Из Википедии, свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
FGR
Идентификаторы
ПсевдонимыFGR , SRC2, c-fgr, c-src2, p55-Fgr, p55c-fgr, p58-Fgr, p58c-fgr, протоонкоген FGR, тирозинкиназа семейства Src
Внешние идентификаторыOMIM : 164940 MGI : 95527 HomoloGene : 3842 GeneCards : FGR
Расположение гена ( человек )
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человека) [1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение FGR
Геномное расположение FGR
Группа1п35.3Начинать27 612 064 п.н. [1]
Конец27 635 185 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 4 (мышь)
Chr.Хромосома 4 (мышь) [2]
Хромосома 4 (мышь)
Геномное расположение FGR
Геномное расположение FGR
Группа4 D2.3 | 4 66,11 смНачинать132 974 095 п.н. [2]
Конец133 001 910 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE FGR 208438 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• активность трансферазы
• связывание нуклеотидов
• активность протеинкиназы
• связывание рецептора иммуноглобулина
• активность киназы
• связывание с белком GO: 0001948
• связывание комплекса Fc-гамма рецептор I
• связывание с АТФ
• связывание протеинкиназы
• активность протеинтирозинкиназы
• немембранный протеин тирозин киназная активность
• связывание фосфотирозиновых остатков
• связывание с рецептором
Сотовый компонент• цитоплазма
• цитозоль
• проекция клетки
• мембрана
• внешний компонент цитоплазматической стороны плазматической мембраны
• митохондриальное межмембранное пространство
• волнистая мембрана
• митохондрия
• актиновый цитоскелет
• внутренняя мембрана митохондрий
• внеклеточная экзосома
• цитоскелет
• внеклеточная область
• клеточная мембрана
• агресома
• секреторная гранула просвет
Биологический процесс• клеточная дифференцировка
• регуляция врожденного иммунного ответа
• сигнальный путь рецептора Fc-гамма, участвующий в фагоцитозе
• фосфорилирование
• сигнальный путь трансмембранного рецепторной протеинтирозинкиназы
• процесс иммунной системы
• позитивная регуляция миграции клеток
• позитивная регуляция секреции цитокинов
• ответ на вирус
• положительная регуляция дегрануляции тучных клеток
• сигнальный путь рецептора клеточной поверхности, регулирующий иммунный ответ
• позитивная регуляция активности фосфатидилинозитол-3-киназы
• фосфорилирование белков
• регулирование пролиферации клеток
• регулирование формы клеток
• пептидил-тирозин автофосфорилирование
• интегрин-опосредованный сигнальный путь
• автофосфорилирование
• положительного регулирование фосфатидилинозитол 3-киназа сигнализация
• пептидило-фосфорилирования тирозина
• регуляции активности протеинкиназы
• регулирование фагоцитоза
• оборонительная реакция к грамположительным бактериям
• миграция клеток
• врожденная иммунная система
• дегрануляция нейтрофилов
• минерализация костей
• морфогенез скелетной системы
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

2268

14191

Ансамбль

ENSG00000000938

ENSMUSG00000028874

UniProt

P09769

P14234

RefSeq (мРНК)

NM_001042729
NM_001042747
NM_005248

NM_010208

RefSeq (белок)

NP_001036194
NP_001036212
NP_005239

NP_034338

Расположение (UCSC)Chr 1: 27.61 - 27.64 МбChr 4: 132.97 - 133 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Гарднеру-Рашид кошачьих саркомы вирусный (V-FGR) онкоген гомолога , также известный как FGR , является белком , который в организме человека кодируется FGR гена . [5] [6]

Функция [ править ]

Этот ген является членом семейства протеинтирозинкиназ (PTK) Src. Кодируемый белок содержит N-концевые сайты для миристоилирования и пальмитоилирования , домен PTK и домены SH2 и SH3, которые участвуют в опосредовании белок-белковых взаимодействий с фосфотирозин-содержащими и богатыми пролином мотивами, соответственно. Белок локализуется в складках плазматической мембраны и действует как негативный регулятор миграции и адгезии клеток, запускаемых путем передачи сигнала интегрина бета-2 . Заражение вирусом Эпштейна-Барраприводит к сверхэкспрессии этого гена. Идентифицировано несколько альтернативно сплайсированных вариантов, кодирующих один и тот же белок. [6]

Открытие [ править ]

Кошачья версия этого гена была открыта Сурайей Рашидом, Мюрреем Гарднером и его коллегами. [7]

Взаимодействия [ править ]

