Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
FOXC1
Белок FOXC1 PDB 1d5v.png
Идентификаторы
ПсевдонимыFOXC1 , ARA, FKHL7, FREAC-3, FREAC3, IGDA, IHG1, IRID1, RIEG3, вилка C1, ASGD3
Внешние идентификаторыOMIM : 601090 MGI : 1347466 HomoloGene : 20373 GeneCards : FoxC1
Расположение гена ( человек )
Хромосома 6 (человек)
Chr.Хромосома 6 (человека) [1]
Хромосома 6 (человек)
Геномное расположение FOXC1
Геномное расположение FOXC1
Группа6п25.3Начинать1 609 915 п.н. [1]
Конец1 613 897 п.н. [1]
Расположение гена ( Мышь )
Хромосома 13 (мышь)
Chr.Хромосома 13 (мышь) [2]
Хромосома 13 (мышь)
Геномное расположение FOXC1
Геномное расположение FOXC1
Группа13 A3.2 | 13 13,52 смНачинать31 806 633 п.н. [2]
Конец31 812 476 п.н. [2]
Паттерн экспрессии РНК
PBB GE FOXC1 213260 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция• связывания ДНК
• ДНК - связывающая последовательность конкретной
• РНК - полимераза ДНК регуляторной области II последовательности-специфическое связывание
• GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 ДНК-связывающий активатор активность транскрипции, РНК - полимераза II , -специфический
• ГО: связывание белка 0001948
• транскрипционный фактор активности, РНК - полимеразы II , связывание дистальный энхансер последовательности специфических
• связывания ДНК, гибка
• транскрипции коактиватор связывания
• ГО: 0001105 транскрипции коактиватор активности
• связывания фактора транскрипции
• связывание промотор-специфические хроматина
• GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции
• GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II
Сотовый компонент• нуклеоплазма
• ядерный гетерохроматин
• ядро клетки
• цитозоль
Биологический процесс• развитие глаз
• сомитогенез
• сигнальный путь Notch
• развитие скелетной системы
• метаболический процесс гликозаминогликанов
• позитивная регуляция дифференцировки гемопоэтических клеток-предшественников
• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• развитие клеток нервного гребня
• формирование параксиальной мезодермы
• оссификация
• передача сигналов фактора роста эндотелия сосудов путь
• организация коллагеновых фибрилл
• поддержание прозрачности хрусталика
• морфогенез сердца
• внутриутробное эмбриональное развитие
• пролиферация клеток сердечной мышцы
• развитие лимфатических сосудов
• транскрипция, ДНК-шаблон
• развитие эмбриональной сердечной трубки
• позитивная регуляция дифференцировки гемопоэтических стволовых клеток
• одонтогенез дентинсодержащего зуба
• позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон
• морфогенез желудочковой сердечной мышцы
• развитие сердца
• ремоделирование кровеносных сосудов
• развитие мозга
• сигнальный путь рецептора фактора роста эндотелия сосудов
• негативная регуляция лимфангиогенеза
• развитие кровеносных сосудов
• положительной регуляция экспрессии генов
• дифференцировка мезенхимальных клеток
• Развитие мезенхимальных клеток
• артерии морфогенез
• развитие яичников фолликула
• негативная регуляция ангиогенеза
• развитие глаз камеры типа
• регулирование роста органов
• зародышевой клетки миграции
• слезной железа развитие
• отрицательного регуляция митотического клеточного цикла
• негативная регуляция апоптотического процесса, участвующего в морфогенезе тракта оттока
• транскрипция с промотора РНК-полимеразы II
• эндохондральная оссификация
• пролиферация клеток
• позитивная регуляция перехода эпителия в мезенхиму
• миграция клеток
• позитивная регуляция связывания ДНК
• позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• клеточный ответ на стимул эпидермального фактора роста
• позитивная регуляция связывания основного промотора
• негативная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• развитие мозжечка
• положительная регуляция дифференцировки кератиноцитов
• развитие клубочкового эпителия
• развитие зачатка мочеточника
• развитие почек
• опосредованный хемокинами сигнальный путь
• клеточный ответ на хемокин
• ангиогенез
• развитие многоклеточного организма
• регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• морфогенез анатомической структуры
• дифференцировка клеток
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

