). «Fbx7 функционирует в комплексе SCF, регулирующем протеолиз протеолиза белка, богатого пролином, Cdk1-циклин B-фосфорилированной гепатомы (HURP)» . Журнал биологической химии . 279 (31): 32592–602. DOI : 10.1074 / jbc.M404950200 . PMID 15145941 .
Коллинз Дж. Э., Райт К. Л., Эдвардс Калифорния, Дэвис М. П., Гринхэм Дж. А., Коул К. Г., Говард М. Е., Агуадо Б., Малля М., Мокраб И., Хакл Е. Д., Биар Д. М., Данэм I. «Основанный на аннотации генома подход к клонированию ORFeome человека» . Геномная биология . 5 (10): R84. DOI : 10.1186 / GB-2004-5-10-R84 . PMC 545604 . PMID 15461802 .
Wiemann S, Arlt D, Huber W., Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (октябрь 2004 г.). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики» . Геномные исследования . 14 (10B): 2136–44. DOI : 10.1101 / gr.2576704 . PMC 528930 . PMID 15489336 .
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети белок-белкового взаимодействия человека». Природа . 437 (7062): 1173–8. DOI : 10,1038 / природа04209 . PMID 16189514 .
Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И., дель Валь С., Арльт Д., Хане Ф., Бектель С., Симпсон Дж., Хофманн О., Хиде В., Глаттинг К. Х., Хубер В., Пепперкок Р., Поустка А., Виманн С. (январь 2006 г.). «База данных LIFEdb в 2006 году» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Выпуск базы данных): D415–8. DOI : 10.1093 / NAR / gkj139 . PMC 1347501 . PMID 16381901 .
Чанг Ю.Ф., Ченг С.М., Чанг Л.К., Чжон Ю.Дж., Юо С.Й. (апрель 2006 г.). «Белок F-бокса Fbxo7 взаимодействует с человеческим ингибитором белка апоптоза cIAP1 и способствует убиквитинированию cIAP1». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях . 342 (4): 1022–6. DOI : 10.1016 / j.bbrc.2006.02.061 . PMID 16510124 .
Лю Ю., Хедват К.В., Мао С., Чжу XH, Яо Дж., Нгуен Х., Кофф А., Нимер С.Д. (апрель 2006 г.). «Белок ETS MEF регулируется зависимым от фосфорилирования протеолизом через протеин-убиквитинлигазу SCFSkp2» . Молекулярная и клеточная биология . 26 (8): 3114–23. DOI : 10.1128 / MCB.26.8.3114-3123.2006 . PMC 1446966 . PMID 16581786 .

Эта статья о гене на 22-й хромосоме человека - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000100225 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000001786 - Ensembl , май 2017 г.

[3] "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10531035-5] Cenciarelli C, Chiaur DS, Guardavaccaro D, Parks W, Vidal M, Pagano M (октябрь 1999 г.). «Идентификация семейства белков человеческого F-бокса». Текущая биология . 9 (20): 1177–9. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (00) 80020-2 . PMID 10531035 .

[pmid10531037-6] Winston JT, Koepp DM, Zhu C, Elledge SJ, Harper JW (октябрь 1999 г.). «Семейство белков F-бокса млекопитающих». Текущая биология . 9 (20): 1180–2. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (00) 80021-4 . PMID 10531037 .

[pmid19038853-7] Ди Фонзо А., Деккер М.С., Монтанья П., Баруцци А., Йонова Э.Х., Коррейя Гедес Л., Щербинска А., Чжао Т., Дуббель-Хулсман Л.О., Воутерс СН, де Граафф Е., Ойен В.Дж., Саймонс Е.Дж., Бридвелд Г.Дж., Остра Б.А. , Хорстинк М.В., Бонифати V (январь 2009 г.). «Мутации FBXO7 вызывают аутосомно-рецессивный паркинсоно-пирамидный синдром с ранним началом». Неврология . 72 (3): 240–5. DOI : 10.1212 / 01.wnl.0000338144.10967.2b . PMID 19038853 .

[entrez-8] «Ген Entrez: FBXO7 F-box белок 7» .

[9] Shojaee S, Син F, Banihosseini С.С., Казее МН, Kalhor R, Шахидите Г.А., Fakhrai-Rad Н, Ronaghi М, Элахи Е (июнь 2008 г.). «Полногеномный анализ сцепления родословной паркинсонического пирамидного синдрома с помощью массивов из 500 K SNP» . Американский журнал генетики человека . 82 (6): 1375–84. DOI : 10.1016 / j.ajhg.2008.05.005 . PMC 2427312 . PMID 18513678 .

[10] Ди Фонзо А., Деккер М.С., Монтанья П., Баруцци А., Йонова Э.Х., Коррейя Гедес Л., Щербинска А., Чжао Т., Дуббель-Хулсман Л.О., Воутерс СН, де Граафф Е., Ойен В.Дж., Саймонс Е.Дж., Бридвелд Г.Дж., Остра Б.А. , Хорстинк М.В., Бонифати V (январь 2009 г.). «Мутации FBXO7 вызывают аутосомно-рецессивный паркинсоно-пирамидный синдром с ранним началом». Неврология . 72 (3): 240–5. DOI : 10.1212 / 01.wnl.0000338144.10967.2b . PMID 19038853 .

[autogenerated1-11] Cenciarelli C, Chiaur DS, Guardavaccaro D, парки W, Vidal M, Пагано M (октябрь 1999). «Идентификация семейства белков человеческого F-бокса». Текущая биология . 9 (20): 1177–9. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (00) 80020-2 . PMID 10531035 .

[Kirk_2008-12] Кирк Р., Ламан Х., Ноулз П.П., Мюррей-Раст Дж., Ломоносов М., Мезиан эль К., Макдональд Н.К. (август 2008 г.). «Структура консервативного домена димеризации в F-бокс-белке Fbxo7 и ингибиторе протеасомы PI31» . Журнал биологической химии . 283 (32): 22325–35. DOI : 10.1074 / jbc.M709900200 . PMID 18495667 .

[:0-13] Ламан Х, Фунес Дж. М., Йе Х, Хендерсон С., Галинанес-Гарсия Л., Хара Е., Ноулз П., Макдональд Н., Бошофф С. (сентябрь 2005 г.). «Трансформирующая активность Fbxo7 опосредуется специфически через регуляцию циклина D / cdk6» . Журнал EMBO . 24 (17): 3104–16. DOI : 10.1038 / sj.emboj.7600775 . PMC 1201355 . PMID 16096642 .

[:1-14] Берчелл В.С., Нельсон Д.Е., Санчес-Мартинес А., Дельгадо-Кампруби М., Иватт Р.М., Погсон Дж. Х., Рэндл С. Дж., Рэй С., Льюис П. А., Холден Г., Абрамов А. Ю., Харди Дж., Вуд Н. В., Уитворт А. Дж., Ламан H, Plun-Favreau H (сентябрь 2013 г.). «Белки, связанные с болезнью Паркинсона Fbxo7 и Parkin, взаимодействуют, опосредуя митофагию» . Природа Неврологии . 16 (9): 1257–65. DOI : 10.1038 / nn.3489 . PMC 3827746 . PMID 23933751 .

[1]