Было показано, что FGR (ген) взаимодействует с белком синдрома Вискотта-Олдрича . [8] [9] [10]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000000938 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028874 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Tronick SR, Popescu NC, Cheah MS, Swan DC, Amsbaugh SC, Ленгель CR, ДиПаоло JA, Роббинс KC (октябрь 1985). «Наук Соединенных Штатов Америки» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 82 (19): 6595–9. DOI : 10.1073 / pnas.82.19.6595 . PMC 391256 . PMID 2995972 .  
  6. ^ a b «Ген Энтреза: FGR Гарднер-Рашид, гомолог онкогена кошачьей саркомы (v-fgr)» .
  7. ^ Rasheed S, M Barbacid, Аронсон S, Гарднер MB (февраль 1982). «Происхождение и биологические свойства нового вируса саркомы кошек». Вирусология . 117 (1): 238–44. DOI : 10.1016 / 0042-6822 (82) 90522-0 . PMID 6175084 . 
  8. ^ Банин S, Чыонг O, Katz DR, Уотерфилд MD, Брикелл PM, подагра I (август 1996). «Белок синдрома Вискотта-Олдрича (WASp) является партнером по связыванию протеин-тирозинкиназ семейства c-Src». Текущая биология . 6 (8): 981–8. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (02) 00642-5 . PMID 8805332 . S2CID 162267 .  
  9. ^ Финан ЛС, Сомс CJ, Уилсон л, Нельсон Д.Л., Стюарт Д. М., Труонга О, Сюань JJ, S Келли (октябрь 1996 г.). «Идентификация областей белка синдрома Вискотта-Олдрича, ответственных за ассоциацию с выбранными доменами 3 гомологии Src» (PDF) . Журнал биологической химии . 271 (42): 26291–5. DOI : 10.1074 / jbc.271.42.26291 . PMID 8824280 . S2CID 1945958 .   
  10. ^ Риверо-Лескано О.М., Marcilla A, Sameshima JH, Robbins KC (октябрь 1995). «Белок синдрома Вискотта-Олдрича физически связывается с Nck через 3 гомологии Src доменов» . Молекулярная и клеточная биология . 15 (10): 5725–31. DOI : 10,1128 / MCB.15.10.5725 . PMC 230823 . PMID 7565724 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Патель М., Фолкнер Л., Кац Д. Р., Брикелл П. М. (1991). «Протоонкоген c-fgr: экспрессия в B-лимфоцитах, инфицированных вирусом Эпштейна-Барра, и в клетках миеломоноцитарной и гранулоцитарной линий». Патобиология . 59 (4): 289–92. DOI : 10.1159 / 000163665 . PMID  1652975 .
  • Реш М.Д. (февраль 1994 г.). «Миристилирование и пальмитилирование членов семьи Src: жиры вещества». Cell . 76 (3): 411–3. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (94) 90104-X . PMID  8313462 . S2CID  30267126 .
  • Lowell CA, Berton G (март 1999 г.). «Передача сигнала интегрина в миелоидных лейкоцитах» . Журнал биологии лейкоцитов . 65 (3): 313–20. DOI : 10.1002 / jlb.65.3.313 . PMID  10080533 .
  • Снаппер С.Б., Розен Ф.С. (1999). «Белок синдрома Вискотта-Олдрича (WASP): роль в передаче сигналов и организации цитоскелета». Ежегодный обзор иммунологии . 17 (1): 905–29. DOI : 10.1146 / annurev.immunol.17.1.905 . PMID  10358777 .
  • Татосян А.Г., Мизенина О.А. (янв 2000). «Киназы семейства Src: структура и функции». Биохимия. Биохимия . 65 (1): 49–58. PMID  10702640 .
  • Патель М.С., Манку Б.С., Брикелл П.М. (апрель 1992 г.). «Полиморфный микросателлитный повтор расположен рядом с промоторной областью протоонкогена c-fgr (FGR) на хромосоме 1p36.2-p36.1». Молекулярная генетика человека . 1 (1): 65. DOI : 10,1093 / HMG / 1.1.65-а . PMID  1339476 .
  • Линк DC, Gutkind SJ, Роббинс KC, Ley TJ (май 1992 г.). «Характеристика 5'-нетранслируемой области гена c-fgr человека и идентификация главного промотора c-fgr миеломоноцитов». Онкоген . 7 (5): 877–84. PMID  1373875 .