2296

17300

Ансамбль

ENSG00000054598

ENSMUSG00000050295

UniProt

Q12948

Q61572

RefSeq (мРНК)

NM_001453

NM_008592

RefSeq (белок)

NP_001444

NP_032618

Расположение (UCSC)Chr 6: 1.61 - 1.61 МбChr 13: 31.81 - 31.81 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Forkhead коробка С1 , также известная как FoxC1 , является белком , который в организме человека кодируется FoxC1 геном . [5] [6] [7]

Функция [ править ]

Этот ген относится к Forkhead семейства факторов транскрипции , которая характеризуется отчетливым ДНК-связывающего вилки головного домена . Специфическая функция этого гена еще не определена; однако было показано, что он играет роль в регуляции эмбрионального и глазного развития.

Развитие сердца и сомитогенез [ править ]

FOXC1 и его близкий родственник FOXC2 являются критическими компонентами в развитии сердца и кровеносных сосудов, а также сегментации параксиальной мезодермы и образования сомитов. Экспрессия белков Fox находится в диапазоне от низких уровней в задней пресомитической мезодерме (PSM) до самых высоких уровней в передней PSM. Гомозиготные мутантные эмбрионы для обоих белков Fox не смогли сформировать сомиты 1-8, что указывает на важность этих белков на ранней стадии развития сомитов. [8]

В морфогенезе сердца FOXC1 и FOXC2 необходимы для правильного развития сердечного тракта оттока. Путь оттока формируется из популяции клеток, известной как вторичное поле сердца. Белки Fox транскрибируются во вторичном поле сердца, где они регулируют экспрессию ключевых сигнальных молекул, таких как Fgf8 , Fgf10 , Tbx1 , Isl1 и Bmp4 . [9]

Клиническое значение [ править ]

Мутации в этом гене вызывают различные фенотипы глаукомы, включая первичную врожденную глаукому, аутосомно-доминантную аномалию иридогониодисгенеза и синдром Аксенфельда – Ригера типа 3. [5]

Роль в раке [ править ]

FOXC1 индуцирует переход эпителия в мезенхиму (EMT), который представляет собой процесс, при котором эпителиальные клетки отделяются от окружающих клеток и начинают миграцию. Этот процесс участвует в метастазировании, что придает FOXC1 решающую роль в развитии рака. Сверхэкспрессия FOXC1 приводит к усилению регуляции фибронектина , виментина и N-кадгерина , которые вносят вклад в миграцию клеток при карциноме носоглотки (NPC). Нокаут FOXC1 в человеческих клетках NPC подавлял экспрессию виментина, фибронектина и N-кадгерина. [10]

Фактор транскрипции FOXC1 регулирует ЕМП при базальном раке молочной железы (BLBC). Активация SMO-независимой передачи сигналов Hedgehog с помощью FOXC1 изменяет свойства раковых стволовых клеток (CSC) в клетках BLBC. [11] Эти CSC, которые регулируются передачей сигналов FOXC1, способствуют пролиферации опухоли, инвазии в ткани и рецидиву. [12]

См. Также [ править ]

