Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
FGFRL1
Идентификаторы
ПсевдонимыFGFRL1 , FGFR5, FHFR, рецептор фактора роста фибробластов, подобный 1, рецептор фактора роста фибробластов, подобный 1, FGFR-5
Внешние идентификаторыOMIM : 605830 MGI : 2150920 HomoloGene : 11067 GeneCards : FGFRL1
Расположение гена ( человек )
Хромосома 4 (человек)
Chr.Хромосома 4 (человек) [1]
Хромосома 4 (человек)
Геномное расположение FGFRL1
Геномное расположение FGFRL1
Группа4п16.3Начинать1 009 936 б.п. [1]
Конец1 026 898 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 5 (мышь)
Chr.Хромосома 5 (мышь) [2]
Хромосома 5 (мышь)
Геномное расположение FGFRL1
Геномное расположение FGFRL1
Группа5 | 5 FНачинать108 692 382 п.н. [2]
Конец108 706 924 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE FGFRL1 gnf1h00389 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• связывание фактора роста фибробластов
• связывание гепарина
• активность рецептора, активируемого фактором роста фибробластов
Сотовый компонент• неотъемлемый компонент мембраны
• аппарат Гольджи
• транспортная везикула
• зона межклеточного контакта
• мембрана
• клеточная мембрана
Биологический процесс• развитие скелетной системы
• морфогенез межжелудочковой перегородки
• межклеточная адгезия посредством молекул адгезии плазматической мембраны
• зависимое от адгезии субстрата распространение клеток
• гомоолигомеризация белков
• морфогенез сердечного клапана
• гетероолигомеризация белков
• развитие диафрагмы
• негативная регуляция пролиферации клеток
• рецептор фактора роста фибробластов сигнальный путь
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

53834

116701

Ансамбль

ENSG00000127418

ENSMUSG00000008090

UniProt

Q8N441

Q91V87

RefSeq (мРНК)

NM_001004356
NM_001004358
NM_021923
NM_001370296

NM_001164259
NM_054071

RefSeq (белок)

NP_001004356
NP_001004358
NP_068742
NP_001357225
NP_001004356.1

NP_001157731
NP_473412

Расположение (UCSC)Chr 4: 1.01 - 1.03 МбChr 5: 108,69 - 108,71 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Фактор роста фибробластов рецептор-1 , как это белок , который в организме человека кодируется FGFRL1 геном . [5]

Белок, кодируемый этим геном, является членом рецептора фактора роста фибробластов.(FGFR), где аминокислотная последовательность высоко консервативна между членами и на протяжении всей эволюции. Члены семейства FGFR отличаются друг от друга сродством к лигандам и тканевым распределением. Полноразмерный репрезентативный белок должен состоять из внеклеточной области, состоящей из трех иммуноглобулиноподобных доменов, одного гидрофобного трансмембранного сегмента и цитоплазматического тирозинкиназного домена. Внеклеточная часть белка взаимодействует с факторами роста фибробластов, приводя в движение каскад нисходящих сигналов, в конечном итоге влияя на митогенез и дифференцировку. Заметным отличием этого генного продукта от других членов семейства является отсутствие в нем цитоплазматического тирозинкиназного домена. Результатом является трансмембранный рецептор, который может взаимодействовать с другими членами семейства и потенциально ингибировать передачу сигналов.Для этого гена было обнаружено несколько альтернативно сплайсированных вариантов транскриптов, кодирующих одну и ту же изоформу.[5]

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000127418 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000008090 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ a b «Ген Entrez: рецептор фактора роста фибробластов FGFRL1, подобный 1» .

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–174. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8 . PMID  8125298 .
  • Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–156. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3 . PMID  9373149 .
  • Видеманн М, Труб Б (2001). «Характеристика нового белка (FGFRL1) из хряща человека, связанного с рецепторами FGF». Геномика . 69 (2): 275–279. DOI : 10.1006 / geno.2000.6332 . PMID  11031111 .
  • Ким И., Мун С., Ю К. и др. (2001). «Новый рецептор фактора роста фибробластов-5, предпочтительно экспрессируемый в поджелудочной железе (1)». Биохим. Биофиз. Acta . 1518 (1-2): 152-6. DOI : 10.1016 / s0167-4781 (00) 00282-7 . PMID  11267671 .
  • Слиман М., Фрейзер Дж., Макдональд М. и др. (2001). «Идентификация нового рецептора фактора роста фибробластов, FGFR5». Джин . 271 (2): 171–182. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (01) 00518-2 . PMID  11418238 .
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–16903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932 .
  • Trueb B, Zhuang L, Taeschler S, Wiedemann M (2003). «Характеристика FGFRL1, рецептора нового фактора роста фибробластов (FGF), предпочтительно экспрессируемого в скелетных тканях» . J. Biol. Chem . 278 (36): 33857–33865. DOI : 10.1074 / jbc.M300281200 . PMID  12813049 .
  • Кларк Х.Ф., Герни А.Л., Абая Э. и др. (2003). «Инициатива по открытию секретируемых белков (SPDI), крупномасштабная попытка идентифицировать новые секретируемые и трансмембранные белки человека: оценка биоинформатики» . Genome Res . 13 (10): 2265–2270. DOI : 10.1101 / gr.1293003 . PMC  403697 . PMID  12975309 .
  • Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Nat. Genet . 36 (1): 40–45. DOI : 10,1038 / нг1285 . PMID  14702039 .
  • Чжан З., Хензель В.Дж. (2005). «Прогнозирование сигнального пептида на основе анализа экспериментально подтвержденных сайтов расщепления» . Protein Sci . 13 (10): 2819–2824. DOI : 10.1110 / ps.04682504 . PMC  2286551 . PMID  15340161 .
  • Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Genome Res . 14 (10B): 2121–2127. DOI : 10.1101 / gr.2596504 . PMC  528928 . PMID  15489334 .
  • Антуан М., Вирц В., Тэг К.Г. и др. (2005). «Характер экспрессии факторов роста фибробластов (FGF), их рецепторов и антагонистов в первичных эндотелиальных клетках и гладкомышечных клетках сосудов». Факторы роста . 23 (2): 87–95. DOI : 10.1080 / 08977190500096004 . PMID  16019430 . S2CID  27380246 .
  • Шильд С., Труб Б. (2006). «Аберрантная экспрессия FGFRL1, нового рецептора FGF, в опухолях яичников». Int. J. Mol. Med . 16 (6): 1169–73. DOI : 10.3892 / ijmm.16.6.1169 . PMID  16273302 .


  • v
  • т
  • е