  • Патель М., Ливерс С.Дж., Брикелл П.М. (февраль 1990 г.). «Структура полного человеческого протоонкогена c-fgr и идентификация нескольких сайтов начала транскрипции». Онкоген . 5 (2): 201–6. PMID  1690869 .
  • Бионди А., Паганин С., Росси В., Бенвестито С., Перлмуттер Р. М., Мантовани А., Аллавена П. (март 1991 г.). «Экспрессия генов протеинтирозинкиназы, ограниченных по происхождению, в естественных киллерах человека». Европейский журнал иммунологии . 21 (3): 843–6. DOI : 10.1002 / eji.1830210348 . PMID  1826268 . S2CID  26645112 .
  • Gutkind JS, Link DC, Katamine S, Lacal P, Miki T, Ley TJ, Robbins KC (март 1991). «Новый экзон c-fgr, используемый в B-лимфоцитах, инфицированных вирусом Эпштейна-Барра, но не в нормальных моноцитах» . Молекулярная и клеточная биология . 11 (3): 1500–7. DOI : 10,1128 / MCB.11.3.1500 . PMC  369433 . PMID  1847500 .
  • Патель М., Ливерс С.Дж., Брикелл П.М. (февраль 1990 г.). «Регулирование экспрессии протоонкогена c-fgr в линиях В-клеток, инфицированных вирусом Эпштейна-Барра». Международный журнал рака . 45 (2): 342–6. DOI : 10.1002 / ijc.2910450222 . PMID  2154410 . S2CID  22888218 .
  • Паркер Р.К., Мардон Дж., Лебо Р.В., Вармус Е.П., епископ Дж. М. (апрель 1985 г.). «Выделение дублированных человеческих генов c-src, расположенных на хромосомах 1 и 20» . Молекулярная и клеточная биология . 5 (4): 831–8. DOI : 10,1128 / MCB.5.4.831 . PMC  366788 . PMID  2581127 .
  • Брикелл П.М., Патель М. (декабрь 1988 г.). «Структура и экспрессия мРНК протоонкогена c-fgr в клеточных линиях, преобразованных вирусом Эпштейна-Барра» . Британский журнал рака . 58 (6): 704–9. DOI : 10.1038 / bjc.1988.294 . PMC  2246855 . PMID  2852026 .
  • Троник С.Р., Попеску, Северная Каролина, Чеа М.С., Лебедь, округ Колумбия, Амсбау, СК, Ленгель С.Р., ДиПаоло Дж. А., Роббинс К. «Выделение и хромосомная локализация протоонкогена fgr человека, отдельного члена семейства генов тирозинкиназы» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 82 (19): 6595–9. Bibcode : 1985PNAS ... 82.6595T . DOI : 10.1073 / pnas.82.19.6595 . PMC  391256 . PMID  2995972 .
  • Cheah MS, Ley TJ, Tronick SR, Robbins KC (1986). «мРНК протоонкогена fgr, индуцированная в В-лимфоцитах инфекцией вируса Эпштейна-Барра» . Природа . 319 (6050): 238–40. Bibcode : 1986Natur.319..238C . DOI : 10.1038 / 319238a0 . PMID  3003578 . S2CID  4323488 .
  • Нисидзава М., Семба К., Ёсида М.С., Ямамото Т., Сасаки М., Тойосима К. (февраль 1986 г.). «Структура, экспрессия и расположение в хромосоме человеческого гена c-fgr» . Молекулярная и клеточная биология . 6 (2): 511–7. DOI : 10,1128 / MCB.6.2.511 . PMC  367540 . PMID  3023853 .
  • Katamine S, Notario V, Rao CD, Miki T, Cheah MS, Tronick SR, Robbins KC (январь 1988 г.). «Первичная структура продукта протоонкогена fgr человека p55c-fgr» . Молекулярная и клеточная биология . 8 (1): 259–66. DOI : 10,1128 / MCB.8.1.259 . PMC  363113 . PMID  3275868 .
  • Иноуэ К., Икава С., Семба К., Сукегава Дж., Ямамото Т., Тойосима К. (1988). «Выделение и секвенирование клонов кДНК, гомологичных онкогену v-fgr, из линии клеток В-лимфоцитов человека, IM-9». Онкоген . 1 (3): 301–4. PMID  3330776 .
  • Нисидзава М., Семба К., Ямамото Т., Тоошима К. (март 1985 г.). «Ген cf gr человека не содержит кодирующей последовательности для актин-подобного белка». Японский журнал исследований рака . 76 (3): 155–9. PMID  3922831 .


  • v
  • т
  • е