  • FOX белки

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000054598 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000050295 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ a b «Entrez Gene: вилка C1 FOXC1» .
  6. ^ Pierrou S, Hellqvist М, Самуэлссон л, Enerbäck S, Carlsson Р (октябрь 1994 г.). «Клонирование и характеристика семи белков вилки человека: специфичность сайта связывания и изгиб ДНК» . Журнал EMBO . 13 (20): 5002–12. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1994.tb06827.x . PMC 395442 . PMID 7957066 .  
  7. ^ Нисимура DY, Swiderski RE, Alward WL, Searby CC, Патил SR, Беннет SR, Kanis AB, Gastier JM, Стоун М., Sheffield VC (июнь 1998). «Ген фактора транскрипции вилки FKHL7 отвечает за фенотипы глаукомы, которые соответствуют 6p25». Генетика природы . 19 (2): 140–7. DOI : 10,1038 / 493 . PMID 9620769 . S2CID 34692231 .  
  8. ^ Kume T, Цзян H, Topczewska JM, Hogan BL (сентябрь 2001). «Мышиные факторы транскрипции крылатой спирали, Foxc1 и Foxc2, оба необходимы для развития сердечно-сосудистой системы и сомитогенеза» . Гены и развитие . 15 (18): 2470–82. DOI : 10,1101 / gad.907301 . PMC 312788 . PMID 11562355 .  
  9. Перейти ↑ Seo S, Kume T (2006). «Факторы транскрипции Forkhead, Foxc1 и Foxc2, необходимы для морфогенеза сердечного тракта оттока». Биология развития . 296 (2): 421–436. DOI : 10.1016 / j.ydbio.2006.06.012 . PMID 16839542 . 
  10. ↑ Ou-Yang L, Xiao SJ, Liu P, Yi SJ, Zhang XL, Ou-Yang S, Tan SK, Lei X (декабрь 2015 г.). «Forkhead box C1 вызывает эпителиально-мезенхимальный переход и является потенциальной терапевтической мишенью при карциноме носоглотки» . Отчеты по молекулярной медицине . 12 (6): 8003–9. DOI : 10.3892 / mmr.2015.4427 . PMC 4758279 . PMID 26461269 .  
  11. ^ Хан, Бингчен; Цюй, Инь; Джин, Янли; Ю, Йи; Дэн, Нан; Вавровский, Коля; Чжан, Сяо; Ли, На; Бозе, Шиха (2015). «FOXC1 активирует сглаженную независимую передачу сигналов ежа при базальном раке молочной железы» . Отчеты по ячейкам . 13 (5): 1046–1058. DOI : 10.1016 / j.celrep.2015.09.063 . PMC 4806384 . PMID 26565916 .  
  12. ^ Хан Б., Цюй И, Джин И, Ю И, Дэн Н, Вавровски К., Чжан Икс, Ли Н, Бозе С., Ван Ц., Саккиа С., Аброл Р., Дженсен Т. В., Берман Б. П., Танака Х, Джонсон Дж., Гао Б., Хао Дж., Лю З., Буттян Р., Рэй П.С., Хунг МС, Джулиано А.Э., Цуй Х (ноябрь 2015 г.) «FOXC1 активирует сглаженную независимую передачу сигналов ежа при базальном раке молочной железы» . Отчеты по ячейкам . 13 (5): 1046–58. DOI : 10.1016 / j.celrep.2015.09.063 . PMC 4806384 . PMID 26565916 .  

