• процессом с малой субъединицей • тельце Кахаля • мембрана • ядрышко • плотный фибриллярный компонент • внеклеточная экзосома • клеточное ядро • блок C / D комплекс snoRNP • гранулярный компонент • хромосома • нуклеоплазма • фибриллярный центр
Биологический процесс
• тРНК обработки • snoRNA локализации • рРНК метилирование • гистона метилирование глутамина • метилирование • окно C / D , snoRNA 3'-конца обработки • snoRNA процесс обмена веществ • дифференцировки остеобластов • Обработка рРНК
рРНК 2'-О-метилтрансферазы фибрилларин представляет собой фермент , который у человека кодируется FBL гена . [5] [6] [7]
СОДЕРЖАНИЕ
1 Функция
2 взаимодействия
3 ссылки
4 Дальнейшее чтение
Функция [ править ]
Этот генный продукт является компонентом ядрышковой частицы малого ядерного рибонуклеопротеина (snRNP), которая, как предполагается, участвует на первом этапе процессинга прерибосомной (r) РНК. Он связан с небольшими ядрышковыми РНК U3 , U8 и U13 и расположен в плотном фибриллярном компоненте (DFC) ядрышка . Кодируемый белок содержит N-концевой повторяющийся домен, который богат остатками глицина и аргинина, как и фибрилларины у других видов. Его центральная область напоминает РНК-связывающий домен и содержит консенсусную последовательность РНП. Антисыворотки примерно 8% людей с аутоиммунным заболеванием склеродермией распознают фибрилларин. [7]
Фибрилларин является компонентом нескольких рибонуклеопротеидов, включая ядрышковый малый ядерный рибонуклеопротеин ( SnRNP ) и один из двух классов малых ядрышковых рибонуклеопротеидов (snoRNP). SnRNAs участвуют в сплайсинге РНК, тогда как snoRNPs участвуют в процессинге рибосомной РНК .
Фибрилларин связан с малыми ядерными РНК U3, U8 и U13 у млекопитающих и подобен дрожжевому белку NOP1. Фибрилларин имеет хорошо консервативную последовательность из примерно 320 аминокислот и содержит 3 домена: N-концевую область, богатую Gly / Arg; центральный домен, напоминающий другие РНК-связывающие белки и содержащий консенсусную последовательность, подобную РНП-2; и С-концевой альфа-спиральный домен. Эволюционно связанный белок процессинга пре-рРНК, который лишен Gly / Arg-богатого домена, был обнаружен у различных архей.
Исследование Schultz et al. показали, что белок 15,5 кДа, связывающий K-поворот (называемый Snu13 в дрожжах), взаимодействует со сплайсосомными белками hPRP31, hPRP3, hPRP4, CYPH и небольшими ядрышковыми рибонуклеопротеинами NOP56 , NOP58 и фибрилларином. Белок 15,5 кДа имеет сходство последовательностей с другими РНК-связывающими белками, такими как рибосомные белки S12, L7a и L30 и белок snoRNP NHP2 . SnRNP U4 / U6 содержит белок массой 15,5 кДа. [8] Белок 15,5 кДа также существует в составе рибонуклеопротеинового комплекса, который связывает мотив B / C U3-бокса. Белок 15,5 кДа также существует как один из четырех ядерных белков небольшого ядрышкового рибонуклеопротеина C / D, который опосредует метилирование прерибосомных РНК.
Были рассмотрены структурные доказательства, подтверждающие идею о том, что фибрилларин является метилтрансферазой мяРНК. [9]
Взаимодействия [ править ]
Было показано, что фибрилларин взаимодействует с DDX5 [10] и SMN1 . [11]
Ссылки [ править ]
^ a b c ENSG00000280548 GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000105202, ENSG00000280548 - Ensembl , май 2017 г.
^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000046865 - Ensembl , май 2017 г.
^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Арис JP, Блобель G (февраль 1991). «Клонирование кДНК и секвенирование человеческого фибрилларина, консервативного ядрышкового белка, распознаваемого аутоиммунными антисыворотками» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 88 (3): 931–5. Bibcode : 1991PNAS ... 88..931A . DOI : 10.1073 / pnas.88.3.931 . PMC 50928 . PMID 1846968 .
↑ Jansen RP, Hurt EC, Kern H, Lehtonen H, Carmo-Fonseca M, Lapeyre B, Tollervey D (май 1991). «Эволюционное сохранение человеческого ядрышкового белка фибрилларина и его функциональная экспрессия в дрожжах» . Журнал клеточной биологии . 113 (4): 715–29. DOI : 10,1083 / jcb.113.4.715 . PMC 2288999 . PMID 2026646 .
^ a b «Ген Энтреза: фибрилларин FBL» .
^ Контакты белок-белок и белок-РНК способствуют 15.5K-опосредованной сборке snRNP U4 / U6 и snoRNP Box C / D Аннемари Шульц, Стефани Ноттротт, Николас Джеймс Уоткинс и Рейнхард Люрманн в молекулярной и клеточной биологии ( 2006) Том 26, страницы 5146–5154.
^ Структура и функция малых ядрышковых рибонуклеопротеинов Стива Л. Рейчоу, Томоко Хаммы, Адриана Р. Ферре-Д'Амаре и Габриэле Варани в Исследовании нуклеиновых кислот (2007) Том 35, страницы 1452–1464.
^ Никол С.М., Causevic М, Прескотт А.Р., Фуллер-Пейс FV (Jun 2000). «Ядерная DEAD-бокс-РНК геликаза p68 взаимодействует с ядрышковым белком фибрилларином и специфически колокализуется в формирующихся ядрышках во время телофазы». Экспериментальные исследования клеток . 257 (2): 272–80. DOI : 10.1006 / excr.2000.4886 . PMID 10837141 .
^ Pellizzoni л, Baccon Дж, Charroux В, Дреифасс G (июль 2001). «Белок выживания мотонейронов (SMN) взаимодействует с белками snoRNP фибрилларином и GAR1». Текущая биология . 11 (14): 1079–88. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (01) 00316-5 . PMID 11509230 . S2CID 12392702 .
Человек нейробластома , ( SH-SY5Y ) клетки , окрашенные с антителами к фибрилларину в зеленом цвете, антитело к нейрофиламентам NF-H в красном и ДНК в темно - синем, связывает фибрилларин антител к пятнам в ядре , соответствующие ядрышки. Ядрышки также содержат ДНК и поэтому выглядят как бледно-голубые точки. Антитело к нейрофиламентам NF-H связывается с цитоплазматическими промежуточными филаментами или 10-нм филаментами . Изображение, антитела и окрашивание EnCor Biotechnology Inc.
Дальнейшее чтение [ править ]
Baserga SJ, Yang XD, Steitz JA (сентябрь 1991 г.). «Неповрежденная последовательность Box C в мяРНК U3 необходима для связывания фибрилларина, белка, общего для основного семейства ядрышковых мяРНП» . Журнал EMBO . 10 (9): 2645–51. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1991.tb07807.x . PMC 452965 . PMID 1714385 .
Окано Ю., Стин В.Д., Медсгер Т.А. (январь 1992 г.). «Аутоантитела к ядрышечному рибонуклеопротеину U3 (фибрилларин) у пациентов с системным склерозом» . Артрит и ревматизм . 35 (1): 95–100. DOI : 10.1002 / art.1780350114 . PMID 1731817 .
Lischwe MA, Ochs RL, Reddy R, Cook RG, Yeoman LC, Tan EM, Reichlin M, Busch H (ноябрь 1985 г.). «Очистка и частичная характеристика антигена ядрышковой склеродермии (Mr = 34000; pI, 8,5), богатого NG, NG-диметиларгинином». Журнал биологической химии . 260 (26): 14304–10. PMID 2414294 .
Méhes G, Pajor L (июнь 1995 г.). «Экспрессия нуклеолина и фибрилларина в стимулированных лимфоцитах и дифференцирующихся клетках HL-60. Анализ проточной цитометрии». Клеточная пролиферация . 28 (6): 329–36. DOI : 10.1111 / j.1365-2184.1995.tb00074.x . PMID 7626687 . S2CID 34753195 .
Магулас С., Зацепина О.В., Джордан П.В., Джордан Э.Г., Фрид М. (февраль 1998 г.). «Белок SURF-6 является компонентом ядрышкового матрикса и обладает высокой способностью связывания нуклеиновых кислот in vitro». Европейский журнал клеточной биологии . 75 (2): 174–83. DOI : 10.1016 / s0171-9335 (98) 80059-9 . PMID 9548374 .
Ай Л.С., Линь С.Х., Се М., Ли К. (октябрь 1999 г.). «Метилирование аргинина глицина и богатого аргинином пептида, полученного из последовательностей человеческого FMRP и фибрилларина». Труды Национального научного совета Китайской Республики. Часть B, Науки о жизни . 23 (4): 175–80. PMID 10518318 .
Пинтар Л., Кресслер Д., Лапейр Б. (февраль 2000 г.). «Spb1p представляет собой ядрышковый белок дрожжей, связанный с Nop1p и Nop58p, который способен связывать S-аденозил-L-метионин in vitro» . Молекулярная и клеточная биология . 20 (4): 1370–81. DOI : 10.1128 / MCB.20.4.1370-1381.2000 . PMC 85287 . PMID 10648622 .
Николь С.М., Кэушевич М., Прескотт А.Р., Фуллер-Пейс Ф.В. (июнь 2000 г.). «Ядерная DEAD-бокс-РНК геликаза p68 взаимодействует с ядрышковым белком фибрилларином и специфически колокализуется в формирующихся ядрышках во время телофазы». Экспериментальные исследования клеток . 257 (2): 272–80. DOI : 10.1006 / excr.2000.4886 . PMID 10837141 .
Pellizzoni L, Baccon J, Charroux B, Dreyfuss G (июль 2001 г.). «Белок выживания мотонейронов (SMN) взаимодействует с белками snoRNP фибрилларином и GAR1». Текущая биология . 11 (14): 1079–88. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (01) 00316-5 . PMID 11509230 . S2CID 12392702 .
Чжоу X, Тан Ф.К., Сюн М., Милевич Д.М., Фегали, Калифорния, Фрицлер М.Дж., Ревейлл Д.Д., Арнетт ФК (декабрь 2001 г.). «Системный склероз (склеродермия): определенные аутоантигенные гены избирательно сверхэкспрессируются в фибробластах склеродермии» . Журнал иммунологии . 167 (12): 7126–33. DOI : 10.4049 / jimmunol.167.12.7126 . PMID 11739535 .
Андерсен Дж. С., Лион CE, Фокс А. Х., Люнг А. К., Лам Ю. В., Стин Х., Манн М., Ламонд А. И. (январь 2002 г.). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека». Текущая биология . 12 (1): 1–11. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9 . PMID 11790298 . S2CID 14132033 .
Cimato TR, Tang J, Xu Y, Guarnaccia C, Herschman HR, Pongor S, Aletta JM (февраль 2002 г.). «Опосредованное фактором роста нервов увеличение метилирования белка происходит преимущественно на сайтах метилирования аргинина I типа и включает протеин-аргининметилтрансферазу 1». Журнал неврологических исследований . 67 (4): 435–42. DOI : 10.1002 / jnr.10123 . PMID 11835310 . S2CID 8041481 .
Фудзияма С., Янагида М., Хаяно Т., Миура Ю., Исобе Т., Фудзимори Ф., Учида Т., Такахаши Н. (июнь 2002 г.). «Выделение и протеомная характеристика человеческих парвулин-ассоциированных прерибосомных рибонуклеопротеиновых комплексов» . Журнал биологической химии . 277 (26): 23773–80. DOI : 10.1074 / jbc.M201181200 . PMID 11960984 .
Whitehead SE, Jones KW, Zhang X, Cheng X, Terns RM, Terns MP (декабрь 2002 г.). «Детерминанты взаимодействия белка SMN, вызывающего мышечную атрофию позвоночника, с модифицированным диметиларгинином боксом H / ACA малым ядрышковым рибонуклеопротеином GAR1» . Журнал биологической химии . 277 (50): 48087–93. DOI : 10.1074 / jbc.M204551200 . PMID 12244096 .
Эррера-Эспарса Р., Крузе Л., фон Эссен М., Кампос Л., Барбоса О., Боллен Дж. Дж., Бадильо И., Авалос-Диас Е. (октябрь 2002 г.). «U3 snoRNP ассоциируется с фибрилларином, компонентом комковатого ядрышкового домена склеродермии». Архив дерматологических исследований . 294 (7): 310–7. DOI : 10.1007 / s00403-002-0338-7 . PMID 12373336 . S2CID 10316081 .
Chen M, Rockel T, Steinweger G, Hemmerich P, Risch J, von Mikecz A (октябрь 2002 г.). «Субклеточное рекрутирование фибрилларина в нуклеоплазматические протеасомы: последствия для процессинга ядрышкового аутоантигена» . Молекулярная биология клетки . 13 (10): 3576–87. DOI : 10.1091 / mbc.02-05-0083 . PMC 129967 . PMID 12388758 .
Уоткинс, штат Нью-Джерси, Дикманнс А., Люрманн Р. (декабрь 2002 г.). «Консервативный стебель II бокс-мотива C / D важен для локализации ядрышка и необходим вместе с белком 15.5K для иерархической сборки бокс-C / D snoRNP» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (23): 8342–52. DOI : 10.1128 / MCB.22.23.8342-8352.2002 . PMC 134055 . PMID 12417735 .