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Сперлинг Р., Бастин М. (июль 1975 г.). «Динамическое равновесие в сборке гистонов: самосборка отдельных гистонов и пар гистонов». Биохимия . 14 (15): 3322–31. DOI : 10.1021 / bi00686a006 . PMID  1170889 .
  • Пьерру С., Хеллквист М., Самуэльссон Л., Энербэк С., Карлссон П. (октябрь 1994 г.). «Клонирование и характеристика семи белков вилки человека: специфичность сайта связывания и изгиб ДНК» . Журнал EMBO . 13 (20): 5002–12. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1994.tb06827.x . PMC  395442 . PMID  7957066 .
  • Хромас Р., Мур Дж., Джонстон Т., Соча С., Клемш М. (июнь 1993 г.). «Гомологи вилки дрозофилы экспрессируются ограниченным по клону способом в гемопоэтических клетках человека» . Кровь . 81 (11): 2854–9. DOI : 10.1182 / blood.V81.11.2854.2854 . PMID  8499623 .
  • Ларссон С., Хеллквист М., Пьерроу С., Уайт И., Энербэк С., Карлссон П. (декабрь 1995 г.). «Хромосомная локализация шести генов вилки человека, freac-1 (FKHL5), -3 (FKHL7), -4 (FKHL8), -5 (FKHL9), -6 (FKHL10) и -8 (FKHL12)». Геномика . 30 (3): 464–9. DOI : 10.1006 / geno.1995.1266 . PMID  8825632 .
  • Лонгхерст Т.Дж., О'Нил Г.М., Харви Р.М., Дэйви Р.А. (ноябрь 1996 г.). «Ген, связанный с устойчивостью к антрациклину (ara), новый ген, связанный с множественной лекарственной устойчивостью в клеточной линии лейкемии человека» . Британский журнал рака . 74 (9): 1331–5. DOI : 10.1038 / bjc.1996.545 . PMC  2074757 . PMID  8912525 .
  • Мирс А.Дж., Мирзаянс Ф., Гулд Д.Б., Пирс В.Г., Уолтер М.А. (декабрь 1996 г.). «Аутосомно-доминантная аномалия иридогониодисгенеза соответствует 6p25» . Американский журнал генетики человека . 59 (6): 1321–7. PMC  1914875 . PMID  8940278 .
  • Гулд Д. Б., Мирс А. Дж., Пирс В. Г., Уолтер М. А. (сентябрь 1997 г.). «Аутосомно-доминантная аномалия Аксенфельда-Ригера соответствует 6p25» . Американский журнал генетики человека . 61 (3): 765–8. DOI : 10.1016 / S0002-9297 (07) 64340-7 . PMC  1715932 . PMID  9326342 .
  • Джордан Т., Эбенезер Н., Маннерс Р., МакГилл Дж., Бхаттачарья С. (октябрь 1997 г.). «Семейная глаукома иридогониодисплазия отображается в области 6p25, связанной с первичной врожденной глаукомой и аномалией иридогониодисгенеза» . Американский журнал генетики человека . 61 (4): 882–8. DOI : 10.1086 / 514874 . PMC  1715988 . PMID  9382099 .
  • Нисимура Д.Ю., Свидерски Р.Э., Алвард В.Л., Сирби С.К., Патил С.Р., Беннет С.Р., Канис А.Б., Гастье Дж.М., Стоун Е.М., Шеффилд В.К. (июнь 1998 г.) «Ген фактора транскрипции вилки FKHL7 отвечает за фенотипы глаукомы, которые соответствуют 6p25». Генетика природы . 19 (2): 140–7. DOI : 10,1038 / 493 . PMID  9620769 . S2CID  34692231 .
  • Мирс А.Дж., Джордан Т., Мирзаянс Ф., Дюбуа С., Куме Т., Парли М., Ритч Р., Куп Б., Куо В.Л., Коллинз С., Маршалл Дж., Гулд Д.Б., Пирс В., Карлссон П., Энербек С., Мориссетт Дж., Бхаттачарья С. , Хоган Б., Раймонд В., Уолтер М.А. (ноябрь 1998 г.). «Мутации гена вилки / крылатой спирали, FKHL7, у пациентов с аномалией Аксенфельда-Ригера» . Американский журнал генетики человека . 63 (5): 1316–28. DOI : 10.1086 / 302109 . PMC  1377542 . PMID  9792859 .
  • Swiderski RE, Reiter RS, Nishimura DY, Alward WL, Kalenak JW, Searby CS, Stone EM, Sheffield VC, Lin JJ (сентябрь 1999 г.). «Экспрессия гена Mf1 в развивающихся сердцах мышей: участие в развитии врожденных пороков сердца человека» . Динамика развития . 216 (1): 16–27. DOI : 10.1002 / (SICI) 1097-0177 (199909) 216: 1 <16 :: AID-DVDY4> 3.0.CO; 2-1 . PMID  10474162 .
  • Мирзаянс Ф., Гулд Д.Б., Хеон Э., Биллингсли Г.Д., Чунг Дж.С., Мирс А.Д., Уолтер М.А. (январь 2000 г.). «Синдром Аксенфельда-Ригера в результате мутации гена FKHL7 на хромосоме 6p25» . Европейский журнал генетики человека . 8 (1): 71–4. DOI : 10.1038 / sj.ejhg.5200354 . PMID  10713890 .
  • Леманн О.Дж., Эбенезер Н.Д., Джордан Т., Фокс М., Окака Л., Пейн А., Лерой Б.П., Кларк Б.Дж., Хитчингс Р.А., Пови С., Хоу П.Т., Бхаттачарья СС (ноябрь 2000 г.). «Хромосомная дупликация с участием гена фактора транскрипции вилки FOXC1 вызывает гипоплазию радужной оболочки и глаукому» . Американский журнал генетики человека . 67 (5): 1129–35. DOI : 10.1016 / S0002-9297 (07) 62943-7 . PMC  1288555 . PMID  11007653 .
  • Нишимура Д.Ю., Сирби С.К., Алвард В.Л., Уолтон Д., Крейг Дж.Э., Макки Д.А., Кавасе К., Канис А.Б., Патил С.Р., Стоун Е.М., Шеффилд В.К. (февраль 2001 г.). «Спектр мутаций FOXC1 предполагает дозировку гена как механизм дефектов развития передней камеры глаза» . Американский журнал генетики человека . 68 (2): 364–72. DOI : 10.1086 / 318183 . PMC  1235270 . PMID  11170889 .
  • Ван Х.Х., МакНатт Л.Г., Шепард А.Р., Якобсон Н., Нисимура Д.Й., Стоун Е.М., Шеффилд В.К., Кларк А.Ф. (апрель 2001 г.). «Оптимальная процедура для извлечения РНК из глазных тканей человека и профилирования экспрессии гена врожденной глаукомы FOXC1 с использованием количественной ОТ-ПЦР». Молекулярное зрение . 7 : 89–94. PMID  11320352 .
  • Кавасе С., Кавасе К., Танигути Т., Сугияма К., Ямамото Т., Китадзава Ю., Алвард В.Л., Стоун Е.М., Нишимура Д.Ю., Шеффилд В.К. (декабрь 2001 г.). «Скрининг мутаций синдрома Аксенфельда-Ригера, вызванных геном FOXC1, у японских пациентов». Журнал глаукомы . 10 (6): 477–82. DOI : 10.1097 / 00061198-200112000-00007 . PMID  11740218 . S2CID  43165728 .
  • Dintilhac A, Bernués J (март 2002 г.). «HMGB1 взаимодействует со многими очевидно неродственными белками, распознавая короткие аминокислотные последовательности» (PDF) . Журнал биологической химии . 277 (9): 7021–8. DOI : 10.1074 / jbc.M108417200 . PMID  11748221 . S2CID  39560486 .
  • Берри Ф. Б., Салим Р. А., Вальтер М. А. (март 2002 г.). «Регуляция транскрипции FOXC1 опосредуется N- и C-концевыми доменами активации и содержит фосфорилированный домен ингибирования транскрипции» . Журнал биологической химии . 277 (12): 10292–7. DOI : 10.1074 / jbc.M110266200 . PMID  11782474 .
  • Borges AS, Susanna R, Carani JC, Betinjane AJ, Alward WL, Stone EM, Sheffield VC, Nishimura DY (февраль 2002 г.). «Генетический анализ PITX2 и FOXC1 у пациентов с синдромом Ригера из Бразилии». Журнал глаукомы . 11 (1): 51–6. DOI : 10.1097 / 00061198-200202000-00010 . PMID  11821690 . S2CID  26094053 .
  • Freyaldenhoven BS, Fried C, Wielckens K (июль 2002 г.). «FOXD4a и FOXD4b, два новых фактора транскрипции крылатой спирали, экспрессируются в клеточных линиях лейкемии человека». Джин . 294 (1-2): 131-140. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (02) 00702-3 . PMID  12234674 .

Внешние ссылки [ править ]

  • FOXC1 + белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии .